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使用元基因组采矿方法从高山土壤的质体中寻找新的降解酶
塑料材料，包括微塑料，即使在欧洲阿尔卑斯山等偏远和寒冷的环境中也积聚在所有类型的生态系统中。这种污染对环境和人类构成了风险，需要解决。使用大约3,000 m a.s.l.的东部瑞士阿尔卑斯山收集的土壤的shot弹枪DNA宏基因组学，我们确定了可能降解塑料的基因及其蛋白质。我们通过差异丰度分析筛选了质体和大块土壤的宏基因组，并与专门针对推定的塑料降解基因的特定数据库进行了基于相似性的筛选，并选择了具有信号肽的高概率的基因，用于信号肽的细胞外导出和高信任的功能率。此过程导致了9个候选基因的最终列表。预测蛋白的长度在425至845个氨基酸之间，预测产生这些蛋白质的属主要属于Caballeronia和Bradyrhizobium。我们使用异源表达进行了功能验证，然后进行上清液的酶测定。测试的九种蛋白质中的五种显示出我们使用酯酶测定时的活性显着增加，而从候选基因（一种水解酶型酯酶）中的五种蛋白质中的一种显然具有最高的活性，高于双倍以上。，我们仅用来自酯化酯酶测定中五个候选基因的蛋白质对塑料类型的塑料降解和生态®进行荧光测定，但是像阴性对照一样，这些蛋白质并未显示出任何偶尔的活性。相比之下，阳性对照的活性（包含文献中已知的Pla降解基因插入物）是阴性对照的20倍以上。这些发现表明，在计算机筛选中进行功能验证，适合查找新的降解酶。尽管我们只发现了一种新的酯酶酶，但我们的方法有可能应用于任何类型的土壤和各种生态系统中的塑料，以快速有效地寻找新的塑料降解酶。
泰国东部两片红树林土壤中分离的产纤维素酶细菌的多样性和纤维素分解活性
摘要。Bamrungpanichtavorn T、Ungwiwatkul S、Boontanom P、Chantarasiri A。2023. 从泰国东部两片红树林土壤中分离出的产纤维素酶细菌的多样性和纤维素分解活性。生物多样性 24：3891-3902。东南亚国家拥有世界上最大的红树林面积。红树林是分离经济微生物酶的潜在来源。纤维素酶是一种广泛用于各种行业中纤维素降解的微生物酶。因此，本研究旨在从泰国东部两片红树林的土壤中分离、遗传鉴定和酶学表征产纤维素酶的细菌。分离了 26 种产纤维素酶的细菌，随后通过聚合酶链反应-限制性片段长度多态性 (PCR-RFLP) 分析 16S rRNA 基因进行基因分型。获得了 13 种不同的 RFLP 模式，并对其进行了遗传分析，分为 6 个细菌属，包括 气单胞菌 、 芽孢杆菌 、 金黄杆菌 、 赖氨酸芽孢杆菌 、 假单胞菌 和 弧菌 。芽孢杆菌属是研究地点产纤维素酶的主要细菌。此外，产纤维素酶的金黄杆菌和赖氨酸芽孢杆菌几乎从未被报道过。芽孢杆菌属菌株 RY08B 是活性最高的产纤维素酶细菌，CMCase 酶活力为 1.510 0.060 U/mL。确定了 CMCase 活性的最适温度和 pH 值为 50°C（pH 为 7.0），热稳定范围为 25-50°C（pH 为 7.0）。这种细菌可应用于多种对生产过程要求温和的环保行业。
审查和更新使用有益的根和土壤细菌来植物生长和养分贫困的可持续性，干旱的土壤
迅速增加的人口，加上气候变化以及对合成肥料过度依赖的数十年，导致了两个紧迫的全球挑战：粮食不安全和土地退化。因此，至关重要的是，实践可以使土壤和植物健康以及可持续性更加积极地追求至关重要。可持续性和土壤生育能力包括诸如改善贫困和干旱土壤中植物生产力，保持土壤健康的生产力，并最大程度地减少对贫困土壤管理带来的生态系统的有害影响，包括农业化学品和其他污染物的径流。促进细菌（PGPB）的植物生长可以通过多种方式改善粮食生产：通过促进宏观和微量营养素的资源获取（尤其是N和P），调节植物激素水平，拮抗致病因素并维持土壤生育能力。PGPB包括属于多个门的细菌的不同功能和分类群，包括蛋白质细菌，富公司，细菌，细菌和静脉细菌等。本综述总结了这些有益的土壤细菌用来促进植物健康的机制和方法，并询问它们是否可以进一步发展为有效的，潜在的商业植物刺激剂，这些植物刺激剂实质上降低或替换了涉及食品生产和生态系统稳定性的各种有害实践。我们的目标是描述有益植物 - 微生物相互作用涉及的各种机制，以及它们如何帮助我们实现可持续性。
不同的微生物组是甲烷排放的不同反应，从多种湿地土壤到氧移动
湿地中的抽象水文转移是全球重要的甲烷（CH 4）来源，是CH 4排放和碳气候反馈的关键限制。对水文驱动的氧（O 2）的变化如何影响微生物CH 4循环的有限理解使湿地CH 4排放不确定。瞬态o 2暴露在温带沼泽中的植物泥炭中显着刺激了缺氧的CH 4产生，通过富集多酚氧化剂和多糖降解剂，从而增强了底物在随后的缺氧条件下朝着甲烷生成的流动。评估土壤微生物组结构和功能的转移是否在湿地类型的跨类型中相似，我们在这里检查了不同湿地土壤对瞬时氧合的敏感性。在从矿物营养的芬中植入泥炭泥炭的浆液中，以及淡水沼泽和盐泥的沉积物，我们检查了微生物体的时间变化以及浆液的地球化学表征和孵化向前空间。氧合不影响微生物组的结构和富含矿物质的Fen-Origin泥炭和淡水沼泽土壤中的缺氧CH 4产生。与O 2刺激的CH 4产生相关的关键分类单元在膜中泥炭中非常罕见，在芬罗根泥炭中支持微生物组的结构，这是湿地对O 2位变化的主要决定因素。与淡水湿地实验相反，盐泥地球化学（尤其是pH值）和微生物组的结构持续且显着改变后氧合作用，尽管对温室气体的排放没有显着影响。简介这些不同的反应表明，湿地可能对2波动有差异。随着气候变化的变化，湿地中的o 2变异性更大，我们的结果为湿地弹性的机制提供了帮助，并将微生物组结构作为潜在的弹性生物标志物。
有机碳和养分在硫化沉积物上发展的酸性土壤中的储存和分布：反应性铁和大孔的作用
摘要：在过去70年中，在硫酸盐和有机富的沉积物上发育于硫酸盐富含硫酸盐的富含硫酸盐的地下（pH 3-4）中，在大孔孔上形成了广泛的褐色至黄色层。我们的数据表明，这些层（“大孔表面”）在1 M HCl提取的反应性铁（2-7％的干重）中强烈富集，很大程度上与Schwertmannite和2-线二氢岩结合。这些反应性铁相捕获了大的不稳定有机物（OM）和可提取的磷，可能是源自培养层的。在土壤聚集体中，OM的性质与大孔表面的性质不同，但与基础硫的沉积物（C-Horizon）相似。这提供了证据表明，散装地下土壤中的沉积物OM在很大程度上保存而没有明显的分解和/或分馏，这可能是由于反应性铁相的生理化学稳定而导致的，而反应性铁相也存在于聚集体内。These findings not only highlight the important yet underappreciated roles of iron oxyhydroxysulfates in OM/ nutrient storage and distribution in acidic sulfate-rich and other similar environments but also suggest that boreal acidic sulfate-rich subsoils and other similar soil systems (existing widely on coastal plains worldwide and being increasingly formed in thawing permafrost) may act as global sinks for OM and nutrients in the短期。关键字：酸性硫酸盐土壤，大孔，反应性铁，硫化物氧化，有机碳储存，养分■简介
有机碳和养分在硫化沉积物上发展的酸性土壤中的储存和分布：反应性铁和大孔的作用
摘要：在过去70年中，在硫酸盐和有机富的沉积物上发育于硫酸盐富含硫酸盐的富含硫酸盐的地下（pH 3-4）中，在大孔孔上形成了广泛的褐色至黄色层。我们的数据表明，这些层（“大孔表面”）在1 M HCl提取的反应性铁（2-7％的干重）中强烈富集，很大程度上与Schwertmannite和2-线二氢岩结合。这些反应性铁相捕获了大的不稳定有机物（OM）和可提取的磷，可能是源自培养层的。在土壤聚集体中，OM的性质与大孔表面的性质不同，但与基础硫的沉积物（C-Horizon）相似。这提供了证据表明，散装地下土壤中的沉积物OM在很大程度上保存而没有明显的分解和/或分馏，这可能是由于反应性铁相的生理化学稳定而导致的，而反应性铁相也存在于聚集体内。These findings not only highlight the important yet underappreciated roles of iron oxyhydroxysulfates in OM/ nutrient storage and distribution in acidic sulfate-rich and other similar environments but also suggest that boreal acidic sulfate-rich subsoils and other similar soil systems (existing widely on coastal plains worldwide and being increasingly formed in thawing permafrost) may act as global sinks for OM and nutrients in the短期。关键字：酸性硫酸盐土壤，大孔，反应性铁，硫化物氧化，有机碳储存，养分■简介
红树林和雨林土壤的微生物表征，以及尼日利亚河流州的牛豆（Vigna Unguiculata L. Walp）种植
摘要 - 不同的微生物群存在于雨林和红树林植被土壤类型中，但对其人口和多样性的了解不多，因此，进行了这项研究，以评估和比较微生物的季节性变化，以及在尼日利亚州河流州哈科尔特港的两种植被土壤中的植被类型的多样性。在干燥和雨季中收集了顶部土壤（0-15cm）和地下土壤（15-30厘米）的样品，并进行标准分析。cow豆在栽培之前和之后的不同土壤和微生物种群中也进行了种植。结果表明，在干旱季节，红树林和雨林植被类型的微生物种群比其他季节都显着（P≤0.05）。微生物种群的范围是：总杂质细菌7.8-25.0 x105cfu/g和6.6-22.1 x105cfu/g;总核真菌2.0-5.4 x103cfu/g和0.3-0.9 x 103 cfu/g;放线菌0.2-3.7x103cfu/g和0.2-0.9x103cfu/g;硝化细菌0.2-6.9 x102 cfu/g和0.2-5.0x102cfu/g;氮固定细菌（0.2-1.3x102cfu/g和0.2-1.5x102cfu/g）分别用于雨林和红树林土壤。在所有季节中，总共分离出33种细菌，2种放线菌和15种真菌。芽孢杆菌是最主要的细菌，而曲霉菌是两种植被类型和所有季节中最为主要的真菌。牛豆种植和季节性变化后，不同土壤中的微生物种群增加了微生物多样性和种群。索引术语 - 植被，土壤，特征，细菌，真菌
通过地中海和欧盟南部的生活实验室来促进碳农业实践，以实现欧洲土壤的健康未来
范围：份额创新实验室通过（i）引入可持续的农业生态系统管理实践来解决强烈耕种土地上土壤退化的挑战，以及（ii）监视和验证其对土壤健康和碳序列化的影响，并与EU土壤任务保持一致。实验室与致力于再生农业和碳养殖的农民，研究人员和利益相关者互动。创新包括恢复土壤生育能力，增强生物多样性并改善碳储存的实践。关键组件：（i）长期实验（LTE），为创新技术提供科学数据； （ii）灯塔农场（LHF），用于测试和推广新技术的示范农场。
对长期施用生物固体的土壤中丛枝菌根真菌接种效果的新见解：强调抗生素和
施用生物固体可以提高土壤肥力和作物产量，但也伴随着重金属和抗生素引入的风险。在重金属污染环境下，利用丛枝菌根真菌 (AMF) 是一种有效的策略，可以增强土壤微生物群落稳定性和植物对重金属的耐受性，并减少抗生素抗性基因 (ARG) 的传播。本研究通过盆栽试验探究了接种 AMF 对土壤和植物重金属含量以及土壤微生物群落的影响。结果表明，接种 AMF 显著提高了植物生物量，并降低了土壤和植物重金属含量。虽然接种 AMF 不会改变细菌和真菌群落的组成，但在较高的生物固体浓度下，它增加了细菌的多样性。值得注意的是，接种 AMF 增强了微生物网络的复杂性，并增加了关键类群的丰度。此外，在接种 AMF 的土壤中，一些对重金属具有高抗性的有益微生物得到了富集。宏基因组分析显示，与未接种AMF的土壤相比，接种AMF的土壤中移动遗传元件（MGE）基因IS91减少，重金属抗性基因增加。MGE介导的耐药基因（ARG）扩散减少的可能性是本研究的主要发现之一。需要注意的是，本研究还检测到接种AMF的高生物固体改良土壤中少数耐药基因的富集。总体而言，接种AMF可能是一种有效的农业策略，可以减轻与生物固体、重金属和抗生素耐药性相关的环境风险，从而促进可持续的土壤管理和健康。
耦合判别统计分析和人工智能对坎彭巴市土壤的岩土工程特性进行描述（刚果民主共和国卢本巴希）
本研究重点是通过体外试验确定卢本巴希市 Kampemba 市区的现场样本的物理和力学特性。在本研究结束时，我们根据土壤参数对其进行了识别，并使用进行的识别试验的组指数法确定其承载能力，从而确定岩土分类。通过使用 AASHTO 分类方法（美国州际公路运输官员协会），我们研究后获得的结果显示，一般而言，土壤分为五类：A-2、A-4、A-5、A-6、A-7，具体而言，有关区域土壤分为八个亚类：A-2-4、A-2-6、A-2-7、A-4、A-5、A-6、A-7-5 和 A-7-6。后者对物理参数的全局值进行了统计分析和基于多层感知器的深度学习。其结果为：流限为31.77%±1.05%，塑限为18.71%±0.76%，塑性指数为13.06%±0.79%，2 mm 筛通过率为83.00%±3.33%，400 μm 筛通过率为76.22%±3.2%，4.75 mm 筛通过率为89.07%±2.99%，80 μm 筛通过率为70.62%±2.39%，稠度指数为1.66±0.61，流动性指数为-0.67±0.62，群体指数为8±1。 关键词