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一个用于鼠标脑映射和分析的优化工具包
在其长达一个世纪的历史中，组织学一直是三维（3D）组织的2维研究。t主要是由于特定的限制，特定的y二维（2D）视野，结合大多数组织过于不透明，无法以较大的量表和高分辨率进行高度分辨率。even尽管在一个多世纪前发明了通过R EFR激活指数构图的组织清除[1]，但缺乏想象和分析能力限制了我们获取高效率IMA GES的能力，并量化了获得的高度ima ges和量化数据获得的数据。在过去的十年中，灯页微观镜的双创新和Br ain清除tec hniques hniques hniques e启用了3D成像的3D成像，具有亚细胞分辨率[2]。ho w e v er，3d ima ging数据量大复合物，m ulti-gigabyte ima ge stac ks，无法轻易进行操作。这是针对特定分析任务优化的专业IMA ge Analy ysis管道的范围，例如识别感兴趣的功能，将其映射到参考模板上，并将结果签到3D [3-6]。不幸的是，这些软件包倾向于依赖于支持软件的复杂而脆弱的环境（例如，特定版本中的Python软件包）。作为一种疾病，这些软件管道的人很脆弱，需要fre-
用RVSV二价疫苗进行口服免疫，包括ADCC在内的保护性免疫反应，包括SARS-COV-2和流感A病毒
Highly accurate long-read single-molecule sequencing has revolutionized the comprehensive assembly of phased genetic architectures (Wenger et al.2019; Vollger等。2020; Nurk等。2022）。In addition, long-read single-molecule sequencing has permitted the direct identification of modified DNA bases such as m6A and 5-methylcytosine (5mC) (Marks et al.2012;克拉克等。2012; Murray等。2012; Loman等。2015; [CSL样式错误：没有印刷表格的参考。]）启用单分子染色质纤维测序（Stergachis等人2020; Lee等。2020; Abdulhay等。2020; Shipony等。2020）。Specifically, single-molecule chromatin fiber sequencing leverages non-specific methyltransferases to selectively stencil chromatin protein occupancy patterns directly onto their underlying DNA molecules in the form of modified bases.修饰碱基。For example, during single-molecule, real-time (SMRT) sequencing, the identity of each base is determined based on the fluorophore-labeled
基于粪便的定量PCR测定法用于诊断青少年和成人的结核病：一项跨国，前瞻性诊断准确性研究
建议引用推荐引用kay，亚历山大； Vasiliu，ANCA；卢西亚的Carratala-Castro； Mtafya，Bariki；门德斯·雷耶斯（Mendez Reyes），何塞·尤伯托（Jose Euberto）； Maphalala，Nontobeko；穆加姆，希尔西亚； Mulengwa，Durbbin；尼斯，塔拉；贝伦的萨维德拉；巴查，杰森； Maphalala，Gugu; Mejia，Rojelio； Mtetwa，Godwin； Acacio，Sozinho； Manjate，Patricia； Mambuque，Edson； Nosisa的志Ba；诺克万达哥达； Ziyane，Mangaliso； Ntinginya，Nyanda Elias；兰格，克里斯托夫；基尔奇纳（H Lester）； Dinardo，Andrew R； Garcia-Basteiro，Alberto L；曼达拉卡斯，安娜·玛丽亚；和Stool4TB全球合作伙伴关系，“基于粪便的定量PCR测定法对青少年和成人的结核病诊断：一项跨国，前瞻性诊断准确性研究”（2024）。教职员工出版物。1687。https://digitalcommons.library.tmc.edu/baylor_docs/1687
absp：有效分析区域的自动化R工具 -
动机：如今，在生物学的每个部分中都研究了表观遗传基因法规，从胚胎发育到癌症和神经退行性疾病等疾病。目前，为了量化和比较特定目标区域的CpG甲基化水平，最容易访问的技术是BisulfE TE -TE测序PCR（BSP）。但是，没有现有的用户友好工具能够分析来自BSP所有方法的数据。因此，处理PCR产品的直接测序（Direct-BSP）处理结果的最方便方法是手动分析色谱图轨迹，这是重复性且容易出现错误任务。结果：在这里，我们实施了一种新的基于R的工具，称为ABSP用于分析BisulfE TE-FITE测序PCR，从而提供了直接-BSP和Cloning-BSP数据的完整分析过程。它使用原始测序痕量文件（.ab1）作为计算和比较CpG甲基化百分比的输入。它是完全自动化的，并包含一个用户友好的界面，作为内置的r闪亮应用程序，质量控制步骤并生成出版物就绪的图形。可用性和实现：ABSP工具和相关数据可在https://github.com/ absp-methylation-tool/absp上获得。联系人：chann.lagadec@inserm.fr补充信息：补充数据可在Online Bioinformatics获得。
通过脑电信号分析对OM诵经对大脑的影响
1，2，3最后一年的学生，4 4 4位CMR工程技术学院教授，海得拉巴摘要：目前通常用于使用手动处理设备切割草的技术。该项目旨在使用蓝牙模块功能来制造由Android应用控制的草切割机系统，该功能通过使用太阳能在电动机的帮助下运行。在前几天，草切割机由燃料和电能运营，这些燃料和电能是昂贵的，需要高维护。太阳能电池板用于给电池充电，因此无需向外部充电。与其他能源相比，基于太阳能的能源更易于使用，更有利，并且易于使用。通过使用太阳能电池板，我们可以利用阳光免费发电。捕获的太阳能用于为电池充电以进行草切割操作。机器的移动由自动模式或手动模式完全控制。蓝牙控制器通过Android应用程序运行该机器的运动和方向。整个系统的控制设备是微控制器。蓝牙模块和直流电动机连接到微控制器。通过蓝牙模块从Android电话应用程序接收到的数据被作为输入到控制器的输入，并且控制器在太阳能切割器的直流电动机上作用。在完成任务时，控制器加载了使用嵌入式“ C”语言编写的程序。关键字：Arduino，太阳能电池板，电池，DC电机，蓝牙模块，电机驱动器，继电器。
生命周期评估是当地一级可持续农业和食品计划的预期工具
由于农业和粮食系统对环境的影响很大，例如它们对气候变化的贡献，因此迫切需要减少其影响。国际和国家政府设定了可持续性目标并实施相应的措施。尽管如此，全球化制度的批评者声称，领土行政规模更适合解决可持续性问题。然而，在国家一级，地方当局很少采用系统性的环境评估来增强其行动计划。本文采用领土生命周期评估方法来改善当地环境农业食品计划。目的是确定显着的直接和间接环境热点，其起源，并制定有效的缓解策略。该方法适用于法国西北部战略农业地区Finistere行政部门。对多种环境标准，包括气候变化，化石资源稀缺，毒性和土地利用。发现，所研究的当地食品系统的主要环境热点来自间接来源，例如牲畜饲料或柴油消耗。牲畜的减少和有机农业转化是最有效的策略，导致气候变化指标降低了25％。但是，在国家目标之后，整体建模的影响减少是不可能的，并且在土地使用指标上仍然有限。这些结果突出了生命周期评估的创新应用，该评估是地方一级的，为进一步的系统和前瞻性局部农业食品评估提供了见解。此外，它们为地方当局提供了指导，以增强计划策略的可持续性。
小鼠中的微生物群耗竭，作为探索因果关系的工具小鼠中的微生物群耗竭，作为探索因果关系的工具
hal是一个多学科的开放访问档案，用于存款和传播科学研究文件，无论它们是否已发表。这些文件可能来自法国或国外的教学和研究机构，也可能来自公共或私人研究中心。
基于有向光氧化诱导的生物成像转化率的双色光关注荧光探针
摘要：我们在本文中提出了一个新概念，以基于一种称为有向光氧化诱导的转化（DPIC）的机制产生双色光转换探针。作为对这种机制的支持，含有芳香的单重氧反应性部分（如呋喃和吡咯）的苯乙烯香豆素（SC）已合成。sc是明亮的荧光团，由于ASORM的定向光氧化而导致可见光的光辐射，它会在可见的光照射下进行高营养转化，从而导致共轭破坏。sc-p，带有吡咯部分的黄色发射探针，转换为稳定的蓝色发射香豆素，具有68 nm的偏移，从而使光转换和跟踪活细胞中的脂质液滴跟踪。这种新方法可能会为新一代的光转换染料铺平道路，用于高级生物成像应用。
交互式网络工具用于分析与癌细胞系的遗传特征相关的药物敏感性和抗性
广泛的治疗曲目已适用于肿瘤学家，包括放射性和化学疗法，小分子和单克隆抗体。但是，药物疗效可以受到使癌细胞逃脱治疗的遗传变化的限制。在这里，我们设计了一个网络工具，可促进癌症中药物敏感性基因组学（GDSC）数据库的数据分析，并在265种认可的化合物上与癌细胞系百科全书中的1001个细胞系（ccle，ccle，cbioportal）中的1001个细胞系有关的大量遗传变化进行了批准。WebTool计算一组遗传改变的耐药性比值比。它提供了分配给细胞信号通路的单个化合物或一组化合物的功效的结果。使用此网络工具，我们复制了已知的遗传驱动因素，并确定了新的候选基因，种系变体，共同享受和药物基因组耐药性和药物重新利用的药物基因组修饰剂。WebTool可用性：https：//tools.hornlab.org/gdsc/。
对井眼中溶解气体的定量监测：分析工具的校准
摘要。气体监测是理解地下环境中天然气的交换，扩散和迁移过程的先决条件，这与多种应用有关，例如CO 2的地质隔离。在这项研究中，将三种不同的技术（微型GC，红外和拉曼光谱镜）部署在一个实验性的钻孔上，以进行CO 2注射后的监测目的。的目的是开发一种实时化学监测装置，通过在井眼内的水中测量溶解的气体浓度，但也通过与井孔水平的平衡中的气体收集系统在表面上进行测量。但是，必须校准所有三种技术以提供最准确的定量数据。为此，实现了实验室中的第一个校准步骤。需要进行新的校准，以确定水中或气体收集系统中的气体浓度和/或浓度。用于气相分析，微型-GC，FTIR光谱和拉曼光谱法。对于CO 2，CH 4和N 2进行了Mi-CRO-GC的新校准，不确定性从±100 ppm到1.5 mol％，具体取决于散装浓度和气体类型。先前对CO 2和CO 2，N 2，O 2，CH 4和H 2 O校准了FTIR和RAMAN光谱仪，其精度为1 - 6％，具体取决于浓度尺度，气体和光谱仪。溶解的CO 2。预测溶解的CO 2浓度的不确定性分别为±0.003 mol kg 1和±0.05 bar。