对于酵母和丝状真菌,建议使用WGS。应通过系统基因分析(例如,使用几个保守序列的串联来产生针对可用相关基因组的系统发育)或通过对同一物种的完整参考基因组的对准来完成身份的确认。在没有WGS数据的情况下,可以使用适合酵母/真菌组合适的歧视性基因的相似性(例如内部转录的间隔区(ITS),D1/D2区域或完全大型亚基核糖体RNA基因)。表8物种识别细节*
INSA Toulouse ( https://www.insa-toulouse.fr/ ) Partnership: CRITT BIO-INDUSTRIES ( https://bioindustries.insa-toulouse.fr/ ), BBF ( https://www.bbf-lab.fr/ ) Period: Starting period between April/May 2025 (duration: 18 months) Funding: Carnot 3BCAR,固体影响项目总工资:2250€/月(INRAE合同)上下文:固态发酵(SSF)是一种生物技术过程,特别适合在植物生物量上培养丝状真菌。这项技术为感兴趣的分子的可持续生产提供了许多优势,包括适用于现有价值链,低水需求和低废物生产的各种副产品。SSF对于食品,绿色化学和化妆品等不同市场具有工业兴趣。SSF流程相对简单地在实验室范围内设置。然而,扩大规模的困难,特别是与内源性菌群的存在,可用生物质的异质性以及在培养过程中对真菌行为的监测有关。稳固的影响项目旨在了解两个关键参数对SSF性能的影响:内源性微生物对生物质的污染水平,以及真菌对底物异质性的适应性和菌丝菌丝周围的环境。为了解决这些局限性,我们将衡量不同净化方法对菌合的建立的影响,并监测异质性在微环境参数中的影响,例如温度,水含量,pH和底物颗粒测定法对真菌生长及其代谢活性。我们将使用丝状真菌brumalis,这是可以在SSF中种植的高木质和纤维素分解酶的高生产商,并且是生物经济性的模型生物量,其培养不会影响食品农业的土地使用:Miscarcanthus。
未来对月球的任务将彻底改变我们的行星殖民化方法。这些任务的核心是对月球表面上丰富的月球灰尘和雷果的有效管理和利用。正在探索一种创新的方法,即具有微生物,尤其是丝状真菌的原位研究利用(ISRU)。这些是通过称为生物无能或生物培训的过程从月球岩石中提取有价值的金属和矿物质的有前途的候选人。该技术旨在使用当地的月球材料来支持月球长期操作,从而减少对基于地球的昂贵的补给的需求。
由于这些生物的困难生物学,反向遗传学在人类丝状寄生虫中的应用滞后。最近,我们开发了一种共同培养系统,该系统允许转染Brugia Malayi的感染性幼体阶段并有效地发展为Fecund成年人。这是开发基于Piggybac Transposon的工具包的,该工具包可用于生产具有稳定整合到寄生虫基因组中的转基因序列的寄生虫。然而,PiggyBac系统通常已被基于群的常规间隔短篇小学重复序列(CRISPR)技术取代,这允许精确编辑基因组。在这里,我们报告了适应b。马来语用于CRISPR介导的敲入插入寄生虫基因组。在b的基因间区域中鉴定出合适的CRISPR插入位点。马来语基因组。修改了双重记者Piggybac载体,用插入位点的序列替换了Piggybac倒的末端重复区域。b。用合成引导RNA,修饰的质粒和cas9核酸酶转染马来语或其。将转染的寄生虫植入沙鼠中,并允许发展为成年人。后代微丝菌进行了筛选,并筛选了质粒中编码的分泌的荧光素酶报告器的表达。发现大约3%的微丝虫分泌荧光素酶;所有这些都包含插入寄生虫基因组中预期位置的转基因序列。这些数据表明CRISPR可用于修改B的基因组。使用适配器介导的PCR测定法,检查了转基因微丝菌是否存在关闭目标插入;没有发现脱靶插入。马来语,开辟了精确编辑这种重要人类丝状寄生虫的基因组的道路。
由于直径少于大约1毫米的物体无法清楚地看到,并且必须使用显微镜检查,因此微生物学主要与生物体和较小的生物和药物有关。然而,某些微生物,特别是某些桉树微生物,在没有显微镜的情况下可见。例如,微生物学家研究了面包模具和丝状藻类,但肉眼可见。微生物学: - 微生物学是对微生物或微生物的各个方面的研究 - 隔离,表征和鉴定,生长控制和灭菌,遗传学,生理学,可能有害或有益的特征,可能是有害或有益的特征,它们与环境的相互作用,与其他生物体及其在工业中的互动及其在工业中的使用方式及其使用方式。
摘要 一个年轻的垃圾填埋场渗滤液含有高浓度的总氨,通常高达 2,700 mg/l,在两个不同的实验室规模厌氧反应器中进行了 1,015 天的厌氧处理,这两个反应器配置为污泥床和混合床。本文介绍了这项长期厌氧可处理性研究的最后 265 天。通过使用 FISH(荧光原位杂交)、克隆、DGGE(变性梯度凝胶电泳)和形态分析来识别优势微生物,将高氨浓度对反应器性能的影响与微生物多样性的变化相关联。结果表明,如果在氨浓度高时对反应器进水进行临时 pH 调节,则可以使用 UASB 或混合床反应器成功处理高氨垃圾填埋场渗滤液。因此,COD 去除效率与微生物多样性和反应器配置无关,而是取决于渗滤液的可生物降解部分。在这种情况下,低乙酸盐水平的反应器的稳定性由甲烷菌群的丰富性支持。在这两个反应器中,还检测到了一些甲烷杆菌科种群,而其他产甲烷菌种几乎不存在。然而,在第 860 天终止 pH 调节之后,由于游离氨浓度突然增加到 400 毫克/升,反应器立即变得不稳定。混合床的 COD 去除效率下降到 42%,UASB 反应器的 COD 去除效率下降到 48%。抑制持续时间不足以严重损害大量的甲烷菌细胞;因此,在两次游离氨抑制之后,许多甲烷菌细胞才再次被鉴定出来。然而,随后,甲烷菌细胞的长丝状形态转变为较短的丝状,并失去了聚集特性。关键词克隆;DGGE;FISH;游离氨;垃圾渗滤液;产甲烷菌
摘要:在基因组工程中,传入 DNA 的整合依赖于分裂细胞产生的酶,这一直是提高 DNA 插入频率和准确性的瓶颈。最近,据报道,使用 CRISPR 相关转座酶 (CAST) 的 RNA 引导转座在大肠杆菌中非常有效且具有特异性。在这里,我们开发了 Golden Gate 载体来在丝状蓝藻中测试 CAST,并证明它在鱼腥藻属菌株 PCC 7120 中有效。含有 CAST 和工程转座子的相对较大的质粒通过使用自杀或复制质粒的结合成功转移到鱼腥藻中。编码靶标前导链但不编码反向补体链的单向导 (sg) RNA 与 sgRNA 中包含的原间隔子相关基序 (PAM) 序列有效。在对两个不同靶位点进行分析的六种病例中,有四种的插入位点位于 PAM 之后正好 63 个碱基处。复制质粒上的 CAST 具有毒性,可用于治愈质粒。在分析的所有六种情况下,只有由从左到右元素的序列定义的转座子货物被插入目标位点;因此,RNA 引导的转座是由剪切和粘贴引起的。没有内源转座子通过暴露于 CAST 酶而重新动员。这项工作为通过 RNA 引导的转座在丝状蓝藻中进行基因组编辑奠定了基础,无论是在培养中还是在复杂群落中。关键词:鱼腥藻、CRISPR 相关转座子 (CAST)、基因组工程、RNA 引导的转座、minion 测序、从头基因组组装 ■ 简介
抽象背景腹膜转移是胃癌最常见的转移模式。胃癌腹膜转移(GCPM)的预后较差,对常规治疗的反应较差。最近,免疫检查点封锁(ICB)在治疗GCPM方面表现出了良好的功效。最佳响应者的分层和ICB疗法的抵抗机制的阐明非常重要,并且仍然是主要的临床挑战。设计我们进行了II期试验,涉及用ICB(Sintilimab)与化学疗法结合的GCPM患者。收集了来自患者的原发性肿瘤,GCPM和外周血的样品进行单细胞测序,以全面解释GCPM的肿瘤微环境及其对免疫疗法疗效的影响。结果GCPM生态系统协调与原发性GC不同的独特免疫抑制模式,该模式由基质 - 乳糖叶菌组成,由SPP1+肿瘤相关的巨噬细胞(TAMS)和血栓形成蛋白2(THBS2)+Matrix Cancer-Cancer-Cancer-Isspatied Fibrobrobrobloblasts(McAfts)组成。因此,该基质乳突串扰是GCPM患者ICB耐药性的主要介体。从机理上讲,累积的THB2+MCAF促进了腹膜特异性组织居民巨噬细胞的募集,并通过补体C3及其受体C3A受体1(C3AR1)转化为SPP1+TAM,从而形成了原生质层状质基质丝状丝状niche。阻塞C3-C3AR1轴均破坏了基质乳突串扰,从而显着提高了ICB在体内模型中的益处。结论我们的发现提供了与GCPM患者ICB耐药性相关的细胞组成的新分子肖像,并有助于优先考虑治疗候选者以增强免疫疗法。
抽象的放线菌种类是人类的共生生物。如果发生粘膜损伤,它将成为病原体。大多数情况仅限于面部和颈部。腹部放线菌病(AA)在临床实践中很少遇到。表现是高度可变的,从急性腹部到可疑恶性肿瘤的腹部质量。此病例报告描述了一名年轻,健康的女性接受急性腹部的录取。在手术过程中发现了带孔和弥漫性腹膜炎的坏疽性阑尾炎。进行了腹腔镜阑尾切除术。病理报告描述了丝状生物的阳性聚集体,与放线肌属于属性。在经验抗生素治疗的启动后,患者完全康复。在4年的随访中未发生腹腔内复发。
摘要:自电子时代开始以来,人们就开始寻求更快、更小的开关,因为这种元素无处不在,是任何电子电路中调节电流的基础。莫特绝缘体是满足这一需求的有希望的候选者,因为它们在电场下会发生极快的电阻切换。然而,这种转变的机制仍存在争议。我们在原型莫特绝缘体 (V 0.95 Cr 0.05 ) 2 O 3 上进行的空间分辨 µ-XRD 成像实验表明,电阻切换与由等结构压缩相组成的导电丝状路径的创建有关,没有任何化学或对称性变化。这清楚地证明了电阻切换机制继承自带宽控制的莫特转变。这一发现可能因此促进电子学新分支——莫特电子学的发展。