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肠道细胞分化依赖于DAAM1/2
哺乳动物肠道是最快的自我更新组织之一，由位于地下室底部的干细胞驱动。paneth细胞构成了利基微环境的主要元素，提供了各种生长因子来编排肠道干细胞稳态，例如Wnt3。不同的wnt配体可以选择性地促成β-catenin - 依赖（规范）或 - 独立（非规范）信号。在这里，我们报告说，形态发生1（DAAM1）及其副狗DAAM2不对称调节规范和非范围WNT（WNT/PCP）信号传导的Di-Shevell相关激活剂。daam1/2与Wnt抑制剂RNF43相互作用，而DAAM1/2双基因敲除刺激刺激可以防止Wnt受体的RNF43依赖性降解（FZD）。单细胞RNA测序分析表明，由于WNT/PCP信号有缺陷，DAAM1/2耗尽会损害Paneth细胞分化。一起，我们将DAAM1/2确定为一个意外的集线器分子，可以协调规范和非规范WNT，这对于指定足够数量的Paneth细胞是基本的。
肠道细胞分化依赖于DAAM1/2
摘要：Nisin具有独特的作用方式和有效的抗菌活性，是新型抗生素设计的非凡灵感。然而，肽具有固有的弱点，尤其是它们对蛋白水解降解的敏感性，例如通过胰蛋白酶限制其更广泛的应用。这使我们推测，由未充分膨胀的细菌物种产生的尼沙蛋白的自然变异可能会克服这些局限性。我们进行了两个Romboutsia Sedimentorum菌株RC001和RC002进行了基因组挖掘，从而发现了Rombocin A，这是25个氨基酸残基Nisin变体，与已知的31-35-35-35氨基酸长的Nis -Nis -Nis -Nis -Nis -Nis -Nis -Nis -long Nis -Nis -Nis -Nis -long Nis -Nis -Nis -Nis variants相比，预计仅具有四个宏观细胞。使用尼生控制的表达系统，我们在乳酸乳酸菌中异逻辑表达了完全修饰和功能性的rombocina，并证明了其针对单核细胞增生李斯特菌的选择性抗菌活性。rombocin A使用涉及脂质II结合活性的双重作用模式和杀死靶细菌的膜电位的耗散。稳定性测试在不同的pH值，温度，尤其是针对酶促降解时证实了其高稳定性。及其基因编码的特征，rombocin a适合生物工程生成新颖的衍生物。进一步的突变研究导致了rombocin K的鉴定，rombocin K是一种对单核细胞增生李斯特氏菌的生物活性增强的突变体。关键字：简短的Nisin变体，四个灯笼环，作用方式，稳定性，特定型，诱变我们的发现表明，rombocin a及其生物工程变体Rombocin K是有望发育的候选者，作为食物防腐剂或针对单核细胞增生乳杆菌的抗生素。
选择性时间依赖于活动和细胞的变化 -
作为了解人脑样本中人类神经精神疾病的一种手段，我们比较了死后脑的转录模式和组织学特征与手术切除后立即分离的新鲜人类新皮层。与许多神经精神疾病相关的术后转录组相比，新鲜的人脑转录组具有完全独特的转录模式。为了理解这种差异，我们测量了全基因组的转录作为清除新鲜组织后时间的函数，以模仿死后间隔。在几个小时内，出现神经元活动依赖性转录本的数量的选择性减少，而相对保留的家政基因通常用作RNA归一化的参考。基因聚类表明，神经元基因表达迅速降低，星形胶质细胞和小胶质细胞基因表达的相互时间依赖性增加，在组织切除后继续至少增加24小时。在同一组织上在组织学上确认了预测的转录变化，表明神经元退化时，神经胶质细胞经历了其过程的生长。神经元基因的快速丧失和神经胶质基因的相互表达突出显示在死后间隔期间发生的高度动态转录和细胞变化。了解这些时间依赖于后尸体大脑样本中基因表达的变化对于解释人脑疾病研究的解释至关重要。
基于基因表达式 - 依赖于不知名的老大主义者...
这样的微阵列技术是原始测试组织（Cancer Genetics，Inc。），以前称为原始测试的PathWork®组织和原始测试的反应性组织。测试测量了2,000个基因的表达，并比较了未知主要癌症的基因表达谱与来自15个具有58个组织学形态的15个组织的已知特征数据库的基因表达谱。为每个肿瘤生成的报告由“相似性评分”组成，这是标本与数据库中15个已知肿瘤谱的基因表达分布相似性的量度。分数范围从0（非常低的相似性）到100（非常高的相似性），并在面板上的所有15个组织中总和到100。如果单个相似性评分大于或等于30，则表明这可能是
内耳发育中依赖于ATP的染色质重塑
摘要：在转录，DNA复制和修复过程中，染色质结构经常进行调节以揭示特定的遗传区域并允许进入DNA相互作用的酶。ATP依赖性染色质重塑络合物使用ATP水解的能量通过重新定位和重新排列核小体来修饰染色质结构。这些复合物由保守的SNF2（催化ATPase亚基）定义，并分为四个家庭：CHD，SWI/SNF，ISWI和INO80。ATP依赖性染色质重塑者对于调节包括内耳在内的许多器官的发育和干细胞生物学至关重要。此外，编码为染色质重塑者一部分的蛋白质的基因突变已与许多神经感觉聋的情况有关。在这篇综述中，我们描述了这些复合物的组成，结构和功能活性，并讨论它们如何促进听力和神经感觉的耳聋。
巨噬细胞由JAK抑制剂重新编程依赖于MAFB
抽象单核细胞衍生的巨噬细胞在炎症性疾病中起关键的致病作用。在类风湿关节炎（RA）的情况下，存在特定的滑膜组织浸润巨噬细胞亚群与活性疾病或炎症分辨率有关。JAK抑制剂（JAKI）是第一个靶向合成疾病改良的抗疾病药物（TSDMARD），批准用于治疗与生物制剂具有可比疗效的RA。然而，目前尚不清楚jaki对巨噬细胞规范和分化的影响。我们已经分析了Jaki对RA患者的人外周血单核细胞亚群的转录和功能效应，以及通过粒细胞衍生的巨噬细胞的分化，由粒细胞 - 巨噬细胞刺激性刺激因子（GM-CSF）促进，这是一种促进RA的发育和发育生产的因素。我们现在报告说，jaki upadacitib恢复了RA患者外周血单核细胞亚群的平衡，并以剂量依赖性的方式恢复了巨噬细胞的偏向巨噬细胞。upadacitib处理的巨噬细胞显示出定义与体内平衡/炎症分辨率相关的滑膜巨噬细胞的基因的阳性富集。具体而言，upadacitinib治疗的巨噬细胞表现出明显升高的MAFB和MAFB调节基因的表达，GSK3β的抑制性磷酸化升高，并且在通过致病性刺激激活后显示出抗炎性细胞因子。这些结果也通过暴露于其他Jaki（Bariticinib，Tofacitinib）的巨噬细胞共享，但在TYK2抑制剂Deucravacitinib的存在下也没有。从整体上讲，我们的结果表明，Jaki促进了巨噬细胞的重新编程，以获取更具反炎/促分辨率的特征，这种效果与Jaki增强MAFB表达的能力相关。
miR-218-2通过补体成分3-依赖于突触囊泡释放的调节
microRNA-218（miR-218）已与几种认知的神经退行性和神经精神疾病有关。但是，miR-218是否在认知功能中起着直接作用仍然未知。在这里，使用miR -218敲除（KO）小鼠模型和海绵/过表达方法，我们表明miR -218-2但不是mir -218-1可以双向调节小鼠的上下文和空间记忆。此外，miR -218-2缺乏诱发的形态和突触前神经递质在海马中释放，以损害长期增强。结合了RNA测序分析和荧光素酶报告基因测定法，我们确定了补体组合3（C3）作为海马中miR-218的主要靶基因，以调节突触前功能。最后，我们证明了在miR中恢复C3活性-218-2 KO小鼠可以挽救突触和学习缺陷。因此，mir -218-2通过C3在小鼠的认知功能中起着重要作用，这可能是对miR -218相关神经元疾病的有缺陷认知的机制。
MLL-ENL 的髓系转化严格依赖于 C/...
混合谱系白血病基因 MLL1 的染色体重排是婴儿急性白血病的标志。粒细胞-巨噬细胞祖细胞状态构成了粒单核细胞白血病干性和 MLL 型癌蛋白转化的表观遗传基础。此前，研究表明，小鼠粒单核细胞 MLL - ENL 转化的建立（而非其维持）依赖于转录因子 C/EBP α，这表明 MLL 驱动的致癌作用存在表观遗传命中和逃逸机制。在这里，我们证明 Cebpa / Cebpb 的化合物缺失几乎完全消除了 MLL - ENL 转化细胞的生长和存活。从化合物 Cebpa / Cebpb 缺失中恢复了罕见、生长缓慢且易凋亡的 MLL - ENL 转化逃逸者。逃逸者均具有高表达常驻 Cebpe 基因的特征，表明 C/EBP ε 对 C/EBP α /C/ EBP β 缺陷的功能补偿较差。异位 C/EBP β 表达和下游激活 IGF1 增强了补充作用，从而促进了生长。Cebpe 基因失活仅在存在补充 C/EBP β 的情况下完成，不存在补充 C/EBP β 时则不会完成，这证实了 Cebpa / Cebpb 双敲除对 Cebpe 的依赖性。我们的数据显示，MLL 转化的髓系细胞在转化的启动和维持过程中依赖于 C/EBP。