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应用简介-使用 HiFi 进行宏基因组测序-...
1. 应用说明 – Kinnex 16S rRNA 试剂盒用于全长 16S 测序 2. Johnson, JS 等人 (2019) 评估 16S rRNA 基因测序在物种和菌株水平微生物组分析中的应用。《自然通讯》。10(1)，5029。 3. 程序和清单 – 使用 HiFi plex 制备试剂盒 96 制备多重全基因组和扩增子文库 4. 程序和清单 – 使用 HiFi 制备试剂盒 96 制备全基因组文库 5. Gehrig, J. 等人 (2022) 找到合适的选择：评估短读和长读测序方法以最大限度提高临床微生物组数据的效用。《微生物基因组学》，8(3)，10.1099/mgen.0.000794。 6. Portik, DM 等人(2024) 使用长读组装、分箱和合并方法从人类肠道微生物群中高度准确地组装宏基因组。bioRxiv。doi：https://doi.org/10.1101/2024.05.10.593587 7. 概述 – HiFi 应用选项和测序建议。8. 程序和清单 – 使用条形码引物扩增细菌全长 16S 基因。9. 程序和清单 – 从 16S rRNA 扩增子制备 Kinnex 文库
使用您喜欢的向量克隆有毒靶标和不稳定的DNA
图1。有毒基因产物成功克隆在CopyCut ER™Epi400™电用量细胞中。大肠杆菌ACP（酰基载体蛋白，抑制细胞生长）和噬菌体T4 regb（分别裂解细菌RNA，对大肠杆菌剧毒的RNA内核酸酶）分别将其克隆到高拷贝矢量PUC18或PET11中。transformax™EC100™细胞中的全长ACP克隆在测序时包含多个点突变。
基于 AI 的 NLRP3 靶标蛋白质结构预测评估
HD1 2.3 (1.3) 2.4 (1.4) 2.4 (1.3) 2.4 (1.3) 2.3 (1.3) WHD 3.5 (2.1) 3.5 (2.1) 3.5 (2.1) 3.4 (2.0) 3.4 (2.1) HD2 8.0 (7.5) 5.3 (4.3) 5.2 (4.2) 7.2 (6.6) 7.1 (6.5) LRR 10.9 (10.6) 10.9 (10.6) 11.0 (10.7) 10.9 (10.7) 11.1 (10.7) 全长 13.0 (12.5) 14.8 (14.4) 23.8 (23.3) 21.9 (21.3) 21.8（21.5）
基于 AI 的 NLRP3 靶标蛋白质结构预测评估
HD1 2.4 (1.4) 2.6 (1.5) 2.5 (1.5) 2.5 (1.5) 2.5 (1.4) WHD 3.2 (2.3) 3.2 (2.3) 3.3 (2.4) 3.2 (2.3) 3.2 (2.4) HD2 16.3 (15.8) 17.6 (17.2) 17.6 (17.6) 16.4 (16.0) 16.5 (16.0) LRR 7.9 (7.4) 8.2 (7.7) 8.2 (7.7) 8.2 (7.7) 8.1 (7.5) 全长 10.7 (10.2) 10.5 (9.9) 10.7 (10.2) 10.5 (9.9) 10.5（9.9）
一种基于荧光的新型基因编辑分子筛选方法，用于治疗连接性大疱性表皮松解症
摘要：连接性大疱性表皮松解症 (JEB) 是一种严重的起泡性皮肤病，由编码皮肤完整性所必需的结构蛋白的基因突变引起。在本研究中，我们开发了一种适用于研究 JEB 相关 COL17A1 基因表达的细胞系，该基因编码 XVII 型胶原蛋白 (C17)，C17 是一种跨膜蛋白，参与连接基底角质形成细胞和皮肤下层真皮。利用化脓性链球菌的 CRISPR/Cas9 系统，我们将 GFP 的编码序列与 COL17A1 融合，导致 GFP-C17 融合蛋白在人类野生型和 JEB 角质形成细胞中在内源性启动子的控制下组成性表达。我们通过荧光显微镜和蛋白质印迹分析证实了 GFP-C17 的准确全长表达和定位到质膜。正如预期的那样，GFP-C17 mut 融合蛋白在 JEB 角质形成细胞中的表达未产生特定的 GFP 信号。然而，在表达 GFP-COL17A1 mut 的 JEB 细胞中，CRISPR/Cas9 介导的 JEB 相关移码突变修复导致 GFP-C17 恢复，这在融合蛋白的全长表达、其在角质形成细胞单层质膜内以及 3D 皮肤等效物的基底膜区内的准确定位中显而易见。因此，这种基于荧光的 JEB 细胞系有可能作为筛选个性化基因编辑分子和体外应用以及在适当的动物模型中体内应用的平台。
问题＃53 11月和2024年12月
Tesuji Thunderwizew Trank，直到死亡超过我，我无效的电线边缘Z家庭欢迎发行＃53。这个问题是致力于我父亲埃德·范·普特（Ed van Pot），他于2024年12月14日去世。他是一位著名的作家和著名的弗林曼，最重要的是榜样父亲，对我的生活产生了最大的影响。我只是在赶上下一期将从现在大约一个月开始发布，并将涵盖2025年1月和2月的发行版。祝贺Chrome Black Future发行了我认为是今年最好的专辑。我真的迫不及待地想听听下一步会发生什么，我更改了一件事是，我没有列出本月的所有金属发行版。在节省时间并遵守我的日程安排，我只是在审查电子邮件发送给我的专辑，我喜欢的专辑以及具有“经验丰富”状态的乐队的专辑 - 至少有五年的全长（或每年发行的那些独奏项目的全长五年）。我将永远听每个月的新发行的金属乐队的一两首歌，我敢肯定，我每月总会有100多张专辑，我将写这张专辑。感谢Vin的污泥聚光灯，克里斯（Chris）的网站，斯科特·莫瑟（Scott Mosher）的徽标，kaia mabli拍摄封面照片，所有在财务上都支持我们的唱片公司（您也没有我的无条件支持）（您都有我的无条件支持），乐队的乐队需要花费时间来促进采访以及阅读。www.transcerding-the-mundane.com/archive
VIII B结构域中F8废话变体的翻译读取有助于残留表达，抑制剂关联
在血友病A，F8废话的变体中，尤其是影响大因子VIII（FVIII）B结构域的，这对于凝结活性是不可接受的，与替代治疗相关的抗FVIII抑制性抗体显示出较低的关联，因此从多个国际数据库中检索。 由于无效的遗传条件有利于抑制剂的发展，因此我们认为对过早终止密码子（PTC）的翻译读取可能会通过插入氨基酸亚群来产生全长蛋白来促进免疫耐受性。 为了定量评估体外的读出输出，我们开发了一种非常敏感的基于荧光素酶的系统，以检测来自F8废话变体的宽面板（n = 45; 〜60％患有PTC）的宽面板（n = 45; 〜60％患者）的全长FVIII合成。 与抑制剂相关的PTC比抑制剂相关PTC的 PTC显示出更高的读取驱动表达水平，PTC是一种新的观察。 尤其是，比其他域中的变体（n = 25）检测到B域变体（n = 20）的水平更高。 对来自六名血友病A的血浆PTC患者的血浆研究，通过表达相应的胡说八道和读取的错义变体的表达，始终显示B域变体的FVIII水平较高。 在高度代表的PTC中发现了一个B域PTC（ARG814*），而与抑制剂无关，而与抑制剂病例的最低比例相关（57个中的4个）。 这些对血友病A分子遗传学的原始见解，尤其是与疾病治疗相关的基因型 - 表型关系，表明B域特征有利于PTC读取输出。，这对于凝结活性是不可接受的，与替代治疗相关的抗FVIII抑制性抗体显示出较低的关联，因此从多个国际数据库中检索。由于无效的遗传条件有利于抑制剂的发展，因此我们认为对过早终止密码子（PTC）的翻译读取可能会通过插入氨基酸亚群来产生全长蛋白来促进免疫耐受性。为了定量评估体外的读出输出，我们开发了一种非常敏感的基于荧光素酶的系统，以检测来自F8废话变体的宽面板（n = 45; 〜60％患有PTC）的宽面板（n = 45; 〜60％患者）的全长FVIII合成。PTC显示出更高的读取驱动表达水平，PTC是一种新的观察。尤其是，比其他域中的变体（n = 25）检测到B域变体（n = 20）的水平更高。对来自六名血友病A的血浆PTC患者的血浆研究，通过表达相应的胡说八道和读取的错义变体的表达，始终显示B域变体的FVIII水平较高。在高度代表的PTC中发现了一个B域PTC（ARG814*），而与抑制剂无关，而与抑制剂病例的最低比例相关（57个中的4个）。这些对血友病A分子遗传学的原始见解，尤其是与疾病治疗相关的基因型 - 表型关系，表明B域特征有利于PTC读取输出。这提供了有助于差异PTC相关抑制剂的潜在分子机制，对F8废话变体的新型，基于实验的基于实验的分类具有转移意义。