元基因组测序彻底改变了我们对微生物学的理解。虽然对元基因组工具和方法进行了广泛的评估和基准测试,但对元基因组分类中使用的参考序列数据库的关注得多。参考序列数据库的问题无处不在。数据库污染是文献中最公认的问题;但是,在大多数分析中,它仍然相对不容置疑。参考序列数据库的其他常见问题包括分类错误,不当包含和排除标准以及序列内容错误。本评论涵盖了参考序列数据库的十个常见问题以及这些问题的潜在下游后果。讨论了每个问题的缓解措施,包括生物信息学工具和数据库策略。在一起,这些策略为更准确,可再现和可翻译的宏基因组测序提供了一条途径。
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1 Broer,S。&Gauthier-Coles,G。哺乳动物细胞中的氨基酸稳态,重点是氨基酸转运。J Nutr 152,16-28(2022)。https://doi.org:10.1093/jn/nxab342 2 Blau,N.,Duran,M.,Gibson,K。M.&Dionisi-Vici,C。遗传代谢疾病的诊断,治疗和随访的医生指南。3-141(Springer-Verlag,2014年)。 3 Holecek,M。为什么饥饿和糖尿病中分支链氨基酸会增加? 营养12(2020)。 https://doi.org:10.3390/nu12103087 4 White,P。J.等。 胰岛素作用,2型糖尿病和分支链氨基酸:一条双向街道。 mol Metab,101261(2021)。 https://doi.org:10.1016/j.molmet.2021.101261 5 Palacin,M。&Broer,S。在医师的诊断,治疗和随访的医师指南中(B.Thorn,M。Duran,M。Duran,K.M.M.M. Gibson和C. Dionisi-Vici)85-99(Springer-Verlag,2014年)。 6 Seow,H。F.等。 hartnup疾病是由编码中性氨基酸转运蛋白SLC6A19的基因突变引起的。 nat Genet 36,1003-1007(2004)。 https://doi.org:10.1038/ng1406 7 Belanger,A。M.等。 抑制中性氨基酸转运以治疗苯酮尿症。 JCI Insight 3(2018)。 https://doi.org:10.1172/jci.insight.121762 8 Belanger,A。J.等。 在鸟氨酸经钙化酶缺乏的小鼠模型中,过量的氮和通过损失SLC6A19的存活增加。 遗传代谢疾病杂志N/A(2022)。 https://doi.org:https://doi.org/10.1002/jimd.12568 9 Jiang,Y。等。3-141(Springer-Verlag,2014年)。3 Holecek,M。为什么饥饿和糖尿病中分支链氨基酸会增加?营养12(2020)。https://doi.org:10.3390/nu12103087 4 White,P。J.等。 胰岛素作用,2型糖尿病和分支链氨基酸:一条双向街道。 mol Metab,101261(2021)。 https://doi.org:10.1016/j.molmet.2021.101261 5 Palacin,M。&Broer,S。在医师的诊断,治疗和随访的医师指南中(B.Thorn,M。Duran,M。Duran,K.M.M.M. Gibson和C. Dionisi-Vici)85-99(Springer-Verlag,2014年)。 6 Seow,H。F.等。 hartnup疾病是由编码中性氨基酸转运蛋白SLC6A19的基因突变引起的。 nat Genet 36,1003-1007(2004)。 https://doi.org:10.1038/ng1406 7 Belanger,A。M.等。 抑制中性氨基酸转运以治疗苯酮尿症。 JCI Insight 3(2018)。 https://doi.org:10.1172/jci.insight.121762 8 Belanger,A。J.等。 在鸟氨酸经钙化酶缺乏的小鼠模型中,过量的氮和通过损失SLC6A19的存活增加。 遗传代谢疾病杂志N/A(2022)。 https://doi.org:https://doi.org/10.1002/jimd.12568 9 Jiang,Y。等。https://doi.org:10.3390/nu12103087 4 White,P。J.等。胰岛素作用,2型糖尿病和分支链氨基酸:一条双向街道。mol Metab,101261(2021)。https://doi.org:10.1016/j.molmet.2021.101261 5 Palacin,M。&Broer,S。在医师的诊断,治疗和随访的医师指南中(B.Thorn,M。Duran,M。Duran,K.M.M.M.Gibson和C. Dionisi-Vici)85-99(Springer-Verlag,2014年)。6 Seow,H。F.等。 hartnup疾病是由编码中性氨基酸转运蛋白SLC6A19的基因突变引起的。 nat Genet 36,1003-1007(2004)。 https://doi.org:10.1038/ng1406 7 Belanger,A。M.等。 抑制中性氨基酸转运以治疗苯酮尿症。 JCI Insight 3(2018)。 https://doi.org:10.1172/jci.insight.121762 8 Belanger,A。J.等。 在鸟氨酸经钙化酶缺乏的小鼠模型中,过量的氮和通过损失SLC6A19的存活增加。 遗传代谢疾病杂志N/A(2022)。 https://doi.org:https://doi.org/10.1002/jimd.12568 9 Jiang,Y。等。6 Seow,H。F.等。hartnup疾病是由编码中性氨基酸转运蛋白SLC6A19的基因突变引起的。nat Genet 36,1003-1007(2004)。https://doi.org:10.1038/ng1406 7 Belanger,A。M.等。 抑制中性氨基酸转运以治疗苯酮尿症。 JCI Insight 3(2018)。 https://doi.org:10.1172/jci.insight.121762 8 Belanger,A。J.等。 在鸟氨酸经钙化酶缺乏的小鼠模型中,过量的氮和通过损失SLC6A19的存活增加。 遗传代谢疾病杂志N/A(2022)。 https://doi.org:https://doi.org/10.1002/jimd.12568 9 Jiang,Y。等。https://doi.org:10.1038/ng1406 7 Belanger,A。M.等。抑制中性氨基酸转运以治疗苯酮尿症。JCI Insight 3(2018)。https://doi.org:10.1172/jci.insight.121762 8 Belanger,A。J.等。 在鸟氨酸经钙化酶缺乏的小鼠模型中,过量的氮和通过损失SLC6A19的存活增加。 遗传代谢疾病杂志N/A(2022)。 https://doi.org:https://doi.org/10.1002/jimd.12568 9 Jiang,Y。等。https://doi.org:10.1172/jci.insight.121762 8 Belanger,A。J.等。在鸟氨酸经钙化酶缺乏的小鼠模型中,过量的氮和通过损失SLC6A19的存活增加。遗传代谢疾病杂志N/A(2022)。https://doi.org:https://doi.org/10.1002/jimd.12568 9 Jiang,Y。等。https://doi.org:https://doi.org/10.1002/jimd.12568 9 Jiang,Y。等。缺乏中性氨基酸转运蛋白B(0)AT1(SLC6A19)的小鼠的FGF21和GLP-1水平升高并改善了血糖控制。MOL METAB 4,406-417(2015)。 https://doi.org:10.1016/j.molmet.2015.02.003 10 Yadav,A。等。 新型化学支架抑制中性氨基酸转运蛋白B(0)AT1(SLC6A19),这是治疗代谢疾病的潜在靶标。 前药11,140(2020)。 https://doi.org:10.3389/fphar.2020.00140MOL METAB 4,406-417(2015)。https://doi.org:10.1016/j.molmet.2015.02.003 10 Yadav,A。等。 新型化学支架抑制中性氨基酸转运蛋白B(0)AT1(SLC6A19),这是治疗代谢疾病的潜在靶标。 前药11,140(2020)。 https://doi.org:10.3389/fphar.2020.00140https://doi.org:10.1016/j.molmet.2015.02.003 10 Yadav,A。等。新型化学支架抑制中性氨基酸转运蛋白B(0)AT1(SLC6A19),这是治疗代谢疾病的潜在靶标。前药11,140(2020)。https://doi.org:10.3389/fphar.2020.00140https://doi.org:10.3389/fphar.2020.00140
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NSR31 系列是专为电池直接连接汽车应用而设计的 150 mA 低压差线性稳压器。3 V 至 40 V 的宽电源电压范围使 NSR31 系列非常适合恶劣的工作条件,包括负载突降、冷启动和启停。NSR31 系列在轻负载下静态电流为 5 μA,非常适合严格限制待机功耗的常开汽车应用。借助集成补偿实现,NSR31 系列可以稳定使用低 ESR 陶瓷输出电容器,范围从 2.2 μF 到 100 μF。
标枪桌面系列现在有3个主要型号:标枪DNA,这是一款入门级手动饲料打印机,标枪DNA Pro,它具有输入和输出料斗(自动馈电)和标枪MBOSS,并具有独特的PRINTHEAD,用于预先获得的金融卡。