1 巴西圣保罗联邦大学-保利斯塔医学院 (UNIFESP/EPM) 微生物学、免疫学和寄生虫学系,2 巴西圣保罗大学 (USP) 生物医学科学研究所寄生虫学系,3 巴西圣保罗大学 (USP) 生物医学科学研究所微生物学系,4 巴西圣保罗以色列爱因斯坦医院,5 美国俄亥俄州克利夫兰凯斯西储大学凯斯综合癌症中心,6 巴西库亚巴马托格罗索联邦大学病毒学实验室,7 巴西圣保罗大学巴斯德科学平台,8 圣保罗国家免疫学研究科学技术研究所 (INCT) (iii)巴西圣保罗
背景:2019 年 12 月,一种新型地方性疾病在中国武汉市蔓延。几周之内,世界卫生组织 (WHO) 宣布了一种新型冠状病毒,将其命名为 2019 冠状病毒病 (COVID-19)。2020 年 1 月下旬,由于该疾病在全球范围内迅速蔓延,世卫组织宣布疫情为“国际关注的突发公共卫生事件”。目前,尚无针对这种新发感染的疫苗或获批治疗方法;因此,本研究的目的是利用免疫信息学方法设计一种针对 COVID-19 的多表位肽疫苗。方法:利用几种促进免疫信息学方法和比较基因组学方法相结合的技术,以确定以 2019-nCoV 的包膜蛋白为靶标设计基于 T 细胞表位的肽疫苗的潜在肽。结果:通过比较测序发现 COVID-19 毒株中存在大量突变、插入和缺失。此外,发现十种与 MHC I 类和 MHC II 类结合的肽是疫苗设计的有希望的候选者,其世界人口覆盖率分别为 88.5% 和 99.99%。结论:基于 T 细胞表位的肽疫苗是针对 COVID-19 设计的,使用包膜蛋白作为免疫原性靶点。尽管如此,仍需要迅速对拟议的疫苗进行临床验证,以确保其安全性、免疫原性,并帮助阻止这种流行病导致毁灭性的全球爆发。
背景:2019 年 12 月下旬,一种新的地方病蔓延至中国武汉市;几周之内,世界卫生组织 (WHO) 宣布了一种新型冠状病毒,称为 2019 年新型冠状病毒 (2019-nCoV)。2020 年 1 月下旬,由于疫情在全球范围内迅速蔓延和增加,世卫组织宣布疫情为“国际关注的突发公共卫生事件”。目前尚无针对这种新发感染的疫苗或获批的治疗方法;因此,本文的目的是利用免疫信息学方法设计一种针对 2019-nCoV 的多表位肽疫苗。方法:我们将重点介绍一种结合免疫信息学方法与比较基因组学方法的技术,以确定以 2019-nCoV 的包膜蛋白为靶点设计基于 T 细胞表位的肽疫苗的潜在靶点。结果:通过比较测序发现 2019-nCoV 毒株存在大量突变、插入和缺失;此外,10 种 MHC1 和 MHC2 相关肽是疫苗设计的有希望的候选肽,其世界人口覆盖率分别达到 88.5% 和 99.99%。结论:基于 T 细胞表位的肽疫苗是针对 2019-nCoV 设计的,使用包膜蛋白作为免疫原性靶点;尽管如此,拟议的基于 T 细胞表位的肽疫苗需要迅速进行临床验证,以确保其安全性和免疫原性,从而有助于在这种流行病导致毁灭性的全球疫情之前阻止它。
• DLVR-M 平台提供了新功能,可将各种不同的蛋白质和/或 RNA 货物递送至各种不同类型的细胞,同时可能降低免疫原性,因为包膜蛋白来源于人体细胞并在人体细胞中表达。 • 我们预计这些新粒子将广泛应用于许多研究和治疗应用,而这些应用目前受到现有递送方式的功能和特性的限制。 • 这项工作引入了新型包膜,并展示了 DLVR-M 平台在体内和治疗相关原代细胞中有效递送大分子的能力和潜力,而这些细胞通常不接受传统的递送方式。 • 未来的工作将包括更详细地描述这些新型粒子的物理特性和免疫学特征。 致谢
要产生慢病毒,HEK 293细胞被编码所需的GAG,POL和REV结构和调节基因的包装质粒以及编码兴趣基因的转移载体(GOI)。复制无能是通过在单独的质粒上表达最小病毒成分来实现的,并通过在转移载体中的3'长末端重复(LTR)的重大删除来结合自我激活(SIN)元素。必需成分与VSV包膜蛋白G结合使用,以进行广泛的病毒质量和纯化过程中稳定性的提高。慢病毒颗粒被分泌到细胞培养基中,在该培养基中收集,过滤并冷冻到等分试样中,以便随后转导到靶细胞中。
TRIM7已被证明在促进宿主防御病毒感染和调节免疫信号通路方面具有重要作用。作为E3泛素连接酶,它催化了各种底物的泛素化,包括衔接蛋白(MAV和STING)和转录因子(NF-K B和IRF3),从而在免疫信号途径上施加阳性或负调控。然而,病毒已开发出免疫逃避机制来抵消TRIM7。某些病毒可以通过将其靶向降解或隔离其靶标的TRIM7功能来抑制TRIM7功能。TRIM7甚至可以通过泛素化病毒蛋白(包括对组织和物种偏向主义至关重要的包膜蛋白)来促进病毒感染。对TRIM7与抗病毒免疫之间相互作用的全面理解对于发展病毒疾病的创新治疗至关重要。
• 科:黄病毒科;黄病毒属。• 形态:有包膜的球形颗粒,直径 40-60 纳米,具有二十面体核衣壳对称性和表面突起;病毒体含有三种结构蛋白:C(衣壳)、E(主要包膜蛋白)和 M(膜),并产生七种非结构蛋白。M 蛋白是病毒成熟过程中产生的前体 (pr)M 蛋白的小蛋白水解片段。黄热病毒有一种血清型,与七种基因型有关。• 核酸:线性、正义、单链 RNA,长 11 kb • 物理化学特性:在 >56°C 下加热 10 分钟灭活;37°C 下半衰期为 7 小时;对脂质溶剂、去垢剂、乙醚、胰蛋白酶、氯仿、甲醛和β-丙内酯敏感;暴露于辐射后传染性降低,在pH 1 – 3时失活。
精原干细胞 (SSC) 是生产转基因动物的资源。然而,对 SSC 的基因操作取得的成功有限。在这里,我们展示了通过慢病毒 (FV-LV) 使用融合蛋白 (F) 将基因有效转移到 SSC 中,融合蛋白是一种参与病毒体/细胞膜融合的仙台病毒 (SV) 包膜蛋白。FV-LV 比传统 LV 更有效地转导培养的 SSC。虽然感染 SV 的 SSC 无法产生后代,但用 FV-LV 转导的 SSC 具有生育能力。体内微注射表明 FV-LV 不仅可以穿透曲细精管的基底膜,还可以穿透血睾屏障,从而成功转导生精细胞和睾丸体细胞。用表达针对 Kit 或 Sycp3 的药物诱导型 CRISPR/Cas9 的 FV-LV 转染培养的 SSC 在移植和体内药物治疗后表现出精子发生受损。因此,FV-LV 为涉及 SSC 和精子发生的基因的功能分析提供了一种有效的方法。
†最后一位联合作者摘要Emery-Dreifuss肌肉营养不良1型(EDMD1)是由EMD基因突变引起的罕见遗传疾病,该突变编码编码核包膜蛋白Emerin。尽管了解了疾病的遗传基础,但肌肉和心脏发病机理的分子机制仍然难以捉摸。进展受患者衍生样品的可用性有限的限制,因此迫切需要人类特异性的细胞模型。在这项研究中,我们介绍了诱导多能干细胞(IPSC)系的产生和表征,这些细胞(IPSC)系来自携带EMD突变的EDMD1患者,这些突变导致EMD突变,这些突变与健康供体的IPSC一起导致截断或缺失。患者特异性的IPSC表现出稳定的核型,保持适当的形态,表达多能标记,并证明将分化成三个细菌层的能力。为模型EDMD1,这些IPSC被分化为肌源性祖细胞,成肌细胞和多核肌管,这些肌管代表了肌发生的所有阶段。每个发育阶段都通过特定于阶段的标记的存在来验证,从而确保模型的准确性。我们提出了第一个基于IPSC的体外平台,该平台捕获了肌发生过程中EDMD1发病机理的复杂性。该模型可以显着有助于理解疾病机制,并为EDMD1制定靶向的治疗策略。
2019-2020 年,严重急性呼吸综合征冠状病毒 2 (SARS-CoV-2)(以前临时名称为 2019 年新型冠状病毒 (2019-nCoV))在中国湖北省武汉市爆发,导致大量冠状病毒感染疾病 (COVID-19) 患者死亡和发病,症状包括发烧、严重呼吸道疾病和肺炎。[1–3] 截至 2020 年 4 月 8 日,全球确诊病例超过 1,431,973 例,导致至少 82,085 人死亡。这些 SARS-CoV-2 分离株属于冠状病毒科的 Betacoronavirus 属,该属是一种有包膜的单链 RNA 病毒,包含 30 kb 的基因组和 14 个开放阅读框,包括四种主要的病毒结构蛋白:刺突蛋白(S)、膜蛋白(M)、包膜蛋白(E)和核衣壳蛋白(N)。[4–7] SARS-CoV-2 分离株的 S 基因序列与犀牛蝠冠状病毒 RaTG13 的核苷酸序列同源性为 93.1%,但与严重急性呼吸综合征冠状病毒 (SARS-CoV) 的核苷酸序列同源性不足 75%。与 SARS-CoV 相比,SARS-CoV-2 的病毒 S 序列在 N 端结构域中有三个额外的短插入,S 蛋白受体结合结构域 (RBD) 的受体结合基序中的五个关键残基中有四个发生改变。 [6,7] 尽管 SARS-CoV-2 和 SARS-CoV 具有相同的人类细胞受体-血管紧张素转换酶 II,但 SARS-CoV-2 似乎更容易在人与人之间传播。[1,8,9]