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开发模块化双生病毒载体以实现植物的高表达和基因靶向
* 通讯地址：电话：919-515-5729；电子邮件：jmalonso@ncsu.edu 摘要 病毒载体可以成为表达重组蛋白以及递送基因编辑机制的有用工具。尽管它们很有用，但这些工具的开发和后续优化通常是一个困难而繁琐的过程。因此，尽管已经做了大量工作来创建用于基因编辑和蛋白质表达的有用病毒载体，但对于如何最好地设计这些载体以用于特定应用，人们缺乏了解。例如，通常不清楚加入异源启动子序列或不同的病毒成分是否会改善货物表达或复制子积累。为了解决其中一些障碍，我们设计了一种基于双生病毒 - 甜菜卷叶病毒 (BCTV) 的 GoldenBraid (GB) 兼容病毒载体系统。该系统允许对各种报告构建体进行简单的模块化克隆。利用这种模块化克隆策略，我们比较了各种替代病毒载体架构。有趣的是，天然 BCTV 启动子的表现优于组成型 35S 启动子，而 BCTV 病毒体正义基因的去除则促进了报告基因的表达。有趣的是，这些修改对总复制子积累没有影响。这些结果表明了新的模块化基于 BCTV 的病毒载体在蛋白质表达和基因靶向应用方面的实用性，同时也揭示了可能为未来基于双生病毒的病毒载体架构提供信息的设计原则。我们预计，这种新模块化系统的推出将引发基于复制子的策略在植物蛋白质表达和基因编辑实验中的广泛应用。关键词：病毒载体、基因编辑、甜菜曲顶病毒、双生病毒、GoldenBraid、瞬时表达。简介病毒载体已被证明可用于各种生物技术应用，例如基因组编辑和蛋白质表达。基于双生病毒的病毒载体已用于递送基因组编辑酶，例如锌指核酸酶 (ZFN) 和 Cas9，以及用于同源定向修复 (HDR) 的修复模板 (RT) (Butler 等人，2016 年；Wang 等人，2017 年；Yu 等人，2020 年；Gil-Humanes 等人，2017 年；Dahan-Meir 等人，2018 年，Eini 等人，2022 年)。
2021-2022 STEM 可持续发展案例大赛
血浆病毒血症。CRISPR 和 LASER ART 协同作用将有效靶向储存位点并完全切断宿主的 HIV-1 前病毒 DNA。此外，CRISPR-Cas9 将用于从宿主基因组中切除 HIV-1 前病毒 DNA，使用 AAV9 进行递送并消除潜伏的 HIV-1 前病毒。小鼠将通过移植人类 CD34+ HSC 进行人源化并通过流式细胞术确认。研究中将使用四组 HIV 感染大鼠：CRISPR-Cas9 治疗组、LASER ART 治疗组、联合治疗组和对照组。联合疗法在啮齿动物试验中已证明在去除潜伏感染性储存器方面取得了一定程度的成功。通过体内切除 HIV-1 亚基因组 DNA 片段来去除整合的前病毒 DNA；接受联合疗法治疗的大鼠没有潜伏的 HIV-1 储存器。相反，仅用 LASER ART 或 CRISPR-Cas9 治疗的啮齿动物组没有消除 HIV-1 的证据。这一证据为进一步研究和进行非人类灵长类动物试验以开发治疗方法的可能性奠定了基础。使用 BLAST 通过宏基因组分析研究海星消耗病的病因 Samantha McGuinness，BSc NEUR [1]，Kathryn Austin，BSc MFB [2]，Emily Gibbons，BSc MBG [3] [1] 圭尔夫大学心理学系，加拿大安大略省圭尔夫 N1G 2W1 [2] 圭尔夫大学综合生物学系，加拿大安大略省圭尔夫 N1G 2W1 [3] 圭尔夫大学分子和细胞生物学系，加拿大安大略省圭尔夫 N1G 2W1 海星消耗病 (SSW) 是一种影响全球小行星的疾病。最严重的是，2013 年，东北太平洋超过 20 种物种大规模死亡。 SSW 的病因不明，但有 3 种理论：病毒感染、微生物作用于有机物 (OM) 导致动物与水界面的 O 2 耗尽，或两者结合形成一种综合症。本研究将通过确定来自含有 OM 诱发的萎缩性 Pisaster ochraceus 的水箱的水是否会在采用不同 OM 处理的水箱中诱发 P. ochraceus 的 SSW，来调查 SSW 是否是一种综合症。受影响水箱的水将通过管道输送到另外两个水箱中，这两个水箱中都有未感染的 P. ochraceus。这三个水箱被分为一个水箱中有受 OM 诱发的受影响 P. ochraceus，一个水箱中有灭菌 OM，一个水箱中没有 OM。将测量 SSW 的发病情况，并使用生物信息学技术 BLAST 在组织和水柱中检测先前确定的微生物的存在和组成。预计没有 OM 的水箱中 SSW 的发生率会较低，因为这种条件下病毒可以存活，而微生物则无法存活。该研究可以评估 SSW 是否是病毒病原体和微生物作用相互作用的结果。在评估每个水箱的致病性和微生物生长水平后，在未来研究中，可以进一步分析显示可见星病数量最多的水箱。由于 SSW 的病因仍然未知，评估病毒和微生物的关系和重要性对于找到可能的解决方案至关重要。尽管证据支持许多潜在的致病因素，但很少有研究研究 SSW 中病毒和微生物之间可能存在的相互作用。利用 CRISPR-Cas9 系统和农杆菌进行外壳蛋白研究，帮助作物产生双生病毒抗性 Kajisha Vijayakumar，食品学学士 [1]，Iman Andrea Niyokindi shima，公共卫生学学士 [2] [1] 圭尔夫大学食品科学系，加拿大安大略省圭尔夫 N1G 2W1 [2] 圭尔夫大学物理系，加拿大安大略省圭尔夫 N1G 2W1 双生病毒已经给印度豆类和非洲木薯产业造成了数百万美元的损失，并引发全球粮食短缺。双生病毒是具有小基因组和少量编码蛋白质的 DNA 病毒。近年来，人们研究了成簇的规律间隔短回文重复序列 (CRISPR)，试图开发出作物对这些病毒的抗性。Cas9（一种位点特异性 DNA 内切酶）和合成的单向导 RNA (sgRNA) 构成了 CRISPR-Cas9 机制。Cas9 通过 sgRNA 定向到其基因组靶区域，并通过两个核酸酶域切割噬菌体。Cas9-切口酶提高了切割准确性并允许更大的缺失。根据文献，CRISPR 可用于删除植物易感性 (S) 基因，以产生作物的抗病性。然而，尚未发现双生病毒的特定 S 基因。一个建议的解决方案是针对外壳蛋白 AV1/V1，这是双生病毒的唯一结构蛋白。这些蛋白质对其功能至关重要，因为它们负责病毒 DNA 往返于细胞核，并与 ssDNA 结合以实现有效复制。我们假设 CRISPR-Cas9 可以与 Cas9-nickases（以提高功效）和农杆菌一起递送到受影响的作物中。农杆菌是一种在植物细胞中产生肿瘤的病原体，但由于其具有转移 DNA 的能力，也用于转基因。农杆菌插入 T-DNA 的预期效果是外壳蛋白发生突变，这将损害外壳蛋白并使其失活。如果没有这种结构蛋白，病毒感染就不会有效，使双生病毒变得毫无用处。这将使农业受益，防止数十亿作物受到感染，从而提高生产力并减少全球粮食危机。很少有研究分析过 SSW 中病毒和微生物之间可能存在的相互作用。利用 CRISPR-Cas9 系统和农杆菌改造外壳蛋白，帮助作物产生双生病毒抗性 Kajisha Vijayakumar，食品学学士 [1]，Iman Andrea Niyokindi shima，公共卫生学学士 [2] [1] 圭尔夫大学食品科学系，加拿大安大略省圭尔夫 N1G 2W1 [2] 圭尔夫大学物理系，加拿大安大略省圭尔夫 N1G 2W1 双生病毒给印度豆类和非洲木薯产业造成了数百万美元的损失，并引发全球粮食短缺。双生病毒是一种基因组较小、编码蛋白质较少的 DNA 病毒。近年来，人们研究了成簇的规律间隔的短回文重复序列 (CRISPR)，试图让作物产生对这些病毒的抗性。 Cas9（位点特异性 DNA 内切酶）和合成的单向导 RNA（sgRNA）构成 CRISPR-Cas9 机制。Cas9 通过 sgRNA 定向到其基因组靶区域，并通过两个核酸酶域切割噬菌体。Cas9-切口酶可提高切割准确性并允许更大的缺失。根据文献，CRISPR 可用于删除植物易感性 (S) 基因，从而在作物中产生抗病性。然而，尚未发现双生病毒的特定 S 基因。建议的解决方案是针对外壳蛋白 AV1/V1，这是双生病毒的唯一结构蛋白。这些蛋白质对其功能至关重要，因为它们负责病毒 DNA 往返于细胞核，并结合 ssDNA 以实现有效复制。我们假设 CRISPR-Cas9 可以与 Cas9-切口酶（以提高功效）和农杆菌一起递送到受影响的作物中。农杆菌是一种在植物细胞中产生肿瘤的病原体，但由于其具有转移 DNA 的能力，因此也可用于转基因。农杆菌插入 T-DNA 的预期效果是外壳蛋白发生突变，这将破坏外壳蛋白并使其失活。如果没有这种结构蛋白，病毒感染就不会有效，从而使双生病毒变得毫无用处。这将使农业受益，防止数十亿农作物受到感染，从而提高生产力并减少全球粮食危机。很少有研究分析过 SSW 中病毒和微生物之间可能存在的相互作用。利用 CRISPR-Cas9 系统和农杆菌改造外壳蛋白，帮助作物产生双生病毒抗性 Kajisha Vijayakumar，食品学学士 [1]，Iman Andrea Niyokindi shima，公共卫生学学士 [2] [1] 圭尔夫大学食品科学系，加拿大安大略省圭尔夫 N1G 2W1 [2] 圭尔夫大学物理系，加拿大安大略省圭尔夫 N1G 2W1 双生病毒给印度豆类和非洲木薯产业造成了数百万美元的损失，并引发全球粮食短缺。双生病毒是一种基因组较小、编码蛋白质较少的 DNA 病毒。近年来，人们研究了成簇的规律间隔的短回文重复序列 (CRISPR)，试图让作物产生对这些病毒的抗性。 Cas9（位点特异性 DNA 内切酶）和合成的单向导 RNA（sgRNA）构成 CRISPR-Cas9 机制。Cas9 通过 sgRNA 定向到其基因组靶区域，并通过两个核酸酶域切割噬菌体。Cas9-切口酶可提高切割准确性并允许更大的缺失。根据文献，CRISPR 可用于删除植物易感性 (S) 基因，从而在作物中产生抗病性。然而，尚未发现双生病毒的特定 S 基因。建议的解决方案是针对外壳蛋白 AV1/V1，这是双生病毒的唯一结构蛋白。这些蛋白质对其功能至关重要，因为它们负责病毒 DNA 往返于细胞核，并结合 ssDNA 以实现有效复制。我们假设 CRISPR-Cas9 可以与 Cas9-切口酶（以提高功效）和农杆菌一起递送到受影响的作物中。农杆菌是一种在植物细胞中产生肿瘤的病原体，但由于其具有转移 DNA 的能力，因此也可用于转基因。农杆菌插入 T-DNA 的预期效果是外壳蛋白发生突变，这将破坏外壳蛋白并使其失活。如果没有这种结构蛋白，病毒感染就不会有效，从而使双生病毒变得毫无用处。这将使农业受益，防止数十亿农作物受到感染，从而提高生产力并减少全球粮食危机。成簇的规律间隔短回文重复序列 (CRISPR) 已被研究，以尝试开发作物对这些病毒的抗性。Cas9（位点特异性 DNA 内切酶）和合成的单向导 RNA (sgRNA) 构成 CRISPR-Cas9 机制。Cas9 通过 sgRNA 定向到其基因组靶区域，并通过两个核酸酶域切割噬菌体。Cas9-切口酶提高了切割准确性并允许更大的缺失。根据文献，CRISPR 可用于删除植物易感性 (S) 基因，以产生作物的抗病性。然而，尚未发现双生病毒的特定 S 基因。建议的解决方案是针对外壳蛋白 AV1/V1，这是双生病毒的唯一结构蛋白。这些蛋白质对其功能至关重要，因为它们负责病毒 DNA 往返于细胞核，并结合 ssDNA 以进行有效复制。我们假设 CRISPR-Cas9 可以与 Cas9-nickases（以提高功效）和农杆菌一起递送到受影响的作物中。农杆菌是一种在植物细胞中产生肿瘤的病原体，但由于其具有转移 DNA 的能力，也用于转基因。农杆菌插入 T-DNA 的预期效果是外壳蛋白发生突变，这将损害外壳蛋白并使其失活。如果没有这种结构蛋白，病毒感染就不会有效，使双生病毒变得毫无用处。这将使农业受益，防止数十亿作物受到感染，从而提高生产力并减少全球粮食危机。成簇的规律间隔短回文重复序列 (CRISPR) 已被研究，以尝试开发作物对这些病毒的抗性。Cas9（位点特异性 DNA 内切酶）和合成的单向导 RNA (sgRNA) 构成 CRISPR-Cas9 机制。Cas9 通过 sgRNA 定向到其基因组靶区域，并通过两个核酸酶域切割噬菌体。Cas9-切口酶提高了切割准确性并允许更大的缺失。根据文献，CRISPR 可用于删除植物易感性 (S) 基因，以产生作物的抗病性。然而，尚未发现双生病毒的特定 S 基因。建议的解决方案是针对外壳蛋白 AV1/V1，这是双生病毒的唯一结构蛋白。这些蛋白质对其功能至关重要，因为它们负责病毒 DNA 往返于细胞核，并结合 ssDNA 以进行有效复制。我们假设 CRISPR-Cas9 可以与 Cas9-nickases（以提高功效）和农杆菌一起递送到受影响的作物中。农杆菌是一种在植物细胞中产生肿瘤的病原体，但由于其具有转移 DNA 的能力，也用于转基因。农杆菌插入 T-DNA 的预期效果是外壳蛋白发生突变，这将损害外壳蛋白并使其失活。如果没有这种结构蛋白，病毒感染就不会有效，使双生病毒变得毫无用处。这将使农业受益，防止数十亿作物受到感染，从而提高生产力并减少全球粮食危机。病毒感染不会有效，使双生病毒变得毫无用处。这将使农业受益，防止数十亿农作物受到感染，从而提高生产力并减少全球粮食危机。病毒感染不会有效，使双生病毒变得毫无用处。这将使农业受益，防止数十亿农作物受到感染，从而提高生产力并减少全球粮食危机。
二尖瓣主动脉瓣心内膜炎的罕见病因
这里我们介绍一例由血双生菌引起的感染性心内膜炎 (IE) 病例，血双生菌是一种很少引起人类感染的病原体。本例患者是一名 50 岁男性，除此以外身体健康，六周内出现呼吸困难、体重减轻、疲劳、发冷和腿部肿胀等症状逐渐加重。他既往没有心脏病史，也从未使用过静脉注射药物，但在一次军事相关伤害后接受过大量牙科治疗。患者对 IE 进行了检查，超声心动图显示二尖瓣主动脉瓣 (BAV) 有赘生物，导致中度至重度主动脉瓣关闭不全。血培养最初仅显示革兰氏阳性球菌，后来确诊为血双生菌。患者随后在接受抗生素治疗和主动脉瓣置换术后康复。患者的 BAV 和重要的牙科病史是该病的风险因素，尽管他的症状不具特异性，也没有表现出其他典型的 IE 风险因素，但他的病例表明保持高度临床怀疑非常重要，以便及时开始适当的治疗。需要对 Gemella 进行更多研究，因为这些物种很难识别，因此可能是比目前已知的更重要的感染原因。
使用双对双生成对抗网络将人类神经活动端到端转换为语音
摘要 — 在最近一项基于听觉诱发电位 (AEP) 的脑机接口 (BCI) 研究中，结果表明，使用编码器-解码器框架可以将人类神经活动转化为语音 (T-CAS)。然而，当前基于编码器-解码器的方法通常采用两步法实现 T-CAS，其中信息通过共享的降维向量在编码器和解码器之间传递，这可能会导致信息丢失。解决此问题的一种潜在方法是使用双生成对抗网络 (DualGAN) 设计一种端到端方法，而无需对传递的信息进行降维，但它无法实现一对一的信号到信号转换（见图 1 (a) 和 (b)）。本文提出一种端到端的人类神经活动直接转化为语音的模型，通过设计一种检测参与者注意力的装置，为注意力较好的参与者创建新的脑电图（EEG）数据集，并引入双对双生成对抗网络（Dual-DualGAN）（见图1（c）和（d））解决人类神经活动到语音的端到端翻译（ET-CAS）问题，通过对EEG信号和语音信号进行分组标记，插入过渡域实现跨域映射。在过渡域中，过渡信号由相应的EEG和语音信号按一定比例级联，为没有对应特征的EEG和语音信号搭建桥梁，实现一对一的跨域EEG到语音的翻译。所提出的方法可以将字长和句子长的神经活动序列转化为语音。实验评估表明，所提出的方法在听觉刺激的单词和句子方面明显优于最先进的方法。
智能和虚拟城市中的人工智能
智慧城市是全球城市的另一个项目，其背后有一个诱人的想法——技术将帮助社会变得更加智能。反过来，城市就像过去的镜子，反映了社会的复杂性和相互竞争的利益、价值观和身份的地域化，或者像创新的试验台——一个预测未来的大型实验室。数字创新和人工智能一直在推动一个互联世界的愿景，这个世界依靠技术来执行越来越复杂的任务，通常需要人类代理，最近承诺人类将责任委托给人工智能代理，以实现更高效、更准确、更客观的结果和成果。随着这些高度复杂的系统运行并嵌入我们的现实，与虚拟世界的联系得到了加强。然而，这些城市双生是纯粹虚拟的还是也是有形的？它们创造了什么可能性？为什么智慧城市对未来的城市有如此大的希望，这些互联的双重现实扮演着什么角色？由于城市数字孪生和个人数字孪生依靠数据来重现虚拟实体，这一新希望的一个方面在于人工智能的潜在力量。虚拟城市正在呈现新的形态，并嵌入新的方式以连接虚拟和物理现实。
顺式调控变异影响基因表达动态......
摘要 顺式调控序列的进化取决于它们如何影响基因表达，并促使人们识别和预测导致物种内和物种间表达差异的顺式调控变体。虽然在将顺式调控变体与表达水平联系起来方面取得了很大进展，但基因激活和抑制的时间对顺式调控序列的进化也可能很重要。我们研究了双生期转变期间酵母菌物种内和物种间的等位基因特异性表达 (ASE) 动态，发现基因表达动态中存在明显的顺式作用变化。物种内 ASE 与基因间变体相关，ASE 动态与插入和缺失的关联性比与 ASE 水平的关联性更强。为了完善这些关联，我们使用高通量报告基因检测来测试启动子区域和单个变体。在重现内源表达的区域子集中，我们识别并表征了影响表达动态的顺式调控变体。在不同物种之间，嵌合启动子区会产生新的模式，并表明基因表达动力学的进化受到限制。我们得出结论，顺式调控序列的变化可以调节基因表达动力学，而表达动力学与表达其他方面之间的相互作用与顺式调控序列的进化有关。
CRISPR/Cas 基因组编辑在番茄改良中的应用
番茄的遗传基础狭窄，给育种带来了严峻挑战。因此，随着成簇的规律间隔短回文重复序列 (CRISPR) 相关蛋白 9 (CRISPR/Cas9) 基因组编辑的出现，快速高效的番茄育种已成为可能。番茄的许多性状已使用 CRISPR/Cas9 进行编辑和功能表征，例如植物结构和花的特性（例如叶、茎、花、雄性不育、果实、单性结实）、果实成熟、品质和营养（例如番茄红素、类胡萝卜素、GABA、TSS、花青素、保质期）、抗病性（例如 TYLCV、白粉病、晚疫病）、非生物胁迫耐受性（例如热、旱、盐度）、CN 代谢和除草剂抗性。CRISPR/Cas9 已被证明可用于将野生近缘种的优良性状从头驯化到栽培番茄，反之亦然。 CRISPR/Cas 的创新允许使用在线工具进行单向导 RNA 设计和多路复用、克隆（例如 Golden Gate 克隆、GoldenBraid 和 BioBrick 技术）、强大的 CRISPR/Cas 构建体、高效的转化方案（例如农杆菌）和用于 Cas9-gRNAs 核糖核蛋白 (RNPs) 复合物的无 DNA 原生质体方法、Cas9 变体（例如无 PAM 的 Cas12a 和 Cas9-NG/XNG-Cas9）、基于同源重组 (HR) 的双生病毒复制子基因敲入 (HKI) 以及碱基/引物编辑（Target-AID 技术）。这篇小型评论重点介绍了 CRISPR/Cas 在番茄快速高效育种方面的最新研究进展。
文章
直接生长技术用于合成几个宏观工程师（MMS），该技术采用可逆的添加 - 碎片链转移（RAFT）聚合通过直接从诺尔伯伦官能官能化的链转移剂（CTA）生长。我们的目的是研究由四种单体中不同单体转化值在不同的单体转化值下通过组合（即耦合）终止的双生烯基物质的形成：苯乙烯，丁烷，丁酸 - 丁基 - 丙烯酸丙烯酸酯，甲基丙烯酸甲酯和N-丙烯酸甲基丙烯酸甲酯和甲基丙烯酰胺。使用Grubbs 3 Rd Generation催化剂（G3）以mm：G3比为100：1的Grubbs对这些MM的开环式聚合（ROMP），导致瓶颈聚合物的形成。通过尺寸排斥色谱分析（SEC）表明，高摩尔质量肩部的高巨大强度归因于掺入这些双苯二烯基物质以产生二聚体或高阶瓶洗聚合物寡聚物。The monomer type in the RAFT step heavily influenced the amount of these bottlebrush polymer dimers and oligomers, as did the monomer conversion value in the RAFT step: We found that the ROMP of polystyrene MMs with a target backbone degree of polymerization of 100 produced detectable coupling at 20% monomer conversion in the RAFT step, while it took 80% monomer conversion to observe在聚（Tert-丁基丙烯酸酯）MMS中耦合。我们没有检测到聚（甲基丙烯酸甲酯）MMS中的耦合，但是SEC峰扩大并增加了分散性的增加，这表明存在隔离活性烷烃链链，这是由抗倍率所产生的。最后，即使在木筏步骤中达到90％的单体转换时，poly（n-丙烯酰基）MMS也没有显示出瓶洗瓶装聚合物的可检测耦合。这些结果突出了单体选择和筏聚合条件在制作摩擦术的MMS中的重要性，以制造定义明确的瓶洗聚合物。
社论：遗传验证及其在作物改善中的作用
基因发现经济上重要的特征在作物基因组学和育种方面仍然是充满挑战的边界。DNA测序技术和遗传分析方法的最新进展为发现许多基因和热点基因组区域铺平了道路。对新型基因组区域或候选基因的检测对于植物繁殖者和遗传学家来说非常有用，可以改善农作物，剖析复杂性状的遗传学，并了解感兴趣的特征基因的生物学机制。定量性状基因座（QTL）映射和基因组广泛的关联研究（GWAS）主导了最近的作物基因发现研究。这些研究正在成为常规活动，以发现重要表型的遗传基础，并导致潜在的等位基因变化，标记性状属性关联以及有利等位基因在目标种质中的频率，以帮助理解作物功能基因组学（Rasheed和Xia 2019）。但是，发现的基因座需要在考虑到繁殖之前需要进一步验证。在大多数GWAS情况下，由于将人口结构与低频因果等位基因混淆的问题可能是模棱两可的，这导致了错误的阴性结果和其他未指定的因素，包括在某些基因座上调用低临床基因型的呼唤（Browning和Yu，Yu，2009）和人口大小（Finnoet al。因此，使用交叉群体的方法进行进一步的验证，其中候选基因座在双生养生中被验证或独立的种质收集（Finnoet al。，2014）。遗传验证（QTL，基因组区域，候选基因，基因表达，标记发育等）是标记辅助和基因组选择的基本步骤之一，以实现其目标。遗传验证检查何时在其他位置或年份生长该材料时，相同的QTL或基因是否往往被显着检测到，以及在不同遗传背景中测试时是否仍然可以显着检测其效果（Sallam等人，2016年）。此外，在不同种群中的多态性DNA标记的验证对于进一步的遗传
布巴内斯瓦尔·普拉丹 (Bhubaneswar Pradhan) 博士
1. Chandrasekhar, K.、Pradhan, B.、Roychowdhury, R.、Dubey, VK 2021. 通过基因操作改良小麦（Triticum spp.）；在：转基因作物的现状、前景和挑战，由 Kishor, PB Kavi, Rajam, MV、Pullaiah, T. 编辑。Springer Singapore（已接受出版），ISBN 978-981-15-5897-9_3。https://doi.org/10.1007/978-981-15-5897-9_3 2. Chakraborty, K.、Mondal, S.、Ray, S.、Samal, P.、Pradhan, B.、Chattopadhyay, K.、Kar, MK、Swain, P.、Sarkar, RK 2020。组织耐受性与离子鉴别相结合可以最大程度地降低水稻耐盐性的能量成本。植物科学前沿：11。265 https://www.frontiersin.org/article/10.3389/fpls.2020.00265。3. Pradhan, B., Chakraborty, K., Prusty, N., Deepa, Mukherjee, A., Chattopadhyaya, K., Sarkar, RK 2019。高分辨率叶绿素荧光成像系统证明了耐盐和部分淹没复合胁迫的水稻基因型的区分和表征。功能植物生物学：46 (3), 248-261。https://doi.org/10.1071/FP18157。 4. Pradhan, B., Jangid, K., Sarwat, M., Bishi, SK 2019 . 组蛋白在叶片衰老过程中的作用：在：植物衰老信号传导，作者：Sarwat M 和 Tuteja N. Academic Press，第 187-197 页，ISBN 9780128131879。https://doi.org/10.1016/B978-0-12-813187-9.00011-1。5. Prusty, N # ., Pradhan, B # ., Deepa., Chattopadhyaya, K., Patra, BC, Sarkar, RK 2018 . 耐洪水和盐分胁迫综合影响的新型水稻（Oryza sativa L.）种质。印度植物遗传资源杂志：31 (3), 260-269。（# 共同第一作者，同等贡献）。6. Vijayan, J.、Senapati, S.、Ray, S.、Chakraborty, K.、Molla, KA、Basak, N.、Pradhan, B.、Yeasmin, L.、Chattopadhyay, K. 和 Sarkar, RK 2018。转录组学和生理学研究确定了水稻发芽阶段耐受缺氧的线索。环境与实验植物学：147，234-248。doi.org/10.1016/j.envexpbot.2017.12.013。7. Pradhan, B.、Tien VV、Dey, N.、Mukherjee, SK 2017。双生病毒 DNA 复制的分子生物学：病毒复制中。 Avidscience 出版物。第 2-34 页。http://www.avidscience.com/book/viral-replication/。8. Pradhan, B.、Naqvi, AR、Saraf, S.、Mukherjee, SK、Dey, N. 2015 年。番茄卷叶新德里病毒 (ToLCNDV) 反应性新型微小 RNA 在番茄中的预测和表征。病毒研究。195，183-195。doi：10.1016/j.virusres.2014.09.001。