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驯化过程中的顺式和反式调控变异......
驯化过程需要将野生形态快速转化为人类选择的栽培形态。这一过程通常通过改变基因调控来实现，然而，顺式和反式调控变异在作物果实驯化中的作用尚无明确模式。利用等位基因特异性表达和网络分析，我们描述了辣椒野生和栽培品种的调控模式和基因表达的遗传，辣椒是一种果实形态变化显著的作物。我们认为，与栽培形式相关的基因表达差异最好由顺式调控中心通过反式调控级联起作用来解释。我们表明，在栽培辣椒中，与果实形态相关的基因表达相对于野生近缘种的基因表达部分是隐性的，这与杂交果实表型一致。栽培辣椒果实成熟和生长基因表达的减少表明，在其驯化过程中发生了功能丧失的选择。反式调控变化是大多数表现出调控差异的基因的基础，并且对基因表达的影响比顺式调控变体更大。对选定的顺式调控基因（包括 ARP9 和 MED25）的网络分析表明，它们与许多参与器官生长和果实成熟的转录因子相互作用。与顺式调控变体相关的差异表达基因及其与下游反式作用基因的相互作用有可能驱动野生果实和栽培果实之间观察到的形态差异，并为辣椒驯化过程中的形态转变提供一种有吸引力的机制。
血液学疾病中的全反式视黄酸
全反式视黄酸（ATRA）在组织发育，神经功能，繁殖，视力，细胞生长和分化，肿瘤免疫和凋亡中起作用。ATRA可以通过诱导自噬信号传导，血管生成，细胞分化，凋亡和免疫功能来起作用。在血液系统中，ATRA首先是在急性寄生虫细胞白血病（APL）中成功使用的，其中ATRA将白血病细胞分化为成熟的粒细胞。ATRA can play a role not only in APL, but may also play a role in other hematologic diseases such as immune thrombocytopenia (ITP), myelodysplastic syndromes (MDS), non-APL acute myeloid leukemia (AML), aplastic anemia (AA), multiple myeloma (MM), etc., especially by regulating mesenchymal stem cells and调节性T细胞用于治疗ITP。ATRA还可以增加肿瘤细胞表达的CD38的表达，从而改善了daratumumumab和cd38-cart的效率。在这篇综述中，我们关注ATRA的作用机理，其在各种血液疾病，药物组合和持续的临床试验中的作用。
和人类特异性缺失的反式调节靶基因
1 美国宾夕法尼亚州宾夕法尼亚州佩雷曼医学院5宾夕法尼亚州，美国9号，美国10 5电气和计算机工程系，乔治·梅森大学，美国弗吉尼亚州费尔法克斯，美国11 6 Neuro-X研究所，EPFL，EPFL，日内瓦，瑞士，瑞士日内瓦12 7 7 7放射学和医学信息学系，日内瓦大学，日内瓦大学，瑞士大学，瑞士大学13 8计算机工程学院，劳伦斯工程学院。 10138年，意大利东部，15 10 NPLAB，网络科学研究所，伦敦东北大学，伦敦，E1W 1LP，联合16联合16王国17 11 Networks单位，IMT Lucca Institute，IMT Lucca，55100，意大利卢卡，意大利55100 12 PURDUE综合神经科学研究所韦尔登（Weldon美国宾夕法尼亚州宾夕法尼亚州佩雷曼医学院5宾夕法尼亚州，美国9号，美国10 5电气和计算机工程系，乔治·梅森大学，美国弗吉尼亚州费尔法克斯，美国11 6 Neuro-X研究所，EPFL，EPFL，日内瓦，瑞士，瑞士日内瓦12 7 7 7放射学和医学信息学系，日内瓦大学，日内瓦大学，瑞士大学，瑞士大学13 8计算机工程学院，劳伦斯工程学院。 10138年，意大利东部，15 10 NPLAB，网络科学研究所，伦敦东北大学，伦敦，E1W 1LP，联合16联合16王国17 11 Networks单位，IMT Lucca Institute，IMT Lucca，55100，意大利卢卡，意大利55100 12 PURDUE综合神经科学研究所韦尔登（Weldon美国宾夕法尼亚州宾夕法尼亚州佩雷曼医学院5宾夕法尼亚州，美国9号，美国10 5电气和计算机工程系，乔治·梅森大学，美国弗吉尼亚州费尔法克斯，美国11 6 Neuro-X研究所，EPFL，EPFL，日内瓦，瑞士，瑞士日内瓦12 7 7 7放射学和医学信息学系，日内瓦大学，日内瓦大学，瑞士大学，瑞士大学13 8计算机工程学院，劳伦斯工程学院。 10138年，意大利东部，15 10 NPLAB，网络科学研究所，伦敦东北大学，伦敦，E1W 1LP，联合16联合16王国17 11 Networks单位，IMT Lucca Institute，IMT Lucca，55100，意大利卢卡，意大利55100 12 PURDUE综合神经科学研究所韦尔登（Weldon美国宾夕法尼亚州宾夕法尼亚州佩雷曼医学院5宾夕法尼亚州，美国9号，美国10 5电气和计算机工程系，乔治·梅森大学，美国弗吉尼亚州费尔法克斯，美国11 6 Neuro-X研究所，EPFL，EPFL，日内瓦，瑞士，瑞士日内瓦12 7 7 7放射学和医学信息学系，日内瓦大学，日内瓦大学，瑞士大学，瑞士大学13 8计算机工程学院，劳伦斯工程学院。 10138年，意大利东部，15 10 NPLAB，网络科学研究所，伦敦东北大学，伦敦，E1W 1LP，联合16联合16王国17 11 Networks单位，IMT Lucca Institute，IMT Lucca，55100，意大利卢卡，意大利55100 12 PURDUE综合神经科学研究所韦尔登（Weldon
带有驾驶场的量子zeno和反式效应...
1986年阅读1968年 - 法国大学的革命年，导致戴高乐将军担任法国总统。上周，有超过一百万的法国学生和学童在街上违反大学的新法律，学生声称，这些法律将收紧要求的要求，将自由入学权转移到了许多情况下，在许多情况下，示威者的父母在大约20年前就被赢得了如此多的胜利。右翼总理雅克·奇尔·阿克（Jacques Chir-Ac）在1968年以戴高乐总理和后来的总统乔治·庞皮杜（Georges Pompidou）的身份处理了这些事件，这次没有胃。他告诉大学部长和搜查，Alain Devaquet撤回了修订法案。这次辞职似乎并不顺序。Chirac不会在这个问题上看到自己或他的政府的沦陷；社会主义者总统弗兰（Fran 此外，Devaquet的律法是各种压力群体之间的妥协，据说对学生有很多同情，并且可能会认为这些魔鬼对自己的位置表示重视。 到目前为止，战斗中的失败者似乎是“ Les Emigres”，在以前的社会主义行政管理期间，一群沉默或无能为力的大学工作人员 -此外，Devaquet的律法是各种压力群体之间的妥协，据说对学生有很多同情，并且可能会认为这些魔鬼对自己的位置表示重视。到目前为止，战斗中的失败者似乎是“ Les Emigres”，在以前的社会主义行政管理期间，一群沉默或无能为力的大学工作人员 -
共生生物的代谢多样性调节肠道免疫和反式1
（未通过同行评审认证）是作者/资助者。保留所有权利。未经许可就不允许重复使用。该预印本版的版权持有人于2023年8月26日发布。 https://doi.org/10.1101/2022.08.26.505490 doi：Biorxiv Preprint
apobec1介导的C-TO-U RNA编辑：目标序列和反式作用因子对
Cold Spring Harbour实验室出版社于2025年2月28日 - 由RNAJournal.cshlp.org发布于
共表达分析揭示了由反式作用遗传变异控制的可解释的基因模块
抽象理解导致疾病发作和进展的因果过程对于发展新型疗法至关重要。尽管反式 - 作用表达定量性状基因座（反式-EQTL）可以直接揭示由疾病变体调节的细胞过程，但由于其小效应大小，检测反式eqtls仍然具有挑战性。在这里，我们分析了来自226至710个个体的六种血细胞类型的基因表达和基因型数据。我们使用从基因表达数据中推断出使用五种方法的共表达模块作为反式-EQTL分析中的特征来限制多重测试并提高可解释性。除了复制三个已建立的关联外，我们还发现了SLC39A8附近的一种新颖的反式 - EQTL，它调节了LPS刺激的单核细胞中的金属硫蛋白基因模块。有趣的是，这种效应是由瞬态顺式-EQTL介导的，仅在早期LPS响应中存在，并且在反式效应出现之前就丢失了。我们的分析重点介绍了共表达与功能富集分析的结合如何改善当应用于新兴细胞类型特异性数据集时，可以改善反式-EQTL的识别和优先级。
CAS12A的反式DNA裂解活性没有可检测到的免疫力对质粒或噬菌体
CAS12A是V-A型CRISPR-CAS RNA引导的内切酶。它在特定位点切割了dsDNA，然后在体外反式跨体内激活以非特征ssDNA的裂解。反式活性的免疫功能仍然未知。为了解决这个问题，我们在大肠杆菌中构建了一个CAS12A靶向系统，其中CAS12A裂解了高拷贝靶质粒以释放反式ssDNA裂解活性。然后，我们分析了Cas12a靶向对非目标质粒和ssDNA噬菌体的影响。结果表明，CAS12A有效地消除了目标质粒，但对噬菌体的非目标质粒或鼠疫形成的维持没有影响。此外，有助于靶质粒耗竭的两间隔crispr阵列仍然对非目标质粒或噬菌体没有可检测的影响。一起，数据表明CAS12A的反式ssDNA切割不会导致体内免疫力。
全反式视黄酸与γ-泌尿酶抑制剂crenigacestat协同作用，以增强多发性骨髓瘤的BCMA和B
B细胞成熟抗原（BCMA）是多发性骨髓瘤（MM）中嵌合抗原受体（CAR）T细胞疗法的铅抗原。挑战是在治疗压力下在MM细胞和BCMA下调的BCMA表达中的患者间异质性和患者内异质性。因此，在接受BCMA-CAR T细胞疗法的患者中，人们希望增加和维持MM细胞的BCMA表达。我们使用全反式视黄酸（ATRA）来增强MM细胞上的BCMA表达，并在临床前模型中增加BCMA-CAR T细胞的效率。我们表明，ATRA处理通过定量逆转录聚合酶链反应导致BCMA转录本的增加，并通过MM细胞系和原代MM细胞中流量细胞仪的BCMA蛋白Ex压缩增加。用超分辨率显微镜确认的分析增加了BCMA蛋白的表达，并在ATRA处理后揭示了非簇的BCMA分子在MM细胞膜上的均匀分布。ATRA治疗后，MM细胞上的BCMA表达增强，导致BCMA-CAR T细胞的细胞解，细胞因子的分泌和体外的BCMA-CAR T细胞的增殖，并增加了MM In Vivo（NSG/MM.1S）鼠尾草模型中BCMA-CAR T-CELL疗法的效率。组合MM细胞用ATRA和γ-泌尿酶抑制剂CrenigAcestat进一步增强了BCMA表达和BCMA-CAR T-Cell T-Cell在体外和体内的效果。在一起，数据表明，ATRA处理会导致BCMA在MM细胞上的表达增强，并巧妙地调节BCMA-CAR T细胞的反应性增强。数据支持ATRA与BCMA-CAR T细胞治疗以及其他BCMA指导的免疫疗法的临床评估。