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孢子形成对于与植物相关的人类病原体蜡状芽孢杆菌的生命周期而言是可有可无的
蜡状芽孢杆菌是一种常见的食源性病原体，是人类食物中毒的重要原因。蜡状芽孢杆菌引起的疾病通常表现出两种主要症状，即呕吐或腹泻，具体取决于产生的毒素。据推测，在摄入受污染的蔬菜或加工食品后，产肠毒素的蜡状芽孢杆菌孢子会到达肠道，在那里发芽并产生导致食物中毒的肠毒素。在我们的研究中，我们观察到，孢子形成是蜡状芽孢杆菌在叶子中生存所必需的，但在即食蔬菜（如菊苣）中是可有可无的。我们证明，最初在孢子形成方面受损但在生物膜形成方面没有受损的蜡状芽孢杆菌营养细胞能够到达肠道并在小鼠模型中引起严重疾病。此外，我们的研究结果
从土壤细菌中生产吲哚乙酸
吲哚乙酸（IAA）的产生是根际细菌的主要资产，可刺激和增强植物的生长。目前的工作涉及分离和鉴定从石榴酸盐，番石榴和Amla农场收集的根际土壤中产生细菌的吲哚乙酸。在十种吲哚乙酸产生分离株中，选择了两个作为有效的生产者。光谱分析，这表明在37°C下孵育72小时后，分离的细菌在孵育72小时后产生了最大浓度IAA。使用标准IAA曲线测量浓度，并通过AA2获得最大浓度。随后，通过POT分析测试了对植物生长的影响。用AA2分离物进行发芽的豌豆种子的体外处理表现出比对照更好的结果。总而言之，研究表明，IAA产生细菌是促进植物生长的有效接种剂。
特刊 - 园艺
植物从其发育早期开始就与有益微生物相互作用，在促进种子发芽、改善养分利用、增强水分吸收、预防植物病原体侵袭和增强对非生物胁迫的反应方面发挥着关键作用。微生物可以从各种来源分离出来，并在体外和体内评估其促进植物生长的潜力。已经提出了几种管理这些有益微生物的策略，包括利用微生物组增强对非生物胁迫的耐受性和促进植物生长的方法。在当前气候变化的背景下，植物生长的条件越来越具有挑战性，迫切需要确定兼容的微生物以确保园艺作物的生长和产量。本期特刊旨在关注植物与微生物的相互作用，并邀请采用多种方法的研究来探索植物相关微生物在生物和非生物胁迫下在园艺生产中的多样性、适应性、生态作用和益处。
Caf
摘要组蛋白伴侣染色质组装因子1（CAF-1）沉积了两个新生的组蛋白H3/H4二聚体在新复制的DNA上，形成了核小体的中心核心，称为Tortasome。CAF-1如何确保有足够的空间来组装四面体。Caf-1的赖氨酸/谷氨酸/精氨酸（KER）区域的结构和生物物理表征揭示了具有前所未有的DNA结合特性的128-Å单α-螺旋（SAH）基序。不同的KER序列特征和SAH的长度驱动Caf-1对于四长长的DNA的选择性，并促进发芽酵母中的功能。在体内，KER与CAF-1中的DNA结合的有翼螺旋结构域合作，以克服DNA损伤敏感性并保持基因表达的沉默。我们建议KER SAH将CAF-1中的功能域与结构精度联系起来，在染色质组装过程中充当DNA结合间隔元件。
引入新芽（使用阈值的区域输出的半自动化划分）：一种适应性的计算机视觉工具，用于生成3D分段
3D图像数据的可用性提高需要提高目前依赖手动标记的数字细分效率，尤其是在将结构分为多个组件时。自动化和半自动化的方法，例如深度学习和智能插值，但需要预先标记的数据，以及专门的硬件和软件。深度学习模型通常需要手动创建广泛的培训数据，尤其是对于复杂的多级分段。在这里，我们介绍了Sprout，这是一种新颖的，半自动化的计算机视觉方法，提供了时间效率且用户友好的管道，用于细分和分析图像数据。发芽基于指定的密度阈值和连接组件的侵蚀生成种子（代表对象的部分），以实现元素分离。种子生长以获得完全分类的分割。我们将Sprout的性能与智能插值的性能进行比较，并将其应用于不同的数据集，以证明此开源3D细分方法的实用性和多功能性。
海洋生物概况：海洋资源的新颖使用
抽象的液化化是一种创新且环保的方法，用于通过在准备好的土壤上喷洒种子，水，覆盖物和添加剂的泥浆混合物来建立植被。将草或天然植物种子，肥料和粘性剂等成分与水和覆盖物混合在一起，以产生均匀的混合物，从而促进快速发芽和生长。该技术可容纳各种各样的种子，从草皮和野花到本地种类，并覆盖农作物，使其用于诸如住宅草坪，高速公路斜坡和退化的土地填海等应用。水层提供了许多环境和实际优势，包括成本效益，快速应用，有效的种子到土壤接触以及土壤侵蚀减少。这也是一种可持续的解决方案，可改善土壤健康，支持生物多样性，并通过稳定斜坡和控制径流来为分水岭提供贡献。该方法将经济利益与环境优势相结合的能力，例如碳固换，本地植被修复和降低热岛的影响，强调了其在可持续土地管理实践中的重要性。简介
定性而不是定量磷化调节塑造了萌芽酵母中减数分裂I的末端
从有丝分裂中退出是由磷光蛋白质组景观的急剧变化引起的。 依赖细胞周期蛋白依赖性激酶（CDK）活性，主要调节激酶以及诸如发芽酵母中Cdc14之类的诸如Cdc14之类的反破坏性磷酸化酶的激活，从而使有序的底物去磷酸化有序，从而允许进入新的细胞周期进入新的细胞周期和复制许可。 在减数分裂中，必须在没有中间DNA复制的情况下执行两个细胞分裂，这意味着必须将全球磷酸化和去型的替代化适应减数分裂的挑战。 使用萌芽酵母中的全球时间分辨磷酸蛋白质组学方法，我们比较了有丝分裂出口与从减数分裂I到减数分裂II之间的磷蛋白组景观。 我们发现，与有丝分裂的退出不同，在减数分裂I结束时，CDK磷酸基因磷酸化的磷酸化大部分稳定，而大多数与CDK无关的基序是通过去磷酸化来重置的。 然而，在减数分裂的中期，CDK的人工降低导致有序的底物去磷酸化，与有丝分裂相当，表明在减数分裂I的末端磷酸化I的磷酸化I的主要是有定性的，而不是定性下降的。从有丝分裂中退出是由磷光蛋白质组景观的急剧变化引起的。依赖细胞周期蛋白依赖性激酶（CDK）活性，主要调节激酶以及诸如发芽酵母中Cdc14之类的诸如Cdc14之类的反破坏性磷酸化酶的激活，从而使有序的底物去磷酸化有序，从而允许进入新的细胞周期进入新的细胞周期和复制许可。在减数分裂中，必须在没有中间DNA复制的情况下执行两个细胞分裂，这意味着必须将全球磷酸化和去型的替代化适应减数分裂的挑战。使用萌芽酵母中的全球时间分辨磷酸蛋白质组学方法，我们比较了有丝分裂出口与从减数分裂I到减数分裂II之间的磷蛋白组景观。我们发现，与有丝分裂的退出不同，在减数分裂I结束时，CDK磷酸基因磷酸化的磷酸化大部分稳定，而大多数与CDK无关的基序是通过去磷酸化来重置的。然而，在减数分裂的中期，CDK的人工降低导致有序的底物去磷酸化，与有丝分裂相当，表明在减数分裂I的末端磷酸化I的磷酸化I的主要是有定性的，而不是定性下降的。
GRUSP 是一种通用应激蛋白，参与赤霉素依赖的拟南芥开花诱导
摘要 — 研究了 T-DNA 插入拟南芥 At3g58450 基因（该基因编码与发芽相关的通用应激蛋白 (GRUSP)）的 3'-UTR 区域的影响。研究发现，在长日照条件下，该突变会延迟 grusp-115 转基因株系的开花转变，这是因为与野生型植物 (Col-0) 相比，内源生物活性赤霉素 GA1 和 GA3 的含量降低。外源 GA 加速了这两个株系的开花，但没有改变 Col-0 和 grusp-115 之间开花开始时间的差异。除了 GA 代谢的变化之外，grusp-115 显然在诱导开花信号的实现方面存在干扰。开花整合因子 FLOWERING LOCUS T ( FT ) 和开花抑制因子 FLOWERING LOCUS C ( FLC ) 的基因表达结果证实了这一点，它们是关键的开花调节因子，作用相反。我们假设，由于 FLC 表达上调，FT 表达水平较低也会影响 grusp-115 表型的形成。
2024_54_DOLS_ER：通过微生物操纵增强海草的生长和弹性
在全球范围内，海草草地以惊人的速度丢失，在过去的30年中，英国损失了多达40％的海草覆盖范围。海草提供各种生态系统服务，因此有几项努力旨在恢复英国这些丢失的草地。迄今为止，已经有三种中心的海草修复方法：将天然存在的海草移植到新地点，将种子直接种植到海床上，并种植了耕种的海草原位，将其种植到海洋环境中。这些方法对于英国海草物种Zostera Mariana和Z. Noltei取得了不同的成功。海洋保护信托基金（Oceant Trust）正在开发一条修复管道，该管道将种子在室内水产养殖设施中种植，并将已建立的植物移植到环境中。苗圃种子可以达到高发芽的成功率，但是这种成功目前是很大的变化，室内设施中的植物健康也是如此。
LAFL种子发育和相变的因素
开发是一种链反应，其中一个事件导致另一个事件直到完成生命周期。相变是生命周期中的里程碑事件。叶状cotyledon1（Lec1），ABA nosistive3（ABI3），FUSCA3（FUS3）和LEC2蛋白（同时称为LAFL）是调节种子和其他发育过程的主转录因子（TFS）。自从LAFL基因的最初表征以来，超过三十年的积极研究产生了有关这些TF的大量知识，这些TF在种子降低和发芽中的作用已得到了全面审查。使用遗传和基因组工具的细胞生物学的最新进展允许以较高的参考物种和农作物的较高吞吐量和分辨率在先前具有挑战性的组织中表征LAFL调节网络。在这篇综述中，我们通过整合表观遗传，转录，转录后和蛋白质水平的进步来提供整体观点，以扩大拟南芥种子发育和相变的LAFL网络的时空调节，并简要讨论这些TF网络的进化。