2型糖尿病(T2D)是全球发病率和死亡率的主要原因[1]。与没有糖尿病的人相比,T2D几乎使死亡率的风险几乎增加了一倍[2],主要是由于循环条件,但越来越多地来自癌症或神经退行性原因[3]。种族是T2D的广泛认可的风险因素;例如,与白人种族相比,南亚和黑人种族的人的患病率较高(南亚,黑人和白人种族的普遍存在:分别为7.7%,5.6%,5.0%),发病率增加(2-3次)和较低的诊断年龄(最高10岁)[4-8] [4-8]。eTh-neity在发展与糖尿病相关的补充方面也影响了后续后遗症,因此,通过种族来理解并发症的差异很重要,因为它可以考虑可能影响死亡率风险的人[4]。最近发生了与T2D相关的死亡率的实质性变化[3,9]。与Vascu相关的临床结果已经下降,因此需要对种族差异的最新证据进行审查[3,9]。糖尿病中的全因死亡率总体上降低了,这被认为是由于治疗途径的改善,风险因素的管理和整体生活方式行为[3,9]。虽然较早的评论强调了T2D种族群体之间死亡率的差异,但这些差异并未通过荟萃分析来量化[10,11]。然而,最近的系统综述和荟萃分析不包括其中一些较大的近期队列研究[7,12,15,16]。来自不同国家的几项大型队列研究,比较了不同种族之间的死亡风险[7,12 - 15]。它包括一些历史人群(2000年前),当T2D管理大不相同时,T2D和其他健康状况的人群(例如,患有多种慢性病的人,例如心脏瓦斯氏病,阿尔茨海默氏病或中风),因此可能不会代表每个种族的T2D人群[16]。审查还没有将南亚种族[16]与其他种族进行比较,更广泛地说,以前没有该群体的死亡率定量比较与其他种族。涉及社区中所有2型糖尿病患者(包括南亚种族的糖尿病患者)的一种全群人的方法,将使不同种族之间进行强有力的比较。因此,需要对族裔群体之间T2D的全因死亡率差异进行更现代和强大的分析。这很重要,因为它将具有关键的研究和临床意义,尤其是在推动可以解释任何死亡率风险差异的因素上的进一步研究中,告知未来重点的临床干预措施,并努力努力改善T2D的结果。这项系统审查和荟萃分析的目的是使用基于人群研究的数据来比较来自不同种族的T2D患者的死亡风险。
口咽癌是头颈癌最常见的类型(HNC)。尽管存在罕见的口咽癌,但绝大多数是鳞状细胞癌(OP-SCC)。几项研究表明,在高收入国家中,OP-SCC的发生率越来越高。1个鳞状细胞癌可能会影响口咽的任何子,包括舌头,palatine扁桃体,浅词表褶皱,valleculae,后咽壁和软皮质。但是,最常见的地点是扁桃体。2人乳头瘤病毒(HPV)是OP-SCC的主要病因危险因素。3 P16免疫组织化学用作OP-SCC中HPV的替代测试。在美国癌症联合委员会(AJCC)分期系统的第八版中,p16阳性和p16阴性OP-SCC被认为是关于肿瘤特征和结果的两个不同实体。与HPV阴性OP-SCC相比, HPV阳性OP-SCC具有有利的预后。 HPV阳性OP-SCC的发生率正在稳步增加,年轻患者的患病率更高。 4,5HPV阳性OP-SCC具有有利的预后。HPV阳性OP-SCC的发生率正在稳步增加,年轻患者的患病率更高。4,5
多年来,人类微生物组对健康和疾病的影响的影响越来越多(1)。高通量测序中的技术进步导致在维持人免疫系统的体内稳态环境中识别微生物组宿主相互作用(2)。此外,微生物群体系结构中的扰动(称为营养不良)与各种人类疾病有关(3-5)。气道微生物组是呼吸稳态的关键驱动力(6),与感染,超敏反应和免疫介导的疾病的敏感性有关(7)。粘膜免疫球蛋白在调节微生物组组成时发挥多种免疫效应子功能(8,9)。分泌的Iga对于使强大的宿主 - 微生物共生症至关重要,可以通过排除外源竞争者的粘膜壁ni,从而在粘膜壁ni中定殖(10)。患有先天性免疫误差(IEI)的患者,适应性或先天免疫系统缺陷导致胃肠道,呼吸道和皮肤介入经常与营养不良有关(11,12)。特别是,由于粘膜免疫力缺陷和微生物易位增加,肠道微生物群的变化已经描述了常见可变免疫降低(CVID)的患者(13,14),导致炎症和免疫失调(13,15)。cVID是最常见的IEI,其特征是低磁性血症,对疫苗接种的抗体反应受损和复发性呼吸道感染(14)。CVID患者中呼吸道微生物组的数据有限(16)。大约一半的患者会出现其他非感染并发症,例如自身免疫性疾病,淋巴增生和恶性肿瘤(14)。在CVID中,感染,免疫失调和微生物免疫相互作用的扰动可能导致气道失调,这有助于建立肺部损伤。通过常规培养方法,我们先前显示了炎型烟草和肺炎链球菌上呼吸道定植与CVID中的呼吸合并症之间的联系(16)。在这项单中心研究中,我们通过分子方法研究了口咽的细菌组成。我们使用口咽为易于访问的采样站点,被证明是有足够反映
。此外,由于尿液可以在家中自我收集,因此这种远程标本的收集能力可以帮助达到服务不足的人群,并在人群范围内实现更有效的癌症筛查。尽管TR-CTDNA方法具有巨大的潜力,但与血液ctDNA相比,关于Tr-CTDNA检测效率的报道混杂(3-7)。对TR-CTDNA进行分析的潜在至关重要因素是知道尿液中存在的Tr-ctDNA片段的长度,因为这会影响测定设计,以在Tr-CTDNA检测中进行最佳灵敏度。迄今为止,已经有关于Tr-ctDNA片段长度的对比报告。基于PCR的TR-CTDNA研究,当使用缩短大于60 bp(4、8、9)时,在检测方面已显示出更大的成功,这是两项最近的下一代测序(NGS)研究(NGS)研究,该研究专门针对TR-CTDNA,表明中间长度的中间长度为112 bp(10)或101 bp(11)或较高的研究表明,与一项较高的comptions(相比),与一项较高的表现相结合。控件(11)。报告的NGS结果的限制是使用的特定库制备方法(例如,双链DNA [dsDNA]库制备方案,基于杂交的ctDNA片段捕获)容易偏向于恢复较短的片段,尤其是超级片段,尤其是超级片段(尤其是<50 bp)(12)(12)。为了检验这一假设,我们利用了能够捕获最小片段的单链NGS方法来开发TR-CTDNA大小的更完整的曲线。鉴于在非癌症环境中对无细胞的无细胞DNA(CFDNA)的研究(例如,孕妇尿液中的胎儿DNA或结核病患者的结核分枝杆菌DNA的胎儿DNA(13,14)(13,14)报道了跨性别的CFDNA是超消除的(<50 bp),我们可以彻底crunder(<50 bp) - 均可能是癌症。尿液。如结果所示,我们的数据表明TR-CTDNA是超短症(<50 bp),可在多种非动物癌症类型中检测到。除了单链DNA(SSDNA)NGS研究外,我们开发了一种基于液滴数字PCR(基于DDPCR)的测定法,以测量尿液中的TR-CTDNA,该测量提供了绝对的量化,更高的精度,更高的精度和更高的吞吐量。我们设计了此测定方法来研究患有HPV +口咽鳞状细胞癌(OPSCC)的患者。在此类患者中,HPV DNA序列在血液循环中以CTDNA为单位,我们假设可以通过DDPCR在尿液中检测到肾脏肾小球屏障的ctDNA片段。HPV ctDNA代表了TR-CTDNA的DDPCR分析开发的理想靶标,因为(a)90%的HPV + OPSCC患者共享单个HPV亚型HPV16的序列,因此,单个HPV16 TR-CTDNA分析可以覆盖大型患者; (b)由于HPV是一个非人类序列,因此预计没有HPV +癌症患者的“背景”信号将很低; (c)HPV16可以在肿瘤基因组内的多个位点整合,从而导致每个肿瘤基因组的信号更高。因此,我们试图开发一种能够从HPV + OPSCC患者的尿液中检测到尿液中超常用的HPV16 TR-CTDNA片段的第一代DDPCR分析。值得注意的是,与HPV +宫颈癌的设置不同,可以将肿瘤DNA直接沉积到尿液中,HPV16 HPV16信号在HPV + OPSCC患者的尿液中必然是跨性别的。我们将此测定(42 bp扩增子)与常规长度测定(77 bp amplicon)进行了比较,发现靶向超短片段对于可靠的尿液TR-CTDNA检测至关重要。利用超短扩增子测定法,我们在HPV + OPSCC患者的尿液中获得了TR-CTDNA检测,这些尿液与匹配的血浆CTDNA的结果一致。此外,使用小病例系列中的纵向尿液样品,我们展示了概念证明,用于早期发现癌症复发。因此,我们的结果表明,通过靶向超短DNA片段,TR-CTDNA成为HPV + OPSCC检测的可行方法,并且有可能在治疗后进行癌症复发监测。
不同16S rRNA可变区检测不同细菌群落的敏感性可能会改变微生物组研究中的比较。某些地区比其他地区提供了更好的识别(Bukin等,2019); for example, V1-V3 regions can discriminate between staphylococcal populations ( Conlan et al., 2012 ), whereas V3-V4 were shown to be better at discriminating a greater number of taxa in the vaginal microbiota such as Gardnerella vaginalis, Bifidobacterium bifidum , and Chlamydia trachomatis Graspeuntner et al.(2018)。16S基于RRNA的技术在处理过程中的高风险,测序误差以及解释不同操作分类单元的存在(OTUS)(OTUS)时也可能受到限制(Quince等,2009,2011; Youssef等,2009)。
摘要目的:鳞状细胞癌(SCC)代表了所有头颈恶性肿瘤中最常见的组织类型,包括口咽鳞状细胞癌(OSCC),这是一种与不同的临床结果相关的肿瘤,并与人类乳头状瘤病毒(HPV)状态有关。转化研究几乎没有可用的体外模型来研究OSCC的不同病理生理行为。本研究提出了基于3维(3D)仿生胶原蛋白的支架,以模仿肿瘤微环境和细胞外基质(ECM)和癌细胞之间的串扰。方法:我们比较了在公共单层支持和脚手架上培养的HPV阳性和HPV阴性OSCC细胞系的表型和遗传特征。我们还探索了癌细胞对3D微环境的适应,及其对在细胞系和原发性培养物上测试的药物的疗效的影响。结果:HPV阳性和HPV阴性细胞系在3D模型中成功生长,并显示了不同的胶原纤维组织。3D培养物引起与上皮 - 间质转变(EMT)和基质相互作用相关的标记表达的增加,并显示出不同的迁移行为,如斑马鱼胚胎异种移植所证实。缺氧诱导因子1α(1α)和糖酵解标记的表达表明脚手架区域内缺氧微环境的发展。此外,3D培养物激活了细胞系和原代培养物中的药物抗药性信号通路。结论:我们的结果表明,基于胶原蛋白的支架可能是繁殖OSCC的病理生理特征的合适模型。此外,3D结构似乎能够诱导抗药性过程,以更好地研究我们对HPV阳性和HPV阴性患者OSCC的不同临床结果的理解。关键字口咽鳞状细胞癌;胶原;仿生支架;斑马鱼;抗药性;初级文化
