CRISPR 基因组编辑是一种很有前途的转化研究工具,但可能会导致不良的编辑结果,既可能在编辑的位点上命中目标,也可能在其他基因组位点上脱靶。在这里,我们研究了通过同源定向修复 (HDR) 和使用非同源末端连接 (NHEJ) 的基因编辑插入疾病相关突变后,人类干细胞中有害的靶向效应 (OnTE) 的发生情况。我们在多达 40% 的编辑克隆中发现了逃避标准质量控制的大型单等位基因基因组缺失和杂合性缺失。为了可靠地检测此类事件,我们描述了简单、低成本且广泛适用的定量基因分型 PCR (qgPCR) 和基于单核苷酸多态性 (SNP) 基因分型的工具,并建议将它们用作编辑后的额外质量控制。这将有助于确保编辑位点的完整性并提高 CRISPR 编辑的可靠性。
摘要 量子游动是量子系统中经典随机游动的类似物。在某些类型的图上,量子游动的命中时间比经典随机游动短,这导致基于量子游动的算法具有量子优势。量子游动的一个重要特征是它们伴随着从一个位置到另一个位置的激发转移,并且命中目标位置的时刻以在该位置观察到激发的最大概率幅度为特征。因此,将此类问题视为量子优势展示的候选问题是有前景的,因为门误差会抹去作为时间函数的转移概率的峰值,但仍然保持可区分性。我们研究了量子噪声对典型量子游动问题(即量子比特链上的完美状态转移 (PST))的命中时间和保真度的影响。我们在量子处理器的典型噪声(同质和非同质泡利噪声、串扰噪声、热弛豫和失相噪声)存在的情况下模拟了单个激发在量子比特链上的动态。我们发现泡利噪声主要抹去了激发传输保真度的峰值,而量子比特之间的串扰主要影响命中时间。了解这些噪声模式使我们能够提出一种错误缓解程序,我们使用该程序来优化在噪声量子处理器模拟器上运行 PST 的结果。