摘要:成簇的、规则间隔的、短回文重复序列 (CRISPR) 和 Cas9 RNA 引导核酸酶的发现为选择性杀死特定种群或物种的细菌提供了前所未有的机会。然而,由于 cas 9 基因构建体无法高效地递送到细菌细胞中,因此 CRISPR-Cas9 在体内清除细菌感染的应用受到了阻碍。在这里,我们使用广宿主范围的 P1 衍生噬菌粒将 CRISPR-Cas9 染色体靶向系统递送到大肠杆菌和引起痢疾的福氏志贺氏菌中,以实现对目标细菌细胞的 DNA 序列特异性杀死。我们表明,辅助 P1 噬菌体 DNA 包装位点 (pac) 的基因改造可显著提高包装噬菌粒的纯度,并改善 Cas9 介导的福氏志贺氏菌细胞的杀灭作用。我们进一步证明,P1 噬菌体颗粒可以使用斑马鱼幼虫感染模型将染色体靶向 cas9 噬菌粒递送到 S. flexneri 体内,从而显著减少细菌负荷并促进宿主存活。我们的研究强调了将基于 P1 噬菌体的递送与 CRISPR 染色体靶向系统相结合以实现 DNA 序列特异性细胞致死率和有效清除细菌感染的潜力。关键词:福氏志贺氏菌、P1 噬菌体、CRISPR-Cas9、抗菌、噬菌粒 ■ 简介
克隆载体是一种能够在宿主生物体内复制的 DNA 分子。将目标 DNA 引入该载体以产生重组 DNA 分子。大肠杆菌作为宿主生物,使用多种克隆载体。有时,需要使用不同的宿主进行克隆实验。因此,已经开发了基于其他细菌(如芽孢杆菌、假单胞菌、农杆菌等)和不同真核生物(如酵母和其他真菌)的各种克隆载体。不同类型的 DNA 分子可用作克隆载体,例如它们可能是质粒、噬菌体、粘粒、噬菌粒或人工染色体
Bioacademia Co.,Ltd。电话。06-6877-2335传真06-6877-2336 info@bioacademia.co.jp https://www.bioacademia.jp/
13)Numan,Z。,Venares,W.A。和Vimpenny,J.W.T。:在化学稳定生长过程中,有和没有质粒RP4的大肠杆菌菌株之间的竞争,CAN.J。Microbiol。,37 pp.509-512(1991)14)Helling,R.B。,Kenney,t。和Adams,J。:含质粒的生物的主要居民大肠杆菌,J.Gen.Microbiol.123 pp.129-141(1981)15)Melling,J.,Ellwood,D.C。和Robinson,A:Chemostat中的混合库中携带大肠杆菌的R因子的生存,FEMS Microbiol.Lett。,2 pp.87-89(1977)16)Jones,S.A。和Melling,R.B。:PBR322-相关质粒在化学抑制培养物中生长的大肠杆菌中的存在,FEMS Microbiol.lett。,22 pp.239-243(1984)
蛋白XPA在核苷酸切除修复途径中起关键作用。最近的实验工作表明,XPA的功能动力学涉及沿DNA的一维扩散以搜索损伤位点。在这里,我们使用各种盐浓度的广泛的粗粒分子模拟来研究所涉及的动力学过程。结果表明扩散机制的盐浓度依赖性很强。在低盐浓度下,与旋转耦合的一维扩散是主要机制。在高盐浓度下,三维机制的扩散变得更有可能。在较广泛的盐浓度下,涉及DNA结合的残基是相似的,并且沿DNA显示的XPA的一维扩散是降低功能。此亚延伸功能暂定归因于XPA – DNA相互作用的各种强度。另外,我们表明,与DNA的结合和盐浓度升高倾向于拉伸XPA的构象,从而增加了位点的暴露范围,以结合其他修复蛋白。
回顾了有关自噬在糖尿病(DM)和糖尿病相关的合并症中的有益和有害作用的目前文献发现。DM中口服降血糖药和自噬的作用。自噬还通过促进细胞存活或在生理环境中启动细胞死亡而在细胞稳态中起重要功能。尽管自噬保护了胰岛素靶组织,但自噬故障引起的细胞器失败会影响DM和其他代谢疾病。内质网和氧化应激增强了自噬水平,使调节压力引起的细胞内变化变得更容易。证据表明,当自噬过度刺激并组成式激活时,可能会发生自噬引起的细胞死亡,这可能预防或发展DM。尽管自噬在DM并发症中的确切作用尚不确定,但自噬机械的放松管制与β细胞破坏和DM的病因密切相关。因此,改善自噬功能障碍是治疗DM和其他代谢疾病的可能治疗目标。
摘要:神经退行性疾病的发作涉及病理机制的复杂相互作用,包括蛋白质聚集,氧化应激和自噬受损。本综述着重于神经退行性疾病中氧化应激与自噬之间的复杂联系,突出了自噬作为疾病发病机理的关键。活性氧(ROS)在细胞稳态和自噬调节中起双重作用,并破坏了氧化还原信号导致神经变性的氧化物。NRF2途径的激活代表了一种关键的抗氧化剂机制,而自噬通过降解改变的细胞成分来保持细胞稳态。p62/SQSTM1,NRF2和KEAP1之间的相互作用是细胞应激反应必不可少的调节途径,其失调会导致自噬和骨料积累受损。靶向NRF2 -P62/SQSTM1途径有望治疗干预,减轻氧化应激和保留细胞功能。此外,本综述探讨了内源性大麻素系统与NRF2信号传导的潜在协同作用。需要进一步的研究来阐明所涉及的分子机制并制定针对神经变性的有效治疗策略。