需要进行定量分析和模型,以将植物的细胞组织与其新陈代谢联系起来。但是,定量数据通常散布在多个研究中,发现此类数据并将其转换为有用的信息是耗时的。因此,有必要集中可用数据并突出其余的知识差距。在这里,我们提出了一种逐步的方法,可以从各种信息源中手动提取定量数据,并统一数据格式。首先,对拟南芥叶的数据进行了整理,检查了一致性和正确性,并通过交叉检查来源进行策划。第二,通过应用计算规则将定量数据组合在一起。然后将它们集成到代表Arabidopsis参考叶的独特综合,参考,可重复使用的数据汇编中。该地图集包含在细胞和亚细胞水平的叶片中发现的15种细胞类型的指标。
16单击“导出传播”,然后将此XML文件保存为QVN文件夹中的“ Quickn XML.xml”。*没有自动识别为.xml文件,因此需要将“ .xml”添加到名称的末尾。*单击“导出切片”,如果您需要地图集图像,但这对于工作流程不是必需的,并且会使您的文件夹混乱。
Hope A. Tanis是1:2.3.4,Anna S.E.1,2,3,5,5,Ben Weisbur 7,2,3,Angli Xue 12,13,Michael Gray 12.13和Andre L.M. Reiz 3,14,Jonathan Margoliash 15,John Marshall 1:2,3,Bakiris Vivian 3:14,12:14,Stuart I. Alexander 4.24 4.24,Owen M. Siggs 1,2,3,Hannah R.Nicholas 1:2,3,1:2,3,1:2,3,1:2,3,1:2,3,3,2,3,2,3,2,3,2.2,3,2,1,2,3,5,5,Ben Weisbur 7,2,3,Angli Xue 12,13,Michael Gray 12.13和Andre L.M. Reiz 3,14,Jonathan Margoliash 15,John Marshall 1:2,3,Bakiris Vivian 3:14,12:14,Stuart I. Alexander 4.24 4.24,Owen M. Siggs 1,2,3,Hannah R.Nicholas 1:2,3,1:2,3,1:2,3,1:2,3,1:2,3,3,2,3,2,3,2,3,2.2,3,2,1,2,3,5,5,Ben Weisbur 7,2,3,Angli Xue 12,13,Michael Gray 12.13和Andre L.M.Reiz 3,14,Jonathan Margoliash 15,John Marshall 1:2,3,Bakiris Vivian 3:14,12:14,Stuart I. Alexander 4.24 4.24,Owen M. Siggs 1,2,3,Hannah R.Nicholas 1:2,3,1:2,3,1:2,3,1:2,3,1:2,3,3,2,3,2,3,2,3,2.2,3,2,Reiz 3,14,Jonathan Margoliash 15,John Marshall 1:2,3,Bakiris Vivian 3:14,12:14,Stuart I. Alexander 4.24 4.24,Owen M. Siggs 1,2,3,Hannah R.Nicholas 1:2,3,1:2,3,1:2,3,1:2,3,1:2,3,3,2,3,2,3,2,3,2.2,3,2,
抽象背景。胶质母细胞瘤(GBM)患者的预后令人沮丧,并且需要新的治疗选择。本研究旨在确定GBM中的新治疗靶标。方法。从基因表达综合和癌症基因组地图集中收集了患者衍生的GBM(n = 1279)和正常脑组织(n = 46)样品的mRNA表达数据。功能基因组mRNA分析用于捕获基因组改变对基因表达水平的下游影响。接下来,进行了GBM和正常脑组织之间的类综合。基于(1)已知的与抗塑性药物的相互作用,(2)人类当前的药物发育状态以及(3)与已知参与GBM有关的生物学途径的关联,将GBM中显着上调的基因显着上调。抗塑性剂对优先靶标的抗肿瘤剂在体外和体内验证。结果。与正常脑组织相比,我们发现了712个GBM中的712个基因,其中27个与抗肿瘤剂具有已知相互作用。在包括EGFR和VEGFA在内的27个基因中有17个已在疗效有限的GBM中进行了临床评估。对于其余10个基因,RRM2,MAPK9(JNK2,SAPK1A)和XIAP在GBM开发中起作用。我们证明了MAPK9抑制剂RGB-286638在多个GBM细胞培养模型中的生存力丧失。尽管在体内未观察到总体生存益处,但有迹象表明RGB-286638可能会延迟肿瘤的生长。结论。MAPK9抑制剂RGB-286638显示出有希望的体外结果。此外,体内靶向促进研究和与这种化合物的组合疗法需要进一步探索。
资金:Burroughs Wellcome基金;丽塔·艾伦基金会;偏头痛研究基金会;爱德华兹(Edwards)疼痛研究中的博士生;巴里家庭哈佛干细胞研究所奖; Ninds U19NS130617; Ninds R01NS119476; Ninds U19NS130608; Ninds U19NS130607; NIDA DP1DA054343; NEI U01EY034709; Teva Pharmaceuticals;
摘要 - 胰腺导管腺癌(PDAC),占胰腺肿瘤的90%的占90%的特征,其预后不良,5年生存率仅为12%。大多数患者被诊断出患有转移性或局部晚期疾病,只有15%有资格进行治疗切除术。PDAC表现出对化学疗法,靶向疗法和免疫疗法的抗性,这主要是由于其高度异质性肿瘤微环境(TME)。在这项研究中,我们对公开可用的SCRNA,空间转录组学和批量RNA测序数据集进行了整合分析,以研究TME组成和肿瘤结构对PDAC进展,治疗反应,治疗反应和临床结果的影响。我们确定了具有不同细胞组成,功能特征和免疫调节性细胞 - 细胞相互作用的TME亚型。在空间上不同的细胞壁细分市场和基因模块揭示了原发性肿瘤和转移性病变的异质性。发现与患者生存相关的独特集群,为TME生物学及其临床意义提供了新的见解。这些发现强调了整合多摩管方法以揭示PDAC TME复杂性的重要性,并强调了其为治疗策略提供信息并改善患者结果的潜力。
1计算生物学计划,彼得·马卡卢姆(Peter MacCallum)癌症中心,澳大利亚维克帕克维尔市7 2呼吸道疾病,默多克儿童研究所,澳大利亚帕克维尔,帕克维尔,澳大利亚帕克维尔8 3 3 3墨尔本大学,帕克维尔大学,帕克维尔大学,维克,维克,维克,维克,澳大利亚9 4呼吸和睡眠医院澳大利亚VIC帕克维尔12 6 6 6墨尔本大学医学生物学系,澳大利亚帕克维尔大学,澳大利亚帕克维尔13 7 Garvan-Weizmann蜂窝基因组学中心,加尔万医学研究所,新南威尔士州悉尼14号,澳大利亚悉尼14 15 8 8 8 UNW Cellular Genomics Futures Institute,New South Wales,New Southney,New Sydney,Newne of Melbcoltion of Mer Berimol,16澳大利亚爵士。帕克维尔,维克,18澳大利亚19 10 10数学与统计学院,墨尔本大学,帕克维尔,维克,澳大利亚20 21 *同等22#通讯作者23
KMT5B的机制和人类神经发育的机制。 Sheppard,S.E。 ; Brying,L。; Wickramascaker,R.N。 ;疫苗接种,c。罗伯茨,b。简,J。; Hulen,J。;沃森(C.J.) ; Faunds,V。; duffourd,y。 Lee,P。;西蒙,M.C。 ; Cruz,X。 N。Patilla;弗洛雷斯·梅德(Flores-Mend); Akizu,n。;微笑,J。;来自R. Silva的Pellemino;仪式。;月,米;玫瑰,a。; Barcelo-Serts,i。 Choa,Z.X。 ; Lim,C.Y。 ;杜布格,c。日记,H。; Demurger,f。; Mulhern,M。;阿克曼,c。 Lippa,n。;安德鲁斯(M。); Baldridge,D。君士坦丁,J。;毛发,A。Van; Snoeck-streef,i。 Chow,P。; Hing,A。; J.M. Graham Jr ; au,m。; Faivre,L。; Shen,W。;毛。 J。Palubos; Viscope,d。; Gahl,W。; tifft,c。; Mamamara,E。; Hauser,n。; Miller,R。; Maffeo,J。; Afenjar,A。; Doummar,d。; Keren,b。 Arn,P。; Macklin-Mania,S。;消息,i。 Callewaert,b。对,a。; Zweier,c。; Brewer,C。; Saggar,A。; Smeland,M.F。 ;库马尔,阿吉斯; Elmslie,F。; Deshpand,c。很好,m。 Cogne,b。 Ierland,Y。Van;威尔克(M。); Slegtenst,M。Van;海岸Chhen,J.Y。 ;干燥,d。码头,d。 Wormanmann,S.B。 ; Kamstean,E.J。 ; Coch,J。; Haynes,d。;污染,L。; Tither,H。; Ranguin,K。; Pitch-Man,A.S。;韦伯,葬礼的佩雷斯,a。 Sanchez del Pozo,J。; J.M. Rosals ; Jose,P。;标准,K。;劳赫(Rauch) Mei,D。;玛丽,f。; Guerrini,r。 Lesin,J。; Tran Mau-Them,f。;菲利普,c。 Dauriat,b。雷蒙德(L. Raymond); Moutton,S。; Quiet-Gonzal,A.M。;火灾,T.Y。 ;朋友,c。格罗托(Grotto)肾脏,f。; Drive,T.G。 ;伊斯兰教。 Sidlik,J.A。 ;亨德森(L.B.)KMT5B的机制和人类神经发育的机制。Sheppard,S.E。 ; Brying,L。; Wickramascaker,R.N。 ;疫苗接种,c。罗伯茨,b。简,J。; Hulen,J。;沃森(C.J.) ; Faunds,V。; duffourd,y。 Lee,P。;西蒙,M.C。 ; Cruz,X。 N。Patilla;弗洛雷斯·梅德(Flores-Mend); Akizu,n。;微笑,J。;来自R. Silva的Pellemino;仪式。;月,米;玫瑰,a。; Barcelo-Serts,i。 Choa,Z.X。 ; Lim,C.Y。 ;杜布格,c。日记,H。; Demurger,f。; Mulhern,M。;阿克曼,c。 Lippa,n。;安德鲁斯(M。); Baldridge,D。君士坦丁,J。;毛发,A。Van; Snoeck-streef,i。 Chow,P。; Hing,A。; J.M. Graham Jr ; au,m。; Faivre,L。; Shen,W。;毛。 J。Palubos; Viscope,d。; Gahl,W。; tifft,c。; Mamamara,E。; Hauser,n。; Miller,R。; Maffeo,J。; Afenjar,A。; Doummar,d。; Keren,b。 Arn,P。; Macklin-Mania,S。;消息,i。 Callewaert,b。对,a。; Zweier,c。; Brewer,C。; Saggar,A。; Smeland,M.F。 ;库马尔,阿吉斯; Elmslie,F。; Deshpand,c。很好,m。 Cogne,b。 Ierland,Y。Van;威尔克(M。); Slegtenst,M。Van;海岸Chhen,J.Y。 ;干燥,d。码头,d。 Wormanmann,S.B。 ; Kamstean,E.J。 ; Coch,J。; Haynes,d。;污染,L。; Tither,H。; Ranguin,K。; Pitch-Man,A.S。;韦伯,葬礼的佩雷斯,a。 Sanchez del Pozo,J。; J.M. Rosals ; Jose,P。;标准,K。;劳赫(Rauch) Mei,D。;玛丽,f。; Guerrini,r。 Lesin,J。; Tran Mau-Them,f。;菲利普,c。 Dauriat,b。雷蒙德(L. Raymond); Moutton,S。; Quiet-Gonzal,A.M。;火灾,T.Y。 ;朋友,c。格罗托(Grotto)肾脏,f。; Drive,T.G。 ;伊斯兰教。 Sidlik,J.A。 ;亨德森(L.B.)Sheppard,S.E。; Brying,L。; Wickramascaker,R.N。;疫苗接种,c。罗伯茨,b。简,J。; Hulen,J。;沃森(C.J.); Faunds,V。; duffourd,y。 Lee,P。;西蒙,M.C。; Cruz,X。 N。Patilla;弗洛雷斯·梅德(Flores-Mend); Akizu,n。;微笑,J。;来自R. Silva的Pellemino;仪式。;月,米;玫瑰,a。; Barcelo-Serts,i。 Choa,Z.X。; Lim,C.Y。;杜布格,c。日记,H。; Demurger,f。; Mulhern,M。;阿克曼,c。 Lippa,n。;安德鲁斯(M。); Baldridge,D。君士坦丁,J。;毛发,A。Van; Snoeck-streef,i。 Chow,P。; Hing,A。; J.M. Graham Jr; au,m。; Faivre,L。; Shen,W。;毛。 J。Palubos; Viscope,d。; Gahl,W。; tifft,c。; Mamamara,E。; Hauser,n。; Miller,R。; Maffeo,J。; Afenjar,A。; Doummar,d。; Keren,b。 Arn,P。; Macklin-Mania,S。;消息,i。 Callewaert,b。对,a。; Zweier,c。; Brewer,C。; Saggar,A。; Smeland,M.F。;库马尔,阿吉斯; Elmslie,F。; Deshpand,c。很好,m。 Cogne,b。 Ierland,Y。Van;威尔克(M。); Slegtenst,M。Van;海岸Chhen,J.Y。;干燥,d。码头,d。 Wormanmann,S.B。; Kamstean,E.J。; Coch,J。; Haynes,d。;污染,L。; Tither,H。; Ranguin,K。; Pitch-Man,A.S。;韦伯,葬礼的佩雷斯,a。 Sanchez del Pozo,J。; J.M. Rosals; Jose,P。;标准,K。;劳赫(Rauch) Mei,D。;玛丽,f。; Guerrini,r。 Lesin,J。; Tran Mau-Them,f。;菲利普,c。 Dauriat,b。雷蒙德(L. Raymond); Moutton,S。; Quiet-Gonzal,A.M。;火灾,T.Y。;朋友,c。格罗托(Grotto)肾脏,f。; Drive,T.G。;伊斯兰教。 Sidlik,J.A。;亨德森(L.B.); Hennessy,L。; Raper,A。;父母,我。 Caiser,F.J。;有时,一个。布克,Ø.L。; Juusola,J。;人,r。 Schnur,R.E。; Vitobello,A。;银行; Bhoj,E.J。; Stepman,H.A.F。2023,文章 /编辑(Adventure Science,9,10,(2023),pp。EADE1463,第1463条)
神经外科,结构和功能连接实验室项目,Azienda Provinciale Per I Servizi Sanitari(APSS),9 Largo Medaglie D'Oro,38122,Trento,Trento,意大利BTRENALO B,ITALY B TRENTO B,NEUROSER GURIGY和NEURORGIGY和NEURELOGRY和NEURELOGY和NEURELOGY和NEURELOGY和NEURELOGY,NERURELOGY和NEURELOGY,NERTERINGER UNIVEMENT,NORTHWESTERN UNIXICY神经外科手术室,神经科学和神经康复部,BambinoGesù儿童医院IRCCS,4 Piazza Sant'Onofrio,00165,00165,意大利d Bruno Kessler Foundation(FBK)法国蒙彼利埃,国家健康与医学研究所(INSERM),U1051,“中枢神经系统的可塑性,人类干细胞和神经胶质肿瘤”,蒙彼利埃大学医学中心蒙彼利埃神经科学研究所,80 AV AVERTIN FLICHE,MONTPELLIER,MONTPELLIER,FRANCE,FRANCE