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基因芯片系统 3000
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建立三克taqman定量实时PCR测定法，用于同时检测马赛克病毒，odontoglossum ringspot病毒和Cymbidium ringspot病毒
兰花是重要的观赏植物，其病毒感染会导致大量经济损害。Cymbidium Mosaic病毒（Cymmv），Odontoglossum Ringspot病毒（ORSV）和Cymbidium Ringspot病毒（CYMRSV）代表三种重要且普遍存在的兰花病毒。本研究中提出的检测系统使用三QMAN定量实时PCR测定法以同时方式识别CYMMV，ORSV和CYMRSV。我们为Cymmv，ORSV和CYMRSV设计了特定的引物和探针，分别为156 bp，148 bp和145 bp的放大序列。cymmv和cymrsv的三重QRT-PCR分析的最小检测极限为1拷贝/测定，最小检测极限为ORSV的10副本/测定。CYMMV，ORSV和CYMRSV的最小稳定检测极限分别为10、10 2和10 2拷贝/分析。因此，该系统比RT – PCR具有更高的灵敏度（约10至10 4倍）。CQ值的内部和跨间隙CV分别小于0.55和0.95％，这表明三重测定法是高度可靠且准确的。此外，使用已建立的测定和基因芯片分析了来自五个不同兰花属的66个样品。检测结果表明，与基因芯片相比，三重探针QRT-PCR具有更高的灵敏度，表明可以将三重实时PCR分析用于检测现场样品。我们的发现表明，三元实时RT – PCR检测系统代表了一种快速，简单，准确的工具，用于在兰花上检测Cymmv，ORSV和CYMRSV。
1型糖尿病运动诱发延迟性低血糖的机制阐明
虽然STZ大鼠和CON+EX大鼠运动前后（0 h～5 h）血糖水平差异不显著，但STZ+EX大鼠运动3 h血糖水平显著低于STZ组（P < 0. 05）。在骨骼肌中，CON和STZ组在1 h时Akt磷酸化水平和GLUT 4易位均显著升高，3 h内降至可忽略的水平，而在STZ+EX组中，Akt磷酸化水平和GLUT 4易位维持至5 h，提示STZ+EX组糖代谢持续。基因芯片分析显示，本研究共发现447个胰岛素信号基因和79个1型糖尿病基因，并筛选出3个可能与GLUT 4调控有关的基因，尤其是制瘤素M（Osm）和信号转导和转录激活因子3（STAT 3）在STZ+EX组运动后3 h和5 h均有升高。
CPVL 通过与 BTK/p300 轴相互作用，抑制 STAT1 通路，促进神经胶质瘤进展
简介 胶质瘤是成人中最常见的原发性脑肿瘤之一，也是最具侵袭性和致命性的人类癌症类型之一（1-3）。世界卫生组织（WHO）将胶质瘤分为 4 级：I-IV（4）。尽管早期检测取得了进展，但大多数患者在诊断时为 IV 级胶质母细胞瘤（GBM）；因此，这些患者的预后仍然不佳（5，6）。GBM 的中位生存期仅为诊断后的 12-15 个月（7）。GBM 的治疗方案仍存在未满足的需求（8）。尽管人们付出了巨大努力来识别对胶质瘤细胞侵袭和增殖至关重要的分子，但迄今为止，对它们的表征却非常少（9-11）。越来越多的证据表明，抑制胶质瘤细胞凋亡是导致致瘤性增加的早期事件（12，13）。因此，鉴定潜在的早期诱导凋亡生物标志物对提高胶质瘤的诊断和预后评估具有重要的临床价值（14）。基因芯片和微阵列表达谱技术在过去十年中得到了广泛的应用，可以快速比较不同样本中大量基因的表达水平，使其适用于基因筛选（15）。在本研究中，通过微阵列表达谱筛选出了CPVL（羧肽酶，卵黄生成样）。CPVL是一种丝氨酸羧肽酶，首次在人类巨噬细胞中被鉴定（16）。CPVL是在利用差异显示PCR寻找人类巨噬细胞限制基因的过程中首次克隆和鉴定的（16）。CPVL在脾脏、胎盘、心脏和肾脏等各种组织中均有明显表达（17，18）。然而，CPVL在包括胶质瘤在内的各种肿瘤中的作用至今仍不清楚。
miR-455-3p具有前列腺癌外周血中PSA的诊断潜力较高
前列腺癌（PCA）是全球男性尿液系统中常见的恶性肿瘤之一，其发病率和死亡率逐年增加[1]。更糟糕的是，通常发生骨转移和复发，这使预后较差[2]。PCA的基本诊断包括直肠数字检查检测，血清前列腺植物抗原（PSA）检测，活检分析和组织学分析[3]。但是，很难通过这些方法来验证PCA的进展和非正常增生[4，5]。在细胞性的PSA结果中易受药物，炎症和良性前列腺病变的影响，导致PCA预后缺乏特异性和敏感性[6]。因此，找到新的临床诊断标记至关重要。microRNA（miRNA）是具有高保守性的单链非编码RNA。它们的长度约为18至22个核苷酸[7]。miRNA通过与Messenger RNA（mRNA）的3'未翻译区（UTR）中的序列结合而干扰蛋白质的翻译，从而降低了mRNA的稳定性或抑制跨文本基因的表达[8]。参与各种生理过程，例如细胞增殖和凋亡，在疾病中起着重要的调节作用，并且与各种肿瘤的发生密切相关[9-11]。近年来，循环miRNA作为各种疾病的诊断标记，由于其在监测方面的便利性[12-14]。但是，关于生物标志物的研究仍然不足。研究表明，循环miRNA是PCA诊断的互补候选生物标志物。随着测序技术的发展，生物信息学已被用来探索基因水平上各种疾病的病理机制。基因表达综合（GEO）数据库是一种在线基因芯片数据库的基因表达数据库[15]。基因图和微阵列用于筛选差异表达的miRNA（demirnas）和基因。本研究通过两个GEO数据集的相互作用分析确定了一个共同的目标miR-455-3p。然后分析 miR-455-3p与PCA中的临床特征的相关性，并用临床样品验证。进一步预测了miR-455-3p的下游结合基因。最后，为靶基因构建了蛋白质 - 蛋白相互作用（PPI）网络，并进行了基因和基因组（KEGG）途径分析的京都百科全书。
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arr(X,Y)x1,(1-22)x2 全基因组染色体 SNP 微阵列 (Reveal) 分析正常。根据下文所述的本报告标准，在 277 万个区域特异性 SNP 和结构靶标中未检测到显著的 DNA 拷贝数变化或拷贝中性区域。当发现新的临床重要基因时，可以根据要求重新检查档案记录。方法：使用 Cytoscan ® HD Accel 平台进行 SNP 微阵列分析，该平台使用 2,029,441 个非多态性拷贝数探针和 743,130 个 SNP 探针进行 LOH/AOH 分析和关系评估。该阵列的平均基因内间距为 0.818 kb，平均基因间距为 1.51 kb。从提供的样本类型中提取总基因组 DNA，用 Xce1 消化，然后连接到 Xce1 接头。纯化并定量 PCR 产物。将纯化的 DNA 破碎，用生物素标记，并与 Cytoscan ® HD Accel 基因芯片杂交。使用染色体分析套件分析数据。分析基于 GRCh37/hg19 组装。此测试由 LabCorp 开发并确定其性能特征。它尚未获得食品和药物管理局的批准或认可。阳性评价标准包括：* DNA 拷贝数损失 >200 kb 或在具有至少一个 OMIM 基因的已知临床重要区域之外增加 >500 kb。* DNA 拷贝数增加/损失在或包括已知 25 kb 或更大的临床重要基因内。* 如果患者结果显示单个染色体中存在 >20 Mb 间质或 >10 Mb 端粒的长连续纯合区域（印迹染色体分别为 15 和 8 Mb），则建议进行 UPD 测试。 * 如果一个区域的连续纯合性大于 8 Mb，但低于 UPD 报告标准，则报告为隐性疾病风险增加。 * 多条染色体内连续纯合性大于 8 Mb 表明存在共同祖先。这些区域具有潜在的隐性等位基因风险。 * 由于存在大量连续的短片段（与地理或社会有限的基因库相关），报告在第 99 个百分位处存在高水平的等位基因纯合性。 SNP 染色体微阵列无法检测： * 真正平衡的染色体变异 * 序列变异