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CRISPR-CasとOMEGashisutemuの分子基盘 - 生化学
202. 3) Wang, JY, Tuck, OT, Skopintsev, P., Soczek, KM, Li, G., Al-Shayeb, B., Zhou, J., & Doudna, JA (2023) 通过 CRISPR 修剪器整合酶进行基因组扩展。Nature，618，855 ‒ 861。4) Wang, JY, Pausch, P., & Doudna, JA (2022) CRISPR-Cas 免疫和基因组编辑酶的结构生物学。Nat. Rev. Microbiol. , 20 , 641 ‒ 656。5) Anzalone, AV、Randolph, PB、Davis, JR、Sousa, AA、Ko-blan, LW、Levy, JM、Chen, PJ、Wilson, C.、Newby, GA、Raguram, A. 等人 (2019) 无需双链断裂或供体 DNA 的搜索和替换基因组编辑。Nature，576，149 ‒ 157。6) Mehta, J. (2021) CRISPR-Cas9 基因编辑用于治疗镰状细胞病和β地中海贫血。N. Engl. J. Med.，384，e91。 7) Kapitonov, VV, Makarova, KS, & Koonin, EV (2015) ISC，一组编码 Cas9 同源物的新型细菌和古细菌 DNA 转座子。J. Bacteriol. ，198，797 ‒ 807。8) Altae-Tran, H., Kannan, S., Demircioglu, FE, Oshiro, R., Nety, SP, McKay, LJ, Dlakić, M., Inskeep, WP, Makarova, KS, Macrae, RK, et al. (2021) 广泛分布的 IS200/IS605 转座子家族编码多种可编程的 RNA 引导的核酸内切酶。 Science , 374 , 57 œ 65。9) Weinberg, Z., Perreault, J., Meyer, MM, & Breaker, RR (2009) 细菌宏基因组分析揭示的特殊结构化非编码 RNA。Nature , 462 , 656 œ 659。10) Hirano, S., Kappel, K., Altae-Tran, H., Faure, G., Wilkinson, ME, Kannan, S., Demircioglu, FE, Yan, R., Shiozaki, M., Yu, Z., et al. (2022) OMEGA 切口酶 IsrB 与 ω RNA 和靶 DNA 复合的结构。 Nature , 610 , 575 œ 581。11) Biou, V., Shu, F., 和 Ramakrishnan, V. (1995) X 射线晶体学显示翻译起始因子 IF3 由两个通过 α 螺旋连接的紧凑的 α/β 结构域组成。EMBO J. , 14 , 4056 œ 4064。12) Schuler, G., Hu, C., 和 Ke, A. (2022) IscB-ω RNA 进行 RNA 引导的 DNA 切割的结构基础以及与 Cas9 的机制比较。 Science，376，1476 ‒ 1481。13) Bravo, JPK、Liu, MS、Hibshman, GN、Dangerfield, TL、Jung, K.、McCool, RS、Johnson, KA 和 Taylor, DW (2022) CRISPR-Cas9 错配监测的结构基础。Nature，603，343 ‒ 347。14) Aliaga Goltsman, DS、Alexander, LM、Lin, JL、Fregoso Ocampo, R.、Freeman, B.、Lamothe, RC、Perez Rivas, A.、Temoche-Diaz, MM、Chadha, S.、Nordenfelt, N. 等人 (2022) 从未培养的微生物中发现用于基因组编辑的紧凑型 Cas9d 和 HEARO 酶。Nat. Commun. ，13，7602。
PAA1基因在酿酒酵母中的褪黑激素生物合成中的作用：搜索新的芳基烷基胺N-乙酰基转移酶
摘要：最近，发酵饮料中褪黑激素的存在与酒精发酵过程中的酵母代谢有关。褪黑激素最初被认为是脊椎动物的松果腺的独特产物，在广泛的无脊椎动物，植物，细菌和真菌中也被鉴定出来。这些发现带来了研究褪黑激素在酵母中的功能以及其合成的机制的挑战。但是，提高发酵饮料中这种有趣分子的选择和生产的必要信息是披露代谢途径中涉及的基因。到目前为止，仅提出了一个基因，该基因参与了酿酒酵母中的褪黑激素的产生，PAA1，一种多胺乙酰基转移酶，这是脊椎动物的Aralkylamine N-乙酰基转移酶（AANAT）的同源物。在这项研究中，我们使用不同的蛋白质表达平台评估了不同可能底物的生物转化，例如5-甲氧氨基胺，色氨酸和5-羟色胺，评估了PAA1的体内功能。此外，我们通过结合全局转录组分析和使用强大的生物信息学工具来预测S. cerevisiae中的Aanat的类似域，从而扩展了对新的N-乙酰基转移酶候选的搜索。候选基因的AANAT活性通过大肠杆菌中的过表达来验证，因为奇怪的是，该系统证明了比其自己宿主的酿酒酵母中的过表达更高的差异。我们的结果证实了PAA1具有乙酰化不同的芳基胺的能力，但AANAT活性似乎不是主要的乙酰化活性。我们还证明，PAA1P并不是这种AANAT活性的唯一酶。我们对新基因的搜索在酿酒酵母中检测到HPA2是一种新的芳基烷基胺N-乙酰基转移酶。这是第一个报告，清楚地证明了该酶参与AANAT活性。
游离胺引导的烯烃双官能团化
胺是有机合成和药物化学中的关键功能团。游离胺和氮杂环在许多具有生物活性的小分子中普遍存在。1 此外，由于其亲核特性，游离胺通常用作有机合成中的化学投入物，包括许多成熟的反应，例如 SN 2 加成、还原胺化、酰胺偶联和 Buchwald-Hartwig 胺化。2–4 二胺是一个特别受重视的子类，因为它们在药物、配体和有机催化剂方面具有独特的应用。5 因此，从简单的起始材料制备结构复杂且取代不同的二胺的新策略在学术界和工业界都很有价值。在此背景下，我们寻求开发一种方法，将各种简单的烯基胺（一级或二级）（一类易于获取的起始材料）直接转化为不同功能化的二胺，其中预先存在的胺通过催化胺化 1,2-双功能化指导第二个胺的安装。近年来，定向三组分烯烃双功能化已成为一种有效的策略，可从简单的化学输入中选择性合成高度取代、多功能和立体化学定义的产品（方案 1A）。在这种情况下，成功的基于胺的导向基团包括基于双齿导向助剂的基团。6-8 和单齿保护基（例如酰胺和磺酰胺）（方案 1B）。 9 在这些情况下，将吸电子基团连接到胺上至关重要，因为它会减弱布朗斯台德和路易斯碱度，从而降低其干扰催化的能力。虽然这种方法本身很有价值，但当需要相应的游离胺产物时，需要两个额外的步骤进行保护和脱保护。此外，除了极少数例外，9h 这些导向基团不能直接进行 N 官能化，需要进一步操作才能安装所需的 N -烷基或 N -芳基取代基。因此，
药物名称：比卡鲁胺
禁忌症： • 不适用于女性 1 注意： • 高剂量比卡鲁胺（如每日 150 毫克）不建议用于局限性前列腺癌患者，否则将接受密切观察或主动监测，因为这种剂量与死亡率增加有关；请参阅患者接受治疗的方案 1,4,5 • 有心脏病史、心血管危险因素、长 QT 综合征、电解质异常、充血性心力衰竭或同时服用其他 QT 延长药物的患者可能会增加发生心血管副作用的风险 1 • 无论患者是否有糖尿病，联合雄激素剥夺疗法都可能导致血糖耐受量降低和/或糖化血红蛋白 (HbA1c) 降低；在开始治疗前评估血糖和/或 HbA1c 1 • 睾酮抑制会导致贫血；在开始治疗前评估贫血风险 1 • 长期联合雄激素剥夺疗法会增加骨质疏松症和骨折的风险；评估具有骨矿物质含量和/或骨量下降重大风险因素的患者的治疗益处 1 致癌性：根据动物研究，此药对人类没有致癌潜力。1,4 致突变性：在 Ames 试验或哺乳动物体内和体外突变试验中无致突变性 1,4 生育力：在动物研究中，在高于人类临床暴露后的暴露量下发生了睾丸萎缩和精子发生抑制。动物受试者的交配间隔和成功交配时间也有所增加，但未观察到对成功交配后生育力的影响。这些影响在最后一次给药后 7 周内是可逆的。基于这些影响，应假设接受治疗的人类男性会出现一段时间的生育力低下或不育症。在雌性测试动物中，在高于人类临床暴露后的暴露量下发生了发情周期不规律，但未观察到对雌性生育力的影响。 1,4 怀孕：在动物研究中，在暴露量低于人类临床暴露量的情况下，接受治疗的雌性后代的雄性后代中观察到阳痿、肛门生殖器距离缩短和导致尿道下裂的女性化。在接受治疗的雌性后代中观察到怀孕率降低。基于这些影响，有育龄女性伴侣的男性患者应在治疗期间和最后一次给药后的 130 天内采取有效的避孕措施。1,4 不建议母乳喂养，因为可能会分泌到母乳中。在动物研究中，在母乳中检测到了比卡鲁胺。1
比卡鲁胺患者.pdf
虽然这可能不直接适用于您，但如果您的伴侣有可能怀孕，您和您的伴侣必须：► 在服用此药的同时使用 2 种有效的避孕方法。除非您的医疗团队另有指示，否则请在最后一次服药后至少 130 天内继续使用避孕措施。与您的医疗团队交谈，找出最适合您和/或您伴侣的方法。如果您的伴侣在您接受比卡鲁胺治疗期间怀孕或怀孕，请告知您的医疗团队。此药可能会影响生育能力（让您的伴侣怀孕的能力）。
第63届实践研讨会“人工智能基础”
第63届实践研讨会“人工智能的基础”主办方：日本岩土工程学会关西支部（公益社团法人）岩土工程领域ICT应用推进研究委员会近年来，人工智能渗透到各个领域，越来越趋向实用化。然而现实情况是，很多人对于如何实现人工智能知之甚少。 因此，今年的实践研讨会主要针对那些从未研究过人工智能的人，以及那些在工作中负责人工智能但对其实现方式不太熟悉的人。它将包括帮助学生了解人工智能基础知识的讲座，以及使用人工智能对岩石标本进行分类的实践练习。通过练习，你将学习如何设置 Python 环境、如何运行它以及如何评估结果。本内容以推进岩土工程领域ICT应用研究委员会举办的AI研究会为基础。我们期待您的参与。 时间：2021 年 9 月 14 日（星期二）举办方式：关西大学 100 周年纪念馆特别会议室（根据新冠肺炎疫情形势，研讨会将通过 Zoom 在线举行）（大阪府吹田市山手町 3-3-35）交通方式：从阪急“关大前”站南口步行约 3 分钟详情请参阅 http://www.jgskb.jp/japanese/gyoujipdf/2021/20210914jitugi-seminar_kaijou.pdf 内容
胺与金纳米粒子的相互作用
了解胺与金纳米粒子表面之间的相互作用非常重要，因为它们在稳定纳米系统、形成蛋白质冠层以及制备半合成纳米酶方面发挥着重要作用。通过使用荧光光谱、电化学、X 射线光电子能谱、高分辨率透射电子显微镜和分子模拟，可以详细了解这些相互作用。本文表明，胺与纳米粒子表面 Au(0) 原子相互作用，其孤电子对的强度与校正空间位阻后的碱度呈线性相关。结合动力学取决于金原子的位置（平面或边缘），而结合模式涉及单个 Au(0) 和位于其上方的氮。一小部分仍然存在的表面 Au(I) 原子被胺还原，产生更强的 Au(0)-RN。 +（RN . ，失去一个质子后）相互作用。在这种情况下，结合模式涉及两个 Au(0) 原子，它们之间有一个桥接氮。当蛋白质参与（至少部分参与）金离子的还原时，可以更好地获得稳定的金纳米粒子，就像稳健的半合成纳米酶制备所需的那样。
探索胺化学：合成... -IJRPR
6。跨学科的整合与协作：整合来自不同学科的见解，包括化学，生物学，材料科学和环境科学，对于应对胺研究中的复杂挑战至关重要。在不同领域具有专业知识的研究人员之间的合作努力可以促进为跨学科问题的整体解决方案的发展。但是，跨学科的有效合作和沟通仍然是一个挑战，需要努力弥合学科界限并促进解决这些问题的知识交流，需要跨学科的研究人员的合作努力，综合和表征的创新方法，以及对可持续性和社会影响的承诺。通过应对这些挑战，研究人员可以提高我们对胺的理解，并利用他们满足关键科学和社会需求的潜力。
多胺的遗传编码的荧光报告
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证（未经同行评审证明）获得的是作者/资助者，他授予Biorxiv授予Biorxiv的许可，以永久显示预印本。这是该版本的版权持有人，该版本于2024年8月26日发布。 https://doi.org/10.1101/2024.08.24.609500 doi：Biorxiv Preprint