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cRISPR靶向H3K4ME3激活基因表达并解锁拟南芥中的丝粒跨界重组
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证。根据作者/资助者提供了预印本（未经同行评审的认证）提供的，他已授予Biorxiv的许可证，以在2025年2月8日发布的此版本中在版权所有者中显示预印本。 https://doi.org/10.1101/2025.02.07.636860 doi：Biorxiv Preprint
使用 ESCORT 试剂将 Bacmid DNA 转染到 SF9 细胞中
*此程序专门适用于转染源自 Bac-to-Bac 系统 (Invitrogen) 的杆粒 DNA。我们使用的杆粒 DNA 通常使用标准小量制备程序生成，如 Bac-to-Bac 用户手册中所述。我们发现使用商用小量制备试剂盒或柱子没有好处。
附录 A. 分析论文列表
1.B.1. 使用遗传算法进行监督学习的有效特征选择（Hilda & Rajalaxmi，2015） 1.B.2. PHGA：用于二元分类特征选择的混合遗传算法（Khiabani & Sabbaghi，2017） 1.B.3. 使用改进的遗传算法和经验模态分解进行 ECG 信号处理的特征选择（Anderson，2015） 1.B.4. 用于支持向量机同时进行模型和特征选择的多目标遗传算法（Bouraoui、Jamoussi & BenAyed，2018） 1.B.5. 基于遗传算法的亲属关系验证特征选择（Alireza-zadeh、Fathi & Abdali-Mohammadi，2015） 1.B.6. 1.B.1. 基于遗传算法和粒子群优化混合的特征选择 (Ghamisi & Benediktsson, 2015) 1.B.2. 基于遗传算法和粒子群优化混合的特征选择 (Ghamisi & Benediktsson, 2015) 1.B.3. 基于遗传算法和粒子群优化混合的特征选择 (Ghamisi & Benediktsson, 2015) 1.B.4. 基于遗传算法和粒子群优化混合的特征选择 (Ghamisi & Benediktsson, 2015) 1.B.5. 基于遗传算法和粒子群优化混合的特征选择 (Ghamisi & Benediktsson, 2015) 1.B.6. 基于遗传算法和粒子群优化混合的特征选择 (Ghamisi & Benediktsson, 2015) 1.B.7. 基于遗传算法的特征选择结合双重分类用于增生性糖尿病视网膜病变的自动检测 (Welikala, Fraz, Dehmeshki, Hoppe, Tah, Mann, Williamson, & Barman, 2015b) 1.B.8. 基于增强遗传算法的混合特征选择用于文本分类 (Ghareb, Bakar, & Hamdan, 2016) 1.B.9. DWFS：一种基于并行遗传算法的包装器特征选择工具 (Soufan, Kleftogiannis, Kalnis, & Bajic, 2015) 1.B.10.基于遗传算法的特征选择方法用于高效的文本聚类和文本分类 (Hong, Lee, & Han, 2015) 1.B.11. 具有积极突变的遗传算法用于 BCI 特征空间中的特征选择 (Rejer, 2015)
开发针对巨噬细胞和中性粒细胞的杀微生物反应的新型宿主疗法，以对抗细菌的抗菌素耐药性
抗菌疗法是针对细菌病原体的化疗的主要组成部分。然而，由于抗菌素耐药性的出现，这种策略的有效性受到越来越多的挑战，目前这种策略的持续应用受到威胁。人类和动物不断接触细菌，并已开发出有效的策略来控制涉及先天和适应性免疫反应的病原体。先天免疫系统对病原体处理受损是细菌感染易感性的关键决定因素。然而，尽管进行了广泛的研究，但这种反应的基本组成部分，特别是那些可以重新校准以改善宿主防御的组成部分，仍然难以捉摸。我们提供了一份简短的评论，重点关注针对巨噬细胞和中性粒细胞的杀微生物反应的治疗靶向性，以减轻对抗菌疗法的依赖。我们重点介绍了指向潜在目标和疗法的临床前和临床数据。我们建议，应特别注意开发针对宿主的治疗策略，以增强髓系吞噬细胞中“少量炎症”微生物的杀灭作用，从而最大限度地清除病原体，同时最大限度地减少炎症反应的有害后果。我们还建议，通过模型开发和比较医学，在开发基于宿主的方法时，One Health 方法非常重要，这有助于我们了解如何实施这一策略。
卡博替尼可有效将载中性粒细胞的纳米颗粒靶向递送至小鼠前列腺肿瘤
。CC-BY 4.0 国际许可，根据 提供（未经同行评审认证）是作者/资助者，他已授予 bioRxiv 永久展示预印本的许可。它是此预印本的版权持有者，此版本于 2020 年 4 月 14 日发布。；https://doi.org/10.1101/2020.04.13.037531 doi：bioRxiv 预印本
将centromeres塑造以抵抗有丝分裂的纺锤力
中心粒是动力学的结合位点，对于整个细胞分裂的染色体的忠实隔离至关重要。酵母中的点丝粒由约115 bp的特异性DNA序列编码，而区域的丝粒范围从裂变酵母中的6 - 10 kbp到人类的5 - 10 Mbp。了解中心粒染色质的物理结构（酵母中的圆锥体），定义为姐妹动物学之间的染色质，将提供基本的见解，以了解如何将Centromere DNA编织成僵硬的弹簧，该弹簧能够在有点裂期间能够抵抗微管拉力。围粒粒粒的一个标志是染色体（SMC）蛋白凝聚蛋白和冷凝蛋白的结构维持的富集。基于种群方法的研究（CHIP-SEQ和HI-C）以及实验获得的荧光粒结构的荧光探针图像，以及模拟与实验结果之间的定量比较，我们提出了一种建立姐妹动物学菌之间张力的机制。我们提出，丝粒是一种染色质瓶洗，是通过环状侵入蛋白冷凝蛋白和粘着素而组织的。由于径向环之间的空间排斥力，瓶颈布置提供了一种生物物理手段，可以将周围质粒染色质转化为弹簧。我们认为，瓶刷是染色体组织的组织原则，该原理已从该领域的多种方法中出现。
使用粒子群优化算法实现并网住宅太阳能发电系统的日前最优能源调度
摘要 本文提出了并网住宅光伏系统的日前优化能源调度技术，以符合电价并优化家庭运营效益。该解决方案被视为优化问题，目标是最大化家庭能源效益，优化变量是电力调度率，即出售给电网的光伏电力与供应负载后的额外光伏能源之比。之后，使用粒子群优化 (PSO) 解决公式化的非线性优化问题。使用位于尼泊尔拉利特布尔的典型并网太阳能供电系统（具有太阳能光伏系统和电池储能系统）进行验证分析。研究结果表明，建议的能源调度策略与启发式优化方法相结合，可成功实现多种能源的优化能源调度，从而在分时电价下实现财务效益最大化。
利用 CRISPR-Cas9 多重编辑 α-淀粉酶/胰蛋白酶抑制剂基因以减少硬粒小麦中的过敏原蛋白
小麦及其衍生食品分布广泛，是全球主要食物来源之一。在过去几十年中，与小麦有关的疾病发病率已成为人类面临的全球性问题，这可能与小麦衍生食品的传播有关。已确定结构和代谢蛋白，如 α-淀粉酶/胰蛋白酶抑制剂 (ATI)，与小麦过敏（面包师哮喘）和非腹腔性小麦敏感症 (NCWS) 的发病有关。ATI 是一组外源性蛋白酶抑制剂，由分散在硬粒小麦和面包小麦的几条染色体上的多基因家族编码。WTAI-CM3 和 WTAI-CM16 亚基被认为是与面包师哮喘和可能的 NCWS 发病有关的主要蛋白质。使用 CRISPR-Cas9 多路复用策略编辑意大利硬粒小麦品种 Svevo 的谷粒中的 ATI 亚基 WTAI-CM3 和 WTAI-CM16，目的是生产出具有减少不良反应中潜在过敏原数量的小麦品系。使用无标记基因方法，即在不使用选择剂的情况下再生植物，直接从 T 0 代获得没有 CRISPR 载体的纯合突变植物。与传统育种计划相比，这项研究证明了 CRISPR 技术能够在更短的时间内敲除免疫原性蛋白质。在分子（测序和基因表达研究）或生化（免疫学测试）水平上确认了对两个目标基因的编辑。值得注意的是，作为一种多效性效应，编辑品系中的 ATI 0.28 假基因被激活。
如何引用本文：Murat Arican，Kemal Polat（2020）。基于二进制粒子群优化（BPSO）的EEG信号通道选择及其
近年来，国家支持的项目试图提高残疾人的社会参与度。然而，即使是患有运动神经元疾病 (MND)、全滑行状态 (TSD) 等神经肌肉疾病的人，其沟通能力也会受到干扰。脑机接口 (BBA) 已有几十年的历史，研究数量呈指数级增长，目前正在开发中，以使患有此类疾病的人能够与周围环境进行交流。拼写系统是 BBA 系统，它可以检测人们在屏幕上的字母和数字矩阵上关注的字母，并通过应用程序将其转换为文本。在这种情况下，通过屏幕上字母的随机闪烁，它旨在检测由于刺激而导致大脑中发生的电变化。研究表明，个体遇到的刺激会导致 EEG 信号中出现一个振幅，称为 P300，介于 250 到 500 毫秒之间。脑机接口通过 EEG 信号为因中风或神经退行性疾病而行动受限的个体提供环境互动。 EEG 信号的多通道结构既增加了系统成本，又降低了处理速度。因此，通过在过程中检测更多活动电极来降低系统成本，可以提高人们的可访问性。在此背景下，在电极选择中使用优化技术，通过随机选择方法确定最有效的通道。在研究中，使用基于群体的优化技术之一的粒子群优化算法与两个分类器（SVM 和 Boosted Tree）一起使用，并确定了八个最常选择的通道，以提高系统在速度和准确性方面的性能。
一种新型遗传病、幼年型粒单核细胞白血病和骨髓增生性肿瘤中的 SH2B3 变异
造血是人类生命周期中不断发展的高度动态过程。胎儿期和围产期是特殊的生理变化和进化时期。在这些发育阶段，体质性遗传条件可能导致维持和分化干细胞和祖细胞的有效调节剂失衡，从而导致新生儿和幼儿出现特定的血液学表型。一个突出的例子是唐氏综合征，其 21 三体性介导的胎儿造血紊乱。大约 10% 的唐氏综合征新生儿出现暂时性异常骨髓造血，其特征是外周血原始细胞增多和转录因子 GATA1 的特异性体细胞突变。1 虽然 10% 至 20% 的病例在出生后 4 年内转变为全面性白血病，但大多数病例无需治疗即可痊愈。另一种常见的发育障碍是努南综合征，该综合征由 RAS/丝裂原活化蛋白激酶 (MAPK) 通路的种系致病变异引起，可在出生后头几个月表现为暂时性骨髓增生性疾病 (MPD)。大多数努南综合征患者携带 PTPN11 种系突变。2 尽管唐氏综合征中暂时性异常髓系生成的突变情况至少已得到部分阐明，但努南综合征相关 MPD 的机制仍然很大程度上不清楚。Perez-Garcia 等人 3 和 Blombery 等人 4 报道了另一种暂时性 MPD，发生在 SH2B3 基因双等位基因种系突变的患者出生后不久。 SH2B3 编码淋巴细胞衔接子 LNK（也称为 SH2B3），是 SH2B 衔接子蛋白家族的成员，该家族还包括 APS（SH2B2）和 SH2B（SH2B1）（图 1）。SH2B 蛋白具有共同的结构，即 N 端二聚化结构域、中央 pleckstrin 同源性 (PH) 结构域和 C 端 Src 同源性