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World File Search System大噬菌
在AI自噬的注意事项上
生成的人工智能（AI）技术和大型模型正在跨各种领域（例如图像，文本，语音和音乐）产生现实的输出。创建这些高级生成模型需要大量资源，尤其是大型和高质量的数据集。为了最大程度地减少培训费用，许多算法开发人员将模型本身创建的数据用作具有成本效益的培训解决方案。但是，并非所有的合成数据都有效地改善了模型的影响，因此需要在使用真实数据与合成数据的情况下保持战略平衡以优化结果。当前，实际和合成数据的先前控制的集成变得无法控制。在线合成数据的广泛和不受监管的传播导致数据集的污染
南大与牛津团队研究新进展细胞修复dna损伤...
有一种新的过程，在这个过程 中，细胞从细胞核中清除有害的 DNA蛋白质病变，确保遗传物质 的稳定性，并促进细胞的存活。 研究小组将这一新的过程称为噬 核（nucleophagy）。 噬核是自噬的一种特殊形 式，是自然的细胞清洁机制，对 于修复DNA和确保细胞存活来说 至关重要。 噬核的过程涉及了一种称为 TEX264的蛋白。在接受结直肠癌 化疗的患者中，药物会导致DNA 的损伤，机体表达为TEX264，它 激活了噬核过程，将病变引导到 细胞的废物处理系统中，从而将 他们分解和破坏。 研究小组利用生物化学、 细胞生物学和生物信息学工具
利福昔明调节肠道菌群治疗非酒精性脂肪性肝病的研究进展
异常及其患病率每年增加。其发育与肠道微生物群的不平衡密切相关，诸如肠道肝轴的破坏，对睾丸屏障的损害以及内毒素血症在其发病机理中起关键作用。近年来，肠道菌群的调节已成为NAFLD治疗的热门话题。Rifaximin是一种口服施用的不可吸收抗生素，在改善肠道菌群，减少氧毒素和减少炎症因子方面已显示出潜力。虽然短期使用已显示出积极的影响，但长期使用的安全及其对有益细菌的影响仍需要进一步研究。future研究应着重于优化利福昔明治疗策略，以为NAFLD提供更有效的治疗选择。
P1噬菌体实现CRISPR-Cas9对福氏志贺氏菌的抗菌活性
摘要：成簇的、规则间隔的、短回文重复序列 (CRISPR) 和 Cas9 RNA 引导核酸酶的发现为选择性杀死特定种群或物种的细菌提供了前所未有的机会。然而，由于 cas 9 基因构建体无法高效地递送到细菌细胞中，因此 CRISPR-Cas9 在体内清除细菌感染的应用受到了阻碍。在这里，我们使用广宿主范围的 P1 衍生噬菌粒将 CRISPR-Cas9 染色体靶向系统递送到大肠杆菌和引起痢疾的福氏志贺氏菌中，以实现对目标细菌细胞的 DNA 序列特异性杀死。我们表明，辅助 P1 噬菌体 DNA 包装位点 (pac) 的基因改造可显著提高包装噬菌粒的纯度，并改善 Cas9 介导的福氏志贺氏菌细胞的杀灭作用。我们进一步证明，P1 噬菌体颗粒可以使用斑马鱼幼虫感染模型将染色体靶向 cas9 噬菌粒递送到 S. flexneri 体内，从而显著减少细菌负荷并促进宿主存活。我们的研究强调了将基于 P1 噬菌体的递送与 CRISPR 染色体靶向系统相结合以实现 DNA 序列特异性细胞致死率和有效清除细菌感染的潜力。关键词：福氏志贺氏菌、P1 噬菌体、CRISPR-Cas9、抗菌、噬菌粒 ■ 简介
针对疾病的自噬：已建立和新策略
抽象的大型噬菌/自噬是一种进化保守的途径，负责清除胞质聚集蛋白，细胞器受损或入侵的微生物。功能失调的自噬导致货物的病理积累，这与一系列人类疾病有关，包括神经退行性疾病，传染性和自身免疫性疾病以及各种形式的癌症。在动物模型中的累积工作，遗传工具的应用和药物活性化合物，提出了自噬调节中疾病中的潜在治疗价值，例如亨廷顿，沙门氏菌感染或胰腺癌。正在探索自噬激活与抑制策略，而自噬在病理生理学中的作用并行研究。然而，自噬调节剂的临床前和临床发展的进展受到选择性药理学剂和生物标志物的缺乏，从而揭示了其对各种形式的自噬和细胞反应的精确影响。在这里，我们总结了自噬相关药物发现中已建立的新策略，并指出了建立更有效发现自噬选择性药物基因剂的途径。有了这些知识，对自动phagy的治疗性开发的现代概念可能会变得更加合理。缩写：ALS：肌萎缩性侧硬化； AMPK：AMP激活的蛋白激酶； ATG：自动phagy相关基因； Autac：靶向自噬的嵌合体；中枢神经系统：中枢神经系统； CQ：Chlor Oquine; GABARAP：Aγ-氨基丁酸A型受体相关蛋白； HCQ：羟氯喹； Lytac：溶酶体靶向嵌合体； MAP1LC3/LC3：微管相关蛋白1轻型链3; MTOR：雷帕霉素激酶的机械靶标； NDD：神经退行性疾病； PDAC：胰腺导管腺癌； PE：磷脂酰乙醇胺； PIK3C3/VPS34：磷脂酰肌醇3-激酶催化亚基3型； PTDINS3K：III类磷脂酰肌醇3-激酶； PTDINS3P：3-磷酸磷脂酰肌醇； protac：靶向蛋白水解嵌合体； SARS-COV-2：严重的急性呼吸综合征冠状病毒2； SQSTM1/p62：隔离1； ULK1：UNC-51喜欢自噬激活激酶1。
定向进化环肽以抑制自噬
成熟的自噬体随后与溶酶体融合，将其内容物降解为单体，以供下游的合成代谢和分解代谢。基础自噬通过清除多余或受损的蛋白质和细胞器来维持细胞稳态，而自噬通量上调是细胞对营养缺乏和细胞毒性药物暴露的一种适应性反应。近年来，越来越明显的是，自噬上调在癌症的发展及其对治疗的反应中起着重要作用。6,7 许多类型的肿瘤——包括卵巢癌、8 胰腺癌、9 乳腺癌 10 和结肠癌 11——依赖于自噬的持续激活来维持在肿瘤微环境血管稀少、缺氧和营养缺乏的条件下的生长。化疗 12 和放疗 13 后自噬的激活已被确定为获得治疗耐药性的主要促成因素。 14
微生物群波动和稳定性 - “多细菌群落的替代品...”
在这项研究中，准备在每种营养状况下继续培养大量细菌群落，并使用称为DNA元法编码的技术分析了每个抗共生中细菌物种的增加或减少。结果表明，在某些营养条件下，每次迭代都过渡到几乎相同的社区，而在其他营养条件下，每次迭代都过渡到少数不同的社区（“替代社区”）。此外，我们已经建立了一种方法来确定是否已经向另一个社区进行了过渡，表明在包含特定营养含量的条件下，已经对替代社区进行了每次迭代。
食品微生物之检验方法-乳酸菌-青春双叉乳酸杆菌之检验
Applied Biosystems QuantStudio TM 5 Real-Time PCR System 鑑別試驗用 5 µM 引子 F .......................................................................................... 1.0 µL 5 µM 引子 R ......................................................................................... 1.0 µL 3.3 µM 探針 P ........................................................................................................................................................................................................................................... ............................................................................................... 20.0 µL 註 3 ： Real-time PCR 溶液應於冰浴中配製。 2.6.检体DNA溶液之制备2.6.1。分离菌株之dna