1.bap:sta金黄色β-β-溶血性链球菌和链球菌。Pneumonia2.emb:g( - )芽孢杆菌在痰中属于痰中属于潜在病原体除非量多于第三区或是纯病原体除非量多于第三区或是纯培养
1 西班牙马德里伊迪帕斯拉巴斯大学医院微生物学服务中心,28046; fernandolazaroperona@gmail.com(FL-P.); elie.dahdouh@idipaz.es(ED); serromansoto@gmail.com (SR-S.); sonia23jr@gmail.com (SJ-R.); juliogarciarodriguez@gmail.com (JG-R.) 2 癌症表观遗传学实验室,医学和分子遗传学研究所(INGEMM),拉巴斯大学医院,28046 马德里,西班牙; rodriguez.antolin.c@gmail.com 3 西班牙马德里 28046 拉巴斯大学医院内科服务部传染病科和热带及旅行医学科; fercalleprieto@gmail.com 4 西班牙马德里拉巴斯大学医院重症医学科,28046; alexander.agrifoglio@salud.madrid.org 5 西班牙马德里 28047 戈麦斯乌拉中央防御医院 CBRN 和传染病科; fmemnov@oc.mde.es * 通信地址:jesus.mingorance@idipaz.es;电话:+ 34-91-207-1625 † 这些作者对这项工作做出了同等贡献。
直接从痰液中直接从痰液中检测到结核病检测的流线型护理点测试。 5,6,Padmapriya Banada 2,#,Yingda L. Xie 2,#,Cameron Myhrvold 1,7,8,9,#,#,†1普林斯顿大学分子生物学系,普林斯顿新泽西州,新泽西州普林斯顿大学,08544,美国08544,美国,美国2公共卫生研究所,新吉尔特吉尔特尔医学院,新吉尔斯医学院,新泽西州,新泽西州,新泽西州。 Epidemiology of Microbial Diseases, Yale School of Public Health, New Haven, Connecticut, United States of America 4 Pulmonary, Critical Care, and Sleep Medicine Section, Yale School of Medicine, New Haven, Connecticut, United States of America 5 Centro Internacional de Entrenamiento e Investigaciones Médicas (CIDEIM), Cali, Colombia 6 Universidad Icesi, Cali, Colombia 7 Department of Chemical and Biological工程,普林斯顿大学,新泽西州普林斯顿大学,美国08544,美国8 Omenn-Darling Bio Giogineering Institute,普林斯顿大学,新泽西州普林斯顿大学,新泽西州,08544,美国9美国,普林斯顿大学,普林斯顿大学,普林斯顿大学,新泽西州,新泽西作者同样贡献#这些作者同样贡献†相应的作者:cmyhrvol@princeton.edu摘要结核分枝杆菌(MTB)是对全球健康的主要威胁,每年造成超过100万人死亡。我们试图开发一种基于CRISPR的等温测定法,再加上兼容,直接的样品处理技术,用于护理点。为了阻止病例的潮流并最大程度地提高了早期干预措施的机会,迫切需要在资源不足的地区负担得起,简单的结核病诊断手段。在这里,我们将重组酶聚合酶扩增(RPA)与CAS13A和CAS12A相结合,以创建两个并行的单锅测定,它们检测MTB的两个保守元素(IS6110和IS1081)和一个内部对照人类DNA。这些测定显示与横向流相兼容,并且很容易冻干。我们的最终测定在痰液中的各种细菌载荷(10 5至10 2 CFU/mL)上表现出敏感性。对于M. Bcg的M. Bovis bcg的M. BCG,测定法检测限为69.0(51.0 - 86.9)CFU/ML的MTB菌株H37RV为MTB菌株H37RV和80.5(59.4 - 101.6)CFU/ML。我们的测定法没有针对广泛的细菌/真菌分离株的交叉反应性。对13个盲痰样品的临床测试显示,与培养物相比,100%(6/6)的灵敏度和100%(7/7)的特异性。我们的测定法在临床样品中表现出与微生物黄金标准,结核病培养以及对核酸最先进的GenExpert MTB/RIF Ultra的敏感性。这项技术以快速且强大的格式简化了从样品提取到测定读数的诊断,这使其成为结合放大和检测的第一个测试,同时与横向流动和冻干兼容。
1。将Zymo(DNA/RNA)盾牌(含3 mL DNA/RNA盾牌)的痰液陷阱和管道移入护士或呼吸治疗师,然后再进入吸入房间(或进行bal手术)。要求将不超过3 mL的痰液或BAL液收集到痰液中。2。在将气管吸气(或BAL)收集到痰液中后,估计收集到痰液中收集的痰液或BAL样品的体积,并且在患者的负压室中为气管吸气(或BAL)增添了相等数量或与3 mL Zymo屏蔽层混合的BAL流体(总共6毫升)。紧紧关闭容器。3。将气管抽吸物或BAL流体与患者的负压室中的7-10X混合在一起。这将使病毒失活,并且可以根据该站点的Covid Bioscecimen加工方案将样品用血液和尿液标本运输。
所有开始接受 ART 治疗或已经接受 ART 治疗且尚未接受结核病预防治疗 (TPT) 的患者都应考虑接受 TPT。在开始 TPT 之前,应通过临床评估和结核病检测排除活动性结核病。如果患者无症状,且 TB GeneXpert 结果良好,则无需推迟开始 TPT。可以在同一天开始 TPT 和 ART。在开始 TPT 之前不需要进行结核菌素皮肤试验 (TST)。结核病检测策略会因年龄而异,因为年幼的儿童无法自发咳出痰液。因此,对于没有症状的健康儿童,痰液检测和 CXR 都不是开始 TPT 的必要条件。对于可以自发咳出的儿童(通常 > 25 公斤),应尝试进行痰液检测,但如果他们身体健康(无症状)且无法咳出痰液,则应开始 TPT,即使没有 CXR 或痰液检测可用。
摘要结核病(TB)的抽象痰收集和测试是有问题的,这是有问题的,因为可能进行了雾化,难以生成优质的样品以及复杂的DNA提取方法。舌头拭子便宜,微创,并且是痰收集的有前途的替代品。我们使用Truenat MTB加上Molbio诊断的测定法研究了舌头签名诊断的诊断精度,并直接使用PCR处理方法。每个参与者使用两个尼龙的拭子和两个旋转的聚酯棉签收集四只舌头拭子。在收集舌头样品后,参与者还提供了两个痰液样品,这些样品由Cepheid Xpert MTB/RIF Ultra或培养物进行了测试。在签名的81名参与者中,有24名参与者(30%)是痰液中TB疾病阳性的。使用Truenat MTB Plus测试,舌头棉签具有54%(52/96)的灵敏度和99%(218/220)的特异性,与痰液Ultra相比。粗裂解物,这允许增加样品输入。使用这种方法,舌头拭子具有70%(67/96)的灵敏度和94%(216/224)的特异性。使用数字PCR的结核分枝杆菌(MTB)样品定量产生20份(最小)和34,000份(最大)(最多)MTB的MTB。此外,连续收集的舌头拭子导致了相似的MTB水平,而Spun聚酯拭子则与尼龙锁的拭子进行了等效。总体而言,这项研究表明,舌拭子样品与Truenat MTB测试平台兼容,而直接对PCR方法是可行的诊断解决方案。
治疗和管理•患有HIVºRIF的患者不应用于接受大多数抗HIV蛋白酶抑制剂(PIS)和非核苷逆转录酶抑制剂(NNRTIS)的患者。RFB;可能需要调整RFB剂量以同时给予某些抗HIV PI和NNRTIS。RIF可与核苷逆转录酶抑制剂(NRTIS)一起使用。请咨询专家。• RIPE treatment regimen º Doses should not be divided º Use EMB with caution in children whose vision cannot be monitored º Discontinue EMB when susceptibility to INH and RIF is demonstrated with good clinical response º Discontinue PZA after the Initial Phase - 8 weeks ( see treatment table for number of doses ) - unless there is resistance to either INH or RIF or lack of clinical response • Drug resistance º Mono-drug resistant disease可能需要改变治疗方案。寻求专家咨询。º多药抗性疾病(对INH和RIF的抗性)需要个性化的治疗方案并延长治疗。寻求专家咨询。•对肺结核患者的痰监测º进行至少每月进行痰液监测,直到连续2种持续的痰培养物变为阴性。ºEDOH建议与结核病专家咨询,以便在初始阶段结束时仍然是痰培养阳性的任何人。 •正在进行的评估ºEDOH建议与结核病专家咨询,以便在初始阶段结束时仍然是痰培养阳性的任何人。•正在进行的评估
如果一两个痰标本的 Xpert MTB/RIF 检测结果为“未检测出 MTB”,则高度可预测疑似活动性肺结核患者的连续荧光抗酸痰涂片中未发现结核分枝杆菌复合体杆菌,并且可用作判断疑似肺结核患者是否需要继续进行空气传播感染隔离 (AII) 的辅助手段。应根据具体的临床情况和机构指南,确定是否需要检测一两个痰标本以决定是否停止 AII。关于是否需要继续进行 AII 的临床决策应始终与其他临床和实验室评估相结合,并且 Xpert MTB/RIF 检测结果不应成为感染控制实践的唯一依据。
由结核分枝杆菌引起的抽象结核病(TB)是世界上10种主要的杀手疾病之一。至少有四分之一的人口被感染,每年有130万人死亡。抗多药(MDR)和广泛抗药性(XDR)菌株的出现挑战结核病治疗。一线和二线方案中广泛使用的药物之一是吡嗪酰胺(PZA)。从统计上讲,50%的MDR和90%的XDR临床菌株对PZA具有抵抗力,并且最近的研究表明,其在耐PZA抗性菌株患者中的使用与较高的死亡率有关。因此,迫切需要开发准确且有效的PZA敏感性测定法。PZA穿过结核分枝杆菌,并通过PNCA基因编码的烟酰胺酶水解为其活性形式,吡唑酸(POA)。多达99%的临床耐PZA菌株在该基因中具有突变,这表明这是最可能的耐药机制。但是,并非所有PNCA突变都赋予PZA稳定性,而只会导致POA产生有限。因此,对PZA的敏感性可能仅仅是由于其形成或不形成POA的能力而言。在这里,我们提出了一种NU-清晰的磁共振方法,可以直接在TB患者收集的痰液上清液中准确量化POA。确定了临床痰培养物水解PZA的能力,结果与其他生化和分子PZA药物易感性测定的结果相关。获得的出色敏感性和特定的价值观表明,该方法可能成为确定PZA敏感性的新金标准。
结果:对来自痰中的43例患者的痰中的343个细菌分离株进行了测试。大莫里德和四环素耐药性是常见的(分离株的82%和35%)。erm(b)和MEF(a)是大环内酯类耐药性最常见的决定因素。wgs揭示了Viridans链球菌作为AMR基因的来源,其中23%还携带与AMR基因和其他移动遗传元件相关的共轭质粒。对流感嗜血杆菌分离株的系统发育分析表明,在诊所的患者之间可能传播。在前瞻性研究中,痰中嗜中性胞酶浓度与香农熵α-多样性(Spearman'sρ= - 0.306,p = 0.005)与与Berger -Parker优势指数(ρ= 0.502,P <0.001)之间存在负相关。相似的关系是指连续样品之间弹性酶浓度的变化,与降低的α多样性相关的弹性酶增加。