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World File Search System底栖
大型底栖无脊椎动物环境DNA 监测技术规范
推荐采用市售商品化的DNA提取纯化试剂盒。如使用CTAB法提取DNA所需试剂如下： a) 乙二胺四乙酸二钠（Na 2 EDTA，C 10 H 14 N 2 O 8 Na 2 ·2H 2 O）。 b) 氢氧化钠（NaOH）。 c) EDTA 溶液：ρ（EDTA）=0.02 mol/L：称取5.8448 g EDTA 溶于适量超纯水中，NaOH 固体调节pH 至8.0，定容至1000 mL，121℃灭菌18 min，冷却后常温保存。 d) 三羟甲基氨基甲烷（Tris，C 4 H 11 NO 3 ）。 e) 浓盐酸：ρ（HCl）=1.19 g/mL。 f) Tris-HCl 溶液：ρ（Tris-HCl）=0.1 mol/L：称取15.76 g Tris-HCl 溶于适量超纯水中，浓盐酸调pH 至8.0，定容至1000 mL，121℃灭菌18 min，冷却后常温保存。 g) 十六烷基三甲基溴化铵（CTAB）。 h) 氯化钠（NaCl）。 i) CTAB 提取液：称取4 g CTAB 和16.38 g NaCl，分别溶于适量超纯水中，加入0.02 mol/L EDTA 溶 液（5.3 c）8 mL 和0.1 mol/L Tris-HCl 溶液（5.3 f）20 mL，定容至200 mL，121℃灭菌18 min， 冷却后常温保存。 j) Tris 饱和酚（pH=8.0）。 k) 三氯甲烷（CHC l3 ）。 l) 异戊醇（C 5 H1 2O ）。 m) 酚氯仿：Tris 饱和酚、氯仿和异戊醇按25:24:1 体积比配制。 n) 乙酸铵（CH 3 COONH 4 ）。 o) 乙酸铵溶液，ρ（CH3COONH4）=7.5 mol/L：称取5.78 g 乙酸铵溶于10 mL 超纯水中。 p) 乙酸钠（CH 3 COONa·3H 2 O）。 q) 乙酸钠溶液，ρ（CH 3 COONa）=3 mol/L：称取102.06 g 乙酸钠溶于适量超纯水中，冰醋酸调节pH 至5.2，定容至250 mL，121 ℃灭菌18 min； r) 无水乙醇（C 2 H 6 O）。 s) 冰乙酸（C 2 H 4 O 2 ）。 t) 蛋白酶K：400 U/mL。 u) 超纯水：经121 ℃，0.1 MPa 灭菌30 min，无细菌无DNA 酶。
底栖栖息地测绘指南
本文件是美国国家海洋和大气管理局 (NOAA) 沿海服务中心的经验、智慧和应用研究的产物。联邦、州和地方层面的许多个人都为本文件做出了贡献。作者特别要感谢北卡罗来纳州博福特 NOAA 沿海渔业和栖息地研究中心的 Randolph Ferguson 博士和 Lisa Wood，感谢他们为开发原始 NOAA 沿海变化分析计划：区域实施指南文件所做的努力以及他们对底栖生物测绘的持续支持。佛罗里达州鱼类和野生动物委员会、佛罗里达海洋研究所的 Frank Sargent 和马萨诸塞州环境保护部的 Charles Costello 一直是 NOAA 在沿海服务中心的底栖生物测绘工作的坚定支持者。他们对沿海环境问题的长远观点和务实态度使本文件受益匪浅。圣约翰河和南佛罗里达水资源管理区的 Robert Virnstein 博士和 Becky Robbins 分别通过合作项目工作帮助形成了这些方法。作者还要感谢 NOAA 沿海服务中心的工作人员，特别是 Dorsey Worthy 博士和 Steve Raber 的领导，感谢他们使本文档成为可能。
底栖栖息地测绘指南
本文件是美国国家海洋和大气管理局 (NOAA) 沿海服务中心的经验、智慧和应用研究的产物。联邦、州和地方层面的许多个人都为本文件做出了贡献。作者特别要感谢北卡罗来纳州博福特 NOAA 沿海渔业和栖息地研究中心的 Randolph Ferguson 博士和 Lisa Wood，感谢他们为开发原始 NOAA 沿海变化分析计划：区域实施指南文件所做的努力以及他们对底栖生物测绘的持续支持。佛罗里达州鱼类和野生动物委员会、佛罗里达海洋研究所的 Frank Sargent 和马萨诸塞州环境保护部的 Charles Costello 一直是 NOAA 在沿海服务中心的底栖生物测绘工作的坚定支持者。他们对沿海环境问题的长远观点和务实态度使本文件受益匪浅。圣约翰河和南佛罗里达水资源管理区的 Robert Virnstein 博士和 Becky Robbins 分别通过合作项目工作帮助形成了这些方法。作者还要感谢 NOAA 沿海服务中心的工作人员，特别是 Dorsey Worthy 博士和 Steve Raber 的领导，感谢他们使本文档成为可能。
白令海和阿留申群岛的底栖鱼类……
理事会的政策是采用明智和负责任的渔业管理做法，以可靠的科学研究和分析为基础，积极主动而非被动应对，确保渔业资源和相关生态系统的可持续性，造福子孙后代。北太平洋生态系统的生产力被公认为是世界上最高的。在过去 25 年里，理事会的管理方法结合了前瞻性的保护措施，以应对不同程度的不确定性。这种管理方法近年来被称为预防性方法。认识到生产力的潜在变化可能是由自然海洋条件、渔业和其他非渔业活动的波动引起的，理事会打算继续采取适当措施，确保管理物种的持续可持续性。它将通过考虑《马格努森-史蒂文斯法案》中所述的合理、适应性的管理措施来实现这一目标，并符合《国家标准》、《濒危物种法案》、《国家环境政策法案》和其他适用法律。这种管理方法考虑到了美国国家科学院关于可持续渔业政策的建议。
i/ca in Epifaunal底栖有孔虫
美国纽约州锡拉丘兹大学的地球科学系B地球科学系，牛津大学，英国牛津大学，英国牛津大学，赫利奥特·瓦特大学，英国爱丁堡，英国爱丁堡，d地质科学系。英国埃格姆伦敦皇家霍洛威大学 - 海洋环境科学中心，不来梅大学，布雷门河，德国，H alfred Wegener研究所，Helmholtz Polar and Marine Research中心，德国I英国英国南极调查美国康涅狄格州纽黑文大学，美国康涅狄格州米德尔敦的地球与环境科学系，美国康涅狄格州米德尔敦美国纽约州锡拉丘兹大学的地球科学系B地球科学系，牛津大学，英国牛津大学，英国牛津大学，赫利奥特·瓦特大学，英国爱丁堡，英国爱丁堡，d地质科学系。英国埃格姆伦敦皇家霍洛威大学 - 海洋环境科学中心，不来梅大学，布雷门河，德国，H alfred Wegener研究所，Helmholtz Polar and Marine Research中心，德国I英国英国南极调查美国康涅狄格州纽黑文大学，美国康涅狄格州米德尔敦的地球与环境科学系，美国康涅狄格州米德尔敦
浅海岸底栖基质遥感 - MDPI
摘要：鳗草 (Zostera marina) 是潮间带和潮下带生态系统的关键组成部分。然而，人类活动的压力已导致其种群在全球范围内下降。划定和持续监测鳗草分布是了解这些压力和提供有效的沿海生态系统管理的重要组成部分。此类空间监测的一种拟议工具是远程图像，它可以经济高效地频繁覆盖大片且难以接近的区域。但是，要有效应用这项技术，需要了解鳗草及其相关基质的光谱行为。在本研究中，原位高光谱测量用于定义关键光谱变量，这些变量可在 Z. marina 和相关水下基质之间提供最大的光谱分离。对于原位水面反射数据集的鳗草分类，所选变量为：斜率 500–530 nm，一阶导数 (R') 在 566 nm、580 nm 和 602 nm，总体准确率为 98%。当原位反射数据集经过水校正时，所选变量为：566:600 和 566:710，总体准确率为 97%。使用现场光谱仪识别鳗草的深度限制平均为 5.0 至 6.0 m，范围为 3.0 至 15.0 m，具体取决于水柱的特性。涉及高光谱机载图像底栖分类的案例研究表明，变量选择的主要优势是满足统计上更复杂的最大值的样本量要求
CoralNet：用于自动注释底栖图像的 AI
Beijbom、Edmunds、Roelfsema、Smith、Kline、Neal、Dunlap、Moriarty、Fan、Tan、Chan、Treibitz、Gamst、Mitchell、Kriegman，“面向底栖调查图像的自动注释：人类专家的多变性和自动化操作模式”，PLOS ONE，2015 年
河口底栖测绘数据的空间分析与可视化工具与技术
图 1。用于在 GIS 中表示底栖栖息地特征的矢量数据模型示例图 2。用于在 GIS 中表示底栖栖息地特征的栅格数据模型示例图 3。栖息地规模、传感器分辨率、分析/可视化技术与底栖栖息地测绘资金之间的关系图 4。传感器的相对尺度和底栖栖息地测绘分析图 5。多波束测深数据显示数据分辨率对在不同空间尺度上可视化底栖栖息地的影响图 6。底栖栖息地数据的数据显示、数据分析和数据集成之间的差异示例图 7。显示了显示和分析测深数据的不同技术的图表。转换为栅格 (b) 的水深点数据 (a) 可以查询以获取其他数据，例如深度轮廓 (c) 图 8。图示说明从侧扫声纳马赛克中划定地质基质，随后使用更高分辨率的 SPI 样本划定子栖息地 图 9。侧扫和多波束声纳数据的比较显示数据连续性的差异 图 10。Kostylev 等人的底栖栖息地测绘示例。2001 图 11。不同点插值技术的比较 图 12。使用平面视图摄影进行鳗草监测的示例数据收集和分析方法。
河口底栖测绘数据的空间分析与可视化工具与技术
海底环境的测绘和地理空间分析是一项多学科任务，近年来由于技术的进步和调查系统成本的降低，这项任务变得更加容易完成。海底物理、生物和化学成分之间存在着复杂的关系，需要先进的综合分析技术，以使科学家和其他人能够直观地看到模式，并由此推断出海底过程。有效的海洋栖息地测绘、分析和可视化尤为重要，因为潮下海底环境不易用肉眼直接观察。因此，海底环境研究严重依赖遥感技术来收集有效数据。由于许多底栖科学家不是测绘专业人士，他们可能没有充分考虑数据收集、数据分析和数据可视化之间的联系。项目通常从明确的目标开始，但可能会受到从收集到分析和呈现的整个过程中保持数据质量所需的技术细节和技能的阻碍。缺乏对整个数据处理过程的技术理解可能会成为成功的重大障碍。虽然许多底栖生物测绘工作已经详细说明了与项目总体科学目标相关的方法，但只有少数已发表的论文和报告关注分析和可视化部分（Paton
旅行费用：浅层底栖微植物昼夜垂直迁移的能量成本
表层微植物底栖硅藻昼夜运动的生理学尚未完全了解。此外，导致迁徙行为的进化压力和垂直迁移的生态作用仍不清楚。行为光保护假说是最普遍接受的，根据该假说，硅藻沿着垂直光梯度移动以找到最佳光环境。然而，这种运动与能量消耗有关，这一点以前尚未得到充分认识。为了阐明这个问题，我们研究了硅藻运动的机制并回顾了它们的运动模式。利用已发表的数据，我们估计一个典型的硅藻细胞在 400 µ m 光区向上（或向下）移动的能量成本为 0.12 pJ。这相当于 3.93 × 10 − 18 mol ATP，由 1.31 × 10 − 19 mol 葡萄糖氧化释放。这仅占典型微底栖硅藻细胞每日净光合产量的 0.0001%，表明昼夜垂直迁移对细胞和生态系统能量预算的影响可以忽略不计。即使单个细胞的迁移能量成本可能与典型硅藻的中心值相差近两个数量级（取决于细胞大小、位移速度和介质粘度），从代谢和生态学的角度来看，计算出的最大值仍然可以忽略不计。结果表明，行为光保护可能是一种能量廉价的机制，与结构/生理光保护相比具有竞争优势。