arrowia lipolytica 属于子囊菌门、酿酒菌亚门和双足菌科 (1)。除了工业用途 (2) 之外,Y. lipolytica 还广泛存在于食品、环境和动物中 (1)。由于其能够在 32°C 以上不稳定地生长,因此通常认为该菌种可安全用于工业用途 (1)。Yarrowia lipolytica 是一种机会性病原体,可引起侵袭性念珠菌病 (3)。在体外,该菌种被认为对氟康唑敏感 (4)。第一个 Y. lipolytica 基因组 (CLIB122) 于 2004 年发布 (5)。我们报告了对氟康唑有抗性的 Y. lipolytica 临床分离株的基因组草图,该分离株是从溃疡性结肠炎手术后的血培养中采集的。有趣的是,尽管之前曾接触过唑类药物,但使用梯度浓度试纸法(Etest;bioMérieux),该菌株的氟康唑 MIC 为 0.256 mg/mL。患者成功地用卡泊芬净治疗。该菌株在 35°C 的显色琼脂平板(CAN2;bioMérieux)上生长,并使用 Vitek 基质辅助激光解吸电离 - 飞行时间质谱 (MALDI-TOF MS) 仪器(bioMérieux)进行鉴定。在溶菌酶细胞壁消化后,使用 QIAmp DNA minikit(Qiagen)提取基因组 DNA。使用 Illumina DNA 制备标记试剂盒(Illumina)构建文库。简而言之,使用珠状转座子技术和集成 DNA 技术 (IDT) 的 Illumina DNA/RNA 独特双重 (UD) 索引集将 30 ng 总 DNA 片段化并进行索引。使用 Qubit 高灵敏度试剂盒 (Thermo Fisher Scienti ) 对文库进行扩增、纯化和定量。最后,将 9 pM 汇集和变性文库放入 2 250-bp v2 试剂盒 (Illumina) 中,并使用 MiSeq 仪器 (Illumina) 进行测序。使用 CLC Genomics Workbench v22.0 (Qiagen) 中的 Trim Reads v2.5 和 De Novo Assembly v1.5 工具对原始读取进行修剪、组装成重叠群并进行搭建。使用覆盖率与长度图丢弃覆盖率为 , 10 且长度为 , 500 bp 的重叠群 (6)。使用 QUAST v5.0.2 对最终的 scaffold 集进行质量分析 (7)。总基因组大小为 20,255,408 bp,分布在 521 个 scaffold 上(覆盖率为 100 ),N 50 值为 105 kbp(最长 scaffold,397 kbp),GC 含量为 49.03%。AUGUSTUS v3.4.0 (8) 使用白色念珠菌训练数据集预测了 6,151 个蛋白质编码基因,使用 tRNAscan-SE 2.0 检测到了 484 个 tRNA 基因 (9)。使用 BUSCO v5.3.2 和 saccharomycetes_odb10 谱系数据集 (10) 估计基因组完整性为 95.3%。平均核苷酸同一性 (ANI) 计算
氟康唑是一种抗真菌药物,常用于治疗和预防早产和足月婴儿的酵母菌感染。酵母菌可引起婴儿全身严重感染,包括皮肤、血液、心脏、眼睛和大脑。婴儿的免疫系统比大孩子和成人弱,因此会发生酵母菌感染,感染可能导致长期健康问题甚至死亡。尽管氟康唑在婴儿中经常使用,但关于其药代动力学或该药物在婴儿体内如何代谢的数据却很少。关于氟康唑对婴儿的安全性和有效性的数据也很少。需要进行这些研究来确定氟康唑的代谢过程、安全性和有效性,以及治疗和预防早产和足月婴儿以及使用生命支持系统的婴儿酵母菌感染的最佳剂量。
摘要:新兴的威胁生命的多种耐药性(MDR)物种,例如Haemulonii物种复合物,Clavispora Lusitaniae(Sin。C。lusitaniae)和其他念珠菌在不久的将来被认为是人类健康风险的增加。(1)背景:许多研究强调,耐药性的增加可能与念珠菌中的几种毒力因素有关,并且其知识对于制定新的抗真菌策略也至关重要。(2)方法:在G. mellonella幼虫上的疏水性,粘附,生物膜形成,脂肪酶活性,对渗透压的耐药性和毒力为“体内”。(3)结果:观察到种内和间隙的变异性。C. haemulonii表现出较高的疏水性和粘附并形成生物膜的能力。C。lusitaniae疏水较少,是生物膜形成 - 应变依赖性的,并且没有显示脂肪酶活性。幼虫的死亡率明显高于感染Haemulonii和C. lusitaniae的死亡率。(4)结论:在这些非野生型念珠菌和克拉维斯普拉斯分离株中观察到的与其疏水能力相关的生物膜,适应压力并在体内模型中感染的能力,显示出其明显的毒力特征。由于定义毒力的因素与这些真菌对可用于临床使用的少数抗真菌性的抗性的发展有关,因此必须考虑这些细胞的生理学差异以开发新的抗真菌疗法。
1个微生物学单元,大romagna枢纽实验室,意大利47522饼; sofi.monta.msm@gmail.com(M.S.M.); mariavittoria.tamburini@auslromagna.it(M.V.T。); valentina.arfilli@auslromagna.it(V.A。); manuela.morotti@auslromagna.it(M.M.); pasqua.schiavone@auslromagna.it(P.S.); francesco.congestri@auslromagna.it(f.c.); martina.manera@auslromagna.it(M.M.); agnese.denicolo@auslromagna.it(a.d。); francesca.taddei@auslromagna.it(f.t。); laura.grumiro@auslromagna.it(l.g。); silvia.zannoli@auslromagna.it(S.Z.); giorgio.dirani@auslromagna.it(G.D.); vittorio.sambri@unibo.it(V.S.); monica.cricca3@unibo.it(M.C。)2医学和外科科学系 - Dimec,母校Studiorum-博洛尼亚大学,意大利博洛尼亚40126; claudia.colosimo2@unibo.it(c.c. ); martina.brandolini@outlook.it(m.b。 ); Alessandra.depascal3@unibo.it(A.M.D.P.) 3 DIN - 母校训练学的工业工程部门 - 博洛尼亚大学,意大利博洛尼亚40126; giulia.gatti12@unibo.it 4卫生服务研究,评估和政策部门,Ausl Romagna,意大利Rimini 42123; michela.fantini@auslromagna.it *通信:anna.marzucco@auslromagna.it;电话。 : +39-34960957142医学和外科科学系 - Dimec,母校Studiorum-博洛尼亚大学,意大利博洛尼亚40126; claudia.colosimo2@unibo.it(c.c.); martina.brandolini@outlook.it(m.b。); Alessandra.depascal3@unibo.it(A.M.D.P.)3 DIN - 母校训练学的工业工程部门 - 博洛尼亚大学,意大利博洛尼亚40126; giulia.gatti12@unibo.it 4卫生服务研究,评估和政策部门,Ausl Romagna,意大利Rimini 42123; michela.fantini@auslromagna.it *通信:anna.marzucco@auslromagna.it;电话。: +39-3496095714
摘要:开发治疗福氏耐格里变形虫脑感染的药物是一项尚未满足的医疗需求。我们结合了化学信息学、基于靶标和基于表型的药物发现方法来识别针对福氏耐格里变形虫必需酶固醇 14-脱甲基酶 (NfCYP51) 的抑制剂。总共对 124 种预先选定的计算机模拟化合物进行了针对福氏耐格里变形虫的测试。表型上鉴定出 EC 50 ≤ 10 μ M 的九个主要化合物。与 NfCYP51 共结晶集中在一个主要化合物上,即咪康唑类化合物 2a。2a 的 S 对映体产生了 1.74 Å 的共晶结构。然后合成并评估一组类似物,以确认 S 构型优于 R 构型以及醚键优于酯键。与 2a 相比,这两种化合物 S - 8b 和 S - 9b 的 EC 50 和 KD 有所提高。重要的是,它们都很容易被大脑吸收。S - 9b 的脑-血浆分布系数为 1.02 ± 0.12,这表明需要进一步评估其作为原发性阿米巴脑膜脑炎的先导物的价值。■ 简介
了解癌症生物学和开发新型癌症治疗药物一直是癌症研究人员的目标。然而,新药的研发受到其漫长的开发时间、高昂的成本、高监管障碍和惊人的失败率的阻碍。鉴于癌症治疗药物开发的挑战,替代策略,特别是重新利用已获批用于其他适应症的“旧”药物,具有吸引力。伊曲康唑是 FDA 批准的三唑类抗真菌药物,已在临床上使用 30 多年。最近的药物重新利用筛选显示伊曲康唑通过抑制血管生成和多种致癌信号通路发挥抗癌活性。为了探索伊曲康唑在不同类型恶性肿瘤中的潜在用途,我们检索了与伊曲康唑在癌症中相关的已发表文献,并回顾了伊曲康唑在临床前和临床癌症研究中的作用机制。目前研究预测hedgehog信号通路是伊曲康唑抑制多种实体癌和血液癌的主要靶点,随着临床试验结果的公布,伊曲康唑有望成为一种新型抗肿瘤药物,可与一线抗肿瘤药物联合使用。
1 波兰格但斯克理工大学化学学院制药技术和生物化学系,Narutowicza 11/12, 80-233 格但斯克;wioletta.brankiewicz@pg.edu.pl (WB);s169840@student.pg.edu.pl (KS) 2 波兰格但斯克大学化学学院分子生物化学系,80-308 格但斯克;joanna.okonska@phdstud.ug.edu.pl (JO);24556@gumed.edu.pl (JL);anna.legowska@ug.edu.pl (A.Ł.); krzysztof.rolka@ug.edu.pl (KR) 3 纳米结构生物相互作用部门,Hirszfeld 免疫学和实验治疗研究所,波兰科学院,12 Weigla-Street, 53-114 Wrocław,波兰;marek.drab@hirszfeld.pl * 通讯地址:natalia.ptaszynska@ug.edu.pl (NP);piotr.szweda@pg.edu.pl (PS);电话:+48-58-523-5092 (NP);+48-58-347-2440 (PS);传真:+48-58-523-5012 (NP)
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