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World File Search System弧菌
高温增加了通过VI型分泌系统
海上温度和热浪的上升对全世界的珊瑚礁构成了重大威胁。属于弧菌属的途径尤其是由于它们与温度相关疾病的关联，后者在人类和珊瑚[1]和珊瑚[2]中均表现出峰值感染率。夏季温度的升高与霍乱病原体的弧菌病原体的爆发爆发相关，突出了温度对弧菌致病性的直接影响[3]，尽管与温度相关感染的特定机制仍然被忽略了。弧菌Coralliilyticus是对温度波动敏感的机会性珊瑚病原体，感染多种珊瑚种类，并对礁生态系统构成全球威胁，尤其是当温度超过27°C时[4]。尽管珊瑚宿主具有多种防御机制，但细菌如V。Coralliilyticus发展了殖民和入侵的多种策略。先前的研究已经探索了这些策略，包括蛋白酶和血素蛋白的分泌，运动能力的调节以及通过预言诱导与共生细菌的竞争[2，5]。在发表在《 PLOS生物学》中发表的研究中，Mass及其同事揭示了V中2型VI型分泌系统（T6SS）的激活。在高温下[6]。他们确定了由T6SS1和T6SS2部署的抗核效应器排放的一系列抗菌效应器（图1），使其能够绕开珊瑚宿主的防御机制。这一发现加强了珊瑚病原体侵入和感染珊瑚的多功能策略。珊瑚微生物组在维持珊瑚健康中起着至关重要的作用。珊瑚动物与光合性内共生鞭毛藻和各种微生物，包括细菌，真菌，古细菌和噬菌体的多种微生物。罗森伯格（Rosenberg
从日本竹荚鱼（Trachurus Japonicus）分离的副溶血性弧菌的抗菌药物耐药性概况
本研究旨在调查副溶血性弧菌 (V. parahaemolyticus) 的抗生素耐药性 (AMR) 概况。从野生和养殖的日本竹荚鱼 (Trachurus japonicus) 中分离出细菌，并检测其抗生素耐药性。此外，使用血清型检测试剂盒和 PCR 方法研究了分离株的血清型以及耐热直接溶血素 (tdh) 和霍乱毒素转录激活因子 (toxR) 的基因。从野生和养殖的日本竹荚鱼中分别分离出 88 株和 126 株副溶血性弧菌菌株。从野生和养殖的日本竹荚鱼中检测到 10 种和 18 种不同的血清型。所有菌株均对 tdh 基因呈阴性，但对 toxR 基因呈阳性。在野生捕获的鱼中观察到 54 株和 23 株对氨苄青霉素 (ABP) 以及 ABP 和磷霉素 (FOM) 均有耐药性，而在养殖鱼中观察到 112 株和 7 株耐药性。在野生捕获的鱼中观察到一株或两株对包括 ABP 在内的三种或四种药物具有多重耐药性。这些结果强烈表明，抗菌药物的环境暴露导致日本竹荚鱼的耐药基因传播。这项研究强调了监测耐药基因向人类肠道菌群以及环境中其他细菌传播的必要性。
颤音属的定量分析。以及菲律宾邦板牙的Minalin的罗非鱼长大池塘的环境质量评估1 Michelle Grace
摘要。一般而言，弧菌是众所周知的病原体，导致水产养殖行业的高鱼死亡率和经济损失。这种细菌属在水生环境中普遍存在。当环境参数不在适当的范围之外，导致鱼类的压力与颤动的病原体（如Vibrio spp）的攻击时，在水生环境中发生细菌疾病爆发。在先前的研究中，这种细菌菌群引起了罗非鱼的疾病并记录了死亡率。因此，本研究量化了假定的颤音属。在尼罗河罗非鱼（Oreochromis niloticus）和在邦板牙Minalin的长大土池塘中获得的环境样品。大多数环境水质参数都在水产养殖的推荐水平之内，除了盐度，SECCHI椎间盘可见性，总溶解固体，电导率和沉积物pH。观察到的推定弧菌属的患病率。在鱼类和水样中均为100％，而沉积物样品中只有65％。进一步的分析表明，从10 8 CFU G -1的沉积物中获得了最高计数。推定弧菌属。鱼类和水中的数量范围为10 6至10 7 CFU G -1
plos One
水质参数会影响致病细菌的丰度。属的气管，弧菌，克雷伯氏菌和分枝杆菌是在废水中鉴定出的代表性途径菌群之一。然而，缺乏有关水质与这些细菌丰度之间相关性的信息，以及它们在现有的废水处理设施（WTF）中的降低率。因此，本研究旨在确定WTF中这些细菌基团的丰度和降低率。从日本和泰国的9个WTF收集了68个样本（34个进水和34个未侵害，处理过的废水样品）。16S rRNA基因扩增子测序分析表明，在所有影响的废水和经过处理的废水样品中，存在气瘤菌，弧菌和分枝杆菌。定量实时聚合酶链反应（QPCR）用于量化气动作，弧菌，克雷伯氏菌肺炎物种复合物（KPSC）和分枝杆菌的丰度。进水废水中空气负体，弧菌，kPSC和分枝杆菌的几何平均值为1.2×10 4 - 2.4×10 5，1.0×10 5 - 4.5×10 6，3.6，3.6×3.6×3.6×10 2 - 4.3.3×10 4，以及6.9×10 4，以及6.9×10 3 - 5.5×10 4 4×10 4 4×10 4×4×10 4 4×10 4 4.分别为0.77–2.57，1.00–3.06，1.35–3.11和-0.67–1.57。本研究提供Spearman's rank correlation coefficients indicated significant positive or nega- tive correlations between the abundances of the potentially pathogenic bacterial groups and Escherichia coli as well as water quality parameters, namely, chemical/biochemical oxygen demand, total nitrogen, nitrate-nitrogen, nitrite-nitrogen, ammonium-nitrogen, suspended solids, volatile悬浮固体和氧化还原潜力。
猪 细小 蛋白 NRPS 基因 的 生物 勘探 及 检测
摘要 ：弧菌病和败血症是由细菌引起的感染，给水产养殖业带来了许多问题。海参等海洋生物被广泛认为含有具有抗菌潜力的共生微生物，因此生物勘探前景十分广阔。本研究旨在分析海参单疣刺参共生菌对嗜水气单胞菌和哈维氏弧菌的抗菌潜力并检测其NRPS基因。研究方法包括海参单疣刺参肠道共生菌的分离、抗菌活性筛选、16S rRNA鉴定和NRPS基因簇检测。共分离出16株细菌，其中12株分离株对病原菌嗜水气单胞菌有抑制潜力，7株分离株对病原菌哈维氏弧菌有抑制潜力。经16S rRNA鉴定，能够抑制A. hydrophila生长的共生菌为枯草芽孢杆菌（Bacillus subtilis），而能够抑制V. harveyi病原菌的共生菌为弯曲芽孢杆菌（Bacillus flexus），在枯草芽孢杆菌和弯曲芽孢杆菌中均检测到NRPS基因簇，扩增子大小约为250 bp。
无定形盐单胞菌-PHB对生长、身体的影响
摘要：聚β-羟基丁酸酯（PHB）是由盐单胞菌等细菌产生的一种代谢产物，在营养受限条件下可作为细菌的碳源和能量储存化合物。开展两个试验研究了饲料中添加盐单胞菌-PHB对杂交石斑鱼（Epinephelus fuscoguttatus♀×E.lanceolatu♂）的影响。试验一，给幼鱼石斑鱼饲喂在基础饲料中添加3%盐单胞菌-PHB（3%HM-PHB）（含1.4%PHB）和3%盐单胞菌（3%HM）（不含PHB）以及对照饲料，连续7周。结果显示，3%HM-PHB组与对照组的存活率、增重和粗脂肪含量无显著差异，但3%HM-PHB组的粗蛋白显著低于对照组。此外，添加 3% HM-PHB 可增加鱼肌肉中的脂肪酸含量，包括长链不饱和脂肪酸 C18:1n9、EPA 和 DHA。在实验 II 中，石斑鱼喂食基础饲料，其中添加了 6.5% 盐单胞菌 -PHB（6.5% HM-PHB）（含 3% PHB）和 6.5% 盐单胞菌（6.5% HM）（不含 PHB），以及基础饲料（对照）。饲养七周后，用鳗弧菌对石斑鱼进行 48 小时的诱变。虽然不同组间存活率和生长情况无显著差异，但饲料中添加6.5% Halomonas -PHB可提高受到鳗弧菌攻击的石斑鱼的存活率，并显著增加血液中过氧化氢酶（ CAT ）和超氧化物歧化酶（ SOD ）基因表达，肝脏、脾脏、头肾和血液中白细胞介素1（ IL1 ）和白细胞介素10（ IL10 ）的表达（ p < 0.05）。综上所述，饲料中添加Halomonas -PHB对鱼的生长性能无显著的积极影响，但增加了鱼肌肉中脂肪酸，包括长链不饱和脂肪酸C18：1n9、EPA和DHA的含量，并提高了对鳗弧菌的抗性，可能是通过增加不同组织器官中免疫相关基因的表达来实现的。我们的研究结果提供了令人信服的证据，表明 Halomonas -PHB 可用作集约化石斑鱼养殖的饲料添加剂，以增强石斑鱼对弧菌的抵抗力。
螃蟹的细菌学评估（Pachycheles ...
背景：贝类易受多种细菌病原体的影响，其中大多数能够在人类中引起疾病，但本质上被认为是腐生的。贝类的细菌学多样性取决于它们周围的捕鱼场，栖息地和环境因素。这项研究评估了与贝类，木壳球素（Crab）（Crab）和Nucella lapillus（狗鲸）相关的细菌，这些细菌是从雌激素生态系统中收集的。方法论：从Obolo地方政府地区（LGA）（LGA）收获的螃蟹（Pachycheles pubescens）和狗whelk（pachycheles pubescens）和狗鲸（Nucella Lapillus）的细菌学评估。使用标准分析程序确定异养和潜在病原体的密度。将纯细菌分离株分组为可识别的分类单元，并将其特征在其通用水平上。结果：平均（和范围）总杂育细菌计数（THBC），总结肠计数（TCC），粪便大肠菌群（FCC），沙门氏菌 - 丝菌计数（SSC）和蟹样品（log10 cfu/g）的总弧菌计数（SSC）和总弧菌计数（TVC）； 4.281±0.085（4.18-4.39）; 4.187±0.078（4.11-4.30）; 4.115±0.081（4.00-4.20）; 4.076±0.058（4.00-4.14）;和4.114±0.085（4.00-4.23）（p = 0.003915）。对于狗鞭子样品，平均值（和范围）THBC，TCC，FCC，SSC和TVC为4.232±0.095（4.11-4.36）; 4.185±0.095（4.04-4.28）; 4.082±0.068（4.00-4.18）; 4.062±0.055（4.00-4.15）和5.155±0.062（4.08-4.23）（p = 0.028856。关键字：细菌； Pachycheles pubescens; Nucella lapillus;河口从螃蟹和狗鲸样品中分离出的细菌种类包括沙门氏菌，芽孢杆菌，志贺氏菌，corynebacterium，铜绿假单胞菌和弧菌（这是来自80％样品中最常见的细菌病原体最常见的细菌病原体）。结论：一些细菌，尤其是从螃蟹和狗whelk样品中分离出的弧菌，沙门氏菌和志贺氏菌是已知的人类病原体，如果这些海鲜在食用前未正确煮熟，它们可能会造成严重的健康风险。
CRISPR SWAPnDROP
生物技术、合成生物学和基础研究对多种染色体修饰的需求要求开发新技术。利用 CRISPR SWAPnDROP，我们将基因组编辑的极限扩展到细菌物种之间大规模体内 DNA 转移。其模块化平台方法有助于物种特异性适应，从而在各种物种中实现基因组编辑。在这项研究中，我们展示了 CRISPR SWAPnDROP 概念在模型生物大肠杆菌和目前增长最快、与生物技术相关的生物弧菌中的实现。我们展示了 151kb 染色体 DNA 在大肠杆菌菌株之间以及从大肠杆菌到弧菌的切除、转移和整合，而无需大小限制的中间 DNA 提取。随着大肠杆菌 MG1655 野生型乳糖操纵子的转移，我们在弧菌中建立了功能性的乳糖和半乳糖降解途径，以扩展其生物技术谱。我们还转移了大肠杆菌 DH5 α lac 操纵子，使 V. natriegens 能够进行 α 互补 - 这是朝着超快速克隆菌株迈出的一步。此外，CRISPR SWAPnDROP 旨在成为基因组工程的瑞士军刀。其应用范围包括无疤痕、无标记、迭代和并行插入和删除、基因组重排以及菌株间和物种间的基因转移。模块化特性有利于 DNA 库应用和标准化部件的回收利用。其新颖的多色无疤痕共选择系统显著提高了单次编辑的编辑效率，四次编辑的编辑效率提高到 83%，并在整个组装和编辑过程中提供视觉质量控制。