摘要在这项病例对照研究中,我们旨在研究先天性心脏病(CHD)儿童可能与流动微生物组相关的特定口腔病原体。在20名CHD和健康对照组的儿童中评估了龋齿,口腔卫生和牙龈指数,并收集了静脉血液样本和唾液。使用定量聚合酶链反应(QPCR),分析血液样品是否存在细菌DNA以确定流动微生物组,并分析唾液样品以识别和量化靶靶微生物,包括链球菌(SM)及其血清型K(SMK),Fusobactim,Fusobacterium。nucleatum(Fn),牙龈卟啉单胞菌(PG),scardovia wiggsiae(SW)和聚集的放线肌ctemycetemcomitans(AA)和其JP2克隆(JP2)。这些发现是由Fisher的确切和Spearman的相关性测试的Mann Whitney U,Chi-Square分析的。细菌DNA。两组之间在唾液中细菌的存在和计数之间没有发现显着差异。但是,冠心病组表现出明显低于对照组的龋齿和更高的牙龈指数得分。PG和AA的存在与较高的牙龈指数分数显着相关。SM和SMK计数与龋齿的经验显着相关。在FN和总细菌计数之间发现正相关。总而言之,在我们的儿科人群中,已提出作为远处疾病的潜在标志的流动微生物组非常罕见。可能与移动微生物组相关的目标微生物的计数在患有冠心病和健康儿童的儿童中没有差异。
木质素的物理化学特征及其在纤维素中的压实会阻碍大量植物生物量的生物技术开发。 div>lacasas构成了介入木质素脱位的多重氧化酶的亚家族。 div>虽然它们在真菌中广泛特征,但对原核生物中拉法萨的多样性和功能的研究尤其集中在链霉菌SP的酶同工型上。 div>在这项工作中,分离了20种土壤放线菌菌株。 div>在与瓜亚科的定性试验中证明了其中17种的LACASA活性,并详细描述了两种选定的菌株。 div>16S rRNA基因序列的形态测试和分析表明,这两个分离的属于tsukamurella和纤维菌粒状细菌。 div>在搅拌淹没培养中,AC01(Tsukamurella sp。)表示108 U/L。 l。的最大ABTS氧化活性(2,2'-Azino-bis-(3-乙基苯甲酰唑林-6-磺酸盐)另一方面, AC18(纤维素微生物sp。) div>表现出大于其余16个菌株的瓜亚科的氧化活性,并且被证明对有毒铜水平具有抵抗力,获得了0.56 U/L的最大氧化值。 div>这些结果表明,在分离的AC18中,底物或电感器特异性的现象,表达的调节剂和可量化的LACASA活性将起作用。 div>除了促进其与真核生物的进化关系之外,新的木质纤维素放线杆菌段的基因组和功能表征还将扩大具有特定生物技术应用的氧化还原中心的范围。 div>
腺样囊性癌(ACC)是一种罕见的,通常增长且侵略性的头部和颈部恶性肿瘤。尽管具有临床意义,但我们对ACC中细胞进化和微环境的理解仍然有限。我们使用16S rRNA基因测序研究了50个ACC肿瘤组织和33个相邻正常组织的肿瘤内微生物组。这使我们能够表征ACC内的细菌群落,并探索细菌群落结构,患者临床特征和通过RNA测序获得的肿瘤分子特征之间的潜在关联。ACC中的细菌组成与相邻的正常唾液组织中的细菌组成显着不同,并且ACC表现出各种水平的物种丰富度。我们确定了ACC中的两个主要微生物亚型:口服样和肠状。口服样微生物组,其特征在于奈瑟氏菌,瘦素,放线症,链球菌,Rothia和Veillonella的多样性和丰度(通常在健康的口腔中发现)与不太积极的ACC-II分子亚型和改善的患者相关。值得注意的是,我们在口腔癌以及头颈部鳞状细胞癌中鉴定了相同的口腔属。在两种癌症中,它们都是与更多样化的微生物组,侵略性较低的肿瘤表型相关的共享口腔群落的一部分,并且可以更好地生存,这些生存率揭示了属属作为ACC和其他头部和颈部癌症中有利微生物的潜在Pancancer生物标志物。相反,肠状肿瘤内微生物组具有低多样性和肠道粘液层降解物种的殖民化,例如菌属,Akkermansia,blautia,blautia,bifidobacterium和entococcus与较差的局面相关联。较高水平的细菌型thetaiotaomicron与生存率明显较差,并且与基于聚糖基基细胞膜成分的肿瘤细胞生物合成呈正相关。
Acanthamoeba是一种在水和土壤中的自由活动的变形虫,是一种新兴的病原体,引起严重的眼部感染,称为Acanthamoeba角膜炎。在其自然环境中,Acanthamoeba作为环境异养捕食者的双重功能,并为一系列抵抗消化的微生物提供了双重宿主。我们的目标是表征系统发育不同的acanthamoeba spp的细胞内微生物。在澳大利亚和印度通过直接从变形虫中测序16S rRNA扩增子。通过原位杂交和电子显微镜进一步证实了细胞内细菌的存在。在评估的51个分离株中,有41%的细胞内细菌聚集在四个主要的门中:假单胞菌(以前称为proteobacteria),杆菌(以前称为拟杆菌),拟杆菌菌,放线症(先前称为actinobacteria)和杆菌(先前已知的杆菌)(以前已知)(以前已知)(以前已知)(以前已知)。线性歧视分析效应尺寸分析确定了样本类型之间的不同微生物丰度模式;假单胞菌物种在澳大利亚角膜分离株中丰富(p <0.007),肠杆菌在印度角膜分离株中显示出更高的丰度(p <0.017),而在澳大利亚水分离株中,细菌含量丰富(p <0.019)。来自印度和澳大利亚的角膜炎患者的acanthamoeba分离株的细菌β多样性显着差异(p <0.05),而α多样性并没有根据原产国或隔离来源而变化(p> 0.05)。与临床分离株相比,在水分离株中鉴定出更多样化的细胞内细菌。共聚焦和电子显微镜证实了经历了二进制裂变宿主内二元裂变的细菌细胞,表明存在可行的细菌。这项研究阐明了Acanthamoeba中同胞生活方式的可能性,从而强调了其作为潜在人类病原体的掩体和载体的关键作用。
土壤微生物和酶通过促进土壤骨料形成和稳定性以及参与SOC循环和积累来在土壤有机碳(SOC)隔离中起关键作用。然而,土壤微生物和酶充当促进快速城市化过程中SOC动态变化的介体的影响尚不清楚。因此,本研究选择了中国南昌市(505 km 2)的建设区域,作为研究区域。采样调查,以区分不同的城市化水平。使用土壤微生物群落和酶活性分析了城市化过程中不同聚集体的动态变化的驱动因素。结果表明,随着城市化强度的增加,SOC含量和股票都显着下降(p <0.05)。在0.25–1 mM的聚集体中观察到最高的SOC股票和贡献率,它们受到城市化的显着影响(p <0.05)。此外,革兰氏阳性细菌(G+)和放线症的生物量以及低腹膜化区域中N-乙酰基葡萄糖氨基酶和酸性磷酸酶(AP)的活性显着高于高腹化区域(P <0.05)。soc与真菌,羊膜霉菌真菌,G+,革兰氏阴性菌,静脉肌动症,原生代,β-1,4-葡萄糖苷酶,N-乙酰基果糖酰胺酶,AP,catalase和Catalase和Catalase和Catalase。与土壤酶相比,土壤微生物在SOC固结中表现出更大的作用(22.7%)。 这些与土壤酶相比,土壤微生物在SOC固结中表现出更大的作用(22.7%)。这些此外,结构方程模型表明,城市化可以直接或间接导致骨料SOC的降低,从而改变土壤的物理化学特性并影响微生物和酶动力学。但是,较大的植被特征索引减轻了城市化对SOC的负面影响。总体而言,城市化对土壤碳储存产生了负面影响。将来,重要的是考虑着专注于改善土壤养分,维持土壤结构,保护现有城市树木并增强植物多样性的策略。
图 1.1. 天蓝色链霉菌线性基因组的表示。 ........................................................................... 2 图 1.2. 天蓝色链霉菌的发育生命周期 .............................................................................. 4 图 1.3. 来自链霉菌的抗生素的主要发现和日期。 ...................................................................... 11 图 1.4. 放线菌紫红素的生物合成。 ............................................................................................. 15 图 1.5. 普罗地金胺的生物合成。 ............................................................................................. 18 图 1.6. 参与调节天蓝色链霉菌次级代谢的双组分系统。 ............................................................................................. 22 图 1.7. 参与调节天蓝色链霉菌次级代谢的单组分和多组分系统。 ............................................................................................. 26 图 1.8. 激活次级代谢产物产生的遗传策略。 ............................................................................................. 31 图 1.9.激活次级代谢产物产生的合成策略。................................................................................................................ 33 图 1.10. 激活次级代谢产物产生的生态策略。...................................................................................................... 36 图 1.11. 激活次级代谢产物产生的化学策略。...................................................................................................... 38 图 2.1. ARC2 系列抑制脂肪酸生物合成途径中的 FabI (Craney 等,2012)。............................................................................................................................................. 43 图 2.2. ARC2 全面改变天蓝色链霉菌 M145 中的基因表达。............................................................................................. 45 图 3.1. 天蓝色链霉菌中涉及 AfsK/R/S 的信号转导途径的当前模型............................................................................................. 88 图 3.2. 响应 ARC2,P afsS - lux 和 P actII-ORF4 - lux 活性增加。 .................. 89 图 3.3. D afsR 和 D afsS 中的放线菌紫素生成受到影响 .............................................. 90 图 3.4. D afsK 中的放线菌紫素生成不受影响 ........................................................ 90 图 3.5. D afsR 和 D afsS 中的 ARC2 反应受到影响 ............................................................. 92 图 3.6. D afsK 中的 ARC2 反应不受影响 ............................................................................. 93 图 4.1. 天蓝色链霉菌基因组上的 afsK 、 afsR 和 afsS 基因的组织以及 AfsS 蛋白序列。 ............................................................................................................. 99 图 4.2. AfsS 是一种具有三个序列重复的保守蛋白。 ............................................................................. 100 图 4.3.AfsS 被预测为一种高度无序的蛋白质。 ........................................................................................... 101 图 4.4. AfsS 序列重复中的点突变损害了基础的放线菌素产生。 ......................................................................................................................... 102 图 4.5. D afsS[ermE *: afsS D31A ] 中的 ARC2 反应受到损害。 ............................................................................. 103 图 A1.1. 小家鼠 PkA 和结核分枝杆菌 PknB 的催化激酶结构域的一级序列比对 . ................................................................................................ 156 图 A1.2. 天蓝色链霉菌 M600 D SCO3820::apr 中的 ARC2 反应受到损害。 ......................................................................................................................... 160 图 A1.3. SCO6219 催化激酶结构域与天蓝色链霉菌的丝氨酸/苏氨酸激酶没有高度同源性。 ........................................................................................... 162 图 A1.4. AfsK、PkaG 和 SCO6219 中的蛋白质结构域预测摘要。 ............................................................................................. 167 图 A1.5. SCO3820 的缺失呈现天蓝色链霉菌 M145 的两种不同表型。 ........................................................................................................................... 168 图 A2.1. 委内瑞拉链霉菌基因组上的 afsR 和 afsS 直系同源物以及 AfsS Sv 蛋白序列的组织。 ........................................................................................... 183 图 A2.2. AfsS Sv 样蛋白在链霉菌中是保守的。 ........................................................................... 185 图 A2.3. AfsS Sv 被预测为一种无序蛋白质。................................................................ 186AfsK、PkaG 和 SCO6219 中的蛋白质结构域预测摘要。 ...................................................................................................................................... 167 图 A1.5. SCO3820 的缺失呈现了天蓝色链霉菌 M145 的两种不同表型。 ............................................................................................................................................. 168 图 A2.1. 委内瑞拉链霉菌基因组上的 afsR 和 afsS 直系同源物的组织以及 AfsS Sv 蛋白序列。 ............................................................................................................. 183 图 A2.2. AfsS Sv 样蛋白在链霉菌中是保守的。 ............................................................................................. 185 图 A2.3. AfsS Sv 被预测为无序蛋白。 ............................................................................................................. 186AfsK、PkaG 和 SCO6219 中的蛋白质结构域预测摘要。 ...................................................................................................................................... 167 图 A1.5. SCO3820 的缺失呈现了天蓝色链霉菌 M145 的两种不同表型。 ............................................................................................................................................. 168 图 A2.1. 委内瑞拉链霉菌基因组上的 afsR 和 afsS 直系同源物的组织以及 AfsS Sv 蛋白序列。 ............................................................................................................. 183 图 A2.2. AfsS Sv 样蛋白在链霉菌中是保守的。 ............................................................................................. 185 图 A2.3. AfsS Sv 被预测为无序蛋白。 ............................................................................................................. 186
1。今天的引言,有机农产品的种植是世界上最重要的问题之一,它基于有机肥料的使用。包括;可以通过使用辅助物来实现。从这个角度来看,可以通过培养辅助作物,达到高生物质,粉碎栽培的生物量,在田间均匀散布,耕作土地,考虑到自然土壤和气候条件,从而满足有机肥料的需求。然而,微生物在将有机肥料转化为植物吸收的一种形式中的重要性是无与伦比的,他们的研究是紧迫的任务之一。辅助作物的种植可改善土壤水和空气状态。当种植尖峰的农作物时,这种情况尤其明显。同样,如果秋季和早春的辅助作物被粉碎在地面上,它们在土壤中扮演卫生作用,并为棉花疾病和害虫的略有减少提供了基础[1,2]。siderates在改善土壤生育能力和土壤中的微生物过程中起着重要作用。根据数据,土壤微生物包括细菌,放线菌和真菌,其中约70%是细菌,约27-30%是放线症,约1-3%是真菌[3,4,5,6]。如果土壤的农业物理,水物质特性是适度的,则其中的微生物被激活,因此土壤肥力会增加。因此,对土壤菌群和生物学的了解,对各种农业技术活动的评估是一个非常重要的问题。尤其是,在短行棉花旋转中从棉花中释放的辅助物不仅会影响土壤的农业物理特性,而且会影响植物中发生的所有生命过程以及土壤的微生物活性,因此其研究是紧迫的问题之一。从来源中知道,从棉花,冬小麦和其他农作物种植的区域清除的土地上,辅助作物对土壤生育能力(包括土壤特性和微生物)具有显着的积极影响。然而,在撒马尔罕区域的旧灌溉草地 - 抗土壤的条件下,纯和混合种植了辅助作物的效果,生物量的培养以及所得的生物量在土壤上对土壤微生物活性的应用,并未充分研究。因此,这项研究是在2019 - 2020年根据萨马尔桑德地区Ishtikhon区的农场“ Nurmon Abdullaev”农场灌溉的草地 - 抗原土壤的条件进行的。
3. Lourenço TGB、Heller D、Silva-Boghossian CM、Cotton SL、Paster BJ、Colombo APV 等。牙周健康和患病患者的微生物特征谱。临床牙周病学杂志。2014;41(11):1027-36。4. Arora N、Mishra A、Chugh S。微生物在牙周炎中的作用:我们到达顶峰了吗?除了红色复合体之外,还有一些未被发现的细菌。印度牙周病学会杂志。2014;18(1):9-13。5. Belibasakis GN、Belstrøm D、Eick S、Gursoy UK、Johansson A、Könönen E 等。牙周微生物学和牙周病的微生物病因:历史概念和当代观点。牙周病学 2000。 2023;第 1-17 页。6. Socransky SS、Haffajee AD。牙周微生物生态学。牙周病学。2000;38(1):135-87。7. Mohanty R、Asopa S、Joseph M、Singh B、Rajguru J、Saidath K 等人。红色复合体:口腔菌群中的多微生物聚集体:综述。家庭医学初级护理杂志。2019;8(11):3480-6。8. Shaikh HM、Patil S、Pangam T、Rathod K。多微生物协同作用和菌群失调:概述。印度牙周病学会杂志。2018;22(2):101-6。 9. Joshi V、Bhat K、Kugaji M、Ingalgi P。印度慢性牙周炎患者和牙周健康成人中伴放线杆菌的出现情况。印度牙周病学会杂志。2016;20(2):141-4。10. Holt SC、Kesavalu L、Walker S、Genco CA。牙龈卟啉单胞菌的毒力因子。牙周病学。1999;20:168-238。11. Slots J、Listgarten MA。牙龈拟杆菌、中间拟杆菌和伴放线杆菌与人类牙周病的关系。临床牙周病学杂志。1988;15(2):85-93。 12. Potempa J、Sroka A、Imamura T、Travis J。牙龈卟啉单胞菌的主要半胱氨酸蛋白酶和毒力因子:多域蛋白复合物的结构、功能和组装。Curr Protein Pept Sci。2003;4(6):397-407。13. Mayrand D、Grenier D。外膜囊泡的生物活性。Can J Microbiol。1989;35(6):607-13。14. Mihara J、Holt SC。从牙龈卟啉单胞菌W50中分离的成纤维细胞活化因子的纯化和表征。Infect Immun。1993;61(2):588-95。15. Mihara J、Yoneda T、Holt SC。牙龈卟啉单胞菌衍生的成纤维细胞活化因子在骨吸收中的作用。感染免疫。1993;61(8):3562-4。16. Onishi S、Honma K、Liang S、Stathopoulou P、Kinane D、Hajishengallis G 等人。Tannerella forsythia 亮氨酸富集重复蛋白 BspA 在牙龈上皮细胞中表达 Toll 样受体 2 介导的白细胞介素 8。感染免疫。2008;76(1):198-205。17. Armitage GC、Dickinson WR、Jenderseck RS、Levine SM、Chambers DW。龈下螺旋体百分比与牙周病严重程度的关系。牙周病学杂志。 1982;53(9):550–6。 18. Honma K、Inagaki S、Okuda K、Kuramitsu HK、Sharma A。连翘胞外多糖合成操纵子在生物膜发育中的作用。微生物病原体。 2007;42(4):156–66。 19. Socransky SS、Haffajee AD、Cugini MA、Smith C、Kent RL。龈下牙菌斑中的微生物复合体。临床牙周病学杂志。1998;25(2):134-44。20. Hajishengallis G. 牙周炎:从微生物免疫颠覆到全身炎症。自然免疫学评论。2015;15(1):30-44。21. Lamont RJ、Koo H、Hajishengallis G. 口腔微生物群:动态群落和宿主相互作用。自然微生物学评论。2009;16(12):745-59。22. Chakar C、Menassa G、Khayat R. 牙周微生物组第一部分:文献综述。国际阿拉伯牙科杂志。2021;12(1):41-7。23. Priyadharsini JV。通过计算机模拟验证非抗生素药物对乙酰氨基酚和布洛芬作为抗红色复合病原体的抗菌剂。《牙周病学杂志》。2019;90(12):1441-8。24. Ushanthika T、Girija ASS、Paramasivam A、Priyadharsini JV。通过计算机模拟方法识别利血平靶向的红色复合病原体中的毒力因子。《天然产物研究》。2021;35(11):1893-8。25. Maheaswari R、Kshirsagar J、Lavanya N。聚合酶链反应:牙周病学的分子诊断工具。《印度社会科学杂志》
Person-to-Person Microbiota Transmission Can Influence Depression and Anxiety in Newly Married Couples: Six-Month Interim Results Running title: Depression and anxiety can be transmitted between spouses Reza Rastmanesh 1* , Balachandar Vellingiri 2 , Ciro Gargiulo Isacco 3 , Abolfazl Sadeghinejad 4 , Neil Daghnall 5 *1 Independent Researcher, # 6 Physicians Building, Sarshar Alley,塔吉里什(Tajrish),德黑兰(Tehran),伊朗,邮政法规:1961835555。R.rastmanesh@gmail.com2人类细胞遗传学和干细胞实验室,旁遮普邦中央大学,旁遮普省旁遮普省旁遮普大学 - 151401,印度旁遮普邦。3 U.O.C.跨学科医学系(DIM) 微生物学和病毒学,巴里大学医院,意大利Bari 70100。 4 Pasdaran,第9 Boostan,#117,Otorhinolaryngology私人诊所,伊朗德黑兰。 5英国曼彻斯特大都会大学心理学学院。 *通讯作者:Reza Rastmanesh,#6医师大楼,Sarshar Alley,Tajrish,Tajrish,Tehran,Tehran,伊朗,邮政编码:1961835555。R.Rastmanesh@gmail.com摘要背景:口服微生物蛋白症和唾液皮质醇与抑郁症和焦虑有关。 配偶之间可能发生细菌传播。 目的:我们探索了口服微生物群,唾液皮质醇和新婚夫妇有关联的抑郁症(DA)表型。 方法:研究人员对匹兹堡睡眠质量库存(PSQI),贝克抑郁库存II(BDI-II)和贝克焦虑库存的匹兹堡睡眠质量清单(PSQI)和贝克焦虑库存的验证了,向过去六个月中已婚的夫妇进行了验证。 研究人员将296个健康对照配偶与296例病例进行了比较。3 U.O.C.跨学科医学系(DIM)微生物学和病毒学,巴里大学医院,意大利Bari 70100。4 Pasdaran,第9 Boostan,#117,Otorhinolaryngology私人诊所,伊朗德黑兰。5英国曼彻斯特大都会大学心理学学院。 *通讯作者:Reza Rastmanesh,#6医师大楼,Sarshar Alley,Tajrish,Tajrish,Tehran,Tehran,伊朗,邮政编码:1961835555。R.Rastmanesh@gmail.com摘要背景:口服微生物蛋白症和唾液皮质醇与抑郁症和焦虑有关。 配偶之间可能发生细菌传播。 目的:我们探索了口服微生物群,唾液皮质醇和新婚夫妇有关联的抑郁症(DA)表型。 方法:研究人员对匹兹堡睡眠质量库存(PSQI),贝克抑郁库存II(BDI-II)和贝克焦虑库存的匹兹堡睡眠质量清单(PSQI)和贝克焦虑库存的验证了,向过去六个月中已婚的夫妇进行了验证。 研究人员将296个健康对照配偶与296例病例进行了比较。5英国曼彻斯特大都会大学心理学学院。*通讯作者:Reza Rastmanesh,#6医师大楼,Sarshar Alley,Tajrish,Tajrish,Tehran,Tehran,伊朗,邮政编码:1961835555。R.Rastmanesh@gmail.com摘要背景:口服微生物蛋白症和唾液皮质醇与抑郁症和焦虑有关。细菌传播。目的:我们探索了口服微生物群,唾液皮质醇和新婚夫妇有关联的抑郁症(DA)表型。方法:研究人员对匹兹堡睡眠质量库存(PSQI),贝克抑郁库存II(BDI-II)和贝克焦虑库存的匹兹堡睡眠质量清单(PSQI)和贝克焦虑库存的验证了,向过去六个月中已婚的夫妇进行了验证。研究人员将296个健康对照配偶与296例病例进行了比较。数据分析使用了适当的统计方法。结果:六个月后,在门水平上,我们确定了坚硬和放线症的丰度和细菌群的增加,蛋白质,蛋白质,fusobacteria,fusobacteria和patescibacteria and Patesibacteria在健康的配偶中与da-phenobsy and da-phenobs的参与中的影响相似,并且与Da-phenobiob的参与变得相似,并且是显着的,并且显着地表明了该型号的相似之处。 (即,如果配偶具有DA-PHENOTYPE,则口服微生物群的组成变得与其配偶DA-PHENOTYPE相似,P <0.001)。这些变化与唾液皮质醇,抑郁和焦虑评分的改变相似。线性判别分析(LDA)表明,梭状芽胞杆菌,Veillonella,芽孢杆菌和lachnospileceae的相对丰度在患有DA-PHENOTYPE的失眠症中明显高于健康对照组(P <0.001)。控制混杂因素后,结果仍然很重要。正式调解分析证实了这些结果。我们观察到口服微生物群,唾液皮质醇水平以及抑郁和焦虑评分的明显类似性别差异。结论:两个人之间的微生物群在彼此之间紧密接触的抑郁症和焦虑。关键字:口服微生物群,细菌传播,抑郁,焦虑,唾液皮质醇