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World File Search System杆菌
植物相关黄杆菌
黄杆菌属是拟杆菌门中一个相对未被探索的属。最近对植物微生物组的分析已将拟杆菌门确定为植物根际的主要细菌群。虽然拟杆菌门中的黄杆菌属物种已被确认为水生生境中的病原体，但微生物组分析和新型黄杆菌属物种的表征表明它们在各种环境中存在的巨大多样性和潜力。许多黄杆菌属物种对植物的健康和发育有积极的贡献，包括促进生长、疾病控制和对非生物胁迫的耐受性。尽管黄杆菌属物种与植物的有益相互作用已被详细描述，但这些相互作用背后的分子机制和细菌决定因素仍不清楚。为了加深对黄杆菌属在植物健康中的作用的理解，我们回顾了最近的研究，重点关注它们的生态位、功能作用以及植物与有益相互作用的决定因素。此外，本综述还讨论了解释植物之间相互作用的假定机制
优化基因修饰 - 葡萄杆菌 -
电穿孔已成为一种高效的方法，可以快速，熟练地将外源质粒DNA引入各种细胞类型，尤其是那些缺乏自然能力的细胞类型。本协议文章描述了一种使用电穿孔转化农杆菌Rhizogenes K599的方法。这种方法虽然需要纯化的质粒DNA，有能力的细菌以及标准的电穿孔设备，例如基因脉冲控制器和比色杯，但就转化效率和速度而言具有显着优势。本文详细介绍的协议不仅概述了程序步骤，还强调了在A. rhizogenes K599研究的背景下有效转化的重要性。此外，它提供了有关所达到的转化率的见解，从而为研究人员提供了评估该方法疗效的基准。通过阐明设备要求和程序上的细微差别，该协议旨在使研究人员能够采用电穿孔作为A. rhizogenes k599遗传操作的可靠工具，从而促进各种生物技术应用中的进步。
乳杆菌Delbrueckii Letm
L. delbrueckii le tm的delbrueckii形式具有出色的免疫调节特性。它通过非特异性和特定的联系影响先天和适应性免疫，从而根据受试者的免疫状态来控制Th1和Th2途径对免疫反应的协调。通过刺激关键细胞因子IFN，TNF，NK细胞，IL-1，IL-2和IL-6的产生来诱导特定的抗体产生并平衡人免疫系统的能力，以保护感染和癌细胞。它也是一种免疫调节剂，可以通过细胞介导的免疫来平衡和归一化的非特异性反应，并在病原剂存在下诱导更高的反应。它在慢性疾病，炎症和免疫失速（如肿瘤）中提供了免疫平衡（通过抑制）。LE菌株因此调节了对内源性和外源致病剂的免疫反应。
乙酰杆菌中的基因组工程内源性CRISPR/CAS系统，乙酰杆菌和梭状芽胞杆菌自动乙醇
乙细菌可以通过将CO 2转换为工业相关的化学物质和燃料的能力来在净零中发挥重要作用。对该潜力的全面开发将依靠有效的代谢工程工具，例如基于链球菌的链球菌CRISPR/CAS9系统的工具。然而，试图将含Cas9的载体引入木质杆菌的尝试不成功，这很可能是由于Cas9核酸酶毒性的毒性，并且存在内源性a。Woodii限制的识别位点 - cas9 Gene中的Modiiii限制（R -M）系统。作为替代方案，本研究旨在促进将CRISPR/CAS内源系统作为基因组工程工具的开发。因此，开发了一个Python脚本，以自动化杂质的邻近基序（PAM）序列的预测，并用于识别A. woodii I型I型I-B CRISPR/CAS系统的PAM候选。分别通过干扰测定和RT-QPCR在体内表征识别的PAM和本地领导者序列。由本机领导者序列，直接重复和足够的间隔者组成的合成CRISPR阵列的表达，以及用于同源重组的编辑模板，成功地导致了300 bp和354 bp的生成Pyre和Pye和PheA的架子内缺失。为了进一步验证该方法，还产生了3.2 kb的HSDR1缺失，以及在PHEA基因座的荧光激活和吸收转换TAG（快速）报告基因的敲入。同源臂长度，细胞密度和用于转化的DNA量显着影响编辑的效率。随后将设计的工作流应用于梭状芽胞杆菌的I型I-B CRISPR/CAS系统，从而使Pyre的561 bp框架内缺失具有100％的编辑效率。这是使用其内源性CRISPR/CAS系统的A. woodii和C.自身乙烷的基因组工程的第一个报告。
农杆菌介导的转化效率和...
摘要 四十年来，植物转化与再生技术不断发展。在水稻（Oryza sativa L.）中，农杆菌介导的转化方法利用成熟种子和未成熟胚在粳稻和一些籼稻品种中具有较高的转化效率。然而，这些方法在2010年以来华南地区开发的最新籼稻品种中转化效率较低。在本文中，我们通过基于CRISPR/Cas的基因组编辑和传统的过表达转化探索了优质高产籼稻品种南桂占（NGZ）的植物培养再生。我们以成熟种子和基因谷粒大小和数量1（GSN1）为例，比较了该品种与其他四个广泛使用的籼稻品种和一个粳稻品种的转化效率。我们观察到不同品种中过表达系的谷粒大小普遍较小，而基因编辑系的谷粒大小较大。 NGZ 表型使其成为研究基因功能的极佳模型。我们还研究了愈伤组织中单核苷酸多态性 (SNP) 的分布和再生相关基因的表达水平差异，可能揭示了 NGZ 在农杆菌介导转化中的优势来源。这些结果为 NGZ 在与谷物改良相关的基因编辑和过表达转化中的高级应用提供了启示，为“水稻育种 4.0 时代”做出了贡献。
农杆菌传递密码子的开发......
此预印本的版权所有者此版本于 2022 年 9 月 20 日发布。；https://doi.org/10.1101/2022.09.20.508560 doi：bioRxiv preprint
高效农杆菌介导转化和...
荞麦 (Fagopyrum tataricum (L.) Gaertn.) 是一种特殊的作物，以其显著的健康益处、高含量的有益多酚和无麸质特性而闻名，使其成为备受追捧的功能性食品。它的自花授粉能力和对恶劣环境的适应性进一步增强了它作为可持续农业选择的潜力。为了利用其独有的性状，荞麦的遗传转化至关重要。在本研究中，我们优化了农杆菌介导的荞麦愈伤组织转化方案，使再生植物的转化率达到约 20%。通过成功的 GUS 染色、GFP 表达以及通过 FtPDS 基因失活产生白化植物，证实了该方案的有效性。这些结果验证了基因操作的可行性，并强调了荞麦性状增强的潜力。
农杆菌介导的多重 CRISPR/...
摘要：在巴基斯坦，棉花作物占国内生产总值的 23%，其大量出口为贸易业务提供了 60% 的总利润。不幸的是，双子病毒以惊人的速度摧毁了棉花作物。现在，CLCuV 导致棉花作物发生棉花卷叶病毒病并降低其产量。这种病毒对棉花植物的攻击给巴基斯坦造成了 50 亿美元的损失。在这方面，使用了一些传统方法，如植物育种和特定的 RNA 编辑。同时，生物技术引入了一些非常有吸引力的技术，这些技术具有根除这种疾病的巨大潜力。这些技术包括 ZFN、TALEN 和 CRISPR/Cas9。在我的研究中，采用 CRISPR 方法是因为其具有出色的位点特异性诱变效率。不同 CLCuV 的 rep 基因的保守位置被确定为靶位点。这些特定位点为 3 个 gRNA 的建立提供了信息。克隆了具有多个引导RNA和1Cas9的单一表达载体pHSE-401。使用了特定的棉花品种coker-312。通过切除棉花植株的下胚轴并通过农杆菌EHA-105菌株进行传递感染来进行载体的转化。然后，将1000个感染性下胚轴转移到具有各自抗生素的MSB上，然后转移到将下胚轴边缘转化为愈伤组织的再生培养基上。仅获得两个转基因愈伤组织，转基因愈伤组织的百分比为0.02％，通过PCR筛选并在凝胶上进行电泳。200bp的条带证实了棉花愈伤组织中存在CRISPR/Cas9构建体。关键词：CRISPR/Cas9，多重载体，3gRNA和Cas9，农杆菌，转化，愈伤组织。版权所有 © 2020 作者：这是一篇开放获取的文章，根据知识共享署名 4.0 国际许可（CC BY-NC 4.0）分发，允许在任何媒体中无限制地使用、分发和复制，用于非商业用途，前提是注明原作者和出处。 1. 引言 巴基斯坦的经济主要依靠农业部门。其在 GDP 中的百分比为 19.82%，但农业部门的参与度从 1950 年的 50% 下降到 2014 年的 21% 左右。农产品、林业劳动力、牲畜养殖和农作物转化所赚取的收入养活了巴基斯坦 64% 的乡村人口。据统计，66% 的巴基斯坦人在农业部门就业。在 20 世纪的十年里，农产品的年增长率为 2.5%。在 1997 年的农业一揽子计划中，农作物产量增长了 5.9%。为了提高农业生产力，年产量从 2010 年的 0.2% 增加到 2015 年的 2.9%（匿名，2014-2015 年）。
农杆菌介导的基因转移
以下几点突出了植物中主要双齿茎的八个主要部分。零件为：1。表皮2。皮下三。一般皮层4。内胚层5。周环6。血管链7。髓质或髓射线8。髓或髓质。DICOT词干：第1部分。表皮：表皮是茎的最外层。它由紧凑型伸长的细胞细胞组成，它们看起来在横截面中看起来是矩形桶形。细胞是透明的，没有叶绿体。