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World File Search System杨忠礼
人工神经网络在边坡稳定性分析中的应用
BP神经网络隐层节点确定方法. 计算机技术与发展 2018; 28(4): 31-35. doi: 10.3969/j.issn.1673-629X.2018.04.007。 2. 温疆, 廖建忠. 岩质边坡稳定性分析方法综述. 西部探矿工程 2012; 24(6): 153-155. doi: 10.3969/j.issn.1004-5716.2012.06.053。 3. 毛江, 赵洪达, 姚建军. 人工神经网络的应用及展望. 电子设计工程 2011; 19(24): 62-65。 4. 李红莲, 柴庆元. 人工神经网络与神经网络控制(NNC)的发展与展望。河北科技图文信息技术有限公司. 2009; 26(5): 44-46. doi: 10.3969/j.issn.1008-6129.2009.05.012。 5. 姚建国. 人工神经网络在岩土力学与工程中的局限性及对策. 中国岩石力学与工程学会. 第八届全国岩石力学与工程学术会议论文集. 2004;385-388。 6. 张建平, 陈倩. BP网络在边坡稳定性分析中的应用. 西南交通大学学报. 2001; 36(6): 648-650。 7. 杨晓峰, 陈天洪. 人工神经网络的优缺点. 计算机科学. 1994; 21(2): 23-26。 8. 冯晓霞, 周林伟, 曾绍琪, 李伟昌. 边坡岩体稳定性分析. 工程与建设 2017; 31(2): 244-247. doi: 10.3969/j.issn.1673-5781.2017.02.032.
参考文献 - 生物多样性
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患者注册部分Kisunla™（Donanemab ...
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PowerPoint 演示文稿
体外数据显示，ASC10 对 SARS-CoV-2 具有显著活性。ASC10 是公司内部发现的候选药物，拥有全球知识产权和商业权利。与美国食品药品监督管理局 (FDA) 批准的 RdRp 靶向 Molnupiravir 相比，ASC10 具有新的差异化化学结构。歌礼已为多种化合物和用途提交了专利申请。动物研究表明，与 Molnupiravir 相比，ASC10 具有更高的生物利用度。歌礼计划于 2022 年上半年在中国、美国等地提交临床试验的试验药物申请 (IND)。
计算机视觉支持的 GWAS 识别出大量毛果杨植物再生的候选调控因子
植物再生是植物繁殖的一个重要方面，也是转基因植物生产的关键步骤。然而，不同基因型和物种的再生能力差异很大，其分子基础在很大程度上是未知的。全基因组关联研究 (GWAS) 等关联作图方法早已证明能够帮助揭示植物性状变异的遗传基础；然而，这些方法的性能取决于表型分析的准确性和规模。为了对模型树杨树的植物愈伤组织和芽再生进行大规模 GWAS，我们开发了一个涉及语义分割的表型组学工作流程，以量化再生植物组织随时间的改变。我们发现得到的统计数据高度非正态分布，因此采用了变换或排列以避免违反 GWAS 中使用的线性模型的假设。我们报告了超过200个统计学上支持的数量性状基因位点（QTL），其中基因包含或接近顶级QTL，包括细胞粘附、应激信号和激素信号通路的调控因子，以及其他多种功能。我们的研究结果鼓励植物再生过程中激素信号转导模型除了通常考虑的生长素和细胞分裂素途径外，还应考虑应激相关信号（例如涉及茉莉酸和水杨酸）的关键作用。我们鉴定的假定调控基因和生物学过程为理解植物再生的生物学复杂性提供了新的见解，并可能成为改善顽固基因型和物种再生和转化的新方法。
杂交杨组织培养中芽器官发生过程中等位基因特异性DNA甲基化和基因表达
植物组织再生对于遗传转化和基因组编辑技术至关重要。在再生过程中，表观遗传修饰的变化伴随着细胞命运的转变。然而，两种单倍型中的等位基因特异性 DNA 甲基化如何影响再生过程中的转录动力学仍不清楚。在这里，我们应用跨物种杂交杨（Populus alba × P. glutumoosa cv. 84 K）作为一个系统，在等位基因水平上表征从头芽器官发生过程中的 DNA 甲基化景观。直接和间接芽器官发生均显示全基因组 DNA 甲基化的降低。在基因水平上，与表达基因相比，未表达基因的甲基化程度较高。在 DNA 甲基化水平与基因表达之间表现出显著相关性的基因中，75% 的基因的表达模式与 CG 环境中的 DNA 甲基化呈负相关，而 CHH 环境中的相关性模式则相反。等位基因偏向的DNA甲基化在芽器官发生过程中是一致的，等位基因特异性甲基化区域偏移的概率不到千分之一。等位基因特异性表达分析表明，在再生过程中只有1909个基因表现出相位依赖性的等位基因偏向表达，其中启动子区域转录因子结合位点差异较大的等位基因对表现出较大的等位基因表达差异。我们的研究结果表明，在芽器官发生过程中，两个亚基因组中的转录调控相对独立，这是由顺式作用基因组和表观基因组变异所致。
天花粉-当归-乳香-没药治疗乳腺癌的药物-靶点-疾病网络分析杨金清 1 ,†
摘要 本研究旨在利用网络药理学和分子对接方法探讨瓜蒌-当归-乳香-没药（TAFM）治疗乳腺癌的关键活性成分、潜在靶点及其分子机制。利用中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）数据库获取TAFM的化学成分和相关靶点；利用GeneCards、OMIM、Drugbank和治疗靶点数据库（TTD）等数据库识别乳腺癌相关靶点；利用Cytoscape 3.9.1软件和STRING（Search Tool for the Retrieval of Interaction Gene/Proteins）数据库可视化药物成分-靶点-疾病和蛋白质相互作用网络，筛选核心成分和关键靶点。使用DAVID（Database for Annotation, Visualization and Integrated Discovery）数据库进行基因本体论（GO）和京都基因和基因组百科全书（KEGG）分析，使用AutoDock和PyMOL软件进行分子对接。发现TAFM在治疗乳腺癌中的关键活性成分包括β-谷甾醇、豆固醇、鞣花酸、天竺葵素和矮牵牛素，共鉴定出ESR1、VEGFA、PTGS2、HSP90AA1、CASP3等38个关键靶点和枢纽基因。分子对接结果证实豆固醇和胱天蛋白酶3（CASP3）是相关最密切的靶点。GO富集分析显示，参与的生物学过程主要包括药物反应、凋亡过程的正向调控和基因表达双向调控等。KEGG通路分析揭示了与癌症、炎症及感染相关疾病相关的通路的参与。研究结果提供了支持性证据，表明β-谷甾醇、豆固醇、鞣花酸、天竺葵素和矮牵牛素代表TAFM的关键生物活性成分，通过调节雌激素受体α（ESR1）、血管内皮生长因子A（VEGFA）、前列腺素-内过氧化物合酶2（PTGS2）、热休克蛋白90α（HSP90AA1）和CASP3在治疗乳腺癌中表现出抗乳腺癌活性。