规范BRG/BRM相关因子(CBAF)复合物对于在哺乳动物细胞中增强剂的染色质开放至关重要。但是,开放染色质的性质尚不清楚。在这里,我们表明,除了产生无组蛋白的DNA外,CBAF还会产生稳定的半糖体样中核小体颗粒,这些核小体颗粒含有与50-80 bp的DNA相关的四个核心组蛋白。我们的全基因组分析表明,CBAF通过靶向和分裂脆弱的核小体来制造这些颗粒。在小鼠胚胎干细胞中,这些亚核体成为主转录因子OCT4的体内结合底物,而与OCT4 DNA基序的存在无关。在增强子处,与在无组蛋白DNA上占据的区域相比,OCT4 – subnuceosoms相互作用增加了Oct4占用率,并将OCT4结合的基因组间隔放大至一个数量级。我们提出,CBAF依赖性亚核体策划了一种分子机制,该分子机制在其DNA基序以外的染色质开放中发挥了OCT4功能。
总结本申请说明证明了将SGRNA序列插入靶向DNA组件的9.5 kb载体中的便利性。与传统的克隆方法不同,必须合成和重新弥补两个寡核体,该新协议提供了一种设计寡核的简单方法,并与所需的向量组装。Nebuilder HIFI DNA组装主混合物对传统方法的实质性改进,特别是节省时间,易用性和成本。
总结本申请说明证明了将SGRNA序列插入靶向DNA组件的9.5 kb载体中的便利性。与传统的克隆方法不同,必须合成和重新弥补两个寡核体,该新协议提供了一种设计寡核的简单方法,并与所需的向量组装。Nebuilder HIFI DNA组装主混合物对传统方法的实质性改进,特别是节省时间,易用性和成本。
摘要:单分子测量值提供了对分子过程的详细机械见解,例如在基因组调节中,DNA访问受核小体和染色质机械控制。然而,作用于定义的染色质底物上的核因子的实时单分子观察对于定量和可重复性执行具有挑战性。在这里,我们提出XSCAN(染色质关联的多路复用单分子检测),一种通过同时对核小体库的成像并行化单分子实验的方法,其中每种核小体类型在其核体DNA中携带一个可识别的DNA序列。并行实验。我们使用这种方法来揭示Cas9核酸酶在入侵染色质DNA作为PAM位置的函数时如何克服核小体屏障。
在许多DIY基因合成工作流中,用户通过购买合成的dsDNA(例如Gblocks)或准备重叠的寡核体的扩增子来获得用于组装的片段。通常,这些部分具有直接由用于生成碎片的寡核苷酸引起的残余误差。身份酸酶将减少/去除来自扩增子的不匹配/indel(插入/缺失)区域,这些区域源自寡核苷酸化学合成过程中掺入的误差。以下方案增加了经酶校正的DNA池中正确片段的群体,然后允许DNA聚合酶扩增以更准确性和效率富集扩增子。校正和富集步骤的组合增强了组装基因合成的质量,从而用所需的正确的DNA序列产生了较高数量的转化细菌菌落。
对于中等或高通量应用,Biolegio提供了在96和384井板中递送寡核苷酸的可能性。Biolegio提供各种或盘子的品牌和格式,例如深井板和PCR板。在冷冻管中也可以交付。要以96和384井格式订购寡寡,您可以使用我们的Excel订单表格,可以从我们的网站下载。在Excel表中(顺序表格),请选择包含您选择格式的选项卡。板中的合成从48个寡核体开始。通常,所有PCR板格式中的所有寡核酸均以10或40 nmol尺度合成,并以最大为单位。100μl水/缓冲液,标准工作浓度为100 pmol/μl(= 10 nmol运输)。用于较大体积的深井板或冷冻管。
摘要 人类和其他生物体中的 p53 基因家族成员编码大量蛋白质亚型,其功能大部分尚不明确。以果蝇为模型,我们发现 p53B 亚型主要在生殖细胞中表达,并与 p53A 共定位到亚核体中。然而,只有 p53A 介导生殖细胞和胞体中对电离辐射的凋亡反应。相反,p53A 和 p53B 都是减数分裂 DNA 断裂正常修复所必需的,当减数分裂重组有缺陷时,这种活性更为重要。我们发现在具有持续性 DNA 断裂的卵母细胞中,p53A 也是激活减数分裂粗线期检查点所必需的。我们的研究结果表明,果蝇 p53 亚型具有 DNA 损伤和细胞类型特异性功能,与哺乳动物 p53 家族成员在基因毒性应激反应和卵母细胞质量控制中的作用相似。
DNA由于其高密度和耐力而成为长期数据存储的有前途的候选者。当今DNA存储中的主要挑战是合成的成本。在这项工作中,我们提出了复合图案,该框架工作使用预制基序的混合物作为构建块,以通过缩放逻辑密度来降低合成成本。为了撰写数据,我们会引入桥寡核苷酸组装,这是一种基于复合基序合成寡核体的酶结扎技术。对于序列数据,我们引入了直接的寡核苷酸测序,这是一种基于纳米孔的技术,用于序列寡核苷,而无需组装和扩增。为了解码数据,我们引入了Motif-Search,这是一个新颖的共识呼叫者,尽管合成和测序误差,但仍提供准确的重建。使用所提出的方法,我们提出了一个端到端实验,其中我们以84位/循环的逻辑密度存储文本“ Helloworld”(14-42×改进了对象。)