核仁应激是指应激反应中细胞核仁向核质移位,[26] 人类肝癌细胞中核仁应激的发生与此类似。正如预期的那样,NPM1 在用 RS-OXA 处理的肝癌细胞中大量弥散在细胞核质中,而 NPM1 的表达在用 PBS 或 OXA 处理的肝癌细胞中以点状灶状出现(图 5b)。与此形成鲜明对比的是,在用 RS-OXA 或 OXA 处理的非癌性肝细胞的核质中未检测到明显的 NPM1 表达(图 5b),这表明 RS 促进了肝癌细胞和细胞核仁特异性地摄取 OXA 并导致核仁应激。相应地,在人肝癌细胞中,RS-OXA 引起的细胞凋亡率(膜联蛋白 V 和碘化丙啶 (PI) 双重染色 [40] 反映出这一点)和细胞毒性(图 5c 和 5d)明显高于 OXA。值得注意的是,RS-OXA 对人类非癌性肝细胞的影响远小于
该细胞系对于专注于核质运输,核孔复合动力学以及NUP50在各种细胞过程中的功能作用的研究特别有价值。NRK-EGFP2-NUP50细胞适用于一系列实验方法,包括光漂白后的荧光恢复(FRAP)(FRAP),荧光相关光谱(FCS)和其他高级显微镜技术。这些研究可以提供对核转运分子机制的见解,并有助于理解与核转运功能障碍相关的疾病,例如某些癌症和神经退行性疾病。
NUP96 基因编码了 NPC 的一个关键成分,对核质运输至关重要。NUP96 的改变不仅会影响运输机制,还会影响整个核结构和功能。因此,该细胞系是研究 NPC 相关病理以及核运输在细胞代谢和信号传导中的作用的绝佳模型。mMaple 整合到 NUP96 中允许实时跟踪和可视化体内 NUP96 动态,使其成为专注于细胞核研究和探索 NPC 功能障碍对癌症和病毒感染等疾病的影响的研究人员不可或缺的工具。
在U-2 OS-Crispr-Nup96-SNAP 33中,在基因座NUP96中的SNAP标记的整合允许荧光底物或其他化学探针的特定且共价连接,这些探针可用于想象活细胞和其他生化测试。此功能使其成为测试核质转运的分子动力学的宝贵工具,对与NPC相关的病理学的理解以及筛选影响NPC功能的治疗化合物。细胞系还保留了U-2 OS母系的特征,包括高水平的遗传稳定性和易于繁殖的易变,这要归功于它适合于高性能筛查和细胞生物学的扩展测试。
基于GO注释,进行GO富集分析,识别13个靶点的共同特征。与三个本体(CC、BP和MF)的处方靶点显著相关的GO术语数量分别为615、602和458个[21]。主要的BP术语包括对凋亡过程的负调控、对药物的反应、对序列特异性DNA结合转录因子活性的正调控、对糖皮质激素的反应以及对原生动物的防御反应。主要的CC术语包括细胞质、细胞核、细胞溶胶、细胞外区域和核质。主要的MF术语包括蛋白质结合、相同蛋白质结合、酶结合、转录因子结合和ATP结合。这些BP、MF和CC与CRC的治疗密切相关,GO富集分析结果如图4所示。
图2 ICM年龄依赖性转录改变(a)基因表达数据的主成分分析(PCA),描述了年轻和老化ICM的群体关系。(b)ICMS的预选为58个心脏和衰老的特定基因的差异表达水平。(c – g)与CM行为不同特征的关键基因的热图:(c)肌膜,(d)钙(Ca2+)循环和核质网(SR),(e)离子通道,(F)ECM沉积和(G)应力响应。(h)统计上改变的ICM的基因表达。使用单向ANOVA进行了统计分析,并进行了HOC Tukey测试。*** <0.001,** p <0.01, *p <0.05,n = 6汇总为2个技术重复。数据表示为平均值±标准偏差(SD)。(i)显示kegg途径的蛋白质组。
尼古丁等。细胞成分(图5B)主要涉及I-κB/NF-κB复合物、胞质溶胶、核质和细胞核。分子功能(图5C)主要集中在同源蛋白结合、转录因子结合、转录调控区DNA结合、RNA聚合酶II远端增强子序列特异性DNA结合、蛋白质同源二聚化活性、染色质结合、转录因子活性、序列特异性DNA结合、蛋白质异源二聚化活性。结果提示ALI/ARDS涉及体内多个生物学过程,RAM可能通过调控这些生物学过程在ALI/ARDS的治疗中发挥作用。总结出排名前20的生物学过程和所有的细胞成分及分子功能,以供直观分析。
全球推翻的循环循环将深海分配到具有独特的物理化学特征的区域,但是这些水质量代表不同生态系统的程度仍然未知。在这里,我们将广泛的基因组信息与水文和水质量年龄相结合,以描绘南太平洋的微生物分类学和功能边界。核质性丰富度随着表面海洋的深度而陡峭地增加,形成了“球形线”,在下面,丰富度始终高,在高年龄的水中略微浸入。重建的基因组自组织为六个具有空间赋予的分类人群和十个功能固定的生物素,它们主要是由在表面上的风驱动循环和深度驱动的密度驱动循环构造的。总体而言,水理化学,按水年龄的深度调节,驱动着层状海洋中的微生物多样性和功能潜力。
自适应突变现象在进化论社区中一直吸引生物学家的注意。在这项研究中,我们根据开放量子系统理论的含义提出了一种自适应突变的量子机械模型。我们调查了一个新框架,该框架解释了如何稳定和指示随机点突变,以根据量子力学约束所规定的微观规则来适应环境引入的应力。我们考虑了一对纠缠量子台由DNA和mRNA对组成,每个量子对使用了一个不同的储层,用于分析使用时间依赖的扰动理论分析纠缠的串扰。储层分别是细胞质和核质和mRNA和DNA周围环境的物理表现。我们的预测证实了适应性突变的环境辅助量子进展的作用。将同步计算作为确定双方DNA-mRNA可以通过纠缠相关的度量。防止纠缠损失对于控制环境影响下的不利点突变至关重要。我们探讨了哪些物理参数可能会影响DNA和mRNA对系统之间的纠缠,尽管与环境相互作用具有破坏性作用。
核孔(NUPS)组装核孔,形成核质和细胞质之间的渗透屏障。核苷也位于胞质灶中,提议充当孔隙组装中间体。在这里,我们表征了完整动物秀丽隐杆线虫中细胞质NUP灶的组成和发生率。我们发现,在年轻的非压力动物中,NUP灶仅出现在发育的精子,卵母细胞和胚胎,表达高水平核孔蛋白的组织。焦点是高度有粘性FG重复核苷(FG-Nups)的冷凝物,它们通过翻译后修饰和伴侣活性在细胞质中的溶解度极限接近其溶解度极限。只有一小部分FG-NUP分子集中在NUP灶中,后者在M期溶解,并且对于核孔组装而言是可分配的。核孔蛋白的凝结通过压力和增长而增强,并且在后有丝分裂神经元中单个FG-NUP的过表达足以诱导异位凝结和生物麻痹。我们推测NUP焦点是非必需的且潜在的毒性冷凝物,其组装在健康细胞中被积极抑制。