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研究人群佐治亚州新兴感染计划(EIP)(由疾病控制与预防中心资助)在卫生区8县亚特兰大地区(2019年人口420万)中,在8县亚特兰大地区进行基于人群的CDI监视。佐治亚州EIP监视活动得到了埃默里大学机构审查委员会(IRB)的批准,并放弃了同意和HIPAA授权。数据收集得到了Emory University IRB,Atlanta VA研发办公室和Grady Memorial Hospital研究监督委员会的批准,并由佐治亚州公共卫生部IRB审查。这项研究评估了2016年1月1日至2019年12月31日之间的卫生区3的成年居民。此结束日期是由于2019年冠状病毒病(COVID-19)大流行期间对FMT的使用而选择的。
基因分析的应用范围十分广泛,包括医学、法医学和农业。在传染病领域,可以通过特异性检测病原体的DNA或RNA来识别病原体。在法医学领域,从生物样本(血液、头发等)中提取的DNA信息被用作识别罪犯的证据。此外,在农业领域,人们进行基因分析是为了从农作物和牲畜中选出有用的个体。在进行此类基因分析时,通常需要从生物组织等样本中提取核酸(DNA和RNA)作为预处理步骤。
梭状芽胞杆菌艰难梭菌通过两种有效的外毒素的作用损害了结肠粘膜。塑造艰难梭菌发病机理的因素未完全理解,但可能是由于胃肠道生态系统,粘膜免疫反应和环境因素的生态因素所致。对艰难梭菌感染(CDI)中药物的作用知之甚少,但最近的研究表明,非甾体类抗炎药(NSAIDS)恶化了CDI。这种现象的基础机制尚不清楚。在这里,我们表明,NSAID通过破坏结肠上皮细胞(CEC)并使细胞对艰难梭菌毒素的敏感性加剧CDI - 介导的损伤与抑制环氧酶(COX)酶的规范作用无关。值得注意的是,我们发现NSAID和艰难梭菌毒素靶向CEC的线粒体并增强艰难梭菌毒素 - 介导的损伤。我们的结果表明,NSAID通过与艰难梭菌毒素协同损害宿主细胞线粒体来加剧CDI。一起,这项工作突出了NSAID在结肠中加剧微生物感染中的作用。
rebyota是一种基于微生物组的治疗方法,用于防止复发性艰难梭菌感染。它是最后一次剂量抗生素后24-72小时给药。rebyota是一种单剂量治疗。在管理之前,应要求患者在可能的情况下清空膀胱和肠子。应将患者放置在左侧的位置,左侧的左侧弯曲,手臂舒适地放在左侧。将润滑的给药管轻轻地插入直肠大约五英寸,朝向肚脐略微插入。袋子缓慢抬起,以使Rebyota随着重力逐渐流动。一旦整个袋子交付,捏合夹子就会关闭,并且管子缓慢拔出,使患者处于左侧位置15分钟。完成后,患者可以自由移动而无需使用洗手间。报告的最常见的不良反应是腹痛,腹泻,腹胀,肠胃气胀和恶心。
抽象的梭状芽胞杆菌艰难梭菌感染(CDI)是医院获得性腹泻的主要原因,这通常是由于广谱抗生素破坏了肠道菌群的破坏。抗生素耐药性艰难梭菌菌株的患病率不断增加,加上最近抗生素候选物的令人失望的临床试验结果,强调了对新型CDI抗生素的迫切需求。为此,我们研究了艰难梭菌Enoyl ACP还原酶(CD Fabk),这是一种从头脂肪酸合成中的至关重要的酶,是用于抗微生物组抗生素的药物靶标。为了测试这一概念,我们评估了苯基咪唑类似物296的活性的功效和体内谱,该光谱已验证以抑制细胞内CD Fabk。的抑制浓度最小(MIC 90)为2 µg/ml,与Vanymoncin(1 µg/mL)相当,这是一种护理抗生素标准。此外,有296个达到了高结肠浓缩,并在CDI结肠炎中显示出剂量依赖性疗效。给出了296个对艰难梭菌的定殖耐药性,并具有与未处理的小鼠相似的微生物组。相反,万古霉素和虚拟霉素都以与先前的报道一致的方式对小鼠微生物组诱导了显着变化。CD Fabk代表了占微生物组的CDI抗生素的潜在靶标,而苯基咪唑为设计这种剂提供了一个很好的化学起点。
梭状芽胞杆菌艰难梭菌(以前是艰难梭菌)是抗生素 - 腹泻腹泻的常见原因,它会导致严重的死亡率和发病率以及医疗保健系统的高成本[1,2]。在千年开始时,PCR核糖型(RT)027在医疗保健环境中的传播将焦点放在c上。艰难梭菌感染(CDI)作为医生疾病[3]。近年来,已经观察到与社区相关的CDI发生率的升高[4]。C的流行病学研究最常见的方法。艰难梭菌,例如PCR核分型和多焦点序列分型(MLST),仅提供适度的分辨率,不足以进行爆发研究[5]。使用核心基因组MLST(CGMLST)或单核苷酸多态性(SNP)分析来分析由整个基因组测序(WGS)产生的数据[6],并且揭示了医疗保健系统中仅考虑CDI病例的一小部分的传播。这表明无症状的运输或环境源在C的传播中起着重要作用。艰难梭菌[7]。梭状芽胞杆菌艰难梭菌也可以由猪和其他牲畜携带[8],并已成为新生小猪搜查的原因[9]。使用WGS [10,11]中描述了活股和人之间的潜在传播,尤其是RT078被认为具有人畜共患潜力[12]。2011年,这与瑞典南部的一次基于医院的暴发有关[15]。簇,该RT是2009 - 2013年瑞典人类中最常孤立的RT之一[15]。在同一时间,这是瑞典中部多种繁殖农场的小猪中唯一发现的RT [16]。尚未为RT046建立人畜共患关系,并且克隆多样性,农场内随时间变化,或者目前已知与人类分离株的关系。这项研究的目的是检测瑞典养猪场和人类CDI病例之间RT046的传播,并使用WGS研究猪群中的RT046多样性。使用两个CGMLST方案和一项SNP分析进行了多个分析策略。
梭状芽胞杆菌(以前为梭状芽胞杆菌)艰难梭菌感染发生时,细菌产生毒素会引起腹泻和结肠的炎症。这些感染的严重程度从轻度症状到威胁性结肠炎。复发性艰难梭菌感染定义为艰难梭菌感染的发作,该发作在初次发作后八周或以下的发作发生在有或没有治疗的情况下。口服抗生素是艰难梭菌感染的第一线治疗方法。发布的数据表明,使用粪便菌群恢复肠道菌群可能是一种有效的治疗艰难梭菌感染的治疗方法。经历了2种或以上艰难梭菌感染的患者可能是粪便菌群移植以防止进一步复发的候选者。