荣誉教授:盖伊·巴拉萨德先生,伊夫·巴拉先生,克劳德特·布莱恩德女士,雅克·卡特丁先生,MmeAndréeCremieux,GérardDumenil先生E Sylvie负责上学的Manon Bonifay女士:Nathalie Besnard夫人
摘要简介:大部分炎症性肠病患者(IBD)经历了胃肠道外IBD相关的炎症状况,称为肠外表现(EIM),进一步降低了生活质量,在极端情况下,可能会危及生命。EIMS的发病机理仍然未知,尽管肠道菌群改变是IBD患者的众所周知的特征,但其与EIMS的关系仍然很少研究。这项研究旨在比较有没有EIM的IBD患者的肠道菌群。方法:该研究中总共包括131名IBD患者,其中86例具有EIMS(IBD-EIM)史,而45例没有(IBD-C)。粪便样品接受了16S rRNA测序。放大序列变体(ASV)映射到SILVA数据库。比较了IBD-EIM和IBD-C之间的多样性指数和距离矩阵。使用自定义多重模型统计分析方法鉴定了差异丰富的ASV,并使用稀疏相关性(SPARCC)(SPARCC)鉴定了共同相关细菌的模块,并且与患者EIM状态有关。结果:IBD患者和EIMS患者表现出疾病活性增加,体重指数,粪便钙骨蛋白钙蛋白酶水平升高以及循环单核细胞和中性粒细胞。微生物学上,IBD-EIM比IBD-C(Mann-Whitney's Test,p = .01)和独特的粪便微生物群组成(方差的置换多变量分析;加权Unifrac,r 2 = 0.018,p = .01)。共有26个ASV在IBD-EIM和IBD-C之间表现出不同的相对丰度,包括减少的Agathobacter和Blautia和IBD-Eim组中的Eggerthella lenta增加。SPARCC分析确定了27个细菌共同关联模块,其中3个与EIM(逻辑回归,p <.05)呈负相关,其中包括重要的健康相关细菌,例如Agathobacter和Agathobacter和Faecalibacterium。结论:EIMS IBD患者的粪便菌群与没有EIM的IBD患者不同,对于EIM发病机理可能很重要。
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证未通过同行评审获得证明)是作者/资助者,他已授予Biorxiv授予Biorxiv的许可,以永久显示预印本。它是此预印本的版权持有人(该版本发布于2024年4月17日。; https://doi.org/10.1101/2024.04.13.589383 doi:Biorxiv Preprint
具核梭杆菌是一种存在于口腔微生物群中的革兰氏阴性厌氧杆菌,与结直肠癌有关 ( 1 , 2 )。结直肠癌是全球第三大常见癌症,也是癌症相关死亡的第二大原因。近年来,具核梭杆菌因其在结直肠癌发展中的潜在作用而备受关注 ( 3 , 4 )。多种风险因素都会影响癌症的发展,包括年龄、家族病史、遗传基因(如林奇综合征和家族性腺瘤性息肉病)、炎症性肠病个人病史(如克罗恩病或溃疡性结肠炎)、肥胖、缺乏运动、吸烟、大量饮酒、富含红肉和加工肉类而纤维含量低的饮食。研究表明,饮食模式在结直肠癌的发展中起着重要作用 ( 5 )。通过经验性饮食炎症模式 (EDIP) 评估确定的某些饮食与肠道炎症增加和 F. nucleatum 阳性结直肠癌风险增加有关 (6)。饮食引起的肠道炎症会改变肠道微生物群,促进结直肠癌的发生。大量食用红肉和加工肉类与结直肠癌风险增加有关,这可能是由于硝酸盐、亚硝酸盐和杂环胺等致癌物所致 (7)。饮食习惯和抗生素使用等环境因素也可能影响 F. nucleatum 在结肠中的行为。另一方面,肠道微生物在启动和促进结直肠癌发展中的作用也越来越被人们所了解。肠道微生物群与结直肠癌之间存在复杂的关系。最近的研究已发现溶没食子酸链球菌、产肠毒素脆弱拟杆菌、具核梭杆菌和大肠杆菌是与结直肠癌相关的潜在病原体 (8)。尽管肠道菌群因人而异,但某些细菌种类一直与结直肠癌有关。据报道,溶没食子酸链球菌是一种革兰氏阳性球菌,是 CRC 的危险因素 (9)。产肠毒素脆弱拟杆菌 (ETBF) 会产生脆弱拟杆菌毒素 (BFT),已知会引起腹泻并导致炎症性肠病 (IBD) (10)。类似地,研究发现,与健康个体相比,肠道共生菌大肠杆菌在结直肠癌患者的结肠中定植的水平更高 ( 11 , 12 )。然而,对这些风险因素的反应可能因种族和地理位置而异,从而影响 CRC 的分布和预后。尽管具核梭杆菌是人类口腔的常见菌,但其在 CRC 患者的结直肠肿瘤和邻近组织中的丰度较高 ( 13 , 14 )。一些研究表明具核梭杆菌与 CRC 之间存在潜在联系 ( 1 , 15 )。据报道,这种细菌在临床前模型中会促进炎症、削弱免疫反应、改变肿瘤微环境、促进化疗耐药性并促进肿瘤生长和转移 ( 16 , 17 )。此外,F. nucleatum 与 CRC 患者的预后不良有关 ( 18 )。F. nucleatum 在结直肠组织中的存在引起了人们对其作为诊断标记物或
一、概述 ............................................................................................................... 1
对微生物群和微生物组的研究以及肠道的研究,由于其改变与多种疾病的关系可能关联,因此确定了极大的兴趣。这些实体包括克罗恩病,自闭症,糖尿病,癌症或情况等多样化,如今像肥胖一样普遍。鉴于这种情况,已经对益生菌,prebi ot剂和后生物学作为微生物群和微生物组的调节剂进行了不同的建议,并寻求预防性和治疗效应,以及粪便材料转移(FMT)作为改变本地天然的天然本地。后者已经成为对肠道微生物组的唯一经验证明的有益干预措施,特别是在治疗与梭状芽胞杆菌艰难梭菌(R-CDI)相关的复发性结肠炎方面。在其余实体中,实验室演讲成本的降低有利于对微生物组的研究,该研究可以通过交付微型人的目录
•期刊分析 - 艰难梭菌感染路易·TJ,米勒MA,Mullane KM,Weiss K,Lentnek A,Lentnek A,Golan Y,Golan Y,Gorbach S,Sears P,Sears P,Shue YK; OPT-80-003临床研究组。fidaxomicin与万古霉素的艰难梭菌感染。n Engl J Med。2011 Feb 3; 364(5):422-31。doi:10.1056/nejmoa0910812。PMID:21288078。