测序运行,从收到样本到报告的周转时间不到 7 天。结果表明,可扩展的检测方法可以准确且可重复地检测出 40ng DNA 中的小变异、拷贝数变异、微卫星不稳定性 (MSI) 和肿瘤突变负担 (TMB),以及 20ng RNA 中的多个基因融合,包括已知和未知的伴侣和剪接变体。对 717 个肿瘤样本和参考材料进行了测序,其中 96 个癌症相关基因存在已知变异,以评估检测性能。所有变异类别均能以一致且可报告的变异等位基因百分比可靠地检测到,总体准确度和精确度 > 99%。我们的结果表明,高通量 CGP 检测是一种准确的分子变异检测方法,支持肿瘤学的精准治疗。支持系统和可扩展的工作流程可以每周高效解释和及时报告数百个患者癌症基因组,并具有出色的分析性能。
高通量筛选 (HTS) 是一种广泛使用的传统药物发现方法,该方法涉及针对特定生物靶标或检测方法测试大量化合物库 [4]。HTS 可以快速筛选数千至数百万种化合物以确定潜在的药物线索。它涉及几个关键步骤,包括化合物库制备和检测方法开发。HTS 需要多样化且具有代表性的化合物集合,即化合物库 [5]。这些库可以包含数千到数百万个小分子或天然产物提取物。库中的化合物通常是根据其结构多样性、药物相似性和商业可用性来选择的。化合物库可以从不同的供应商处采购,也可以在内部合成,也可以从天然产物提取物中衍生 [5]。相比之下,检测方法开发涉及设计和优化强大的生物或生化检测方法,以测量与目标疾病或病症相关的特定靶标或活性 [4, 5]。检测方法的选择取决于靶标和药物的预期作用方式。检测范围包括基于酶的检测、基于受体结合的检测、基于细胞的检测以及表型检测。
定量聚合酶链反应(QPCR)提供了一种快速,自动化和强大的现场方法,用于量化肺炎乳杆菌在构建饮用水系统中,补充并有可能替代传统的基于文化的技术。然而,由于发现与可行,传染性细菌无关的基因组副本,它在评估人类健康风险中的应用使人们越来越多。本研究通过QPCR和基于培养的方法研究了肺炎乳杆菌测量的关系,旨在建立QPCR与培养的浓度比率,以告知相关的健康风险。合格的研究使用成对水样品中的分子和基于培养的方法收集了有关肺炎乳杆菌浓度的定量数据。我们开发了一个泊松对数正态比率模型和一个随机效应荟萃分析模型,以分析跨站点内部和跨站点的QPCR培养比的变化。在系统评价中的17项研究中,有7项,包括23个特定地点数据集,用于荟萃分析。我们的发现表明这些比率通常从1:1到100:1不等,在所有地点的比率接近1:1。因此,采用默认的1:1转换因子似乎是必要的,作为一种谨慎的方法,将QPCR浓度转换为可培养的浓度,以用于健康风险模型,例如量化微生物风险评估(QMRA)。如果这种方法可能过于保守,则可活力-QPCR可以提高基于QPCR的QMRA的准确性。标准化QPCR和基于培养的方法以及影响肺炎乳杆菌可培养性的特定地点环境因素将改善对两种方法之间关系的理解。此处介绍的比率模型超出了简单的相关性分析,从而促进了关系中时间和空间异质性的研究。该分析是QMRA和分子生物学整合的一步,针对肺炎乳杆菌的框架适用于在环境中监测的其他病原体。
SNI ISO/TS 20224-4:2020,分子生物标志物分析 — 通过实时PCR检测食品和饲料中动物源性材料 — 第4部分:鸡DNA检测方法,是与ISO/TS 20224-4:2020,分子生物标志物分析 — 通过实时PCR检测食品和饲料中动物源性材料 — 第4部分:鸡DNA检测方法,采用相同对齐采用路径编制的一项新标准,采用单一语言翻译采用方法,并由BSN于2024年确定。在本标准中,采用的ISO/TS 20224-4:2020标准中的“本文件”一词替换为“本标准”,并翻译为“本标准”。本标准采用了 ISO 标准,该标准是 ISO/TS 20224 系列标准的一部分,《分子生物标志物分析 — 通过实时 PCR 检测食品和饲料中的动物源性材料》,包括: — 第 1 部分:牛 DNA 检测方法; 第2部分:绵羊DNA检测方法; 第3部分:猪DNA检测方法; 第4部分:鸡DNA检测方法; 第5部分:山羊DNA检测方法; 第六部分:马DNA检测方法; 第七部分:驴DNA检测方法。本标准中作为规范性参考使用的标准已被采纳为 SNI,即: — ISO 16577,分子生物标志物分析——术语和定义,已被采纳并具有相同的对齐级别,成为 SNI ISO 16577:2016,分子生物标志物分析——术语和定义; ISO 20813,分子生物标志物分析 - 食品和食品中动物物种检测和鉴定的分析方法(基于核酸的方法) - 一般要求和定义,已与 SNI ISO 20813:2019,分子生物标志物分析 - 食品和食品中动物物种检测和鉴定的分析方法(基于核酸的方法) - 一般要求和定义具有相同的一致性; — ISO 21571,食品—转基因生物及其衍生产品的分析方法—核酸提取,已与 SNI ISO 21571:2005,食品—转基因生物及其衍生产品的分析方法—核酸提取具有相同的一致性; — ISO 24276,食品-转基因生物及其衍生产品的分析方法-一般要求和定义,已与 SNI ISO 24276:2006,食品-转基因生物及其衍生产品的分析方法-一般要求和定义具有相同的一致性。本标准由生物分子测试方法和生物技术技术委员会19-07制定。该标准已通过技术会议讨论,并于2024年10月16日在雅加达通过电话会议达成共识,利益相关方出席
免责声明:这些工具包中提供的资源是信息资源,旨在为需要开发和验证疫苗发布检测方法的实验室提供支持。这些工具包并不意味着所有检测方法都是疫苗发布所必需的,并且许多这些文件标准资源提供了各种分析方法的信息和最佳实践,但没有提供分步程序。遵循当地法律和 cGMP 来确定疫苗产品发布所需的检测方法。此外,依赖本文档中信息的各方对了解和遵守任何适用的联邦、州或地方法律和要求负有独立责任。这些分析工具包侧重于最终疫苗产品,而不是批量疫苗物质。这些工具包的关键点是:
基于核酸的检测方法用于各种场合,其中最常见的包括检测传染性病原体(例如病毒、细菌)和残留细胞物质(例如宿主细胞 DNA),以及疾病分析。最近,此类检测方法还用于法医目的和检测生物材料中的痕量污染。后者包括药物开发应用,例如疫苗种子批次和组织培养细胞库中的病毒清除和外来因子检测。本章介绍了一系列一般信息章节,这些章节提供了支持核酸检测和分析程序的技术。使用这些技术的检测方法可能会在 USP 通用章节或其他规范中介绍。并非旨在传达监管机构可强制执行的要求。
免责声明:这些工具包中提供的资源是信息资源,旨在为需要开发和验证疫苗发布检测方法的实验室提供支持。这些工具包并不意味着所有检测方法都是疫苗发布所必需的,并且许多这些文件标准资源提供了各种分析方法的信息和最佳实践,但没有提供分步程序。遵循当地法律和 cGMP 来确定疫苗产品发布所需的检测方法。此外,依赖本文档中信息的各方对了解和遵守任何适用的联邦、州或地方法律和要求负有独立责任。这些分析工具包侧重于最终疫苗产品,而不是批量疫苗物质。这些工具包的关键点是:
tib.eu › viewer › content › targetFileName=...MSDF(多传感器数据融合)的概念和技术利用了...计算负担非常大,因此目标算法。
淡水龟种群的保护依赖于精准有效的监测技术。环境 DNA (eDNA) 分析是识别水生生态系统中隐蔽和难以捉摸的龟种的潜在方法。eDNA 分析有助于确定保护工作的重点区域并监测种群水平随时间的变化。本研究旨在评估一种快速 eDNA 检测方法对黄泥龟 (Kinosternon flavescens,一种在美国某些州濒临灭绝的指示种) 的有效性,该龟栖息于南德克萨斯州卡梅伦县的当地牛轭湖(例如 resacas)。一种针对物种的嵌套 PCR 检测旨在增强对黄泥龟种群的检测。我们从卡梅伦县的五个地点采集了水样以检测黄泥龟 eDNA。结果显示,在五个调查地点中有两个地点有黄泥龟存在。我们的研究表明,eDNA 监测对黄泥龟种群具有巨大潜力。该研究还提供了使用 eDNA 监测保护黄泥龟物种的见解,并为未来的研究和保护举措提供了建议。