结果:对95种病毒物种(包括72种RNA病毒物种和23种DNA病毒物种)共收集了2,847种病毒疫苗,手动注释并存储在小提琴疫苗数据库中。这些病毒疫苗使用了542疫苗抗原。分类学分析发现病毒疫苗涵盖的各种DNA和RNA病毒。这些疫苗针对不同的人,动物疫苗和HPV疫苗,以不同的病毒生命周期阶段(例如,病毒进入,组装,出口和免疫逃避)为目标。疫苗抗原蛋白也显示在病毒(例如HRSV疫苗)的不同病毒素位置。结构性和非结构性病毒蛋白已用于病毒疫苗的发育。根据Vaxign-ML计算,保护性疫苗抗原的蛋白质得分> 85%,该计算衡量了预测疫苗使用的适用性。虽然预测的粘合剂仍然具有保护性抗原的明显更高的机会,但只有21.42%的保护性病毒疫苗抗原被预测为粘附素。此外,我们的基因本体论(GO)富集分析使用定制的Fisher的精确测试确定了许多富集的模式,例如病毒进入宿主细胞,DNA/RNA/ATP/ION结合,并抑制宿主1类Interferon介导的信号介导的信号传导途径。病毒疫苗及其相关的实体和关系在疫苗本体论(VO)中是本体论建模和代表的。开发了小提琴Web界面,以支持病毒疫苗的用户友好查询。
Hannah P. Gideon, 1 , 2 , 23 Travis K. Hughes, 3 , 4 , 5 , 23 Constantine N. Tzouanas, 3 , 4 , 5 , 23 Marc H. Wadsworth II, 3 , 4 , 5 , 6 Ang Andy Tu, 7 Todd M. Gierahn, 7 Joshua M. Peters, 4 , 7 Forrest F. Hopkins, 4 , 8 Jun-Rong Wei, 4 , 8 Conner Kummerlowe, 9 Nicole L. Grant, 1 Kievershen Nargan, 10 Jia Yao Phuah, 1 H. Jacob Borish, 1 Pauline Maiello, 1 Alexander G. White, 1 Caylin G. Winchell, 1 , 2 , 11 Sarah K. Nyquist, 3 , 4 , 5 , 9 , 12 Sharie Keanne C. Ganchua, 1 Amy Myers, 1 Kush V. Patel, 1 Cassaundra L. Ameel, 1 Catherine T. Cochran, 1 Samira Ibrahim, 3 , 4 , 5 Jaime A. Tomko, 1 Lonnie James Frye, 1 Jacob M. Rosenberg, 4 , 8 , 13 Angela Shih, 13 Michael Chao, 4 , 8 Edwin Klein, 14 Charles A. Scanga, 1 , 2 Jose Ordovas-Montanes, 4 , 5 Bonnie伯格(Berger),约书亚·T·马蒂拉(Joshua T. Shalek 3,4,5,6,6,18,24,25, * 1微生物学和分子遗传学系,匹兹堡大学医学院,宾夕法尼亚州匹兹堡,宾夕法尼亚州匹兹堡研究中心,匹兹堡,宾夕法尼亚州匹兹堡大学,美国宾夕法尼亚州匹兹堡大学,美国3号宾夕法尼亚州匹兹堡大学3.哈佛大学,马萨诸塞州剑桥,美国5麻省理工学院和哈佛大学,马萨诸塞州剑桥市6美国6化学系,马萨诸塞州理工学院,马萨诸塞州剑桥市,美国7 7生物工程系),sfortune@hsph.harvard.edu(S.M.F.美国马萨诸塞州波士顿,马萨诸塞州波士顿公共卫生学院9计算与系统生物学计划,马萨诸塞州技术研究所,美国马萨诸塞州剑桥市,美国10号非洲卫生研究所,南非德班,南非,肺部,过敏和重症监护医学司,匹兹堡大学,匹兹堡大学,匹兹堡,帕特斯堡,帕特斯堡,帕特斯堡,帕特斯堡,帕特斯堡,美国12级计算机。美国马萨诸塞州剑桥市技术,13美国马萨诸塞州马萨诸塞州马萨诸塞州综合医院,美国马萨诸塞州波士顿,美国14号实验室动物研究部,匹兹堡大学,匹兹堡宾夕法尼亚州匹兹堡大学15美国匹兹堡,匹兹堡大学匹兹堡大学的传染病学系,美国15南非德班,纳塔尔17化学工程系,马萨诸塞州剑桥,马萨诸塞州剑桥市,美国马萨诸塞州剑桥研究所18宾夕法尼亚州剑桥市的马萨诸塞州综合癌症研究所,马萨诸塞州科技研究所19 of KwaZulu-Natal, Durban, South Africa 21 Department of Infection and Immunity, University College London, London, UK 22 Department of Microbiology and Physiological Systems, University of Massachusetts Medical School, Worcester, MA, USA 23 These authors contributed equally 24 These authors contributed equally 25 Lead contact *Correspondence: joanne@pitt.edu (J.L.F.),shalek@mit.edu(A.K.S。)https://doi.org/10.1016/j.immuni.2022.04.004
慢性疼痛病理是由周围和/或中枢神经系统的适应不良变化引起的,是一种影响 20% 欧洲成年人口的致残性疾病。更好地了解这种发病机制将有助于确定新的治疗目标。最近,从大脑网络之间连贯的低频血流动力学波动中提取的功能连接 (FC) 为研究大规模大脑网络及其在神经/精神疾病中的破坏提供了一种强有力的方法。对 FC 的分析通常是对随时间推移的平均信号进行的,但最近,对 FC 动态的分析也提供了新的有希望的信息。考虑到持续性疼痛动物模型的局限性以及它们作为增进我们对慢性疼痛致病性神经生物学基础的理解的有力工具,本研究旨在通过使用功能性超声成像(一种具有独特时空分辨率(100 μ m 和 2 ms)和灵敏度的神经成像技术)来确定临床相关的持续性炎症疼痛(佐剂性关节炎)动物模型中功能连接的变化。我们的研究结果显示,关节炎动物的 FC 发生了显著变化,例如躯体运动 (SM) 网络的一个子部分,发生在疾病开始后数周。此外,我们首次证明通过超声评估的动态功能连接可以为我们定义为大脑状态的动态模式提供定量和可靠的信息。虽然主要状态由 SM 网络中血流动力学波动的整体同步组成,但关节炎动物在统计上花费更多时间处于其他两种状态,其中发炎后爪的初级感觉皮层的波动与 SM 网络的其余部分不同步。最后,将 FC 变化与个体动物的疼痛行为相关联表明 FC 改变与疼痛的认知或情感方面之间存在联系。我们的研究引入了 fUS 作为一种新的转化工具,以增强对慢性疼痛主要临床前模型中动态疼痛连接组和大脑可塑性的理解。
背景和目的。在医学成像中,群体研究必须克服个体之间存在的差异,以识别可用于诊断目的的不变图像特征。在功能性神经成像中,识别在群体水平上成立的神经编码原理的一个有吸引力的解决方案是受试者间模式分析,即从来自多个受试者的数据中学习预测模型并评估其对新受试者的泛化性能。尽管近年来它越来越受欢迎,但由于文献中明显缺乏正式定义,其广泛采用仍然受到阻碍。在本文中,我们精确介绍了针对功能性神经成像的多变量组分析的受试者间模式分析的第一个原则性形式化。方法。我们建议将受试者间模式分析构建为多源传导传递问题,从而将其置于几个定义明确的机器学习设置中并拓宽可用算法的范围。我们描述了两组使用几个开放数据集的受试者间大脑解码实验:一项涉及 16 名受试者的脑磁图研究和一项涉及 100 名受试者的功能性磁共振成像范例。我们通过进行模型比较来评估我们框架的相关性,其中一个大脑解码模型利用我们的形式化,而其他则不利用。结果。第一组实验证明了使用受试者标准化的大脑解码器与使用其他标准化方案的最先进模型相比具有优越性,证明了我们形式化的传导和多源组件的兴趣第二组实验定量表明,即使经过这样的转换,大脑解码器也更难以推广到新参与者而不是来自训练阶段可用的参与者的新数据,从而凸显了需要克服的转移差距。结论。本文将受试者间模式分析的第一个形式化描述为多源传导迁移学习问题。我们利用几个互补的功能性神经成像数据集上的概念验证实验证明了这种形式化的附加价值。这项工作将有助于推广功能性神经成像人群研究的受试者间模式分析,并为未来的方法创新铺平道路。
描述 用于分析空间点模式的综合开源工具箱。主要关注任何空间区域中的二维点模式,包括多类型/标记点。还支持三维点模式、任意维度的时空点模式、线性网络上的点模式和其他几何对象的模式。支持空间协变量数据,例如像素图像。包含 3000 多个用于绘制空间数据、探索性数据分析、模型拟合、模拟、空间采样、模型诊断和形式推理的函数。数据类型包括点模式、线段模式、空间窗口、像素图像、镶嵌和线性网络。探索性方法包括样方计数、K 函数及其模拟包络、最近邻距离和空白空间统计、Fry 图、成对相关函数、核平滑强度、交叉验证带宽选择的相对风险估计、标记相关函数、分离指数、标记依赖性诊断和协变量效应的核估计。还支持随机模式的正式假设检验(卡方、Kolmogorov-Smirnov、蒙特卡罗、Diggle-Cressie-Loosmore-Ford、Dao-Genton、两阶段蒙特卡罗)和协变量效应检验(Cox-Berman-Waller-Lawson、Kolmogorov-Smirnov、ANOVA)。可以使用与 glm() 类似的函数 ppm()、kppm()、slrm()、dppm() 将参数模型拟合到点模式数据。模型类型包括泊松、吉布斯和考克斯点过程、奈曼-斯科特聚类过程和行列式点过程。模型可能涉及对协变量的依赖、点间相互作用、聚类形成和对标记的依赖。模型通过最大似然法、逻辑回归法、最小对比度法和复合似然法进行拟合。可以使用函数 mppm() 将模型拟合到点模式列表(重复的点模式数据)。除了上面列出的所有特征外,该模型还可以包括随机效应和固定效应,具体取决于实验设计。
抽象背景。尽管在IDH-WildType胶质母细胞瘤的生物学上取得了进步,但它仍然是一种毁灭性的疾病,中位生存期不到2年。然而,对当前护理标准治疗方案的异质反应的分子基础包括最大安全切除,辅助辐射和替莫唑胺化学疗法的分子基础仍然未知。方法。对106名患者的配对初始和复发性胶质母细胞瘤试样进行了全面的组织病理学,基因组和表观依赖氏症评估,以研究分子进化和细胞表型,这些分子进化和细胞表型。结果。虽然TERT启动子突变和CDKN2A纯合缺失是通过初始肿瘤和复发性肿瘤共享的神经胶质作用期间的早期事件,但大多数其他复发性遗传改变(例如,EGFR,PTEN,PTEN和NF1)通常是私有的,属于初始或反复发生的肿瘤,表明后期在后球后期的摄取。此外,胶质母细胞瘤表现出异质的表观基因组进化,亚群在全球性高甲基化,低甲基化或保持稳定的情况下变得越来越稳定。进行肉瘤转化的胶质母细胞瘤的复发时间较短,并且在NF1,TP53和RB1改变以及间质表观遗传学类中显着富集。在替莫唑胺治疗后出现体细胞超突变的患者与疾病复发和长时间的总生存期间的间隔明显更长,并且在MGMT启动子区域的4个特定CpG位点上增加了甲基化,这与这种超孕期的发展显着相关。最后,开发了347个关键CpG位点的DNA甲基化水平变化的表观基因组进化特征,与临床结局显着相关。结论。胶质母细胞瘤经历异质的遗传,表观遗传和细胞进化,其基础是预后不同的治疗反应。
本研究旨在分析印尼科技公司实施的 B2C 电子商务模式,并确定影响其成功的因素及其实施过程中面临的挑战。随着互联网普及和智能手机使用,B2C(企业对消费者)电子商务模式在印尼迅速发展。此外,政府政策和中小企业的数字化是该国电子商务行业发展的关键因素。本研究采用文献综述和描述性分析方法,收集行业报告、期刊和印尼领先电子商务公司的数据中的二手数据。结果表明,印尼 B2C 模式的成功受到消费者信任、公司之间激烈竞争以及仍然存在挑战的物流基础设施的显著影响。此外,人工智能和区块链等技术可以增强客户体验并改进数据管理系统。Tokopedia 和 Bukalapak 等大公司已经证明,制定正确的战略可以帮助他们保持市场份额。不过,由于激进的客户获取策略,他们也面临着利润率下降的挑战。展望未来,全球市场扩张和中小企业赋权对于确保印度尼西亚 B2C 电子商务模式的可持续增长至关重要。本研究有望为政策制定者和行业参与者提供见解,以制定更有效的战略来优化印度尼西亚电子商务的潜力。
结果:IFOF 存在显著的年龄相关差异,体积和 MD 均有显著变化。具体而言,IFOF 的体积在 31-40 岁年龄组达到峰值(14.42 ± 6.05),在 41-50 岁年龄组下降(8.71 ± 5.07),统计学上显著的 p 值为 0.019。同时,MD 随年龄显著增加,从 18-30 岁组的 0.86 ± 0.08 增加到 31-40 岁组的 1.09 ± 0.13,在 41-50 岁组稳定在 0.96 ± 0.12(p < 0.001)。值得注意的是,虽然 FA 值在各年龄组中保持相对稳定(p = 0.063),但 MD 的增加表明神经效率下降或潜在的髓鞘退化。其他神经束,包括 SFOF 和 SLF,在各个年龄组中表现出体积、FA 和 MD 的稳定性,表明某些神经通路具有一定程度的弹性。
按照国际上对太阳能利用区域的划分,北非是世界上太阳辐射最强的地区之一[1],图1为北非地区年平均太阳辐射强度分布图,图2为北非地区70 m高度风速分布图,是可再生能源发展的资源基础[2],[3]。近年来,北非地区许多国家都制定了自己的清洁能源发展计划,摩洛哥计划到2030年将可再生能源占总装机容量42%的目标进一步提高到52%;2018年,突尼斯宣布到2030年,其可再生能源装机容量将达到4.7 GW,国内能源需求的30%将来自可再生能源;埃及计划到2022年将可再生能源发电量占比提高到20%。
摘要 — 本文介绍了一种基于扰动双模基片集成波导 (SIW) 腔的紧凑型新型宽阻带带通滤波器 (BPF)。在 SIW 腔体中心引入扰动金属通孔,通过将 TE 101 模式的谐振频率移向 TE 201 模式来实现双模 SIW 腔体。此外,通过将外部端口设置为高阶杂散模式的电场零点位置,可以实现宽阻带 BPF。通过抑制至少包含七种模式的不需要的模式,可以在单个 SIW 腔体中获得最宽的阻带,最宽的阻带可达 2 f 0。为了验证所提出的宽阻带滤波器,设计、制造并测量了两个原型,阻带为 2 f 0,抑制水平分别优于 20dB 和 30dB。