半胱氨酸靶向具有许多优势,因为半胱氨酸具有高度亲核性,有许多兼容的亲电试剂,并且 Cys → Ser 突变研究可以确认结合反应特异性。此外,它们可以具有较长的药效学持续时间、增强的选择性并能够实现特定的占用生物标志物方法 (1, 2)。然而,不利的一面是,高亲核性会阻碍微环境敏感探针的开发,大多数蛋白质结合位点不含有 Cys,而 Cys → Ser 突变会导致耐药性(例如 BTK、EGFR)。因此,需要开发与半胱氨酸以外的残基反应的替代亲电弹头。磺酰氟 (SuFEx) 被偶然发现与蛋白质结合位点中的多种氨基酸残基发生反应(图 1)(3-5)。
摘要:Solanum torvum L. 是一种常见于印度次大陆的野生药用植物。AKT1 是抗乳腺癌的极佳抗癌靶点,因为抑制 AKT1 会降低细胞侵袭和运动能力,尽管 AKT1 激活可能会促进细胞生长。在本研究中,S. torvum 中的十种生物活性植物化学物质与乳腺癌相关靶蛋白 AKT1 对接,并与已知药物他莫昔芬进行比较。在十种生物活性化合物中,三种植物化学物质,螺甾烷-3,6-二酮、绿原酸和 β-谷甾醇-d-葡萄糖苷,与标准他莫昔芬相比表现出更高的结合能力,对接得分分别为 -17.4、-12.2 和 -11.5 Kcal/mol。这些热门生物活性化合物的结构稳定性和反应性基于前沿分子轨道进行了进一步研究,电子光谱通过密度泛函理论在 B3LYP/6-311 G 水平上揭示了激发态。观察到的电子跃迁为 π→π* 和 → *。根据吸收、分布、代谢、排泄、毒性和生理化学参数评估了热门生物活性化合物的药物相似性特征。这项计算机研究将促进 S. torvum 在常规治疗中的应用,并启动体外模型以开发治疗乳腺癌的新药。
本文研究了在市政环境中应用优化和模拟方法对能源系统建模和场景设计的影响。在此过程中,对“优化”和“模拟”的先前理解进行了进一步的区分,并记录了现有文献中概述的建模方法的应用情况。在实际比较中,测试了建模方法的选择如何影响市政案例研究的未来能源系统场景的设计。将提出的逐步模拟方法获得的能源系统场景和结果与已建立的多目标优化方法进行了比较。结果表明,对于所研究的市政案例,可以使用基于模拟的方法获得与多目标优化结果相当的结果。最终,建模方法的选择是一个复杂的问题,建模者必须考虑必要的建模自由度、利益相关者的参与度和可用的系统知识。建模者不仅需要考虑使用什么工具,还需要考虑如何使用它;该工具可用于优化和模拟,并且两者都可以作为开发未来能源系统场景的有效方法。
开发一项研究计划,该计划为传输系统运营商的系统服务开发,以支持在电力系统上集成可再生能源的系统。使用基于实验室的能量存储使用的共模拟方法,以与循环中称为Power Hardware的实时数字模拟合作模拟网格尺度存储
摘要 好的仿真模型是能够充分表示真实系统的模型。众所周知,仿真模型的精度水平与该模型的复杂性(范围和细节水平)有关。鉴于此,在建模和仿真 (M&S) 的背景下,向仿真模型添加更多细节会产生什么效果?当两种不同的模拟方法结合在一起时,这种效果是否相同?为了回答这些问题,本文提出了一种方法,该方法可以 (i) 分析仿真模型中的元素,以及 (ii) 分析它们之间连接的性质。从该方法的应用中,三个仿真模型的结构用图形表示。通过分析图表,可以感知到向实体添加更高级别的细节时产生的效果。比较模拟方法时,这种效果更加明显。使用混合模拟可以创建更简单、更强大的连接。(2022 年 8 月收到,2023 年 5 月接受。本文与作者一起进行了 5 个月的 1 次修订。)
AS.440.616. 贝叶斯计量经济学。3 学分。本课程的主要目标是为学生提供贝叶斯方法与基于频率论观点的传统计量经济学方法的替代观点。本课程将介绍贝叶斯推理的基本原理、线性回归模型的贝叶斯分析和回归模型的扩展,以及用于贝叶斯实现的数值方法。现代贝叶斯计量经济学在很大程度上依赖于数值模拟方法和计算算法。随着计算能力的进步和新模拟方法的出现,基于模拟的贝叶斯方法在实践中越来越受欢迎,应用范围越来越广。本课程的很大一部分将用于解释和演示如何应用数值贝叶斯方法,特别是马尔可夫链蒙特卡罗 (MCMC) 方法,例如吉布斯抽样和 Metropolis-Hastings 算法,来估计经济学和金融学中各种有趣的模型。学生将通过涉及计算机编程的动手练习获得后验模拟的实践经验。先决条件:440.601 微观经济理论、440.606 计量经济学。
摘要:本文介绍了结构可靠性分析 (SRA) 方法的最新进展,旨在确定每种方法的关键应用及其拟议的变体、合格特征、优点和局限性。由于现代海上导管架结构的复杂性和规模日益扩大,越来越有必要提出一种准确有效的方法来评估其材料特性、几何尺寸和操作环境中的不确定性。SRA 作为一种不确定性分析形式,已被证明是结构设计中的有用工具,因为它可以直接量化输入参数的不确定性如何影响结构性能。在此,我们特别关注概率断裂力学方法,因为它准确地解释了在此类结构的设计中占主导地位的疲劳可靠性。成熟的分析/近似方法(例如一阶和二阶可靠性方法 (FORM/SORM))被广泛使用,因为它们为实际问题提供了准确性和效率之间的良好平衡。然而,在高度非线性系统的情况下,它们并不准确。因此,人们使用共轭搜索方向法、鞍点近似、子集模拟、证据理论等方法对其进行了修改。以提高准确性。最初,直接模拟方法(例如蒙特卡洛模拟方法 (MCS))及其各种方差减少技术(例如重要性抽样 (IS)、拉丁超立方抽样 (LHS) 等)对于具有非线性极限状态的结构来说是理想的,但对于计算非常低的失效概率的问题来说,它们表现不佳。总体而言,每种方法都有其优点和局限性,其中 FORM/SORM 是最常用的,但最近,由于计算能力的不断进步,模拟方法的使用越来越多。其他相关方法包括响应面法 (RSM) 和替代模型/元模型 (SM/MM),它们是高级近似方法,非常适合具有隐式极限状态函数和高可靠性指标的结构。文献中也发现了高级近似方法和可靠性分析方法的组合,因为它们适用于复杂、高度非线性的问题。
我们根据Bhandari最近提出的工作进行了比较牛顿的普遍重力法与校正的模拟方法,在该方法中保持了引力常数g。相对于质量中心之间的距离,两个隔离重力公式之间存在互惠关系。我们总结了两个引力公式的一对一映射。我们不需要爱因斯坦的时空弯曲结构。
摘要:本文介绍了结构可靠性分析 (SRA) 方法的最新进展,旨在确定每种方法的关键应用及其拟议的变体、合格特征、优点和局限性。由于现代海上导管架结构的复杂性和规模日益扩大,越来越有必要提出一种准确有效的方法来评估其材料特性、几何尺寸和操作环境中的不确定性。SRA 作为一种不确定性分析形式,已被证明是结构设计中的有用工具,因为它可以直接量化输入参数的不确定性如何影响结构性能。在此,我们特别关注概率断裂力学方法,因为它准确地解释了在此类结构的设计中占主导地位的疲劳可靠性。成熟的分析/近似方法(例如一阶和二阶可靠性方法 (FORM/SORM))被广泛使用,因为它们为实际问题提供了准确性和效率之间的良好平衡。然而,在高度非线性系统的情况下,它们并不准确。因此,人们使用共轭搜索方向法、鞍点近似、子集模拟、证据理论等方法对其进行了修改。以提高准确性。最初,直接模拟方法(例如蒙特卡洛模拟方法 (MCS))及其各种方差减少技术(例如重要性抽样 (IS)、拉丁超立方抽样 (LHS) 等)对于具有非线性极限状态的结构来说是理想的,但对于计算非常低的失效概率的问题来说,它们表现不佳。总体而言,每种方法都有其优点和局限性,其中 FORM/SORM 是最常用的,但最近,由于计算能力的不断进步,模拟方法的使用越来越多。其他相关方法包括响应面法 (RSM) 和代理模型/元模型 (SM/MM),它们是高级近似方法,非常适合具有隐式极限状态函数和高可靠性指标的结构。文献中也发现了高级近似方法和可靠性分析方法的组合,因为它们适用于复杂、高度非线性的问题。
项目描述 该项目将综合模拟方法融入城市可再生建筑和社区优化 (URBANopt) 平台,以便对相连建筑区域内的废热源进行详细分析。这些进步将通过将 URBANopt 软件开发工具包 (SDK) 与开源 Modelica 编程语言和下一代 EnergyPlus Spawn(美国能源部 (DOE) 支持的建筑能量模拟程序)相结合来实现。更新后的 URBANopt 平台将能够评估与商业和住宅建筑相关的工业流程和废热机会。