胎儿神经干细胞 (NSC) 在生理上存在于低氧条件下(1% – 5% 的组织 pO 2 ),但通常被转移并维持在 21% pO 2 的大气氧水平(高氧)下以进行体外研究。这些改变的氧条件会导致 NSC 发生适应性变化,从而使体外数据的解释变得复杂。然而,潜在的适应动力学在很大程度上仍然是个谜。在这里,我们研究了短期高氧效应(3% pO 2 中 5 天,随后在 21% pO 2 中 2 天),并与持续高氧效应(21% pO 2 中 7 天)和生理氧对照(3% pO 2 中 7 天)进行了比较。我们利用皮质 NSC 通过流式细胞术和累积 BrdU 掺入测定法来分析细胞周期阶段。在持续高氧条件下培养时,NSC 的细胞增殖严重减少,但短期高氧后没有变化。随后通过流式细胞术进行的细胞周期分析表明,在持续和短期高氧条件下,NSC 明显从 G0/G1 期转向 S 期或 G2/M 期。然而,虽然短期高氧显著缩短了细胞周期,但在持续高氧条件下,细胞周期却增加了。总之,我们的结果证明了生理氧对体外扩增 NSC 的有益作用,并揭示了短期高氧与持续高氧相比的不同作用。
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摘要:多项研究表明,癌症患者的无细胞DNA(CFDNA)在片段长度和片段末端基序(fem)的差异与健康个体不同,但是缺乏对这两个因素如何与癌症和基因转移相关的如何相关的。在这项研究中,我们使用肺癌患者(n = 12)和健康个体(n = 7)的血浆进行了CFDNA片段组学评估。使用H3K36ME3无细胞染色质染色质免疫沉淀测序(CFCHIP-SEQ)从血浆中建立了一个个人基因表达。与低表达的基因相比,具有最高表达的基因表现出富集短的CfDNA片段(中值= 19.99%,IQR:16.94–27.13%,p <0.0001)。此外,在CFCHIP之后,富含富含GC的FEM。将短CfDNA片段的频率与存在不同的FEM的存在相结合,从而进一步富集了表达最多的基因(中位数= 37.85%,IQR:30.10-39.49%,p <0.0001)。<150 bp cfDNA的体外尺寸选择可以分离代表活性基因的cfDNA,尺寸选择富集与CFCHIP-SEQ富集相关(Spearman R范围:0.499-0.882,p <0.0001)。这项研究扩大了有关CFDNA片段学的知识,并阐明了基因活性与CfDNA片段长度和不同的FEM的相关性的新启示。
目的生物制药产品必须限制宿主细胞残留 DNA 污染物,以防止对患者产生基因毒性和免疫毒性风险。现有的残留宿主细胞 DNA 监管指南要求每剂量 ≤10ng,DNA 大小为 200bp 或更低。在病毒载体生产中,衣壳化 DNA 的数量、大小和致癌序列是额外的关注点。为了满足这一需求,赛默飞世尔科技开发了两种旨在满足监管指导的互补检测方法。Applied Biosystems™ resDNASEQ™ 定量 HEK293 DNA 试剂盒可定量总残留宿主细胞 DNA,Applied Biosystems™ resDNASEQ™ E1A DNA 片段长度试剂盒可对针对 E1A 致癌基因的短(86bp)、中(200bp)和长(476bp)片段进行大小分析。