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高氧对胎儿皮质神经干细胞细胞周期阶段长度有持续时间依赖性的影响
胎儿神经干细胞 (NSC) 在生理上存在于低氧条件下（1% – 5% 的组织 pO 2 ），但通常被转移并维持在 21% pO 2 的大气氧水平（高氧）下以进行体外研究。这些改变的氧条件会导致 NSC 发生适应性变化，从而使体外数据的解释变得复杂。然而，潜在的适应动力学在很大程度上仍然是个谜。在这里，我们研究了短期高氧效应（3% pO 2 中 5 天，随后在 21% pO 2 中 2 天），并与持续高氧效应（21% pO 2 中 7 天）和生理氧对照（3% pO 2 中 7 天）进行了比较。我们利用皮质 NSC 通过流式细胞术和累积 BrdU 掺入测定法来分析细胞周期阶段。在持续高氧条件下培养时，NSC 的细胞增殖严重减少，但短期高氧后没有变化。随后通过流式细胞术进行的细胞周期分析表明，在持续和短期高氧条件下，NSC 明显从 G0/G1 期转向 S 期或 G2/M 期。然而，虽然短期高氧显著缩短了细胞周期，但在持续高氧条件下，细胞周期却增加了。总之，我们的结果证明了生理氧对体外扩增 NSC 的有益作用，并揭示了短期高氧与持续高氧相比的不同作用。
大肠癌中无基因组无细胞DNA片段长度分布的通道容量
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证是根据作者/资助者提供的，他已授予Medrxiv的许可证，以永久显示预印本。（未通过同行评审认证）
结直肠癌全基因组游离DNA片段长度分布的通道容量
此预印本的版权所有者此版本于 2024 年 11 月 1 日发布。；https://doi.org/10.1101/2024.07.17.24310568 doi: medRxiv preprint
大肠癌中无基因组无细胞DNA片段长度分布的通道容量
该预印本版的版权持有人于2024年7月24日发布。 https://doi.org/10.1101/2024.07.17.24310568 doi：medrxiv preprint
大肠癌中无基因组无细胞DNA片段长度分布的通道容量
该预印本版的版权持有人于2024年7月23日发布。 https://doi.org/10.1101/2024.07.17.24310568 doi：medrxiv preprint
大肠癌中无基因组无细胞DNA片段长度分布的通道容量
此预印本版的版权持有人于2024年7月18日发布。 https://doi.org/10.1101/2024.07.17.24310568 doi：medrxiv preprint
无细胞DNA末端基序和片段长度的整合可以鉴定液体活检中的活性基因
摘要：多项研究表明，癌症患者的无细胞DNA（CFDNA）在片段长度和片段末端基序（fem）的差异与健康个体不同，但是缺乏对这两个因素如何与癌症和基因转移相关的如何相关的。在这项研究中，我们使用肺癌患者（n = 12）和健康个体（n = 7）的血浆进行了CFDNA片段组学评估。使用H3K36ME3无细胞染色质染色质免疫沉淀测序（CFCHIP-SEQ）从血浆中建立了一个个人基因表达。与低表达的基因相比，具有最高表达的基因表现出富集短的CfDNA片段（中值= 19.99％，IQR：16.94–27.13％，p <0.0001）。此外，在CFCHIP之后，富含富含GC的FEM。将短CfDNA片段的频率与存在不同的FEM的存在相结合，从而进一步富集了表达最多的基因（中位数= 37.85％，IQR：30.10-39.49％，p <0.0001）。<150 bp cfDNA的体外尺寸选择可以分离代表活性基因的cfDNA，尺寸选择富集与CFCHIP-SEQ富集相关（Spearman R范围：0.499-0.882，p <0.0001）。这项研究扩大了有关CFDNA片段学的知识，并阐明了基因活性与CfDNA片段长度和不同的FEM的相关性的新启示。
海报：resDNASEQTM HEK293 和 E1A 片段长度定量分析：基因治疗和疫苗制造中 GMP 批签发的综合解决方案
目的生物制药产品必须限制宿主细胞残留 DNA 污染物，以防止对患者产生基因毒性和免疫毒性风险。现有的残留宿主细胞 DNA 监管指南要求每剂量 ≤10ng，DNA 大小为 200bp 或更低。在病毒载体生产中，衣壳化 DNA 的数量、大小和致癌序列是额外的关注点。为了满足这一需求，赛默飞世尔科技开发了两种旨在满足监管指导的互补检测方法。Applied Biosystems™ resDNASEQ™ 定量 HEK293 DNA 试剂盒可定量总残留宿主细胞 DNA，Applied Biosystems™ resDNASEQ™ E1A DNA 片段长度试剂盒可对针对 E1A 致癌基因的短（86bp）、中（200bp）和长（476bp）片段进行大小分析。