综合多矩分析揭示了与疾病进展相关的新型特发性肺纤维化亚型。呼吸研究。24(1),1-12。•Ren,Yue,Peifeng Ruan,Mark Segal,Mirela Dobre,Jeffrey R. Schelling,Upasana Banerjee,Tariq Shafi,Peter Ganz,Ruth F. Dubin和Cric研究研究人员。2023。评估透析肾衰竭患者的大规模适体蛋白质组学平台。PLOS ONE。 18(12),E0293945。 •Peifeng Ruan和Shuang Wang。 2021。 disnep:一种特异性基因网络增强,以改善优先候选疾病基因的优先级。 生物信息学的简报,22(4),P.BBAA241。 •Peifeng Ruan,Shuang Wang和Hua Liang。 2020。mirpls:一种使用microRNA的癌症亚型的部分线性结构标识符方法。 生物信息学,36(19),pp.4902-4909。 •Peifeng Ruan,Ya Wang,Ronglai Shen和Shuang Wang。 2019。 使用关联信号注释来增强相似性网络融合。 生物信息学,35(19),pp.3718-3726。 •Hailin Huang,Jizi Shangguan,Peifeng Ruan和Hua Liang。 2019。 在高维AFT模型中的双层特征选择,并应用了基因组研究。 遗传学和分子生物学中的统计应用,18(5)。 •Ya Wang,Min Qian,Peifeng Ruan,Andrew E. Teschendorff和Shuang Wang。 2019。 使用加权表观遗传距离的方法检测表观遗传缺陷。 核酸研究,47(1),pp.e6-e6。PLOS ONE。18(12),E0293945。•Peifeng Ruan和Shuang Wang。2021。disnep:一种特异性基因网络增强,以改善优先候选疾病基因的优先级。生物信息学的简报,22(4),P.BBAA241。•Peifeng Ruan,Shuang Wang和Hua Liang。2020。mirpls:一种使用microRNA的癌症亚型的部分线性结构标识符方法。生物信息学,36(19),pp.4902-4909。•Peifeng Ruan,Ya Wang,Ronglai Shen和Shuang Wang。2019。使用关联信号注释来增强相似性网络融合。生物信息学,35(19),pp.3718-3726。•Hailin Huang,Jizi Shangguan,Peifeng Ruan和Hua Liang。2019。在高维AFT模型中的双层特征选择,并应用了基因组研究。遗传学和分子生物学中的统计应用,18(5)。•Ya Wang,Min Qian,Peifeng Ruan,Andrew E. Teschendorff和Shuang Wang。2019。使用加权表观遗传距离的方法检测表观遗传缺陷。核酸研究,47(1),pp.e6-e6。•Peifeng Ruan,Jing Shen,Regina M. Santella,Shuigen Zhou和Shuang Wang。2016。nepic:一种使用均值和方差组合信号进行表观遗传学研究的网络辅助算法。核酸研究,44(16),E134-E134。
1 西安科技大学机电工程学院,西安 710054,中国 2 上海交通大学材料科学与工程学院金属基复合材料国家重点实验室,上海市东川路 800 号,200240,中国 3 上海交通大学国家转化医学基地,上海 200240,中国 4 上海电力学院数理学院、能源与机电工程学院,上海 201306,中国 5 右江民族医学院附属医院,百色 533000,中国 6 埃迪斯科文大学工程学院先进材料与制造中心,270 Joondalup Drive, Joondalup, Perth, 6027 WA,澳大利亚
趋化因子受体是细胞表面受体,在不同的生理过程中发挥着重要作用:胚胎发生、炎症反应、发育、白细胞归巢等。这些受体嵌入细胞膜,可形成同型二聚体、异型二聚体和寡聚体1,均为功能性构象。趋化因子受体在细胞膜上的组织和动力学影响其行为以及细胞对趋化因子梯度的反应2,3。肌动蛋白细胞骨架重塑、细胞膜脂质组成或寡聚化的改变会损害正常细胞反应。一些证据表明异二聚体具有功能性,因此有必要分析它们在细胞表面的动态,以及配体如何对其进行修饰。4,5 CXCR4(一种常规趋化因子受体)和非典型趋化因子受体 ACKR3 形成异二聚体。ACKR3 识别两种配体,CXCL11 和 CXCL12,而 CXCR4 仅识别 CXCL12。因此,这是一个非常好的系统,可以分析这两种受体在细胞表面的动态,以及配体如何对其进行修饰。4,5由于 CXCR4 和 ACKR3 共享一个配体,并通过不同的途径发出信号,该模型可以解释趋化因子受体异二聚体是否具有与单个受体形成的二聚体相似的动力学,或者相反遵循不同的特征,当与配体一起激活时,它如何影响复合物,以及产生的功能后果是什么。全内反射显微镜 (TIRF-M) 是一种新的先进荧光技术,在研究膜过程方面具有巨大潜力。2,3 当显微镜的入射光完全反射时,在盖玻片和细胞培养基之间的界面上会产生衰减波。这种物理现象允许与盖玻片接触的细胞荧光染料被激发,因此非常适合研究细胞膜相关现象。此外,TIRF-M 允许单粒子跟踪 (SPT)。在我们的案例中,对瞬时转染了与单体绿色荧光蛋白 (Ac-GFP) 偶联的趋化因子受体的细胞进行分类,以获得模拟生理条件的低受体表达细胞群。以人类 T 淋巴细胞为模型,我们研究了当人类 T 细胞表达两种受体 (CXCR4 和 ACKR3) 和仅表达 ACKR3 时 CXCR4 和 ACKR3 的动态。当人类 T 细胞不表达 CXCR4 时,ACKR3 寡聚化对共享配体 CXCL12 的响应要低得多。这些差异可能会影响信号传导特性和功能响应。
人工智能 (AI) 领域的深度学习作为一项创新技术,在学术界和工业界都备受关注。世界各地都在研究和应用深度学习,以推动第四次工业革命。由于其发展和未来潜力,其在生物医学领域的应用已被多个国家列为优先事项。由于市场规模的快速扩大,深度学习也受到了工业界的极大关注。生物医学人工智能研究部门 (BMAI) 致力于开发新的人工智能基础技术,以推进当前的深度学习方法,并促进其在生物医学领域(诊断支持、成像等)的应用及其在临床实践中的转化。
临床试验是一种研究,旨在开发新的测试和治疗方法,以评估其对人类健康的影响。 3 对医疗干预的结果,即对人类志愿者的研究产品或药物(“新药”)进行评估。 试验产品可以是药物、疫苗、医疗器械、外科和放射学程序、行为治疗、预防保健、细胞和生物制品,这些产品是在该国获得上市许可后制造的。 4 临床试验是根据利益相关者(患者、医生和实验主持人)的需求为每种新药进行独特而周到的策划。 5 试验程序经过审查,只有在获得批准后才能开始试验。 6 因此,临床试验是对人类受试者(无论是患者还是非患者志愿者)的药品进行系统研究,以发现或验证临床、药理学(包括药效学/药代动力学)和不良反应,目的是在产品在印度上市之前确定其安全性和有效性。 7
三洋的 MDF 系列生物医学冷冻机具有出色的可靠性和性能,可满足各种存储和研究应用的需求。在医疗领域,它们可有效储存救命的新鲜和冷冻血液供应、疫苗以及诊断样本。在生物技术领域,它们可有效储存用于基因研究的酶以及用于测试的培养基、试剂和样本。在工业领域,它们是电子元件、精密设备和复合树脂老化和温度测试的理想选择。作为存储环境,这些冷冻机具有出色的安全特性、易于操作和许多其他特性,可提供无与伦比的可靠性和功能性。如果您正在寻找精密温控存储设备,请关注三洋。
从生物学数据中提取知识。它包括通过算法和软件的开发来分析,可视化或预测数据的集合,存储,检索,操作和建模。•生物信息学不仅是生物和信息学的组合
评估小组:健康科学 - 生物医学和分子生物学 研发单位:健康研究与创新研究所(i3S) 协调员:马里奥·阿道夫·蒙特罗·罗查·巴博萨 综合博士研究员:431 总体质量等级:优秀 评估标准评级 (A) 申请研发单位综合研究员的研发活动的质量、优点、相关性和国际化:5 (B) 综合研究员团队的优点:5 (C) 目标、战略、活动计划和组织的适当性:5 基础资金(2020-2023 年):7038 K€ 建议的计划支持博士奖学金:21 计划资金:1915 K€,其中包括 5 个(3 个初级、2 个辅助)新博士研究员合同。理由、评论和建议 i3S 是一个年轻的研究中心,成立于 2015 年,由三个研发单位合并而成,即分子和细胞生物学研究所 (IBMC)、生物医学工程研究所 (INEB) 和波尔图大学病理学和分子免疫学研究所 (IPATIMUP)。小组赞扬该单位及其成功合并的方向,这创造了一个令人印象深刻的基础和应用生物医学研究中心,在国际最高水平上具有充分的竞争力,并拥有出色的运作模式。i3S 的科学结构包括三个主题线:癌症、宿主相互作用和反应以及神经生物学和神经系统疾病。这些研究领域涵盖分子和细胞生物学、遗传学、免疫学、病理学和生物工程学的研究,以促进我们对正常生理学中生命系统的分子和细胞基础及其病理状态下的偏差的理解,为开发新的诊断和治疗策略铺平道路。专家组完全支持这个促进跨学科和跨国界思维的现代科学组织,并建议反思加强计算生物学资源和专业知识,这可以巧妙地连接各种活动,并促进对基于(病理)生理现象的极其复杂的细胞和生物体调节回路的更深入理解。此外,专家组完全相信 i3S 的组织结构和运作,它支持上述科学组织。它赞赏该中心将在与大学结束持续讨论后于 2019 年成为法人实体。在与波尔图大学校长进行简短讨论后,专家组希望强调,波尔图大学和该地区通过这种卓越中心的存在而获得的声望应该转化为更强有力的支持,包括为研究人员提供职位。i3S 的科学非常出色,尽管团队之间不可避免地存在差异。除其他荣誉外,i3S 还获得了多项 ERC 资助,这说明其科研水平在国际上处于领先地位。小组对三个专题领域的出色简短介绍印象深刻。然而,团队表现的显著差异值得持续关注。在这方面,小组对定期监测团队表示赞赏(见下文)。i3S 的重大突破性发现包括细胞分裂与基因组(不)稳定性之间的功能联系、神经退行性疾病的机制以及对 T 细胞分化机制理解的进展。i3S 是遗传性弥漫性胃癌的国际参考中心,开发和进行基因诊断。后者的活动包括开发基因诊断工具。小组祝贺 i3S 制定了操作原则,该原则可供该部门的所有成员使用。这是 i3S 的一个独特功能,应该由该国所有主要研发部门采用。这些运作原则特别涉及由外部科学顾问委员会选出的外部专家每 4 年对所有团队进行一次科学评估、空间分配规则和作者身份的定义。事实上,小组指出,i3S 显然是唯一一个根据委员会的建议制定作者身份指导方针的单位
• Christel Devaud – CRCT - Distant antimetastatic effect of enterotropic colon cancer-derived α4β7+CD8+ T cells • Ines Osma- Garcia – Infinity - The RNA binding proteins TIA1 and TIAL1 promote Mcl1 mRNA translation to protect germinal center responses from apoptosis • Lionel Mouledous – CBI - Targeting Nociceptin/Orphanin FQ在慢性应激的小鼠神经内分泌模型中挽救认知症状的受体。•Miriam Pinilla - IPBS- EEF2灭活毒素会引起NLRP1炎症体并促进上皮屏障破坏