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生化和生物物理研究通信
人工智能（AI）对我们的社会产生了革命性的影响。它正在帮助人类面对本世纪的全球挑战。传统上，AI是在软件或硬件中通过神经形态工程开发的。最近，已经提出了一种全新的策略。是所谓的化学AI（CAI），它利用了湿软件中的分子，超分子和系统化学的分子化学化学。在这项工作中，描述了两种有前途的CAI的有前途的方法。一个人指的是设计和实施可以通过光学或化学信号进行通信的神经替代物，并引起网络以进行计算目的并开发微/纳米型。另一种方法涉及可以在包括未来纳米米医学在内的各种情况下用于应用的“自下而上的合成细胞”。这两个主题均以基本层面的形式提出，主要是为了向广泛的非专家们介绍，并赞成对这些边界主题的兴趣兴起。
生物化学和化学生物学结构生物学和分子生物物理学7,8-二羟基氟氟酮是吡啶还毒素磷酸酶的直接抑制剂
维生素B6缺乏症已与人类脑疾病的认知障碍联系在一起数十年。仍然，将维生素B6与这些病理联系起来的分子机制仍然很少了解，并且补充维生素B6是否可以改善认知也不清楚。吡啶毒素磷酸酶（PDXP）是一种控制吡啶多毒素5'-磷酸盐水平（PLP）的酶，即维生素B6的共酶活性形式，可能代表一种替代性的治疗剂进入维生素B6相关病理学。但是，缺乏测试此概念的药理学PDXP抑制剂。现在，我们确定了鼠海马中PLP水平的PDXP和年龄依赖性下降，这为PDXP抑制剂的发展提供了理由。使用小分子筛选，蛋白质晶体学和生物层干涉法，我们发现，可视化和分析7,8-二羟基氟氟酮（7,8-DHF）作为直接且有效的PDXP抑制剂。7,8-DHF结合并可逆地抑制PDXP，其微摩尔亲和力和亚微摩尔效应。在小鼠海马神经元中，7,8-DHF以PDXP依赖性方式增加了PLP。这些发现将PDXP验证为可药的目标。值得注意的是，尽管对其作用机理进行了积极的争论，但7,8-DHF是脑部疾病模型中良好的分子。我们发现7,8-DHF作为PDXP抑制剂提供了有关围绕大脑7,8-DHF介导的作用的争议的新型机械见解。
神经丝生物物理学：从结构到生物力学
摘要神经丝（NFS）是多基因的，神经元特异性的中间细丝，该细丝由直径10 nm的细丝“核心”组成，周围是一层长的内在无序蛋白（IDP）“尾巴”。 NF被认为可以调节发育过程中的轴突能力，然后稳定成熟的轴突，而NF亚基的不利性，突变和Ag gregation在多种神经系统疾病中显着。该领域对NF结构，力学和功能的理解已被多种生物化学，细胞生物学和小鼠遗传研究深入了解了四十年以上。这些研究为我们对轴突生理学和疾病中NF功能的集体理解做出了很大的贡献。近年来，在两个新的情况下，人们对NF亚基蛋白引起了人们的兴趣：作为神经元损伤的潜在血液和脑脊液的生物标记，以及具有吸引人特性的模型IDP。在这里，我们回顾了NF结构和功能方面的既定原则和最新发现。在Pos sible的地方，我们将这些发现放在NF组装，相互作用和对轴突力学的贡献的背景下。
利用复杂生物物理网络模型的活动模式来优化纹状体内深部脑刺激
在本研究中，我们开发了一个针对孤立纹状体的大规模生物物理网络模型，以通过使用网络产生的时空模式来优化潜在的纹状体内深部脑刺激，例如应用于强迫症。该模型使用改进的 Hodgkin-Huxley 小世界连接模型，而空间信息（即神经元的位置）是从详细的人体图谱中获得的。该模型产生将健康与病理状态区分开的神经元活动模式。使用三个指标来优化刺激方案的刺激频率、幅度和定位：整个网络的平均活动、腹侧纹状体区域的平均活动（使用模块化检测算法出现为定义的社区）以及整个网络活动的频谱。通过最小化上述指标与正常状态的偏差，我们指导深部脑刺激参数的位置、幅度和频率的优化。
对生物物理学或医学物理学感兴趣的学生
实验室或私人公司：研究领域包括集体行为，神经科学，单细胞生物物理学，进化生物学和人群遗传学，免疫学，细胞生物力学，分子动力学等的统计物理学。生物技术和制药行业：从药物设计到癌症治疗设计，
生物电子医学：从生物物理学到精准治疗的多学科路线图
12 加拿大不列颠哥伦比亚省维多利亚市维多利亚大学医学科学系，13 加拿大魁北克省蒙特利尔市麦吉尔大学神经病学和神经外科系，14 加拿大魁北克省魁北克市拉瓦尔大学分子医学系，15 加拿大不列颠哥伦比亚省温哥华市不列颠哥伦比亚大学生物化学和分子生物学系，16 美国佛罗里达州奥兰多市中佛罗里达大学计算机科学系，17 美国德克萨斯州理查森市德克萨斯大学达拉斯分校生物工程系，18 美国德克萨斯州登顿市北德克萨斯大学生物医学工程系，19 美国康涅狄格州新哈特福德市 Luxi 集团，20 美国德克萨斯州加尔维斯顿市德克萨斯大学医学分校妇产科系，
审查了解病变创造生物物理学并改善射频导管消融过程中的病变评估。 ACH
房颤（AF）是一种普遍的心律不齐，而肺静脉分离（PVI）已成为其处理中的基石。耐用病变的产生对于成功和持久的PVI至关重要，因为不一致的病变导致消融后的重新连接和复发。已经开发出各种方法来评估体内病变质量和跨性别的方法，用作改善病变创造的替代物，并利用射频（RF）能量的长期结局。本综述手稿研究了使用RF能量时每天在电生理实验室中每天使用的病变创造和不同病变评估技术的生物物理学。这些方法为病变有效性提供了宝贵的见解，促进了优化的消融程序并减少心律不齐的复发。但是，每种方法都有其局限性，建议在AF导管消融过程中进行全面病变评估的技术组合。成像技术的未来进步，例如磁共振成像（MRI），光学相干断层扫描和光声成像，在进一步增强病变评估和指导治疗策略方面有望。
土壤生物物理化学特性之间的关系...
摘要：磷（P）是农作物生产力至关重要的至关重要的。植物从土壤中吸收P盐，主要是殖民磷酸盐，但主要的P来源位于有机材料中。土壤磷酸酯酶（APASE）在通过水解从有机物释放P中起着至关重要的作用。酸和碱性磷酸酶对于缓解植物的P缺乏至关重要。在这篇综述着重于农业土壤的综述中，我们研究了生物物理学，农业管理和气候因素的关系，以及其与农作物生长和产量的联系。我们的发现表明，孔和土壤pH值之间存在很强的联系，受粘土含量，有机物，微生物生物量碳和氮的积极影响。采用健康的土壤实践，例如平衡的有机肥料使用，最佳的土壤水位，耕作减少，耕作和使用有益的植物微生物有助于增强APASE活动。然而，由于该领域的研究不足，孔和作物生产率之间的联系仍然不确定。我们的审查强调了评估基本与巨福纳的关系的至关重要的需求，以及基本的植物营养素，例如钾，养分比以及各种因素的协同作用。了解P通过植物土壤和/或植物 - 微生物生态系统中的孔快速，有效地同化，这对于农作物的生产力和产量至关重要。
生物物理学本科手册秋季 - 冬季2023
物理和天文学。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。33 Phys 1011 3.0-物理i。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。33 Phys 1012 3.0-物理2。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。33 Phys 1070 3.0-天文学的基本原理。。。。。。。。。。。。。。34 Phys 1411 3.0-物理基本原理1。。。。。。。。。。。。。。。。34 Phys 1412 3.0-物理基本原理2。。。。。。。。。。。。。。。。35 Phys 1421 3.0-具有生命科学应用的物理学1。。。。。。。。。35 Phys 1422 3.0-具有生命科学应用的物理2。。。。。。。。。35 Phys 1470 3.0-天文学的亮点。。。。。。。。。。。。。。。。36 Phys 1510 3.0-物理学简介。。。。。。。。。。。。。。。。36 Phys 1800 3.0-工程机制。。。。。。。。。。。。。。。。37 Phys 1801 3.0-工程师的电力，磁性和光学。。。。。。37 Phys 1901 3.0-物理实验室1。。。。。。。。。。。。。。。。。38 Phys 1902 3.0-物理实验室2。。。。。。。。。。。。。。。。。38 Phys 2010 3.0-古典力学。。。。。。。。。。。。。。。。。。38 Phys 2020 3.0-电力和磁性。。。。。。。。。。。。。。。39 Phys 2030 3.0-物理学家和工程师的计算方法。。。。39 Phys 2040 3.0-相对论和现代物理。。。。。。。。。。。。。。40 Phys 2060 3.0-光学和光谱。。。。。。。。。。。。。。。。。。40 Phys 2070 3.0-星系和宇宙。。。。。。。。。。。。。。。41 Phys 2211 1.0-实验电磁学。。。。。。。。。。。。。41 Phys 2212 1.0-实验物理学。。。。。。。。。。。。。。。。。42 Phys 2213 3.0-具有数据分析的实验物理。。。。。。。。。43 Phys 3010 3.0-经典力学。。。。。。。。。。。。。。。。。。43
剖析本质上无序蛋白的生物物理学和生物学
大量证据支持蛋白质中本质上无序区域（IDR）在正常细胞功能和包括癌症在内的许多疾病过程中起关键作用[1]。尽管我们对IDR如何调节众多生物学过程（例如基因调节和细胞内信号传导）的理解有了很大的进步，但仍有许多空旷的问题和挑战。此外，IDR现在被广泛认为是生物分子冷凝物的驱动因素和调节剂，它们是无膜的亚细胞集线器，在活细胞中生化过程的动态分区中起重要作用[1]。突变已显示导致冷凝物的异常行为，导致细胞质中信号事件的失调以及细胞核中致癌转录程序的激活[2，3]。因此，迫切需要了解IDR的生物学功能的基础机械原理，并利用这些知识来针对其在疾病过程中的异常行为。