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World File Search System生长曲线
Roseinatronobacter sp。完整的基因组序列。菌株S2，一种从pH 12蛇形化系统中分离出的化学硫代表营养
s2是从山的Ney Springs中分离出来的Shasta，加利福尼亚州，在最小培养基板上，其中包含20 mM多硫化物和10毫米乙酸盐（6）。S2在含有20 mm硫代硫酸盐和10 mm乙酸盐的液体最小培养基中进行有氧培养。详细的媒体说明可在此处找到：dx.doi.org/10.17504/protocols.io.bqjgmujw。S2在室温下孵育5天，以实现由先前的生长曲线确定的近似最大浊度（6）。DNA，并使用量子荧光计（美国Thermofisher Scientific，USA）进行定量。所有测序均由单个DNA准备。纳米孔库在高智能模式（280 bp/s）下使用R10.4.4的流动池（FLO-MIN114）用天然条形码24 V14试剂盒（牛津纳米孔技术，英国牛津，英国）进行测序。用孔雀鱼V.6.4.6进行，删除了质量分数<7的读数（7）。 在Seqcenter LLC（美国匹兹堡，美国）进行了 Illumina库准备和测序。 简要地，使用Illumina DNA准备套件制备库，并用10 bp独特的双指数进行条形码，并在Illumina Novaseq（2×150个测序）上进行测序。 使用BCL-Convert（v.4.0.3）进行反复式，质量控制和适配器修剪。 纳米孔序列> 2,000 bp用菲尔隆（V.0.2.1）（8）过滤质量，并去除了最差的10％的读取碱基。 过滤的长读数与Flye组装（v.2.9.1）（9）。 进行了四轮抛光。 质量评估和基因组统计数据，删除了质量分数<7的读数（7）。Illumina库准备和测序。简要地，使用Illumina DNA准备套件制备库，并用10 bp独特的双指数进行条形码，并在Illumina Novaseq（2×150个测序）上进行测序。使用BCL-Convert（v.4.0.3）进行反复式，质量控制和适配器修剪。纳米孔序列> 2,000 bp用菲尔隆（V.0.2.1）（8）过滤质量，并去除了最差的10％的读取碱基。过滤的长读数与Flye组装（v.2.9.1）（9）。进行了四轮抛光。质量评估和基因组统计数据Illumina读取的质量是用FastQC（v.0.12.1）（10）过滤的，所有读取的质量得分> Q30。简短的读数与Burrows -wheeler对准器（V.0.7.17）（11）对齐，并用Pilon（V.1.24，-fix all）（12）抛光组件。
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4。地衣：-4.1类型； 4.2繁殖； 4.3经济重要性。4.4地衣在植物继承和污染监测中的作用。5。经济和药用重要性：-5.1蘑菇 - 印度属品种的食品价值和二项式 - agaricus，calocybe，pleurotus和volvariella; 5.2真菌来源和用途 - SCP，贝克酵母，乙醇，柠檬酸，色氨酸， - 淀粉酶，核黄素，Griseofulvin，nystatin和Cyclosporin; 5.3医学真菌学 - 结局的定义；在菌丝中用作“环虫”或滴虫病和念珠菌病的因果生物和抗生素。微生物学1。微生物和微生物学研究 - 主要概念； 1.1原核生物（原核生物）和真核生物的微生物和王国的分类（G. E. Murray 1968＆R。H. Whittaker 1969）[初步想法]； 1.2现代分类，签名密码子，三个领域的分类概念（Carl R. Woese 1978）和通用系统发育树的概念（Norman R. Pace 1997）[仅基本概念]。2。古细菌：-2.1特征（简短概述）； 2.2细胞壁； 2.3发生。3。4。病毒：-4.1病毒和植物病毒的类型； 4.2植物病毒的传播； 4.3 TMV - 理化特征及其繁殖模式； 4.4 T 4噬菌体 - 结构，感染和裂解周期； 4.5 lambda（）噬菌体 - 溶酶体的机制和意义； 4.6病毒和王室。5。细菌：-3.1一般特征； 3.2细菌生长 - 二进制裂变，指数生长和生长曲线（具有单个碳源的封闭系统中的一般模式 - 单相）3.3化学本质，糖卵形，粘液层，果皮层，鞭毛，pili，pili和fimbriae的化学性质，超结构和功能； 3.4细胞壁 - 革兰氏阳性和革兰氏阴性细菌之间的化学性质和差异； 3.5细菌基因组和质粒； 3.6遗传重组 - 转化[DNA摄取的一般过程，自然和诱导的能力和机制]，结合['F'因子，F +和HFR男性以及染色体动员]和转导[一般概念和适用性]； 3.7细菌多样性 - 以下组的一般概念和系统位置： - 光合细菌（蓝绿色，紫色和绿色细菌，氧合和氧合群的概念），衣原体，氮固定细菌（符号和非肌生物）（符号和非肌生元），结实和结构细菌，又有细菌，又有元素，且异常，且群体，以及构成的，构成的，构成的，构成的，构成的，构成的，以及构造的群体，及其群体和群体，构造和群体及其群体，放线菌科。应用细菌学：-5.1来源（仅名称）和用途 - 杆菌蛋白，新霉素，链霉素，氯霉素，两性霉素B，淀粉酶，纤维酶，纤维素酶，蛋白酶，赖氨酸，赖氨酸和右旋烷； 5.2生物肥料，生物气体和生物农药的生产中使用的细菌（仅）； 5.3霍乱，细菌痢疾，伤寒，白喉，结核病，结核病，瘟疫和肺炎的因果生物（只有名称）。