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首届 UT 系统医疗保健项目人工智能研讨会
口头报告 Geracci，James — 门诊初级保健中人工智能支持的临床文档：解决医疗保健体验问题的处方？ 5 Sankaranarayanan, Ganesh – 使用高级深度学习对机器人胃空肠造口术视频进行自动任务分割 6 Wang, Song – 使用大型语言模型检测不一致的自杀原因注释 7 Makhija, Disha – 公平的人工智能：确保分布式医疗保健系统中的公平预测 9 Fu, Sunyang – FunctionalAI4EHR：一种基于语言模型的人工智能框架，用于在电子健康记录中确定功能状态和跌倒发生情况 10 Zhou, Qin – 图形卷积网络，将组织学信息与空间转录组学相结合，揭示空间细胞水平的基因表达 11 Muneer, Amgad – 使用多尺度集成变压器 (SCENT) 进行 PD-L1 表达预测 13 Segar, Matthew – 基于种族不可知机器学习的模型可改善心房颤动发病率预测14 邓北川 – 自监督混合神经网络实现定量生物发光断层扫描，用于癌症研究 16 韩毅 – 由 T 细胞受体-抗原基础模型赋能的 T 细胞反应性生物标志物 18
UT 系统医疗保健人工智能研讨会摘要
口头报告 Geracci，James — 门诊初级保健中人工智能支持的临床文档：解决医疗保健体验问题的处方？ 5 Sankaranarayanan, Ganesh – 使用高级深度学习对机器人胃空肠造口术视频进行自动任务分割 6 Wang, Song – 使用大型语言模型检测不一致的自杀原因注释 7 Makhija, Disha – 公平的人工智能：确保分布式医疗保健系统中的公平预测 9 Fu, Sunyang – FunctionalAI4EHR：一种基于语言模型的人工智能框架，用于在电子健康记录中确定功能状态和跌倒发生情况 10 Zhou, Qin – 图形卷积网络，将组织学信息与空间转录组学相结合，揭示空间细胞水平的基因表达 11 Muneer, Amgad – 使用多尺度集成变压器 (SCENT) 进行 PD-L1 表达预测 13 Segar, Matthew – 基于种族不可知机器学习的模型可改善心房颤动发病率预测14 邓北川 – 自监督混合神经网络实现定量生物发光断层扫描，用于癌症研究 16 韩毅 – 由 T 细胞受体-抗原基础模型赋能的 T 细胞反应性生物标志物 18
饮食饮食中补充剂减弱肠毒素大肠杆菌（ETEC）诱导的炎症反应和小猪的肠壁功能障碍
在动物肠道中未被宿主使用的铁可以直接由微生物（尤其是有害的生物）使用。有机铁（例如Fe-Gly）在体内具有较高的消化率和吸收效率。目前尚不清楚它是否可以减少ETEC对铁的利用，从而减轻ETEC感染造成的伤害。该实验主要研究将Fe-gly添加到饮食中对被ETEC感染的断奶小猪的生长性能，铁营养状况和肠形态的影响。研究发现，在饮食中增加50 mg的Fe-gly会显着增加30.6和35.3％（p <0.05），并减轻了腹泻问题，并降低了ETEC感染引起的生长绩效。腹泻率降低了40％（从31.25％降低至18.75％）。除了保护小猪的健康外，添加Fe-gly还可以提高Piblet血清中的TIBC水平（P <0.05），从而增强了它们结合和转运铁的能力。从基因表达结果和组织段结果中，添加Fe-Gly也可以减轻ETEC挑战在某种程度上引起的空肠的损害（p <0.05）。总而言之，增加50毫克的Fe-gly可以满足小猪的每日需求，提高铁的利用效率并减少肠中的残留铁。这减少了用于肠道病原性微生物的铁，从而抑制了肠道病原体的增殖并确保小猪的肠道健康。
细菌病原体在自身免疫性疾病中的作用
自身免疫性疾病（AD）当免疫系统错误地攻击自我组织时会出现，这通常是由于自我耐受性的崩溃。受遗传和环境因素影响的这些条件越来越多地与细菌感染作为重要触发因素有关。健康的免疫系统可保护人体免受感染。但是，当免疫系统出现故障时，它会攻击健康的细胞，组织和人体器官。这种故障或功能障碍称为自身免疫性疾病，可能影响身体的任何部位，损害心理功能并可能致命。本评论探讨了细菌病原体（例如幽门螺杆菌，弯曲杆菌的空肠杆菌和结核分枝杆菌）如何通过分子模拟物，旁观者活化和表位散布等机制来促进自身免疫性。这些过程会引起交叉反应性免疫反应，放大免疫失调并加剧组织损伤。流行病学和实验研究揭示了细菌感染与诸如Guillain-Barré综合征，类风湿关节炎和结节病之间的疾病之间的密切关联。通过分析这些病原体与免疫机制之间的相互作用，综述突出了细菌在破坏免疫耐受性和驱动自身免疫性疾病进展中的关键作用。此外，针对细菌诱导的自身免疫性的抗生素，免疫调节剂和疫苗等治疗策略为预防和治疗提供了有希望的途径。关键字：自身免疫性疾病；自我耐受；细菌感染；免疫反应了解细菌作用的机制为有效诊断，预防措施和疗法的发展提供了宝贵的见解。这篇综述强调了对自身免疫性细菌发病机理的持续研究，尤其是在遗传易感人群中，以完善有针对性的临床方法并改善这些复杂疾病的结果。
2021 年国防人文科学研讨会
按需海报 11 月 29 日星期一 – 12 月 1 日星期三 主题：睡眠和疲劳特质水平的认知和心理因素与 COVID-19 期间对睡眠障碍的适应力有关 Sean Drummond、Joshua Wiley、Johanna Boardman、Tony Cunningham 和 Elizabeth Kensinger 可以策略性地利用白天睡眠时间来操纵内部生物钟对夜间工作的反应 Greg Roach、Drew Dawson 和 Charli Sargent 睡觉和起床时间的变化对优秀运动员睡眠质量的影响 Shona Halson、Rich Johnston、Charli Sargent 和 Greg Roach 主题：提高表现的新干预措施 已建立和新提出的认知适应力结构在遵守 COVID-19 防护措施和心理恢复中的作用：一项验证研究 Sabina Kleitman、Dayna J. Fullerton、Lisa Zhang 和 Eugene Aidman P3R - 预处理计划对女性陆军新兵训练结果的影响 Jace Drain、Penny Larsen 和 Herbert Groeller 探索空肠弯曲菌受控人体感染模型中宿主肠道菌群的变化 Blake Stamps、Janelle Kuroiwa、Sandra Isidean、Megan Schilling、Clayton Harro、Kawsar Talaat、David Sack、David Tribble、Alexander Maue、Joanna Rimmer、Renee Laird、Chad Porter、Michael Goodson 和 Frédéric Poly 虚拟环境中的交互 Ken McAnally 和 Guy Wallia 决策辅助演示对多线索信号识别中决策的影响
单龙蛋白对猪腹泻病毒感染的小猪的肠道屏障，血液化学特征，免疫力和抗氧化功能
摘要单龙蛋白（ML）对感染猪流行腹泻病毒（PEDV）的仔猪健康的影响尚未完全了解。这项研究旨在研究其在血液生物化学特征，肠道屏障功能，抗氧化功能以及感染PEDV感染的小猪中的表达中的作用。将32个小猪随机分为四组：对照组，ML组，PEDV组和MLÞPEDV组。小猪在PEDV感染前用ML以100 mg/kg·BW的剂量口服。结果表明，PEDV感染显着降低了D-木糖含量，并增加了肠道脂肪酸结合蛋白含量，这表明PEDV感染破坏了肠道屏障和吸收功能。虽然可以通过ML给药进行修理。此外，ML给药可显着降低PEDV感染后的血浆血液尿素氮和总蛋白质含量。这些结果表明ML可能会提高蛋白质利用效率。mL给药可显着减少大型未染色细胞和HB的数量，并增加了pedv感染的小猪血液中白细胞和嗜酸性粒细胞的数量，表明ML可以改善人体的免疫防御功能。在存在PEDV感染的情况下，ML给药分别显着增加了血液和结肠中的超氧化物歧化酶和过氧化氢酶活性，表明ML可以提高抗氧化能力。这项研究表明，ML可以用作一种饲料添加剂，以促进PEDV感染后的猪健康。此外，ML给药还逆转了整个小肠，在空肠和回肠中的小肠中的ISG15，IFIT3和IL-29的表达，表明该身体正在从PEDV感染中恢复。
在OVO给药中核苷的施用改善了肉鸡的性能，明显的可代谢能量和肠道发育
在OVO研究中，进行了一项关于核苷（25、50和100 mg/egg）对孵化力，生长性能，能量可分配性和肠形态的核苷作用的影响的研究。将四百八十（480）个肥卵分为四组（四个重复分别有30个卵）。在鸡蛋孵化的第18天，进行蜡烛，并选择了肥沃的鸡蛋，并给出了OVO管理中的四个。第一组用作对照，并注入了磷酸盐缓冲盐水（PBS）。其他组在100 µL的OVO给药（25、50和100 mg/eg）的OVO给药中通过蛋黄囊途径给出，并孵化了各个组的小鸡。在实验组中，孵化力是可比的。然而，在以100 mg/eg的形式注射较高水平的核苷的组中，孵化力受到影响。从更高剂量的核苷（50和100 mg）中孵化的小鸡的体重（BW）高（p <0.05）。在注入核苷的组中观察到较高的能量代谢性（％）。血浆蛋白浓度较高，用于核苷（50和100 mg）的组中。在组织学上，肠绒毛长度在100 mg注射组中最大，然后是50 mg和25 mg。在3、7和14天大的所有注射组中，在空肠中同型（CDX）的相对表达显着（P <0.05）。核苷辅助组具有更好的性能，能量代谢性和肠形态。在实验组中，以50 mg/卵的核苷施用导致肉鸡较高的生长性能，血浆蛋白，肠表面和绒毛发育。
小蛋白质y口服对生长性能，肠道屏障功能和肠道微生物群的影响
摘要在体外有效抑制沙门氏菌的各种血清型，但抗菌作用对S进行了有效抑制。家禽中的紫菜仍然不清楚。这项研究是第一个评估安全性和抗s的研究。MCCY在没有特定病原体（SPF）雏鸡中的胃部感染。安全性测试表明，体重，IgA和IgM血清的体重，IgA和IgM水平以及3组口服的小鸡的盲肠菌群结构不同剂量的MCCY（5 mg/kg，10 mg/kg，20 mg/kg）与对照组的体重没有显着差异。然后，将雏鸡随机分为3组进行抗S的实验。胃部感染：（i）阴性对照组（NC），（ii）s。Pullorum-Challenged组（SP，5×10 8 CFU/BIRD），（iii）MCCY处理的组（MCCY，20 mg/kg）。结果表明，与SP组相比，MCCY的治疗增加了体重和平均每日增益（p <0.05），减少了s。粪便，肝脏和盲肠中的胸部负担（p <0.05），增强了胸腺，并减轻了脾脏和肝脏指数（p <0.05）。此外，麦基提高了空虚的绒毛高度，降低了空肠和伊利尔的加密深度（p <0.05），并上调了jejunum和ileum中IL-4，IL-10，ZO-1，ZO-1的表达，以及在Jejunum（p <0.05）中的CLDN-1的表达。此外，MCCY增加了益生菌菌群（Barnesiella等。），同时减少（p <0.05）致病菌群（Escherichia和沙门氏菌等）的相对丰度与SP组相比。关键字微蛋白Y，沙门氏菌，肠屏障，肠道菌群
利用链球菌进行体内多重基因靶向...
胰腺导管腺癌是一种致命的癌症类型，与体细胞中的多种基因突变有关。基因工程小鼠几乎不适用于开发胰腺癌模型，异种移植模型在反映早期胰腺癌方面存在局限性。因此，使用成簇的规律间隔的短回文重复序列进行体内体细胞基因工程用于生成胰腺癌动物模型越来越受到关注。在本研究中，我们选择了 Kras、Trp53、Ink4a、Smad4 和 Brca2 作为靶基因，并应用空肠弯曲菌 Cas9 (CjCas9) 和化脓性链球菌 Cas9 (SpCas9) 通过腺相关病毒 (AAV) 转导来开发胰腺癌。在确认 AAV2 的多灶性和弥漫性转导后，我们生成了 SpCas9 过表达小鼠，该小鼠在两次 AAV 转导后表现出靶基因中高双链 DNA 断裂 (DSB) 和胰腺上皮内瘤变 (PanIN) 病变；然而，三次 AAV 转导的野生型 (WT) 小鼠没有出现 PanIN。此外，将小型 Cjcas9 应用于具有两个 AAV 系统的 WT 小鼠，该小鼠还出现了高广泛性 DSB 和 PanIN 病变。观察到了导管和胰岛细胞中的组织学变化和癌症标志物（如 Ki67、细胞角蛋白、Mucin5a、α 平滑肌肌动蛋白）的表达。此外，研究还揭示了几个发现，例如 1) AAV-CjCas9 的多重 DSB 潜力、2) 导管周围淋巴细胞浸润、3) 多灶性癌症标志物表达，以及 4) 在 AAV 介导的靶向中启动 PanIN 需要 12 个月以上。在这项研究中，我们提出了一种用于体内癌症建模的有用工具，该工具也适用于其他疾病模型。
scFv-CdtB 作为乳腺癌治疗新型免疫毒素的计算机设计和评估
背景：乳腺癌是女性人群中最常见的癌症类型，约 15% 至 20% 的乳腺癌患者为人表皮生长因子受体 2 (HER2) 阳性。目前的癌症治疗方法，如手术、放疗和化疗，在降低死亡率方面效果不佳；然而，免疫疗法是一种治疗癌症的新方法，它更有效，对身体的危害更小。抗癌免疫毒素是嵌合分子，包含两部分，即免疫部分（抗体或抗体的结合片段）和毒素部分（杀伤毒素分子）。目的：在本研究中，我们试图设计一种新型免疫毒素，包括抗 HER2 受体曲妥珠单抗，它源自与空肠弯曲菌细胞致死扩张毒素 (Cj-CdtB) 的功能部分相连的单链可变片段 (scFv)。方法：分别使用 ProtParam、PROSO II 和 GORV 分析嵌合蛋白的理化性质、溶解性和二级结构。使用 I-TASSER 建立三维 (3D) 模型，并使用 GalaxyRefine 进行细化。使用 PROCHECK 和 RAMPAGE 对细化前后的模型结构进行评估。使用 AlgPred 服务器预测免疫毒素的致敏性，并使用 RNAfold 评估 mRNA 稳定性。最后，使用 ZDOCK 将免疫毒素与 HER2 对接。结果：分析表明嵌合蛋白可以是一种稳定的可溶性蛋白质，其各部分的二级结构不会改变，蛋白质具有稳健的 3D 结构，可能具有稳定的 mRNA 结构并可与 HER2 受体结合。结论：设计的免疫毒素是一种稳定的可溶性蛋白质，具有与 HER2 受体结合的能力，使其成为乳腺癌治疗的合适免疫毒素候选药物。当前研究的结果可能对未来的实验研究有用。