XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search System组分
宏基因组分析揭示健康母马与患有子宫内膜炎的母马子宫微生物组的新分类学差异
Albihn, A.、Båverud, V. 和 Magnusson, U. (2003)。从患有生育问题的母马体内分离的细菌的子宫微生物学和抗菌药物敏感性。《斯堪的纳维亚兽医学报》，44 (3–4)，121–129。https://doi. org/10.1186/1751-0147-44-121。Ballas, P.、Reinländer, U.、Schlegl, R.、Ehling-Schulz, M.、Drillich, M. 和 Wagener, K. (2021)。患有和不患有轻度子宫内膜炎的奶牛在授精时宫内可培养需氧微生物群的特征。《动物生殖学》，159，28–34。 https://doi.org/10.1016/ j.theriogenology.2020.10.018 Bicalho, MLS、Lima, S.、Higgins, CH、Machado, VS、Lima, FS 和 Bicalho, RC (2017)。牛子宫微生物群的遗传和功能分析。第二部分：化脓性阴道分泌物与健康奶牛。乳业科学杂志，100 (5), 3863–3874。https://doi.org/10.3168/jds.2016- 12061 Clemmons, BA、Reese, ST、Dantas, FG、Franco, GA、Smith, TPL、Adeyosoye, OI、Pohler, KG 和 Myer, PR (2017)。产后哺乳奶牛的阴道和子宫细菌群落。 Frontiers in Microbiology，8，1047。https://doi.org/10.3389/fmicb.2017.01047 Díaz-Bertrana, ML、Deleuze, S.、Pitti Rios, L.、Yeste, M.、Morales Fariña, I. 和 Rivera Del Alamo, MM (2021)。野外条件下马子宫内膜炎的微生物流行率和抗菌敏感性。动物，11 (5)，1476。https://doi.org/10.3390/ani11051476 Diel de Amorim, M.、Khan, FA、Chenier, TS、Scholtz, EL 和 Hayes, MA (2020)。健康母马和患有子宫内膜炎或纤维化子宫内膜退化的母马子宫冲洗液蛋白质组分析。生殖、生育力和发育，32 (6), 572–581。 https://doi.org/10.1071/RD19085 Durazzi, F.、Sala, C.、Castellani, G.、Manfreda, G.、Remondini, D. 和 De Cesare, A. (2021)。 16S rRNA 和鸟枪测序数据比较肠道微生物群的分类学特征。科学报告，11 (1), 3030。https://doi.org/10.1038/s41598-021-82726-y Frontoso, R.、De Carlo, E.、Pasolini, MP、van der Meulen, K.、Pagnini, U.、Iovane, G. 和 De Martino, L. (2008)。生育问题期间马子宫内细菌分离株及其抗菌敏感性的回顾性研究。《兽医学研究》，84 (1), 1–6。https://doi.org/10.1016/j.rvsc.2007.02.008 Heil, BA, Thompson, SK, Kearns, TA, Davolli, GM, King, G., & Sones, JL (2018). 使用多种技术对马子宫常驻微生物组进行宏遗传学表征。马兽医学杂志，66，111。https://doi.org/10.1016/j.jevs.2018.05.156 Holyoak, GR, Premathilake, HU, Lyman, CC, Sones, JL, Gunn, A., Wieneke, X., & DeSilva, U. (2022)。健康的马子宫拥有独特的核心微生物群以及丰富多样且随地理位置而变化的微生物群。科学报告，12(1), 14790。https://doi. org/10。1038/s41598-022-18971-6 Hurtgen, JP (2006). 马子宫内膜炎的发病机制与治疗：综述。《兽类生殖学》66 (3), 560–566。https://doi.org/10。1016/j.theriogenology.2006.04.006 Jianmei, C., Bo, L., Zheng, C., Huai, S., Guohong, L., & Cibin, G. (2015). 鉴定对羟基苯甲酸乙酯为产于
麦角项目：迄今为止加拿大最大的麦角菌调查和基因组分析
数百年来，麦角菌一直是人类与谷物关系的祸根。麦角菌是许多加拿大谷物的真菌病原体，导致受生物碱霉菌毒素污染的深色菌核生长。麦角生物碱合成 (EAS) 基因簇产生的代谢物也与严重危害（包括麦角中毒）以及令人兴奋的潜在治疗方法有关。在本研究中，我们探索了麦角菌核的历史参考样本，以及 2014 年至 2024 年的数千个未表征的收获样本。该项目的目标是以比以前更大的规模检查麦角菌的附属基因组。进一步了解麦角的地理和环境差异以及基因型变异可能会为农业管理和制药潜力提供发展。
全基因组分析表征癌症之间的共同遗传性并确定新的癌症易感区域
1 华盛顿大学流行病学系，美国华盛顿州西雅图 2 弗雷德·哈钦森癌症研究中心公共卫生科学部，美国华盛顿州西雅图 3 华盛顿大学环境与职业健康科学系，美国华盛顿州西雅图 4 哈佛陈曾熙公共卫生学院生物统计学系，美国马萨诸塞州波士顿 5 加利福尼亚大学洛杉矶分校大卫·格芬医学院病理学与实验室医学系，美国加利福尼亚州洛杉矶 6 印度理工学院海得拉巴分校数学系，印度特伦甘纳邦坎迪 7 哈佛陈曾熙公共卫生学院流行病学系，美国马萨诸塞州波士顿 8 南加州大学凯克医学院人口与公共卫生科学系，美国加利福尼亚州洛杉矶 9 多伦多大学西奈山医院 Lunenfeld Tanenbaum 研究所，加拿大安大略省多伦多 10 希望之城国家医学中心肿瘤内科与治疗学研究系中心，美国加利福尼亚州杜阿尔特 11 世界卫生组织国际癌症研究机构，法国里昂 12 美国夏威夷大学癌症中心，美国夏威夷州檀香山 13 西班牙巴塞罗那洛夫雷加特郡加泰罗尼亚肿瘤研究所 - IDIBELL 肿瘤数据分析项目 14 西班牙马德里 CIBER 流行病学与公共健康组织 (CIBERESP) 15 西班牙巴塞罗那大学医学院临床科学系 16 西班牙巴塞罗那洛夫雷加特郡贝尔维特奇生物医学研究所 (IDIBELL) ONCOBEL 项目 17 美国纽约州纽约市纪念斯隆凯特琳癌症中心医学系临床遗传学服务 18 美国纽约州纽约市威尔康奈尔医学院医学系 19 哈佛医学院布莱根妇女医院医学系钱宁网络医学分部美国马萨诸塞州波士顿 20 美国马萨诸塞州剑桥哈佛拉德克利夫研究所 21 澳大利亚昆士兰州布里斯班 QIMR 伯格霍夫医学研究所遗传学和计算生物学系 22 英国爱丁堡大学癌症研究中心，爱丁堡 23 英国剑桥大学哈奇森-MRC 研究中心 MRC 癌症部，剑桥 24 澳大利亚布里斯班 QIMR 伯格霍夫医学研究所统计遗传学系 25 德国莱比锡大学医院内脏、移植、胸腔和血管外科系 26 英国霍尔本伦敦大学学院临床试验研究所 27 斐济苏瓦南太平洋大学 28 德国马尔堡大学医院人类遗传学中心 29 美国国立卫生研究院国家癌症研究所癌症流行病学和遗传学分部美国马里兰州 30 美国国立卫生研究院国家癌症研究所跨部门研究项目，美国马里兰州贝塞斯达 31 斯坦福大学流行病学和人口健康系，美国加利福尼亚州帕洛阿尔托 32 英国伦敦癌症研究所遗传学和流行病学分部 33 美国明尼苏达州罗切斯特市梅奥诊所综合癌症中心实验室医学和病理学系 34 瑞典于默奥大学放射科学系 35 美国加利福尼亚州旧金山市加利福尼亚大学神经外科系 36 美国马萨诸塞州波士顿市哈佛大学陈曾熙公共卫生学院环境健康系 37 美国田纳西州纳什维尔市范德堡大学医学中心流行病学分部胸外科系 38 美国德克萨斯州休斯顿市贝勒医学院临床和转化研究中心
人脑成年海马神经发生的空间转录组分析
在25年前大约在25年前首次提出了人齿状回（DG）的成年海马神经发生（DG）。1成年人类脑中的成年海马神经起源已得到广泛研究，但主要采用免疫组织化学方法，得出了高度不一致的结论。2–9文献中关于人脑中成年海马神经发生的程度的争议可以归因于广泛的因素，包括大脑标本10-12的差异以及用于鉴定用于鉴定抗体的神经源性细胞类型的免疫组织化学方案，用于识别人类Neuurogense的4,13，该协议识别4,13。11这些差异最终导致了关于成年人类海马中标记的不同神经源细胞免疫的结论。例如，在各种免疫组织化学研究中已广泛使用双核（DCX）抗体来表征
关于可持续淡水水产养殖生产中病原体监测宏基因组分析的新观点：系统评价
近年来，淡水和盐水水生食品行业经历了最显着的增长，并越来越被认为是促进繁荣的社会自我绩效和生态上的可持续替代方案。水产养殖生产中的一个主要经济和健康危险因素是健康控制，在热带和发展中国家中可能会发现更严重的影响。虽然宏基因组学对在水产养殖等农业工业领域的应用有很大的希望，但其采用仍然有限。因此，本研究旨在评估开发和应用宏基因组学在识别淡水水产养殖中病原体时的前景。WIPO数据库用于搜索使用宏基因组学开发的专利，以监测淡水水产养殖中的病原体。宏基因组方法已广泛用于不同的领域，例如医学，兽医，生物技术，农业，特别是在重点是不同生态系统中的微生物群落的研究中。在水产养殖中，宏基因组学的利用主要围绕研究抗生素耐药性基因，主要是在盐水农场中。尽管如此，淡水水产养殖，尤其是在鱼类和甲壳类动物中，与可持续发展目标密切相符，尤其是（SDGS）2、3、6和13。国家，例如美利坚合众国，韩国和加拿大，在利用元基因组学对淡水水产养殖的疾病监测的最前沿，其积极的专利发展证明了这一点。与生物信息学工具和数据库相结合的宏基因组分析代表了用于预防目的的环境监测的快速，安全且无创的方法。
人类粪便样品的代谢组和脂肪组分析
微生物组与许多疾病之间的新出现联系使人类肠道浓度（GM）和营养 - 微生物组 - 宿主 - 宿主相互作用处于临床研究的最前沿，旨在探索这种联系的因果关系和影响。粪便已成为微生物组研究的最常用的生物基质，这主要是由于其无创的可用性以及对16S-RRNA基因研究的适用性。然而，粪便中的定量代谢组分分析比缓冲系统和高度ho型样品基质（如血浆或血清）中的分析更具挑战性。粪便还直接受到每日营养，药物摄入，液体摄入和肠道活性等因素的影响。结果，即使在不同时间点从同一个体中概述了样品，粪便样品的代谢组分析也比其他样品更高，甚至来自不同地形位置的同一粪便样品。这种可变性表明，迫切需要对粪便的代谢组分析进行标准化，并制定准备，并开发用于可重复和准确分析的工具。
实验水培系统中种植绿叶蔬菜的微生物群落的宏基因组分析
水培是一个正在发展的食品生产行业，尤其是在绿叶蔬菜领域。由于绿叶蔬菜是食源性疾病的主要来源之一，水培被认为是减少病原体爆发的一种工具。虽然水培和其他受控环境农业系统消除了土壤和户外种植系统中的许多污染源，但污染的风险并未消除。先前对水培的研究表明，细菌病原体（STEC、沙门氏菌和李斯特菌）在水培系统中生长并迅速传播，而且水培农产品的细菌病原体内化率高于土壤种植的植物1-3。事实上，近几个月来，由于沙门氏菌和李斯特菌的污染，水培绿叶蔬菜已被多次召回。尽管如此，与土壤系统相比，有关这些系统的微生物学信息仍然有限。
实体瘤的综合基因组分析和基因检测
免责声明州和联邦法律以及合同语言，包括定义和特定的包含/排除，优先于临床政策，必须首先考虑确定覆盖范围的资格。根据任何适用的医疗保险和医疗补助服务中心（CMS）覆盖范围的报表，包括国家覆盖范围确定（NCD），当地医疗审查政策（LMRP）和/或地方覆盖范围的确定，我们的Medicare和/或Medicaid成员的承保范围也可能有所不同。请参阅CMS网站。必须使用成员的健康计划福利，这是对渲染日期服务的生效。临床政策无意旨在避免审查医学主管的判断，也不是向医疗保健提供者裁定如何执业医学。医疗保健提供者应在提供适当的护理方面行使其医疗判断。在医疗保险策略中识别设备，测试和程序的选定品牌名称仅供参考，并且不是对其他设备，测试或程序对另一个设备的认可。临床技术正在不断发展，我们保留定期审查和更新该政策的权利。未经Humana的许可，可以复制该出版物的任何部分，以任何形式或形式存储在检索系统中或以任何形式或形式传输，无论是电子，机械，复印还是其他方式。例子包括Altera肿瘤基因组分析，Guardant360，Neogenomics实体肿瘤NGS融合面板和Tissuenext。相关的医学/药房覆盖政策遗传检测血液学恶性肿瘤和可疑的髓样疾病液体活检药物基因组学和伴侣诊断描述说明全面的基因组分析（CGP）（CGP）（CGP）（也称为全面的分子分析）是一种属于遗传学方法（tumor）的方法（tumor），是一种遗传学方法（Tumor）的一种象征性，评估肿瘤组织中大量生物标志物的大量生物标志物，以帮助管理晚期实体瘤，包括指导治疗决策以及确定临床试验资格。技术可能因测试而异，并且可能包括下一代测序（NGS），荧光原位杂交（FISH）和免疫组织化学（IHC），并且通常提供有关肿瘤突变负担（TMB），微卫星不稳定性（MSI）和同源性重组不足（HRD）的信息。
基于工程双组分向导 RNA 的分子接近传感器
合成生物学的目标之一是能够设计具有可编程输入和输出的任意分子电路。此类电路将电子电路和自然电路的特性结合起来，以可预测的方式在活细胞内处理信息。基因组编辑是合成分子电路的潜在强大组成部分，无论是用于调节目标基因的表达还是用于将信息稳定地记录到基因组 DNA 中。然而，将蛋白质-蛋白质相互作用或诱导接近等分子事件编程为基因组编辑的触发因素仍然具有挑战性。在这里，我们展示了一种称为“P3 编辑”的策略，它将蛋白质-蛋白质接近与功能性 CRISPR-Cas9 双组分向导 RNA 的形成联系起来。通过设计 crRNA：tracrRNA 相互作用，我们证明了各种已知的蛋白质-蛋白质相互作用以及化学诱导的蛋白质结构域二聚化可用于激活人类细胞中的原始编辑或碱基编辑。此外，我们还探索了 P3 编辑如何整合基于 ADAR 的 RNA 传感器的输出，从而可能允许特定 RNA 在更大的电路中诱导特定的基因组编辑。我们的策略增强了基于 CRISPR 的基因组编辑的可控性，有利于其在活细胞中部署的合成分子回路中的应用。
通过功能基因注释和比较基因组分析揭示从国际空间站分离的新型细菌物种对太空条件的适应性
三种不形成孢子的微生物和一种形成孢子的微生物，均从国际空间站分离而来。使用基于深度学习的工具 - deepFRI - 我们能够对所有研究物种中接近 100% 的蛋白质编码基因进行功能注释，战胜了其他注释工具。我们的比较基因组分析突出了这五个物种的共同特征以及这些国际空间站微生物独有的特定遗传性状。蛋白质组分析反映了这些基因组模式，揭示了相似的特征。这些集体注释表明了它们对太空生活的适应，包括通过机械敏感通道蛋白来管理与微重力相关的低渗应激、增强 DNA 修复活性以抵消增强的辐射暴露，以及存在增强新陈代谢的移动遗传元素。此外，我们的研究结果表明，某些遗传特征的进化表明了潜在的致病能力，例如小分子和肽合成以及 ATP 依赖性转运蛋白。这些特征是国际空间站微生物所独有的，进一步证实了以前的报告，解释了为什么暴露在太空条件下的微生物表现出增强的抗生素耐药性和致病性。结论：我们的研究结果表明，我们研究的从国际空间站分离出来的微生物已经适应了太空生活。机械敏感通道蛋白、增强的 DNA 修复活性以及金属肽酶和新型 S 层氧化还原酶等证据表明，这些不同的微生物之间存在趋同适应，可能在微生物群落的背景下相互补充。促进适应国际空间站环境的共同基因可能使未来太空任务所需的基本生物分子得以生物生产，或者如果这些微生物构成健康风险，则可作为潜在的药物靶点。 54