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World File Search System组分分析
与肝炎有关的晚期发作肠道病毒感染（...
结果：11例患者患有持续性肝炎（HSCT或GT后6年的中位数）。这种情况与肝脏和/或粪便中的肠道病毒（人Aichi病毒，诺如病毒和Sapovirus）的慢性检测有关，这在Scidh-组的粪便中未发现（n = 12）。多组分分析确定了具有高I和II干扰素特征的效应器记忆CD8 + T细胞的扩展。肝炎与在调节，嵌合裂解和B细胞功能缺陷期间缺乏骨髓性有关，占具有这些特征的44例SCID患者中的25％。部分骨髓性重新植入或GT患者的患者（我们称为“与肝炎相关的肠道病毒感染”）导致T-和B细胞免疫的重构以及5例患者的肝炎的缓解，并与病毒清除相一致。
人类粪便样品的代谢组和脂肪组分析
微生物组与许多疾病之间的新出现联系使人类肠道浓度（GM）和营养 - 微生物组 - 宿主 - 宿主相互作用处于临床研究的最前沿，旨在探索这种联系的因果关系和影响。粪便已成为微生物组研究的最常用的生物基质，这主要是由于其无创的可用性以及对16S-RRNA基因研究的适用性。然而，粪便中的定量代谢组分分析比缓冲系统和高度ho型样品基质（如血浆或血清）中的分析更具挑战性。粪便还直接受到每日营养，药物摄入，液体摄入和肠道活性等因素的影响。结果，即使在不同时间点从同一个体中概述了样品，粪便样品的代谢组分析也比其他样品更高，甚至来自不同地形位置的同一粪便样品。这种可变性表明，迫切需要对粪便的代谢组分析进行标准化，并制定准备，并开发用于可重复和准确分析的工具。
使用代谢组和定量分析方法妊娠对血浆鞘脂的影响
摘要：在怀孕期间发生的孕产妇代谢组和特定的母体脂肪组的变化相对未知。本研究的目的是使用代谢组学分析，然后进行确定的定量分析，评估妊娠对鞘脂水平的影响。我们专注于鞘脂的三个子类：神经酰胺，鞘脂蛋白和鞘氨酸。在这项研究中，有47至50岁的47岁孕妇。血样，以进行代谢组学分析。在妊娠25至28周之间收集了妊娠样本，产后学习日样本被收集≥3个月的产后。每个参与者都是自己的控制。使用超表现液相色谱/质谱/质谱法（UPLC/MS/MS）测定法对这些样品进行分析，该测定法产生了半定量峰面积值，用于比较妊娠和产后之间的鞘脂水平。在此脂质分析后，对同一研究样本进行了定量LC/MS/MS/MS/MS靶向/确认分析。在代谢组分分析中，鉴定了43个鞘脂代谢物，并使用相对峰面积值评估其水平。 这些pro -LED鞘脂分为三类：神经酰胺，鞘磷脂和鞘氨酸。 与产后相比，怀孕期间的43种分析物中的在怀孕期间有35个显着不同（P <0.05）（包括7种神经酰胺，26个鞘氨质和2个鞘氨醇）和32个显着差异。在代谢组分分析中，鉴定了43个鞘脂代谢物，并使用相对峰面积值评估其水平。这些pro -LED鞘脂分为三类：神经酰胺，鞘磷脂和鞘氨酸。在怀孕期间有35个显着不同（P <0.05）（包括7种神经酰胺，26个鞘氨质和2个鞘氨醇）和32个显着差异。在代谢组学之后，对23种不同的鞘脂脂进行了单独的定量分析，并产生了定量分析值，其中四个在代谢组学研究中也检测到了四个。定量分析支持了代谢组学结果，其中17个分析物中有17个在怀孕期间被发现有显着差异，其中包括11种神经酰胺，4种鞘磷脂和两个鞘氨酸。怀孕期间其中的14个显着高。我们的数据表明，血浆鞘脂浓度的总体增加，可能对内皮功能，妊娠糖尿病（GDM），妊娠肝内胆汁淤积和胎儿发育产生影响。这项研究为怀孕期间母体鞘脂代谢的改变提供了证据。
化学计量学用于定量测定萜烯的总反射率 - 傅立叶变换红外光谱：教学LA
摘要：化学计量技术，例如部分最小二乘（PLS）回归，已应用于各种化学问题，包括复杂混合物中分析物的多组分分析。尽管如此，很少有实验室教学练习的例子涉及学生从基于红外光谱的仪器中获取化学数据，然后使用PLS进行定量化学计量分析。在本文中，我们提出了一项计算活动，该计算活动在仪器分析实验室环境中介绍了本科生，使用衰减的总反射率 - 较较高的转换红外（ATR-FTIR）光谱谱图进行数据获取，然后使用PLS进行数据分析。活动的第一部分涉及学生创建由p- cymene和limonene组成的二元萜烯组件的混合设计。然后使用ATR-FTIR光谱仪分析了这些混合物，在那里学生熟悉了该仪器，并显示了如何使用其生成的FTIR光谱来表征和区分上述萜烯。活动的第二部分涉及从第一部分中获得获得的FTIR光谱数据的预处理，然后同时使用PLS确定准备好的萜烯。根据学生的调查，可以得出结论，这项方便且廉价的活动最终成功地介绍了使用ATR-FTIR的化学计量学用于对萜烯进行定量分析。关键字：上限本科，分析化学，基于计算机的学习，化学计量学，红外光谱，光谱■简介这项易于做的两周活动可以用作仪器分析实验室类别的独立活动，甚至可以集成在应用光谱和化学计量学的高级课程中。
项目摘要
项目建议结直肠癌（CRC）是世界上最普遍的癌症实体之一，在该疾病后期出现的患者的预后却令人沮丧。这主要是由于癌细胞在整个人体中的全身分布，转移细胞对护理标准疗法具有抗性。但是，如果我们了解如何转化为高级阶段，我们将克服全身治疗的需求。为驱动恶性转化的破译细胞和分子事件，我们启动了e Arly c Ororectal Cancer和T Herapy Protect Project项目的侵害和t的反应。该项目的总体目标是解码患者结肠中从良性病变到恶性病变的时空过渡，重点是早期发作结直肠癌（EOCRC）。与UKHD胃肠病学系合作，您的角色将是在保护项目的伞下在各个时间点采样的临床标本的深入表征。您将利用各种多组分分析（大量，单细胞或空间转录组学）来解密恶性转化的机制，以及哪些释放因子因素有助于进展。此外，您将生成各种患者的体内培养物，以识别和研究机制。总体而言，这个具有最高临床相关性的多学科项目旨在破译机制，以增强未来的试验设计，以提高早期癌症检测或预防恶性转化。我们正在寻找一个积极进取的候选人，他们的目标是在一流的互动中工作（项目中涉及许多合作）和国际研究团队。在DKFZ/HI-STEM/UKHD上，我们通过出色的技术和智力支持进行最先进的研究。
基于血液的多组学引导检测对癌前胰腺肿瘤
在十年前，纵向多组分分析被开创以进行早期疾病检测和单独定制的精确健康干预措施。然而，高样本处理成本，广泛的多种形式调查以及复杂的数据分析使这种方法成为精确/个性化医学的方法。在这里，我们在案例报告中描述了一种更实用的方法，该方法使用了更少的测量，年度抽样和更快的决策。我们还展示了这种方法如何在完全表现出来之前检测出极为罕见且潜在的致命状况。特别是，我们在本案中描述了纵向多组学监测（LMOM）有助于检测癌前胰腺肿瘤的多态多组学监测（LMOM），并导致了成功的手术干预。该患者自2018年以来就参加了年度血液LMOM，在2021年6月和2022年的年度代谢组学和蛋白质组学结果中发生了巨大变化，促使胰腺癌的临床诊断测试促进了进一步的临床诊断测试。使用腹部磁共振成像，检测到患者胰腺尾部的2.6厘米病变。抽吸活检中的肿瘤流体的肿瘤流体具有正常癌囊抗原水平的10,000倍。手术切除肿瘤后，组织病理学发现确认它是癌前胰腺肿瘤。术后OMICS测试表明，大多数代谢物和蛋白质水平都恢复到患者的2018年水平。血液LMOM保证未来的程序化转化研究，具有精密医学的目标，并为癌症的诊断和治疗而定。此病例报告说明了血液LMOM对精确/个性化医学的潜力，以及对胰腺癌的潜在挽救生命的早期诊断的新思维方式。
在溃疡性结肠炎患者中，细菌伴侣与粪便微生物移植衰竭的持续粘膜定植和粪便代谢功能障碍
粪便微生物移植（FMT）为治疗溃疡性结肠炎（UC）提供了希望，尽管治疗失败的机制尚不清楚。这项研究利用了纵向收集的结肠活检（n = 38）和粪便样本（n = 179），来自19名患有轻度至中度UC的成年人接受串行FMT，其中抗菌预处理和递送模式（capsules versus versus versus versus versus versus versus versus versus versus versus versus versus sorge均可评估临床响应（从临床上降低）。结肠活检进行了双RNA-Seq；粪便样品接受了平行的16S rRNA和shot弹枪元基因组测序以及未靶向的代谢组分分析。与反应性（R）患者相比，无反应性（NR）患者的结肠粘膜（NR）患者的结肠粘膜（NR）患者的结肠粘膜增加了细菌的负担，包括细菌的负担增加，这些细菌表达了更多的抗菌耐药性基因。NR患者还表现出先天免疫抗菌反应基因的粘膜表达。FMT，NR和R粪便微生物组和代谢组表现出明显的差异。NR代谢组具有升高的免疫刺激化合物，包括鞘磷脂，溶血磷脂和牛磺酸。nr粪便微生物组富含菌丝脆弱的菌丝和细菌剂盐菌株，这些菌株编码了能够生产牛磺酸的基因。这些发现表明，有效的粘膜微生物清除率和重新引入细菌，使腔内代谢与FMT成功相关，以及持续的粘膜粘膜和粪便抗菌细菌菌种物种可能会导致FMT失败。
肠道少生型和血清代谢产物的特征变化：多词分析
抽象的慢性耳鸣是一种中枢神经系统疾病。当前，肠道菌群对耳鸣的影响仍未探索。为了探索肠道菌群与耳鸣之间的联系，我们在70名耳鸣和30名健康志愿者的患者组中进行了16S rRNA测序，对粪便菌群和血清代谢组分分析进行了16s rRNA测序。我们使用加权基因共表达网络方法来分析肠道菌群与血清代谢产物之间的关系。随机森林技术被用来选择代谢物和肠道分类单元来构建预测模型。耳鸣组中明显的肠道营养不良，其特征是细菌多样性降低，富公司/细菌的比率增加，并且包括气或细菌在内的一些机会性细菌富含。相比之下，一些有益的肠道益生菌减少了，包括乳杆菌和乳杆菌科。在血清MIC分析中，耳鸣患者和这些差异代谢产物的血清代谢障碍富含神经炎症，神经递质活性和突触功能的途径。预测模型在测试集中表现出出色的诊断性能，达到0.94（95％CI：0.85-0.98）和0.96（95％CI：0.86-0.99）。我们的研究表明，肠道微生物群的变化可能会影响耳鸣的发生的出身和慢性，并通过血清代谢产物的变化发挥调节作用。总体而言，这项研究提供了对肠道微生物群和血清代谢产物在耳鸣的发病机理中潜在作用的新看法，并提出了“肠道 - 脑耳 - 耳朵”的概念，作为耳鸣的病理机制，具有明显的临床诊断含义和治疗潜力。
Pogostemon Cablin的综合代谢组和转录组分析为Pogostone的完整生物合成途径提供了新的灯光
pogostemon cablin（Patchouloi）是一种著名的多年生草本植物，用于中药，其主要的生物活性化合物是Patchouloulolol和Pogostone。Patchouli的生物合成途径已经很早就解决了，而Pogostone的生物合成途径由于缺乏直接合成Pogostone的末端酶而无法完全解决。在这里，本研究旨在通过综合转录组和代谢组分分析来预测Pogostone生物合成的末端酶，并重建其最可能的完整生物合成。广香叶的代谢组和转录组纤维与根和茎的叶子大致不同。广圆紫胶类似物（如广宁酸酯和叶氨基烯）主要积聚在叶片中，而pogostone含量的根部含量更高。基于对差异表达的基因和代谢产物的综合分析，我们重建了广丘洛尔的生物合成途径，并预测了pogostone的最可能完整的生物合成途径。此外，我们还鉴定了29个涉及广patlouli的新辛托比底基因组Pogostone生物合成的高表达基因，并且它们的大多数表达水平与Pogostone含量密切相关。尤其是Patcholi Bahd-DCR酰基转移酶（BAHD-DCR）在系统发育上远离但与其他已知的植物Bahd酰基转移酶相似，但结构上相似。他们中的大多数具有保守的催化基序HXXXD，催化中心可以与4-羟基-6-甲基-2-吡酮和4-甲基化甲基-COA和Pogostone的产物分子的广泛认识的底物分子结合。因此，建议广pation胶根中高表达的bahd-dcrs是直接合成pogostone的末端酶。这里的发现提供了更多支持的证据