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2025年生物信息学与计算生物学国际学术会议
基因组学和疾病研究、高通量数据分析、网络生物学、计算遗传学、模型解释和可视 化、生物数据挖掘、比较基因组学、机器学习和医学影像分析、蛋白质结构与功能预测、 宏基因组学与微生物组、知识图谱构建、生物信息学工具开发、转录组学和表达谱的分析、 药物发现与设计、遗传流行病学、蛋白质组学、个性化医疗与精准医学、生物医学工程、 结构生物信息学、计算工具和软件开发、进化生物信息学、系统生物学、环境与生态计算 生物学和流行病学、计算生态学、序列分析、模式识别与生物信号处理、生物信息学与统 计分析、下一代测序技术、计算生物学与人工智能的融合、生物数据挖掘、处理与分析、 计算医学与临床应用、代谢组学、生物信息学工具与网络科学。
生长阶段特异性基因的转录组谱图...
肝发育和免疫功能的机制。使用加权基因共表达网络分析（WGCNA），我们分析了10天（n = 3），2个月（n = 10），6个月（n = 6）和10个月（n = 10）hanwoo犊牛的肝样品，以鉴定生长阶段的基因模块。我们确定了与免疫反应，代谢过程和细胞外基质组织有关的重要基因表达模式，尤其是在关键发育阶段。这些发现表明，肝功能的动态转移，尤其是早期的免疫调节，这是由于免疫相关的HUB基因DOCK2的参与而强调的，并且随着犊牛成熟而增强了代谢活性。这些结果有助于了解肝脏特异性发育和
肠道综合征中的肠道微生物组和细胞因子谱
1以微生物和病毒学系以阿斯塔纳医科大学的Sh.i.Sarbasova命名，阿斯塔纳010000，哈萨克斯坦； dusmagambetov.m@amu.kz（M.D. ）; dusmagambetova.a@amu.kz（A.D。）2 Microbiome实验室，生命科学中心，国家实验室阿斯塔纳实验室，纳扎尔巴耶夫大学，阿斯塔纳010000，哈萨克斯坦； skozhakhmetov@nu.edu.kz（S.K. ）; madiyar.nurgaziyev@nu.edu.kz（M.N。 ）; zharkyn.jarmukhanov@nu.edu.kz（Z.J. ）; st.paulmississippi@gmail.com（e.v. ）; laura.chulenbayeva@nu.edu.kz（L.C。） 3阿斯塔纳医科大学，阿斯塔纳010000，哈萨克斯坦阿斯塔纳医科大学的小儿传染病系； mynzhanova.a@amu.kz（A.M。）; Daulbaeva.a@amu.kz（A.D。）4国家研究心脏外科中心，阿斯塔纳010000，哈萨克斯坦； tauekelovajnura@gmail.com（A.T。）; cardiacsurgeryres@gmail.com（m.b。） *信函：mussabay.k@amu.kz（K.M. ）; akushugulova@nu.edu.kz（又称）1以微生物和病毒学系以阿斯塔纳医科大学的Sh.i.Sarbasova命名，阿斯塔纳010000，哈萨克斯坦； dusmagambetov.m@amu.kz（M.D.）; dusmagambetova.a@amu.kz（A.D。）2 Microbiome实验室，生命科学中心，国家实验室阿斯塔纳实验室，纳扎尔巴耶夫大学，阿斯塔纳010000，哈萨克斯坦； skozhakhmetov@nu.edu.kz（S.K.）; madiyar.nurgaziyev@nu.edu.kz（M.N。）; zharkyn.jarmukhanov@nu.edu.kz（Z.J.）; st.paulmississippi@gmail.com（e.v.）; laura.chulenbayeva@nu.edu.kz（L.C。）3阿斯塔纳医科大学，阿斯塔纳010000，哈萨克斯坦阿斯塔纳医科大学的小儿传染病系； mynzhanova.a@amu.kz（A.M。）; Daulbaeva.a@amu.kz（A.D。）4国家研究心脏外科中心，阿斯塔纳010000，哈萨克斯坦； tauekelovajnura@gmail.com（A.T。）; cardiacsurgeryres@gmail.com（m.b。）*信函：mussabay.k@amu.kz（K.M.）; akushugulova@nu.edu.kz（又称）
空间神经脂肪组学MALDI质谱成像...
图3中枢神经系统（CNS）组织中脂质物种的MALDI成像在不同的神经退行性疾病中。（a）多模式的MALDI-MSI显示在双极性的双极性中与淀粉样菌斑相关的脂质和冠状动脉小鼠脑组织剖面的肽（Tgarcswe）。离子以10μm空间分辨率获得的脂质的图像：磷脂酰肌醇（PI 38：4，m/z 885.6）为阴性（绿色），溶物磷脂酰胆碱，LPC 16：0，M/z 496.3，在正（RED）AM-AM-Z Pallitive and-Z-pallition and-Z-paltem-Z-β（RED）中的emiD-emiD and-amy noid a i riD-amy in noID a a a i.pallie n imy。 4257.6）在同一成像区域中的肽（蓝色）离子图像。109（b）硫化物种类的MALDI-MS离子图像（A）Shexcer（41：2），（B）Shexcer（42：2）和（C）在对照（左）和MPTP杀伤力的Macaque Macaque Brain Tissue，帕克森氏病动物模型中。横向分辨率为150μm。 76（c）脂质的代表性3D图像在斑马鱼模型的中枢神经系统中 - 挑选疾病1.通过重建样品的20个连续部分来制备3D图像。此处显示的脂质是神经酰胺（CER 34：1，CER 37：1），磷脂酰甲酯（PS 44:11）和磷脂酰乙醇胺（PE 40：5）。MALDI MSI以50μm的空间分辨率在负离子模式下获得。 81
利用基于质谱的蛋白质组学用于连续的定向进化
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证（未经同行评审证明）获得的是作者/资助者，他授予Biorxiv授予Biorxiv的许可，以永久显示预印本。它是制作
激酶组表达谱研究有望为多发性骨髓瘤寻找新的治疗途径
多发性骨髓瘤 (MM) 约占血液系统恶性肿瘤的 10%，是第二大常见血液系统疾病。激酶抑制剂被广泛使用，其治疗癌症的功效也已得到证实。在此，为了鉴定对 MM 治疗有潜在治疗价值的激酶，我们研究了大型患者群体中激酶组表达谱的预后影响。我们鉴定了 36 个与 MM 预后价值显著相关的激酶组相关基因，并根据它们的表达建立了激酶组指数。激酶组指数 (KI) 与 MM 的预后、增殖、分化和复发有关。然后，我们在人骨髓瘤细胞系中测试了针对七种已鉴定蛋白激酶 (PBK、SRPK1、CDC7-DBF4、MELK、CHK1、PLK4、MPS1/TTK) 的抑制剂。所有测试的抑制剂均显著降低了骨髓瘤细胞系的活力，我们证实了其中三种抑制剂对患者原发性骨髓瘤细胞的潜在临床意义。此外，我们还证明了它们能够潜在地降低常规治疗（包括美法仑和来那度胺）的毒性。这凸显了它们在骨髓瘤治疗中的潜在有益作用。三种激酶抑制剂（CHK1i、MELKi 和 PBKi）克服了对来那度胺的耐药性，而 CHK1、PBK 和 DBF4 抑制剂使美法仑耐药细胞系重新对这种常规治疗药物敏感。总之，我们证明了激酶抑制剂可能具有治疗意义，尤其是对于 KI 定义的高风险骨髓瘤患者。 CHEK1、MELK、PLK4、SRPK1、CDC7-DBF4、MPS1/TTK 和 PBK 抑制剂单独使用或与美法仑或 IMiD 联合使用可为难治性/复发性骨髓瘤患者提供新的治疗选择。
激酶组表达谱研究有望为多发性骨髓瘤寻找新的治疗途径
多发性骨髓瘤 (MM) 约占血液系统恶性肿瘤的 10%，是第二大常见血液系统疾病。激酶抑制剂被广泛使用，其治疗癌症的功效也已得到证实。在此，为了鉴定对 MM 治疗有潜在治疗价值的激酶，我们研究了大型患者群体中激酶组表达谱的预后影响。我们鉴定了 36 个与 MM 预后价值显著相关的激酶组相关基因，并根据它们的表达建立了激酶组指数。激酶组指数 (KI) 与 MM 的预后、增殖、分化和复发有关。然后，我们在人骨髓瘤细胞系中测试了针对七种已鉴定蛋白激酶 (PBK、SRPK1、CDC7-DBF4、MELK、CHK1、PLK4、MPS1/TTK) 的抑制剂。所有测试的抑制剂均显著降低了骨髓瘤细胞系的活力，我们证实了其中三种抑制剂对患者原发性骨髓瘤细胞的潜在临床意义。此外，我们还证明了它们能够潜在地降低常规治疗（包括美法仑和来那度胺）的毒性。这凸显了它们在骨髓瘤治疗中的潜在有益作用。三种激酶抑制剂（CHK1i、MELKi 和 PBKi）克服了对来那度胺的耐药性，而 CHK1、PBK 和 DBF4 抑制剂使美法仑耐药细胞系重新对这种常规治疗药物敏感。总之，我们证明了激酶抑制剂可能具有治疗意义，尤其是对于 KI 定义的高风险骨髓瘤患者。 CHEK1、MELK、PLK4、SRPK1、CDC7-DBF4、MPS1/TTK 和 PBK 抑制剂单独使用或与美法仑或 IMiD 联合使用可为难治性/复发性骨髓瘤患者提供新的治疗选择。
代谢组谱图揭示了不同茶品种质量的组成差异
抽象茶厂在生物活性化合物中丰富，包括类黄酮，氨基酸，生物碱，萜类化合物和脂质，这些主要影响茶质量和口味。尽管有许多关于不同茶品种的代谢产物的研究，但其生物合成和调节的组成差异仍然是未知的。在这项研究中，使用靶向的代谢组学广泛的代谢组学，包括192个黄酮和28 neminds和28 amino，从根尖的芽中检测到505种代谢产物（'shuchazao'：'scz'：'scz'：'scz'：'huangkui'：'hk'和'hk'和'zijuan'：'zj'：'zj'。代谢产物分析表明，黄酮醇和花色苷主要以三种品种的糖苷形式分布，其中花青素及其糖苷主要在“ ZJ”中积累，表明与颜色属性有相关性。EGCG成为三种品种中最丰富的Flavan-3-ols化合物。l-茶氨酸代表主要的游离氨基酸，与1叶相比，主要集中在顶端芽中，但同样，脂质与游离氨基酸相似，主要是在三个品种的顶端芽中积聚。这些发现为遗传和代谢物多样性提供了宝贵的见解，从而增强了我们对茶叶特定代谢物的生物合成的理解。
