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针对增殖细胞核抗原 (PCNA) 进行癌症治疗
增殖细胞核抗原 (PCNA) 是许多细胞过程中必不可少的支架蛋白。它最出名的作用是作为 DNA 复制过程中的 DNA 滑动夹和加工因子，这一点已被其他人广泛评论。然而，PCNA 的重要性不仅限于其在 DNA 复制、染色质重塑、DNA 修复和 DNA 损伤耐受 (DDT) 中的 DNA 相关功能，因为最近发现了 PCNA 在细胞溶胶中的新非典型作用。这些作用包括在调节免疫逃避、细胞凋亡、代谢和细胞信号传导中的作用。PCNA 的多种作用主要由其无数的蛋白质相互作用介导，其在细胞过程中的核心地位使 PCNA 成为有效的抗癌治疗靶点。PCNA 在所有细胞中表达，并在正常细胞稳态中起着至关重要的作用；因此，靶向 PCNA 的主要挑战是选择性地杀死癌细胞，同时避免对健康细胞产生不可接受的毒性。本章重点介绍 PCNA 与压力相关的作用，以及如何在癌症治疗中利用这些 PCNA 作用。
由于 t(14;18) 易位的存在，淋巴瘤细胞核基因组组织的改变
摘要：染色体重排已被证实会改变基因组结构，从而影响基因表达。对某些类型白血病的研究表明，由于染色体易位引起的融合基因核定位改变，基因表达可能会加剧。然而，迄今为止，对淋巴瘤的研究非常有限。本研究的范围是探索携带已知会导致 BCL2 基因过度表达的 t(14;18)(q32;q21) 重排的淋巴瘤细胞中的基因组结构。为了实现这一目标，我们使用荧光原位杂交技术仔细绘制了淋巴瘤衍生细胞系 Pfeiffer 中整个染色体区域和参与易位的单个基因的定位。我们的数据显示，尽管整个染色体区域的定位没有明显改变，但易位基因可能会占据任一野生型基因的核定位。此外，BCL2 基因在发生 t(14;18) 易位的一定比例细胞核中形成环状，但在没有易位的对照细胞核中则没有形成环状，这表明染色体环状可能是淋巴瘤细胞中 BCL2 表达的重要机制。
通过体细胞核转移（SCNT）
这种SCNT卵母细胞的人工激活导致细胞分裂和染色体分离为伪极性体，并以70％的效率下的二核原体。与正常二倍体（n = 46）数量相比，极性体和Zygotes中单个染色体的下一代测序表明，染色体的数量降低了近一半（n = 19）（n = 19）。同源对的全面测序表明，平均将23对同源对的一半（n = 11）正确分离为极体和合子，而剩余的染色体对保持在一起，导致了肾上变。未检测到体细胞同源物之间的重组证据。
鱼藤酮抑制腺病毒从内体运输到细胞核
无论人类腺病毒 (HAdV) 感染对健康人群的临床影响以及在免疫抑制患者的高发病率如何，目前仍无特定的治疗方法。在本研究中，我们筛选了 CM1407 COST Action 的化学库，其中包含 1,233 种天然产物，以鉴定限制 HAdV 感染的化合物。其中，我们鉴定出鱼藤醇酮，它是一种显著抑制 HAdV 感染的化合物。接下来，我们选择了四种与鱼藤醇酮结构相关的异黄酮类化合物（例如鱼藤酮、鱼藤素、小米酮和特弗罗辛），即鱼藤类化合物，以评估和体外表征它们对 HAdV 和人类巨细胞病毒 (HCMV) 的抗病毒活性。它们对 HAdV 的 IC 50 值范围从鱼藤酮的 0.0039 µM 到 tephrosin 的 0.07 µM，选择性指数范围从鱼藤酮的 164.1 到 deguelin 的 2,429.3。此外，在斑块测定中每种化合物获得的 IC 50 浓度的两倍下，HCMV 复制的抑制范围为 50% 到 92.1%。我们的结果表明，鱼藤酮、deguelin 和 tephrosin 的作用机制涉及 HAdV 复制周期的后期阶段。然而，鱼藤酮的抗病毒作用机制似乎涉及微管聚合的改变，从而阻止 HAdV 颗粒到达细胞的核膜。这些异黄酮类化合物在纳摩尔浓度下对 HAdV 表现出高抗病毒活性，可被视为开发新型广谱抗病毒药物的有力候选药物。
来自肠道微属沟的克隆副细胞核苷作为克罗恩病并发症的可传播的细胞毒性琥珀酸盐 - 敏感模型
（未通过同行评审认证）是作者/资助者。保留所有权利。未经许可就不允许重复使用。此预印本版的版权持有人于2024年1月10日发布。 https://doi.org/10.1101/2024.01.09.574896 doi：Biorxiv Preprint
10x 单细胞多组 ATAC + 基因表达测序的细胞核分离方法
- 裂解稀释缓冲液 - 1X 裂解缓冲液 - 0.1X 裂解缓冲液 - 洗涤缓冲液 - 稀释的细胞核缓冲液 II。注意 - 在制备稀释的细胞核缓冲液之前，先将细胞核缓冲液 (20X) 从 -20 中取出，并使其平衡至室温。 - 来自 Chromium Next GEM 单细胞多组 ATAC + 基因表达用户指南 (CG000338) 的转座混合物需要与稀释的细胞核缓冲液同时制备。裂解稀释缓冲液体积 (μL)
两亲物模拟转录簇在细胞核中的扩散
可以使用完全合成的，分离的DNA-纳米动物模仿生物分子冷凝物，从而模仿相位分离，从而在几种功能性纳米材料中实现明显的控制和性能的增加。干细胞表现出控制和执行基因转录到RNA的大分子的突出簇，这也通过相分离机制形成。由于两亲性效应，被转录的基因可以展开甚至分散这些簇。在这里，我们用具有纳米固定剂的聚胸腺素尾巴部署两亲性DNA的纳米t，以重现由DNA-纳米动物形成的液滴的生物学观察到的诱导型。我们使用多能斑马鱼胚细胞中转录簇的超分辨率显微镜图像作为生物参考数据。延时显微镜，两亲性滴定实验和Langevin动力学模拟表明，将两亲 - 莫蒂夫添加到合成系统中会重现胚胎细胞中转录簇看到的形状变化和分散。我们的工作说明了生物模型系统的组织原理如何指导实施新的方法来控制合成纳米材料的介观组织。
使用体细胞核转移的躯体细胞核转移产生基因核的核细胞核转移生成
牲畜的遗传工程（GE）最初是主要使用核对核微注射到Zygotes（1985-1996）的。由于较低的整合效率，由于随机整合而导致的异常转基因表达以及在转基因创始动物中存在遗传镶嵌物，因此该技术的应用受到限制。尽管为国内物种建立了胚胎干细胞（ESC）的巨大努力，但牲畜不存在ESC GE技术。体细胞核转移（SCNT）的发展绕过了牲畜ESC的需求，并通过提供第一个基于细胞的基于细胞的遗传操作的平台来彻底改变牲畜转基因领域。自多莉（Dolly）诞生以来近二十年（1996 - 2013年），SCNT是产生敲除和敲除牲畜的唯一方法。新一代基因编辑技术的CRISPRS/CAS9系统的到来使我们能够轻松有效地引入精确的基因组修饰。这种技术进步加速了SCNT的GE牲畜的产生，并恢复了合子微观渗透，作为重要的GE方法。SCNT技术的主要优点是能够在动物产生之前体外确认所需的遗传修饰。还可以测试编辑的细胞的潜在脱靶突变。此外，这种方法消除了合子微观渗透后经常观察到的遗传镶嵌的风险。复制（2021）162 F11 – F22尽管效率低，但SCNT还是世界上许多实验室的完善程序，并将继续在GE牲畜领域发挥重要作用。
细胞核中染色质的物理性质
基因组信息编码在长链 DNA 上，DNA 折叠成染色质并储存在微小的细胞核中。核染色质是一种带负电荷的聚合物，由 DNA、组蛋白和各种非组蛋白组成。由于其高电荷性质，染色质结构随周围环境（例如阳离子、分子拥挤等）而变化很大。过去 10 年，已经开发出捕获活细胞中染色质的新技术。我们对染色质组织的看法已从规则和静态转变为更加多变和动态。染色质形成许多紧凑的动态区域，它们充当高等真核细胞中基因组的功能单位，局部呈现液体状。通过改变 DNA 的可及性，这些区域可以控制各种功能。基于来自多功能基因组学和先进成像研究的新证据，我们讨论了拥挤的核环境中染色质的物理性质及其调控方式。