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色氨酸代谢决定结核性脑膜炎的结果：有针对性的代谢组学分析
1. 印度尼西亚万隆帕查达兰大学传染病护理与控制研究中心 14 2. 荷兰奈梅亨拉德堡德大学医学中心内科系和拉德堡德传染病中心 (RCI) 15 3. 美国马萨诸塞州剑桥麻省理工学院和哈佛大学布罗德研究所 17 4. 越南胡志明市牛津大学临床研究中心； 18 5. 印度尼西亚万隆帕查兰大学医学院哈桑萨迪金医院内科部 20 6. 印度尼西亚万隆帕查兰大学医学院哈桑萨迪金医院神经内科部 22 7. 印度尼西亚大学医学院 Cipto Mangunkusumo 医院神经内科部 23 8. 英国牛津大学纳菲尔德医学院热带医学与全球健康中心 24 9. 英国伦敦吉佩尔街伦敦卫生与热带医学院 25 10. 荷兰阿姆斯特丹大学医学中心医学微生物学与感染预防系 26 11. 越南胡志明市第五区热带病医院 27 12. 越南胡志明市第五区范玉石结核病与肺病医院5，胡志明市，越南 30 13. 印度尼西亚万隆巴查达兰大学医学院生物医学科学系 31 14. 个性化感染医学计算生物学系，个性化感染医学中心 (CiiM) 和 TWINCORE，亥姆霍兹感染研究中心 (HZI) 与汉诺威医学院 (MHH) 的合资企业，33 汉诺威，30625，德国 34 15. 印度尼西亚牛津大学临床研究中心，印度尼西亚大学医学院 35
流行病学，发病机理，临床表现和结核性脑膜炎的管理策略
结核性脑膜炎（TBM），是肺外结核病最严重的表现，由于其高死亡率和复杂的病理生理学，对全球健康挑战提出了重大的全球健康挑战。本评论综合了有关TBM的最新发现，涵盖了流行病学，发病机理，临床表现，诊断和管理策略。TBM不成比例地影响包括艾滋病毒患者在内的免疫功能低下的人群，在低资源环境中死亡率最高。发病机理涉及结核分枝杆菌破坏血脑屏障，从而引起肉芽肿性炎症反应，从而有助于神经毒性。诊断的进步，例如下一代测序和新型成像技术，已改善了早期检测和治疗指导。管理策略强调多药方案，辅助皮质类固醇和新兴疗法，例如鞘内给药和基于纳米颗粒的药物递送。靶向免疫调节和氧化应激的宿主定向疗法在改善预后，尤其是耐药性TBM方面有希望。尽管有进步，诊断延迟，治疗耐药性以及神经系统作用的高率强调了进一步研究的需求。专注于早期诊断，可修改风险因素管理和公共卫生干预措施的预防策略对于减轻TBM的全球负担至关重要。本评论重点介绍了整合创新诊断，量身定制的治疗方法和预防措施以应对TBM挑战并改善患者预后的重要性。
结核性脑膜炎诊断和治疗
结核性脑膜炎（TBM）是结核分枝杆菌（MTB）引起的一种严重形式的非纯性脑膜炎，是最关键的肺外结核（TB）表现，尽管可用治疗，但死亡率仍为30-40％。缺乏独特的临床症状和有效的诊断工具会使早期发现复杂化。核酸检测，基因组学，代谢组学和蛋白质组学的最新进展导致了新型的诊断方法，从而提高了灵敏度和特异性。本综述着重于基于核酸的方法，包括XPERT Ultra，宏基因组下一代测序（MNGS）和整个脑组织的单细胞测序，以及代谢组和蛋白质组织生物标志物的诊断潜力。通过评估技术特征，诊断准确性和临床适用性，本综述旨在为TBM诊断策略的优化提供信息，并探讨多态技术的整合和临床翻译。
脑脊液靶向测序快速鉴定耐药结核性脑膜炎
摘要 结核性脑膜炎 (TBM) 的死亡率仍然保持在 30% 左右，大多数死亡发生在开始治疗后的 2 个月内。耐药菌株的死亡率更高，因此及早发现耐药性 (DR) 至关重要。靶向下一代测序 (tNGS) 产生高读取深度，可以检测低频率的 DR 相关等位基因。我们将 Deeplex Myc-TB（一种 tNGS 检测）应用于 72 名经微生物学确诊的 TBM 成人的脑脊液 (CSF) 样本，并将其基因组药物敏感性预测与表型敏感性测试 (pDST) 和全基因组测序的综合参考标准以及临床结果进行了比较。Deeplex 在 24/72 (33.3%) 个 CSF 样本中检测到结核分枝杆菌复合体 DNA，并为 22/24 (91.7%) 生成了完整的 DR 报告。 Deeplex 生成的读取深度与 MTB/RIF Xpert 的半定量结果相关。在与一线 DR 相关的典型基因座上可以看到频率 <20% 的等位基因。忽略这些低频等位基因，Deeplex 与除吡嗪酰胺和链霉素以外所有药物的综合参考标准 100% 一致。三名患者在治疗 30 天后脑脊液培养呈阳性；参考测试和 Deeplex 在其中两名患者中鉴定出异烟肼耐药性，而 Deeplex 单独在一名患者中鉴定出低频利福平耐药等位基因。五名患者死亡，其中一名患者通过 pDST 鉴定出吡嗪酰胺耐药性。脑脊液 tNGS 可以快速准确地检测出耐药 TBM，但其应用仅限于细菌负荷较高的患者。对于细菌负荷较低的患者，需要开发诊断和耐药性检测的替代方法。
色氨酸代谢决定结核性脑膜炎的结果：有针对性的代谢组学分析
1 印度尼西亚万隆巴查达兰大学传染病护理与控制研究中心； 2 荷兰奈梅亨拉德堡德大学医学中心内科系和拉德堡德传染病中心 (RCI)； 3 麻省理工学院和哈佛大学布罗德研究所，美国剑桥； 4 越南胡志明市牛津大学临床研究中心； 5 印度尼西亚万隆巴查嘉兰大学医学院哈桑萨迪金医院神经内科； 6 印度尼西亚万隆巴查嘉兰大学医学院哈桑萨迪金医院内科系； 7 印度尼西亚雅加达印度尼西亚大学医学院 Cipto Mangunkusumo 医院神经内科； 8 英国牛津大学纳菲尔德医学系热带医学与全球健康中心； 9 伦敦卫生与热带医学院，伦敦，英国； 10 荷兰阿姆斯特丹大学医学中心医学微生物学和感染预防系； 11 越南胡志明市热带病医院； 12 越南胡志明市范玉石结核病和肺病医院； 13 印度尼西亚万隆巴查嘉兰大学医学院生物医学科学系； 14 个性化感染医学计算生物学系、个性化感染医学中心 (CiiM) 和 TWINCORE，德国汉诺威亥姆霍兹感染研究中心 (HZI) 与汉诺威医学院 (MHH) 的合资企业； 15 印度尼西亚雅加达印度尼西亚大学医学院牛津大学临床研究中心