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World File Search System脂症
de.nbi春季学校2025年生物信息学
日期：2025年3月24日至28日地点：生物技术中心 - Bielefeld大学主题：脂质组学生物信息学，重点介绍质谱数据分析和工作流程内容：De.NBI Spring School 2025将提供脂质生物学生物学的深入知识和实践经验。参与者将探索对脂质学研究，综合脂肪组学工作流程至关重要的最先进的生物信息学工具，以及脂质症学从多个角度的挑战和局限性。
高脂血症研究，治疗和监测
●明显的高甘油三酯血症或对治疗有抵抗力的高甘油三项血症。> 20mmol/L的甘油三酸酯将由生物化学部致电GP实践/要求临床医生（除非这是先前的发现或患者在脂质诊所的照顾下）。这部分是由于继发于高甘油三项血症的急性胰腺炎的风险，其次是提示紧急行动以识别潜在原因并治疗它。如果患者的甘油三酸酯> 20mmol/L建议紧急与UHB脂质诊所团队联系以寻求建议。这些患者可能需要在纤维化（只要没有禁忌症的情况下）进行胰岛素输注或开始，以帮助将甘油三酸酯降低。甘油三酸酯10-20mmol/l应在5-14天之间重复建议。如果甘油三酸酯仍然> 10mmol/L考虑转介到UHB脂质诊所。与此同时，应就减少/避免酒精，低脂肪饮食和糖尿病控制的咨询咨询。
治疗万古霉素耐药肠球菌 (VRE) 感染的途径
研究小组假设，Na+转运VoV1-ATPase可能是VRE存活的重要酶。这种酶起到钠泵的作用，在肠道的碱性环境中将Na+输出出细胞，从而维持体内平衡并使细菌生长（图1a）。这种蛋白质存在于多种能在碱性环境下生长的致病菌中，但在动物、植物以及乳酸杆菌、双歧杆菌等有益菌中却不存在，因此抑制该蛋白质的化合物有望成为新型抗菌药物。 因此，我们假设，如果我们能够找到一种化合物来抑制这种 Na + 转运 V o V 1 -ATPase 的功能，我们也许能够抑制 VRE 的增殖，并且我们从广泛的化合物库中寻找抑制剂。
通过对脂质膜的差异影响，脂肽和表面素的不同生物防治活性
脂肽具有化学农药的有希望的替代品，用于植物生物防治目的。我们的研究通过检查它们与脂质膜的相互作用，探讨了脂肽表面蛋白（SRF）和富霉素（FGC）的独特植物生物防治活性。我们的研究表明，FGC具有直接的拮抗活性，对辣椒粉，并且在拟南芥中没有明显的免疫吸收活性，而SRF仅表现出刺激植物免疫力的能力。它还揭示了SRF和FGC对膜完整性和脂质堆积的影响。SRF主要影响膜的物理状态，而没有明显的膜通透性，而FGC透化膜而不会显着影响脂质堆积。从我们的结果中，我们可以提出脂肽的直接拮抗活性与它们透化脂质膜的能力有关，而刺激植物免疫的能力更可能是它们改变膜的机械性能的能力。我们的工作还探讨了膜脂质成分如何调节SRF和FGC的活动。固醇对两种脂肽的活性产生负面影响，而鞘脂会减轻对膜脂质填料的影响，但会增强膜泄漏。总而言之，我们的发现强调了考虑膜脂质填料和泄漏机制在预测脂肽的生物学作用中的重要性。它还阐明了膜组成与脂肽的有效性之间的复杂相互作用，从而提供了靶向生物控制剂设计的见解。
原位产生的细菌脂质对沉积脂质组的实质性贡献
摘要：沉积脂质池由无数个单个成分组成。由于它们对有机碳固换的重要性及其在古气候和地球生物学重建中的应用，因此已经研究了数十年来的构图，但仍缺乏对其组成的总体看法。在某种程度上，这种不确定性与沉积物脂质的不同来源有关，它们都可以通过沉积物从上覆的水柱中传递，但也可以由沉积物居住的生物在原地中产生。另一种不确定性与脂质组之间的保存程度不同，并且相对于其他有机物。在这里，我们使用高分辨率质谱法对黑海中的沉积脂多组进行了不靶向的分析。除了发现了浮游植物衍生的化石脂质外，还发现了一套多种多样的鞘脂，占沉积性脂质体的约20％。这些鞘脂是由沉积性厌氧菌在原位产生的，厌氧菌可能使用鞘脂代替磷脂，这可能是由于缺氧沉积物中磷酸盐的缺乏。我们的结果表明，尽管浮游植物衍生的脂质贡献了50-60％的沉积脂肪组，但可能会忽略了细菌脂质的重要性，尤其是原位产生的鞘脂。
