基础编辑器是基因组编辑工具箱的创新补充,该工具箱向该领域介绍了新的基因组编辑策略。不是使用双链DNA断裂,而是使用核碱酶修饰化学的化学方法有效,精确地将单核苷酸变体(SNV)纳入活细胞的基因组。目前存在两类的DNA碱基编辑器:脱氧基丁胺脱氨酸衍生的编辑器(CBE,促进C•G至T•A突变)和脱氧腺苷脱氨基衍生的基础编辑器(ABES,促进A•T•T to G to G•C突变)。最近,线粒体碱基编辑器的发展也允许将C•G引入T•A突变也将其引入线粒体DNA。基础编辑人员作为治疗剂和研究工具表现出巨大的潜力,并且已经进行了广泛的研究,以改善原始基础编辑构造,以帮助各种学科的研究人员。尽管它们广泛使用,但很少有出版物重点是阐明基础编辑中间体处理过程中所涉及的生物学途径。由于基本编辑器引入了独特的DNA损伤产品(A U•与DNA骨架不匹配,用于CBES,而与DNA骨链的I•与ABES的DNA骨架不匹配)来促进基因组编辑,对DNA损害修复的深入了解,促进或促进基础的进一步改进方面的进一步改进技术,并具有进一步的改进。在这里,我们首先回顾了典型的脱氧尿苷,脱氧氨酸和单链破裂修复。然后,我们讨论这些不同维修过程之间的相互作用如何导致不同的基础编辑结果。通过这篇综述,我们希望促进有关基础编辑的DNA修复机制的周到讨论,并帮助研究人员改善当前的基础编辑和新基础编辑者的发展。
背景:铁铁作用是一种不同的铁细胞死亡形式,是由于活性氧(ROS)的产生引起的严重脂质过氧化引起的。乳腺癌患者的生存与Rho鸟苷三磷酸酶水解酶(GTPase)活化蛋白6(ARHGAP6)的肿瘤抑制特性相关。这项研究研究了ARHGAP6对乳腺癌螺栓吞噬作用的影响和机制。方法:使用定量RT-PCR,Western印迹和免疫荧光染色,在基因表达数据集,癌组织样品和细胞中检测到ARHGAP6表达。ARHGAP6。使用5-乙基-2-脱氧尿苷(EDU)测定法测量细胞增殖,并使用LDH细胞毒性测定法测定细胞死亡率。As indicators of ferroptosis, Fe 2+ ion content, lipid ROS, glutathione peroxidase 4 (GPX4), ChaC glutathione specific gamma-glutamylcyclotransferase 1 (CHAC1), prostaglandin-endoperoxide synthase 2 (PTGS2), solute car- rier family 7 member 11 (SLC7A11), and评估了酰基-COA合成酶长链家族成员4(ACSL4)水平。结果:在癌症组织和细胞中,ARHGAP6显然被下调。ARHGAP6的过表达降低了细胞增殖,细胞死亡升高和脂质ROS,降低了GPX4和SLC7A11,PTGS2,ACSL4和CHAC1增加,并抑制了癌细胞中的RhoA/Rock1和P38 MAPK信号。ARHGAP6敲低与ARHGAP6过表达相反的影响。ARHGAP6 mRNA水平与肿瘤组织中的铁凋亡指标呈正相关。p38 signaling抑制逆转了arhgap6敲低对逆转录病的影响,而rhoa/rock1信号抑制作用损害了arhgap6对p38 mapk信号传导的影响。在小鼠模型中,ARHGAP6以及诱导肌毒死剂RSL3合作的促进性铁氧作用增强并抑制了癌细胞的肿瘤生长。结论:这项研究表明,ARHGAP6通过通过RhoA/Rock1/p38 MAPK信号传递肿瘤来抑制乳腺癌的肿瘤生长。将ARHGAP6与诱导脂肪毒剂诱导剂相结合可能是乳腺癌治疗的有前途的治疗策略。
摘要:在成年啮齿动物中,空间学习可增加海马齿状回的神经发生。此前,啮齿动物大脑中另一个主要的神经发生区,即脑室下区 (SVZ),尚未发现类似的效应。尽管大多数 SVZ 产生的神经元会前往嗅球,但一小部分神经元会横向迁移到纹状体。考虑到纹状体在运动学习中的作用,我们想知道运动学习是否会增加成年 SVZ 神经发生。为了验证这一假设,成年雄性 C57Bl/6 小鼠接受了转棒训练,并注射了 5-乙炔基-2'-脱氧尿苷 (EdU) 来标记分裂细胞。使用了两个对照组:模拟训练小鼠静止坐在静止的转棒上,而幼稚小鼠则留在笼子里。在任务完成后 1、7 和 30 天收集大脑,并用 EdU、双皮质素 (DCX) 和 NeuN 进行免疫组织化学处理,以定量分析不同时间点的神经元增殖和存活情况。FACS 对 EdU 标记的细胞核进行分选作为次要测量。我们发现运动学习会增加 SVZ 神经发生,任务完成后一天,与模拟训练小鼠相比,转棒小鼠的 EdU+ 细胞增加了 1.4 倍,总 EdU 强度增加了 1.8 倍。重要的是,一组使用跑步机代替转棒的对照实验表明,在排除运动作为混杂因素的情况下,跑步小鼠和静止小鼠的 SVZ EdU 标记没有差异。转棒小鼠和模拟训练小鼠的 SVZ 中的 DCX 表达最初升高了 1.7 倍,但 7 天后在模拟训练小鼠中恢复到基线水平,而在转棒训练小鼠中仍保持较高水平。这些结果表明,学习诱导的神经发生会在运动训练后的一周内持续进行。转棒训练任务的影响在纹状体中也持续存在一段时间。在训练后 7 天和 30 天,转棒训练小鼠的纹状体 EdU+ 细胞更加丰富。此外,在训练后 7 天,纹状体中存在迁移的 EdU+ / DCX+ 神经元,尽管很少见,但在训练后 30 天仍可识别出存活的纹状体 EdU+ / NeuN+ 神经元。总体而言,这些结果证明了运动学习在成年啮齿动物 SVZ 中的神经发生影响,并表明运动学习可能会驱动未成熟神经元迁移到纹状体。
摘要α1,3-羟基转移酶9(FUT9)负责Lewis X [Le X,Galβ1-4(FUCα1-3)Glcnac]碳水化合物表位的合成,这是多能或多元组织特异性干细胞的标记。尽管未缺乏的小鼠表现出与焦虑相关的行为,但大脑中的结构和细胞异常仍有待研究。在这项研究中,使用原位杂交和免疫组织化学技术结合使用,我们在大脑和视网膜中阐明了FUT9的时空表达以及Le X的时空表达。我们发现表达FUT9的细胞对CTIP2是阳性的,CTIP2是位于V/VI层中的神经元的标记,而TLE4是Cortex的VI层的皮质丘脑投影神经元(CTHPN)的标记。在胚胎日(E)11.5,5-溴-2--脱氧尿苷在E12.5时使用5-乙基甲尿尿苷(E),在e14.5处于E14.5的GFP表达质粒的子宫倍孔中,在E14.5降低了E1.5的VIIN中,E14.5在E14.5中,E14.5的gfp表达质粒的静脉外,E12.5的UTERO电穿孔中,E14.5在E14.5中均在E14.5中,在E14.5中,E14.5在E14.5中,E14.5在E14.5中,E14.5在E14.5中,在E14.5中, 。 P0 FUT9 - / - 小鼠中的视网膜的神经节细胞层。 此外,层VI/子板神经元的这种减少持续到成年期,导致CTIP2强/SATB2的数量减少 - 成人FUT9 - / - Cortex的V/VI中的兴奋性神经元。 这些结果表明FUT9在皮质和视网膜中神经前体细胞的分化,迁移和成熟中起着重要作用。。 P0 FUT9 - / - 小鼠中的视网膜的神经节细胞层。 此外,层VI/子板神经元的这种减少持续到成年期,导致CTIP2强/SATB2的数量减少 - 成人FUT9 - / - Cortex的V/VI中的兴奋性神经元。 这些结果表明FUT9在皮质和视网膜中神经前体细胞的分化,迁移和成熟中起着重要作用。。 P0 FUT9 - / - 小鼠中的视网膜的神经节细胞层。 此外,层VI/子板神经元的这种减少持续到成年期,导致CTIP2强/SATB2的数量减少 - 成人FUT9 - / - Cortex的V/VI中的兴奋性神经元。 这些结果表明FUT9在皮质和视网膜中神经前体细胞的分化,迁移和成熟中起着重要作用。。 P0 FUT9 - / - 小鼠中的视网膜的神经节细胞层。 此外,层VI/子板神经元的这种减少持续到成年期,导致CTIP2强/SATB2的数量减少 - 成人FUT9 - / - Cortex的V/VI中的兴奋性神经元。 这些结果表明FUT9在皮质和视网膜中神经前体细胞的分化,迁移和成熟中起着重要作用。。 P0 FUT9 - / - 小鼠中的视网膜的神经节细胞层。此外,层VI/子板神经元的这种减少持续到成年期,导致CTIP2强/SATB2的数量减少 - 成人FUT9 - / - Cortex的V/VI中的兴奋性神经元。这些结果表明FUT9在皮质和视网膜中神经前体细胞的分化,迁移和成熟中起着重要作用。