摘要:子宫内膜异位症是一种依赖雌激素的妇科疾病,具有相关的慢性炎症成分,其特征在于子宫腔外的子宫内膜组织。其主要症状是疼痛,这种情况显然改变了疾病女性的生活质量。本综述旨在详尽地收集有关子宫内膜异位症相关疼痛中嘌呤能信号传导的当前知识。因核苷酸酶活性的变化而改变的细胞外ATP水解已在子宫内膜异位症中报道。 ATP在子宫内膜微环境中产生的积累表明核苷酸受体(P2受体)的持续激活能够产生持续的疼痛信息。P2X3受体,在感觉神经元中表达,介导伤害性,神经性疼痛和炎症性疼痛,并参与与子宫内膜异位相关的疼痛。对P2X3受体的药理抑制作用正在评估是子宫内膜异位症女性的疼痛治疗。此处还讨论了其他ATP受体的作用,例如P2X4和P2X7受体,这些受体参与了炎症细胞 - 粘膜和小胶质细胞 - 脑串扰,因此在炎性弹药和神经性疼痛中。腺苷受体(P1受体)主要扮演抗伤害感受和抗渗透性角色。尖锐的靶向药物,包括核苷酸受体和代谢酶,是用于子宫内膜异位相关疼痛的药理学管理的潜在非激素治疗工具。
为什么我们需要颠换碱基编辑器? CRISPR-Cas9 系统彻底改变了基因组工程领域。该系统通过在基因组中生成小的插入/缺失,可高效地引起靶向敲除。从一个核苷酸到另一个核苷酸的精确修改需要充足的供体模板供应和同源定向修复 (HDR) 途径的诱导 [1]。胞嘧啶碱基编辑器 (CBE) 和腺嘌呤碱基编辑器 (ABE) 的发明使我们能够在没有供体模板的情况下在 DNA 或 RNA 中进行靶向 C 到 T 和 A 到 G 的转换 [2-5]。CBE 和 ABE 都已广泛应用于各种生物体,以创建或纠正点突变,用于不同的应用 [5、6]。然而,CBE 和 ABE 仅催化碱基转换(嘌呤到嘌呤或嘧啶到嘧啶),并且只能用于实现 12 种可能的碱基替换中的 4 种。尽管如此,许多生物、治疗和作物改良应用都需要
概率的父母之间没有血缘关系。确认了II型中枢神经系统的诊断,通常会提取和测序他的父母的血液基因组DNA及其父母的血液基因组DNA。遗传测试结果显示两个可疑的纯合致病突变。一个突变是C.1456 T> G P.Y486D纯合突变。Y486D位于外显子5上,将1,456胸腺素(T)改为鸟嘌呤(G),并将残留物486酪氨酸(Tyr)变成天冬氨酸(ASP)。他的父母是C.1456 T> G P.Y486D杂合载体(补充数字S1A – C)。另一个突变是c.211g> a p.g71r纯合突变。g71r位于外显子1中,将211鸟嘌呤(g)突变为腺嘌呤(a),并将残基71从甘氨酸(Gly)变化为精氨酸(ARG)。他的父亲是C.211G> p.g71r纯合子载体,没有任何症状,他的母亲是杂合携带者(补充数据S1D – F)。
摘要:多聚谷氨酰胺脊髓小脑共济失调 (SCA) 是由单个基因编码区胞嘧啶-腺嘌呤-鸟嘌呤重复扩增引起的六种常染色体显性共济失调的异质性群体。目前,这些疾病尚无治愈或减缓疾病的治疗方法,但它们的单基因遗传为基因治疗策略的发展提供了理论依据。事实上,RNA 干扰策略已在 SCA1、SCA3、SCA6 和 SCA7 的细胞和/或动物模型中显示出有希望的发现。此外,反义寡核苷酸疗法已在 SCA1、SCA2、SCA3 和 SCA7 模型中提供了令人鼓舞的概念证明,但它们尚未进入临床试验。相反,基因编辑策略,例如成簇的规律间隔的短回文重复序列 (CRISPR/Cas9),已被引入
DNA 中的信息被编码在以侧链形式固定在脱氧核糖磷酸聚合物骨架上的碱基序列中。腺嘌呤-胸腺嘧啶和鸟嘌呤-胞嘧啶成对碱基残基之间的双氢键和三氢键使互补 DNA 序列能够选择性地自组装,从而产生以四碱基编码的分子梯状结构。1 由于这种序列选择性自组装,DNA 已成为一种多功能的纳米结构介质,在热熔化和退火后,设计的 DNA 链混合物可以杂交以提供复杂的多维结构。2–4 然而,尽管基于 DNA 的纳米技术取得了成功,但对链间氢键和糖磷酸骨架的依赖可能会损害所得结构的机械、热和化学稳定性。5,6
我们最近开发了定向甲基化和长读测序 (DiMeLo-seq),以绘制全基因组范围内的蛋白质-DNA 相互作用。DiMeLo-seq 能够绘制单个 DNA 分子上的多个相互作用位点,在内源性 DNA 甲基化的背景下分析蛋白质结合,识别单倍型特异性蛋白质-DNA 相互作用,并绘制难以用短读方法研究的基因组重复区域中的蛋白质-DNA 相互作用。使用 DiMeLo-seq,通过使用蛋白质 A 将 Hia5 甲基转移酶束缚到抗体上,对目标蛋白质附近的腺嘌呤进行原位甲基化。然后通过使用长读单分子 DNA 测序平台(如纳米孔测序)直接读取腺嘌呤甲基化来检测蛋白质-DNA 相互作用。在这里,我们提供了执行 DiMeLo-seq 的详细协议和实用指南。该协议可以在新鲜、轻度固定或冷冻细胞的细胞核上运行。该方案需要 1-2 天进行原位靶向甲基化,1-5 天进行文库制备(取决于所需片段长度),1-3 天进行纳米孔测序(取决于所需测序深度)。该方案需要基本
摘要这项研究组装了93种结核分枝杆菌复合物(MTBC)分离株的DNA腺嘌呤甲基组,并从7个谱系中与完全注销的,完成的,从头组装的基因组配对。综合分析产生了四个关键结果。首先,甲基转移酶 - 甲基甲基映射校正的甲基转移酶变体效应以前被基于参考的变体调用遮盖。第二,部分活性的甲基转移酶等位基因的异质性分析表明,细胞内随机甲基化在等生培养物中产生甲基甲基化合物的镶嵌性,我们将其形式化为“细胞间摩西甲基化”(IMM)。突变驱动的IMM在全球突出的北京sublineage中几乎无处不在。第三,启动子甲基化是广泛的,与D HSDM转录组中的差异表达相关,表明启动子HSDM甲基化直接影响转录。最后,比较和功能分析确定了351个位点可在分离株和许多推定的调节相互作用之间进行高变量。这种多摩变整合揭示了临床分离株中甲基甲基变异性的特征,并为假设DNA腺嘌呤甲基化在MTBC生理学和适应性进化中的功能提供了合理的基础。
脱氧核糖核酸(DNA)是存在于所有生物体所有细胞中的分子,负责携带生物的遗传信息。 DNA 是一种聚合物,这意味着它是由一系列较小的组成部分组成的,形成一条链。这个谜题的组成部分是核苷酸,其中含有含氮碱基(腺嘌呤、胸腺嘧啶、胞嘧啶和鸟嘌呤)。 DNA 中有两条相关的多核苷酸链,它们盘绕在一起形成双螺旋。 DNA 中的碱基序列负责编码蛋白质,因为核苷酸最终将被转化为蛋白质,每次三个含氮碱基。这种从母细胞传递给子细胞的完整“说明书”的特性使得性状能够在几代人之间遗传。生物信息学在分析 DNA 序列时负责分析和解释这些序列,以识别基因、调控区域、遗传变异,并了解生物体的进化和多样性。
DNA 是什么? • DNA 代表脱氧核糖核酸,是人类和几乎所有其他生物体的遗传物质。 • 大部分 DNA 位于细胞核中(称为核 DNA),但少量 DNA 位于线粒体中(称为线粒体 DNA)。 • DNA 由两条链组成,两条链相互缠绕形成双螺旋结构,携带生长所需的遗传指令。 • DNA 由 23 对染色体组成,为整个生物体和蛋白质的构建提供指令。 • DNA 中的信息以代码形式存储,由四种化学碱基组成:腺嘌呤 (A)、鸟嘌呤 (G)、胞嘧啶 (C) 和胸腺嘧啶 (T)。人类 DNA 由大约 30 亿个碱基组成,其中 99% 以上的碱基在所有人中都是相同的。 • DNA 的一个重要特性是它可以复制,即自我拷贝。双螺旋结构中的每条 DNA 链都可以作为复制碱基序列的模式。