膜联蛋白(ANNS)是一个在植物生长,发育和压力反应中起关键作用的进化保守,依赖钙依赖性的磷脂结合蛋白的家族。利用26个高质量玉米基因组的泛基因组,我们鉴定了12个ANN基因,其中包括9个核心基因(以所有26条线为单位)和3个近核基因(以24-25条为单位)。这突出了基于单个参考基因组研究ZMANN基因的局限性。评估26个品种中ANN基因的KA/KS值表明Zmann10在某些品种中处于正选择状态,而其余基因的Ka/ks值小于1,表明纯化选择。系统发育分析将ZMANN蛋白分为六组,其中VI仅包含ZMANN12。某些品种的结构变化改变了保守的结构域,产生了许多非典型基因。转录组分析表明,不同的ANN成员在各种组织以及不同的非生物和生物应力处理下具有不同的表达模式。在冷应力下,来自各种玉米组织的转录组数据的加权基因共表达网络分析鉴定出参与共表达模块的四个ANN基因(Zmann2,Zmann6,Zmann7,Zmann9)。总体而言,这项研究利用高质量的玉米pangenomes对Zmann基因进行生物信息学分析,为ZMANN基因的进一步研究提供了基础。
摘要 促炎细胞因子通过经典途径从分泌囊泡分泌或通过非经典途径从细胞外囊泡 (EV) 分泌,它们共同在三阴性乳腺癌 (TNBC) 进展中发挥关键作用。膜联蛋白 A6 (AnxA6) 是一种 Ca 2+ 依赖性膜结合蛋白,在 TNBC 中与细胞生长和侵袭性有关。AnxA6 与 EV 相关,但它是否影响促炎细胞因子和/或 EV 的分泌仍有待完全阐明。为了评估 AnxA6 是否影响细胞因子和细胞外囊泡的分泌,我们使用细胞因子阵列分析了对照 AnxA6 表达和 AnxA6 下调的 MDA-MB-468 TNBC 细胞澄清培养上清液中的分泌因子。这表明,AnxA6 下调后,单核细胞趋化蛋白 1 (MCP-1/CCL2)、白细胞介素 8 (IL- 8)、dickkopf1 (DKK1)、血细胞反应蛋白-1 (TSP-1) 和骨桥蛋白 (OPN) 的分泌减少。我们还表明,在 AnxA6 下调的细胞中,小 EV 的分泌显著减少,而 AnxA6 的上调促进了治疗的分泌,也与 Rab7、胆固醇和 MCP-1 水平相关的 EV 增加有关。此外,在 AnxA6 表达细胞中,EV 中的胆固醇含量明显高于 AnxA6 下调的细胞,并且在长期拉帕替尼诱导 AnxA6 上调后。从机制上讲,我们证明 MCP-1 和/或 EVs 的分泌依赖于 AnxA6,这需要 AnxA6 易位到细胞膜并与 SNAP23 相互作用。AnxA6 中和抗体大大降低了 AnxA6 低 TNBC 细胞的存活率,但对表达相对高水平蛋白质的 TNBC 细胞的存活率影响甚微。总之,这些数据表明 AnxA6 促进 EVs 和促炎细胞因子的分泌,这可能对 TNBC 进展至关重要。关键词:膜联蛋白 A6、促炎细胞因子、外泌体、细胞外囊泡、SNAP23、分泌、三阴性乳腺癌简介
抽象的客观胰腺癌是一种无法治愈的恶性疾病,预后极不良和复杂的肿瘤微环境。我们试图表征膜联蛋白A1(ANXA1)在胰腺癌中的作用,包括促进肿瘤性肿瘤病和抗肿瘤免疫反应的能力。通过免疫组织化学和免疫荧光检查了151例胰腺癌病例中151例胰腺癌病例中,Anxa1和裂解的caspase-3(C-CASP3)的肿瘤表达和肿瘤浸润的CD68 +巨噬细胞的数量。使用髓样特异性的Anxa1-敲除小鼠研究了Anxa1在胰腺癌中的作用。通过单细胞RNA测序和流式细胞术评估了巨噬细胞中Anxa1缺乏引起的肿瘤浸润免疫细胞群体的变化。结果胰腺癌患者样品中的Anxa1表达与CD68 +巨噬细胞的数量相关。Anxa1 +肿瘤 - 浸润巨噬细胞的百分比与C-CASP3表达负相关,并且与较差的生存率显着相关。在小鼠中,髓样特异性的ANXA1缺乏症抑制了肿瘤的生长,并伴随着凋亡细胞在胰腺肿瘤组织中的积累,这是由于抑制巨噬细胞肿瘤的抑制作用,这依赖于CGAS刺激途径诱导的I型I型干扰素信号传导。Anxa1缺乏症可以通过增加效应T细胞和促炎性巨噬细胞的数量来显着重塑肿瘤轴承小鼠中肿瘤内淋巴细胞和巨噬细胞室。结论这项研究发现了巨噬细胞anxa1在胰腺癌中的新作用。此外,对焦虑症与吉西他滨和抗编程的细胞死亡蛋白-1抗体的结合疗法导致胰腺肿瘤生长的协同抑制作用。ANXA1-通过肿瘤相关巨噬细胞对肿瘤的介导的调节可通过刺激信号传导促进抗肿瘤免疫反应,这表明胰腺癌的潜在治疗策略。
引言质膜经常暴露于机械破坏,导致膜病变,该膜病变的形状和大小可能因细胞类型和功能而变化。在功能稳定或修复质膜的基因中的突变与多种不同的疾病有关,包括肌肉营养不良,心肌病和神经病(1,2)。随着膜破裂,细胞外Ca 2+的涌入可以启动质膜修复。在小膜病变的情况下,已经提出了几种质膜修复模型(3-5)。在一个模型中,细胞内囊泡以Ca 2+依赖性方式募集到损伤部位,它们彼此融合并融合到膜病变(6-8)。第二个模型暗示了受伤的膜的收缩,随后芽出来,并将受伤的膜脱落到细胞外空间中(9-12)。其他人除了膜向损伤部位的横向扩散外,还描述了受伤的膜区域的内吞作用(13-16)。这些模型的各个方面最终可能有助于膜修复和重新密封,部分地取决于细胞类型以及膜破坏的大小和深度。介导膜修复的机械参与其他细胞运输过程,脚手架受体和信号传导复合物以及调节肌动蛋白动力学的调节,这些动力学并非专用于膜修复。膜联蛋白以Ca 2+依赖性的方式与带负电荷的磷脂结合,除细胞迁移和粘附外,其在膜修复中的作用已被认可(17-22)。在肌肉膜修复的情况下,受伤部位形成了修复盖。附属蛋白A1,A2和