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World File Search System草酸
共生真菌和草酸盐降解：是否有联系？
草酸是生物体生产的最常见的低分子有机酸之一，它在草酸盐使用和处置的策略中多样化（Smith 2002）。例如，植物可能会在细胞内积聚，以获得电荷平衡，钙调节和防御，而真菌的草酸盐分泌与致病性有关，如Palmieri等人所述。（2019）。相反，细菌可以使用草酸盐作为能量和碳源（Herve等人2016）。在这种情况下，人类落在灰色区域。的确，在人类以及许多非人类动物中，草酸盐是乙二醇代谢的最终产物（Ermer等人。2023），由于酶促库缺乏草酸盐降解酶及其生理功能尚不确定（Palmieri等人2019）。然而，在自然界中草酸盐的广泛存在和使用反对人类中草酸盐的这种还原性的视力。的确，除了微生物或微生物群的结构化群落外，不能认为人类会殖民到外部环境中暴露于外部环境的所有表面，包括肠道，这代表了来自饮食中草酸盐的附加来源。据估计，在健康的个体中，饮食和内源性合成也同样有助于草酸盐水平（Mitchell等人。2019）。微生物群包括细菌和真菌，它们可能整合了宿主代谢途径，从而为草酸盐的合成和降解提供了酶，从而总体上有助于维持其稳态水平。考虑到分别称为原发性（pH）和次级（SH）高氧化尿症的草酸盐积累的病理弊端，这一点尤其重要，这导致肾脏中草酸盐的形成
在氟化钠和血清分离剂管中测得的葡萄糖浓度的比较和稳定性研究
简介：氟化钠/草酸钾（NAF/KOX）管已被视为葡萄糖分析的金标准管。尽管在几项研究中尤其是在第一个1-4H中报道了它们立即抑制糖酵解的无效性，但它们仍用于我们的临床生物化学实验室进行葡萄糖测量。然而，在不存在的情况下，仅使用血清分离器进行葡萄糖测量。我们旨在确定血清分离器管（SSTS）是否可以替代NAF/KOX管以实验室测量血糖，并评估3天期间葡萄糖浓度的稳定性。方法和发现：NAF/KOX管类型是参考方法，而SSTS类型是葡萄糖测量的候选方法。总共将50个配对样品在NAF/KOX管中分别收集的甘比亚成年人参考的健康成年参与者Tervals研究（GARIS）项目（GARIS）项目的SST被用作项目样本量。在血液收集和分离后，在2小时内测量葡萄糖浓度，在24h，42h和72h的时间点内测量。我们的数据分析显示，参考管和候选管类型之间的平均葡萄糖浓度无显着差异（平均差= 0.06 mmol/L; p = 0.38）记录在不同的时间点中。使用生长轨迹和混合效应模型，研究数据进一步显示葡萄糖浓度没有显着变化（p = 0.25）三天。结论：研究证实，在没有NAF/KOX管的情况下使用SST可以产生相似的葡萄糖结果。此外，当样品在2小时内分离并在2 - 8°C中冷藏时，葡萄糖浓度在两个管中均稳定三天。
用于开发新型阿片类和非阿片类镇痛疗法的受体和分子靶点
选择仍然有限（2）。尽管 μ 受体阿片类药物仍然是控制疼痛的主要药物，但持续的阿片类药物泛滥刺激了对替代疗法的研究。目前正在努力重新配制药物，以限制副作用和成瘾风险，同时其他研究侧重于内源性疼痛通路，以指导新型止痛药的开发（3）。整个神经系统中已经发现了止痛疗法的新靶点。几种离子通道受体参与通过外周神经元的疼痛传递，包括电压依赖性钠通道（Nav1.7、Nav1.8）的异构体、电压依赖性钙通道（Cav2.2）和瞬时受体电位香草酸-1（TRPV1）受体（4-6）。参与多系统信号传导的其他分子，如一氧化氮、前列腺素 E2 (PGE2) 和白细胞介素 6 (IL-6)，介导炎症和痛觉神经可塑性重塑 (7- 9)。在中枢神经系统中，疼痛感觉被认为涉及 μ-阿片类药物、κ-阿片类药物、δ-阿片类药物、N-甲基-D-天冬氨酸 (NMDA) 和大麻素受体活性 (10-12)。随着新技术的实现，其他方法现在旨在修改神经营养因子信号传导、表观遗传乙酰化或疼痛基因组 (13-15)。本篇对现有文献的叙述性回顾旨在描述几种有望成为新型镇痛疗法潜在靶点的受体和机制，包括初级传入神经、电压门控钠通道抑制剂、电压门控钙通道阻滞剂、TRPV1 靶点、全身介质、一氧化氮合酶抑制剂、微粒体前列腺素 E 合酶 1 (mPGES-1) 抑制剂、IL-6 抑制剂、中枢疼痛通路、κ -阿片类药物激动剂、δ -阿片类药物激动剂、NMDA 受体拮抗剂、大麻素、脂肪酸酰胺水解酶 (FAAH) 抑制剂、抗神经生长因子 (NGF) 抗体和各种基因干预。
通过基于核糖核蛋白的CRISPR – CASPR – CAS9系统从可再生生物量生产的琥珀酸生产的曲果蛋白CRISPR – CAS9系统 niger的代谢工程 通过在纳米镜上进行多聚体的适体来改善癌症靶向 脊柱操纵对运动单位行为的影响 集成能量系统的协调操作WP1 Aalborg Univertet技术数据和天然气成本... 使用低成本的开源脑部计算机界面和3D打印的手腕外骨骼诱导神经可塑性
摘要背景：琥珀酸具有巨大的潜力，可以成为基于生物的新基础，用于推导工业中多种增值化学品。基于可再生生物量的琥珀酸生产可以提供一种可行的方法来部分减轻全球制造对石油炼油厂的依赖性。为了改善生物过程的经济学，我们试图通过真菌细胞平台探索可能的解决方案。在这项研究中，尼日尔（Aspergillus Niger）是一种著名的生物基有机酸工业生产生物，因其琥珀酸产生的潜力而被利用。结果：使用核糖核蛋白（RNP）的CRISPR – CAS9系统，连续的遗传操作是在产生柠檬酸菌株的工程中实现的。两种涉及两种副产品的基因，即葡萄糖酸和草酸，被破坏。此外，有效的C 4-二羧酸盐转运蛋白和可溶性NADH依赖性富马酸酸盐还原酶被过表达。所得的菌株SAP-3产生了17 g/l琥珀酸，而使用合成底物在野生型菌株中未检测到可测量水平的琥珀酸。此外，还研究了两个培养参数，温度和pH值，以实现其对成功的粉刺产生的影响。3天后在35°C下获得最高量的琥珀酸，低培养pH值对琥珀酸的产生具有抑制作用。探索了两种类型的可再生生物量作为琥珀酸产生的底物。6天后，SAP-3菌株能够分别从甜菜糖蜜和小麦水解物中产生23 g/L和9 g/l琥珀酸。结论：在这项研究中，我们成功地将基于RNP的CRISPR-CAS9系统应用于尼日尔的基因工程中，并显着改善了工程菌株中的琥珀酸产生。关于栽培参数的研究揭示了pH和温度对琥珀酸产生的影响以及未来在菌株发展中的挑战。使用可再生生物量使用糖浆和小麦稻草水解产物来证明了可再生生物量来生产琥珀酸。关键字：尼日尔曲霉，代谢工程，琥珀酸生产，CRISPR – CAS9系统
CAS9系统从更新中产生琥珀酸
摘要背景：琥珀酸具有巨大的潜力，可以成为基于生物的新基础，用于推导工业中多种增值化学品。基于可再生生物量的琥珀酸生产可以提供一种可行的方法来部分减轻全球制造对石油炼油厂的依赖性。为了改善生物过程的经济学，我们试图通过真菌细胞平台探索可能的解决方案。在这项研究中，尼日尔（Aspergillus Niger）是一种著名的生物基有机酸工业生产生物，因其琥珀酸产生的潜力而被利用。结果：使用核糖核蛋白（RNP）的CRISPR – CAS9系统，连续的遗传操作是在产生柠檬酸菌株的工程中实现的。两种涉及两种副产品的基因，即葡萄糖酸和草酸，被破坏。此外，有效的C 4-二羧酸盐转运蛋白和可溶性NADH依赖性富马酸酸盐还原酶被过表达。所得的菌株SAP-3产生了17 g/l琥珀酸，而使用合成底物在野生型菌株中未检测到可测量水平的琥珀酸。此外，还研究了两个培养参数，温度和pH值，以实现其对成功的粉刺产生的影响。3天后在35°C下获得最高量的琥珀酸，低培养pH值对琥珀酸的产生具有抑制作用。探索了两种类型的可再生生物量作为琥珀酸产生的底物。6天后，SAP-3菌株能够分别从甜菜糖蜜和小麦水解物中产生23 g/L和9 g/l琥珀酸。结论：在这项研究中，我们成功地将基于RNP的CRISPR-CAS9系统应用于尼日尔的基因工程中，并显着改善了工程菌株中的琥珀酸产生。关于栽培参数的研究揭示了pH和温度对琥珀酸产生的影响以及未来在菌株发展中的挑战。使用可再生生物量使用糖浆和小麦稻草水解产物来证明了可再生生物量来生产琥珀酸。关键字：尼日尔曲霉，代谢工程，琥珀酸生产，CRISPR – CAS9系统
CRISPR/Cas 技术及其在大肠杆菌中的应用
大肠杆菌是生产生物燃料和大宗化学品（如乙醇、高级醇、脂肪酸、氨基酸、莽草酸衍生物、萜类化合物、聚酮化合物和聚合物前体（如 1,4-丁二醇））的最广泛使用的细胞工厂之一（Yang 等人，2021 年）。生产这些生化物质的代谢工程需要对细胞代谢进行大量调节以提高生产率。基因组编辑需要高效的工具来执行节省时间的顺序或多重操作。大肠杆菌有许多基因编辑工具，但它们都有特定的优点和缺点。使用双链 DNA（dsDNA）进行基因工程重组通常需要选择标记，这些标记应在下一步中被消除，以便进行后续修改（Datsenko 和 Wanner，2000 年；Sharan 等人，2009 年）。与双链DNA相比，单链DNA（ssDNA）介导的重组效率更高，并已进一步发展为可进行多重编辑的基因编辑工具，如多重自动基因组工程（MAGE）（Wang et al.，2009）和可追踪多重重组（TRMR）（Warner et al.，2010）。但这些方法不适用于没有选择标记的20bp以上的多个靶基因插入，通常需要强大的高通量筛选方法（Li et al.，2015）。近来发展的成簇的规律间隔的短回文重复序列（CRISPR）/CRISPR相关蛋白（Cas）系统被广泛应用于大肠杆菌的基因工程，极大地促进了其应用。成熟的 CRISPR RNA (crRNA) 和反式激活 crRNA (tracrRNA) 双链（或单个合成向导 RNA，sgRNA）或仅 crRNA 引导 Cas 核酸酶切割具有所需原型间隔区相邻基序 (PAM) 的靶 DNA 序列 (Jiang et al., 2013)。我们之前的文章 (Liu et al., 2020) 总结了不同类型的 CRISPR 系统的机制。CRISPR/Cas 系统持续切割靶位点，直到成功编辑或未编辑的细胞死亡，从而无需使用选择标记。
生物防治
本研究旨在通过多步骤工艺开发一种有效的生物制剂，以防止新鲜柑橘类水果采后真菌腐烂，该工艺包括从柑橘果皮中分离和鉴定乳酸菌 (LAB)、选择具有高抗真菌活性的 LAB 菌株、对无细胞上清液 (CFS) 进行化学表征、配制用 LAB 发酵物激活的柠檬皮粉状培养基 (LM)、对发酵 LM 进行化学表征以及评估新生物制剂对抗蓝霉菌的功效。从柑橘类水果皮中回收了 13 种 LAB，并通过肽质量指纹图谱法进行鉴定。使用双培养覆盖法和扩散琼脂测定法，分别测试了从柑橘类水果中分离的 LAB 以及从其液体培养物中获得的无细胞上清液 (CFS) 对抗多种植物病原真菌和卵菌的抗真菌活性。两个分离株被命名为 N3B2 和 M2B2，均被鉴定为植物乳杆菌，因其相关的抗真菌活性而被选中。这两个分离株都表现出广谱拮抗活性，包括柑橘果实的主要采后病原体，例如指状青霉菌和意大利青霉菌，分别是绿霉菌和蓝霉菌的病原体，链格孢菌，胶孢炭疽菌，喀斯特炭疽菌，柑橘腐霉菌和Ph. nic otianae。N3B2 和 M2B2 分离株被用作发酵剂，以发酵富含营养水溶液 (LM) 的柠檬皮粉培养基。通过使用 N3B2 和 M2B2 分离株发酵 LM 获得的两种制剂对用于初步筛选 LAB 的相同广泛病原体表现出强大的体外抑制活性。此外，这两种基于 LM 的配方降低了蓝霉感染的严重程度，并抑制了人工接种的柠檬果实上 P. italicum 的孢子形成。基于 LM 的生物配方的化学分析表明，它们的抗真菌活性很可能是由于乳酸菌衍生的酸性成分，包括乳酸、乙酸、DL-3-苯基乳酸、3-4-二羟基氢化肉桂酸、水杨酸香草酸。这些创新的基于 LM 的生物配方用乳酸菌衍生的抗真菌化合物激活，将被用作可食用和可生物降解的水果涂层，以延长新鲜柑橘水果的保质期并防止收获后腐烂。
与奥沙利铂相关的神经不良事件
Oxaliptin，可有效治疗消化系统肿瘤，例如结肠癌，胃癌和肝癌。基于奥沙利铂的疗法，包括FOLFOX（奥沙利铂与叶酸和5-氟尿嘧啶）和Capox（Oxaliptin和Capecitabine）广泛用于结肠癌（Mine等，2022）。奥沙利铂通过形成DNA-铂金合并的形成来干扰肿瘤细胞增殖，从而发挥其抗癌作用（Yang等，2021）。然而，奥沙利铂也可能与高增殖率的正常细胞相互作用，从而改变其生理特征并引起不良副作用（Oun等，2018）。多年来，许多研究突出了奥沙利铂对不同器官和组织的有害作用，包括神经毒性，胃肠道反应和骨髓抑制（Branca等，2021）。神经不良事件（AES）是奥沙利铂的最突出的剂量和残疾副作用，并影响超过80％的治疗患者（Seretny等，2014）。奥沙利铂的神经AES主要表现为冷敏感性的异常，发抖和运动症状，优先在手和脚上，类似于库存和玻璃的模式（Ventzel等，2016）。异常包括麻木，刺，刺痛或挠痒痒（Oun等，2018）。情感障碍表现出刺激的疼痛，通常不会引起疼痛或其他触摸的异常感觉（Oun等，2018）。奥沙利铂的神经学在临床上很重要，原因有几个。运动症状包括束缚和长时间的肌肉收缩（Yang等，2021）。首先，由于奥沙利铂的特定剂量限制性毒性可能导致奥沙利铂剂量的降低或早期终止治疗，这可能会影响患者的化学疗法有效性（Marcotti等，2023）。第二，奥沙利铂诱导的神经系统可能最终导致长期神经系统污染，例如感觉丧失和本体感受的变化，这可能会影响患者的日常活动并持续数月甚至几年（Mols等人，2013年）。第三，奥沙利铂诱导的神经系统经常出现，并且影响了80％以上的治疗患者（Velasco等，2014）。第四，有效的神经系统AE的有效治疗和预防策略是有限的。杜洛西汀是美国临床肿瘤学会治疗奥沙利铂诱导的神经病的唯一药物，但不良药物反应使其引起争议。不建议预防奥沙利铂诱导的神经病（Loprinzi等，2020）。因此，迫切需要对草酸磷脂相关神经AE的详细研究。尽管在某些临床试验中已经描述了与草钙蛋白相关的神经学AE，但
BMI 介导的草甘膦暴露与动脉粥样硬化性心脏病风险增加之间的关联：一项大规模横断面研究
动脉粥样硬化性心血管疾病是指脂肪和纤维物质在动脉内膜堆积，形成斑块并逐渐侵入动脉管腔，最终导致组织缺血和心脏和血管的一系列病理改变[1]。动脉粥样硬化心血管疾病是全球死亡的主要原因，据统计，2015年有超过1700万人死于动脉粥样硬化心血管疾病，约占总死亡人数的1/3[1]。动脉粥样硬化心血管疾病的危险因素很多，不良的饮食和生活习惯、基础疾病等因素会加速动脉粥样硬化心血管疾病的发生和进展[2]。由于动脉粥样硬化心血管疾病的死亡率极高且预后不良，因此预防其发病、减缓其进展至关重要。近年来，环境污染等问题日益严峻，越来越多的证据表明环境污染物的暴露与动脉粥样硬化心血管疾病的进展存在相关性[3]。草甘膦又名 N-膦甲基甘氨酸，是草甘膦类除草剂的主要有效成分 [4]。由于其广谱活性和有效的杂草抑制作用，该类除草剂目前在 140 个国家和地区使用，是全球使用最广泛的除草剂 [5]。草甘膦类除草剂的广泛使用导致草甘膦广泛暴露，可在空气、食物、土壤和水中检测到 [6]。环境中的草甘膦可通过皮肤接触、吸入和食入等各种途径进入人体 [7]。以前人们认为，尽管草甘膦在环境中暴露，但它对人体健康的危害很小，因为其除草作用主要抑制植物中的莽草酸途径，而该途径在脊椎动物中并不存在 [5]。然而，随着研究的进展，越来越多的证据表明草甘膦对脊椎动物也有不利影响。一项关于豚鼠的研究发现，草甘膦损害了它们的生长和生殖功能[8]。另一项关于虹鳟鱼的研究发现，长期暴露于环境中低浓度的草甘膦会影响其后代的发育和代谢[9]。此外，近年来进行的几项大规模横断面研究表明，草甘膦与糖尿病、抑郁和肝功能障碍等不良事件显著相关[10-12]。但目前关于草甘膦与ASCVD之间关联的研究有限。经查阅文献，我们仅发现将草甘膦暴露与心血管疾病（CVD）联系起来的报道，并且这些报道得出了负面结果[13]。同样，现有关于有机磷（OP）暴露与心血管疾病之间关联的研究也得出了相互矛盾的结论。缅甸的一项研究表明，长期接触有机磷农药的工人患心血管疾病的风险显著高于未接触有机磷农药的工人[14]。相反，美国的一项横断面研究结果表明，长期接触有机磷农药与心血管疾病之间无统计学显著相关性。
链格孢属植物的拉曼和量子化学研究。
纸上的真菌色素：链格孢属菌种的拉曼和量子化学研究。Victor V. Volkov 和 Carole C. Perry* 诺丁汉特伦特大学科学技术学院跨学科生物医学研究中心，克利夫顿巷，诺丁汉 NG11 8NS，英国。摘要为了加深对影响图书馆、博物馆和档案馆的文化遗产的真菌分子生物化学的了解，我们研究了拉曼光谱在识别纸上真菌有色发色团组成的诊断能力。在本研究中，我们探索了共振拉曼在区分高湿度下在纸上生长的真菌丝中的发色团的诊断能力，重点是表征链格孢属菌种的发色团。为了促进分子分析，我们对在紫外-可见光谱范围内具有光吸收的代表性代谢物进行了量子化学计算。通过理论与实验的比较，我们发现，在成熟的菌丝丝中存在 fonsecin、erythroglaucin 和 aurasperone 类型的发色团，而 β-胡萝卜素在纸面上的酵母沉积物中占主导地位。成熟丝的共振拉曼光谱表明，比 β-胡萝卜素更长的胡萝卜素对光谱特征的贡献更大。利用微观分辨率，我们在丝从酵母沉积物开始的空间区域中区分了丰富的拉曼特征集，这些特征集被归因于木质素、flavoglaucin、核黄素、cycloleucomelon(e) 和 asperyellone 分子成分。在这些区域中，丝的微结构刺激了成熟三维支架的发育，拉曼共振的多样性证实了发育结构具有丰富的生物化学性质。这里介绍的特征真菌发色团和代谢物的光学和光谱响应计算库对于理解真菌对各种纸制品（包括书籍、版画、素描、水彩画、雕刻甚至雕塑）的影响以及设计基于真菌菌丝垫的下一代材料至关重要。 关键词 拉曼、显微镜、真菌、纸、光学、密度泛函理论 引言 真菌界早期 [1] 的专业化归因于原真菌细胞在概念上依赖可渗透壁的生物学来提供快速分子运输和外部消化食物。后者在我们的生活中对真菌起着至关重要的作用：在工业和文化中。如果说系统地使用真菌作为生产剂的理念自直观的古代发酵以来一直发展缓慢，直到 19 世纪末设计出第一种草酸生产的药物化学方案 [2]，那么，人们直到最近几十年才开始意识到真菌作为我们日常生活中的积极参与者，无论是作为病原体，还是作为共生体，或者作为一种冷漠竞争的生命力，只有在了解这些生物组成了自己的王国之后，我们才能理解它们之间的区别 [3]。真菌对人类文化有着巨大的影响，这里我们讨论的是保存在纸质文物中的遗产。纸是一种由纤维素纤维制成的片状材料。在过去的两千年里，纸张是日常使用中信息存储和传输的主要“载体”，取代了蜡和粘土板、桦树皮和皮革羊皮纸。作为一种由多糖链构成的吸湿性有机材料，纸可能是许多微生物的营养来源。真菌是导致纸张降解的主要菌群 [4 ]。它们是图书馆、档案馆和博物馆中书面和印刷遗产的主要威胁 [5 ]。各种曲霉菌、镰刀菌、木霉菌、漆霉和青霉菌都能在纸上有效生长，并引起纸张基质的化学改变。