奇异果藤蔓衰落综合征(KVD)的特征是严重的根系障碍,导致冠层不可逆地枯萎。植物通常会因第一个地上症状的出现而迅速崩溃,即使在接下来的季节也没有恢复。自2012年首次爆发以来,综合征在意大利的不同领域(意大利的不同地区)一直对奇异果产量产生负面影响。迄今为止,尚未找到一个独特的,常见的因果因素,综合征称为多因素。在本文中,我们研究了与在三种不同的地下矩阵/隔室(土壤,根际和根)中开发KVD相关的整个生物群落(真菌,细菌和Oomycetes)。采样。要解决综合征的多因素性质,并研究了非生物因素在塑造这些群落中的潜在作用,还对土壤进行了物理化学分析。这项研究调查了组成微生物组以及生物和非生物因素之间的分类群体之间的关联。营养不良被认为是塑造KVD微生物群落的驾驶事件。从这项研究中获得的结果突出了卵属植物属的作用,这主要导致了卵菌的组成,尽管它也存在于健康的基质中。与KVD相关的根际群落是由不植物过程驱动的。细菌和真菌群落都导致属的丰富度高,并且与采样位点和基质高度相关,并强调了多个位置在地理上和空间上采样的重要性。此外,对患病的根际对关联网络的分析表明,存在潜在的跨王朝竞争,这是腐生,卵形和细菌之间植物来源碳的潜在竞争。
Joanna Szczurkowska, 1,8 Seong-Il Lee, 1,8 Alan Guo, 1 Andrzej W. Cwetsch, 4,5 Tanvir Khan, 1 Sneha Rao, 1 Gerd Walz, 2 Tobias B. Huber, 3 Laura Cancedda, 4,6 Sophie Pautot, 7 and Maya Shelly 1,9, * 1 Department of Neurobiology and行为,Stony Brook大学,Stony Brook,纽约州11794-5230,美国2医学系,大学医学中心弗莱堡大学医学院,弗莱堡大学医学院,弗莱堡大学,弗莱堡IM BREISGAU,德国3 III。Department of Medicine, University Medical Center Hamburg-Eppendorf, Hamburg, Germany 4 Local Micro-environment and Brain Development Laboratory, Istituto Italiano di Tecnologia, Genova, Italy 5 Universita` degli Studi di Genova, Genova, Italy 6 Dulbecco Telethon Institute, Italy 7 ITAV-CNRS USR 3505, Toulouse 31106,法国8这些作者同等贡献9铅联系 *通信:maya.shelly@stonybrook.edu https://doi.org/10.1016/j.cellerep.2020.03.03.083
Corentin Iltis,JérômeMoreau,KarolinaPecharová,DenisThiéry,Philippe Louapre。 欧洲葡萄藤蛾Botrana(Tortricidae)的生殖性能受到变暖情景的不利影响。.虫害科学杂志,2020,93(2),第679-689页。 10.1007/s10340-020-01201-1。 hal-02531426Corentin Iltis,JérômeMoreau,KarolinaPecharová,DenisThiéry,Philippe Louapre。欧洲葡萄藤蛾Botrana(Tortricidae)的生殖性能受到变暖情景的不利影响。.虫害科学杂志,2020,93(2),第679-689页。10.1007/s10340-020-01201-1。hal-02531426
种类葡萄葡萄(常见的葡萄)分为两个子种:Vitis Vinifera subsp。vinifera(培养的葡萄)和Vitis Vinifera subsp。sylvestris(野葡萄)。Vitis Vinifera subsp。Vinifera广泛用于餐桌水果,并作为生产与葡萄相关饮料的主要来源,包括葡萄酒和醋。野葡萄(Vitis Vinifera subsp。sylvestris)引起了人们的极大兴趣,因为它们被认为是培养品种的祖细胞,并且是一般理解葡萄树驯化过程的关键。为了解锁葡萄藤驯化的分子机制,基于基因组的研究被广泛进行。在这项研究中,两个格鲁吉亚野生葡萄树样品的完整叶绿体基因组受到光照射测序和计算机基因组组装,然后进行基因注释。根据结果,每个分析的叶绿体基因组的长度为160.928 bp,共有128个基因(83个蛋白质编码,37个tRNA,8 rRNA),属于遗传上独特的“ rkatsiteli'rkatsiteli'haplotype(AAA)。一项比较基因组研究揭示了叶绿体基因组中某些插入和SNP的存在。
准确的品种识别是涉及葡萄藤资源和衍生产品的每个过程的必不可少的要求。在过去几年中取得的进步允许对能够鉴定葡萄干品种的多个分子标记物进行分析。尽管为此目的建立了建议的九种微卫星(SSR)标记的推荐集,但它们使用从必须的DNA和葡萄酒样品提取的DNA进行了有效的应用仍然是一项艰巨的任务。这项工作旨在根据适用于使用叶子,必须和葡萄酒样品的SSR标记来开发高分辨率熔解(HRM)测定法。使用的葡萄藤品种是赤霞珠,图里加·弗兰卡(Touriga Franca),图里加(Touriga Nacional)和鲁菲特(Rufete)。总共使用12个SSR标记来筛选品种:OIV推荐的九个标记(VVMD5,VVMD7,VVMD25,VVMD27,VVMD27,VVMD28,VVMD28,VVMD32,VVS2,VVS2,VRZAG62,VRZAG62和VRZAG79)和VRZAG79)和三个标记5的长度和三个标记的长度和3个标记和vrifs and and ockrif和thend and offocroff和(vriff 5) VCHR9A)。来自葡萄酒样品的DNA多重PCR扩增的结果表明,这三个标记的性能优于九个已建立的SSR标记。HRM分析是针对标记VVIV35,VCHR5C和VCHR9A的,成功地区分了必须DNA样品中的品种组成。使用葡萄酒DNA进行了有希望的结果,在该葡萄酒中,HRM-VCHR9A测定法被证明具有最高的判别能力。需要在大量品种中应用HRM-SSR分析,以探索整个葡萄酒链中对葡萄指纹应用的适用性。总体而言,提出的小型SSR制造商可以更适合于葡萄酒DNA分析。此处介绍的HRM-SSR方法提供了快速的结果,从而使必DNA中的品种组成完全歧视。它也表明是使用葡萄酒DNA区分品种的有前途的工具,这项任务通常受到葡萄酒样品的固有复杂性的阻碍。
气候变化的多方面性质正在增加选择有弹性的葡萄藤品种或产生新的,变形品种的紧迫性,以承受许多新的挑战性条件。传统繁殖方法的限制速度阻碍了这一目标的实现,这需要数十年才能带来新的选择。另一方面,标记辅助育种在一个或几个基因控制的特征方面有用,对表型具有很大的影响,但其效率仍然受到许多基因座控制的复杂性状的限制。在这些前提下,创新的策略正在出现,可以帮助选择,利用Vitis属内部的遗传多样性的整体。通过适应和开拓性转化方案的遗传物质的来源也可以作为遗传物质的来源,可以作为遗传物质的来源,这些转化方案将自己作为在葡萄藤等顽固物种(例如葡萄剂)上的未来应用的有希望的工具。基因组编辑与这两种策略相交,这不仅是以相对较快的方式获得重点变化的替代方案,而且还通过支持对其他方法开发的新基因型的细胞调整。在此处介绍了有关可用遗传资源和使用创新技术在选择中使用创新技术的可能性的审查,以支持生产气候 - 玛丽特葡萄藤基因型。
从无DNA编辑的葡萄藤原生质体中的植物再生Simone scintilla 1*,Umberto salvagnin 1,Lisa Giacomelli 2,Tieme Zeilmaker 2,Mickael A. Mickael A. Malnoy A. Malnoy 1,Jeroen Rouppe Van der Voort 2,Claudio Moser 1。1果实作物,研究与创新中心的基因组学和生物学系,E. Mach 1,I-38010,San Michele A/Adige(TN)意大利; 2 Enza Zaden,Haling 1-E,1602 dB,Enkhuizen,荷兰。*通讯作者:Simone Scintilla博士(Simone.scintilla@unitn.it)。抽象的CRISPR-CAS技术已广泛扩展了植物育种中基因组编辑的应用领域,从而使遗传库中可能的特定和最小突变。关于标准基因组编辑技术,可以以核糖核蛋白(RNP)的形式引入CRISPR-CAS机械,从而避免将外源性DNA引入细胞中。对将无DNA递送到植物细胞中应用中的兴趣不断增加,尤其是在有价值的木本植物精英品种的情况下,CRISPR-CAS9技术将保留其基因型,同时仍导致靶向遗传修饰。通过确保CRISPR-CAS DNA-RNP作为RNP的无效递送,并且由于单个编辑的单元将不存在嵌合体,因此,使用CRISPR-CAS DNA-无需递送,非常适合新育种技术的需求。然而,通常通过低编辑效率和不成功的再生过程来阻碍木质植物中原生质体的细胞培养。深红色的L.胚胎愈伤组织。此策略符合无DNA策略要求。我们在这里描述了一种成功的无DNA方法,以获得完全编辑的葡萄植物,该方法是从V. vinifera cv获得的原生质体中再生的。在浓霉敏感性基因VVDMR6-2上编辑了转染的原生质体。再生的编辑植物表现出1bp或2bp的纯合缺失,以及1BP的纯合插入。引言基因组编辑技术允许以高度精确度修改细胞DNA。尤其是随着CRISPR-CAS9的出现(群集定期间隔短的短质重复 - CAS9)技术,基因组编辑的应用领域已被广泛扩展。该系统基于通过互补的RNA序列和CAS核酸酶介导的DNA双链破裂对DNA编辑位点的识别,这使得插入,缺失,甚至仅仅使一个核苷酸的修饰成为可能。因此,尤其是在木质植物遗传改善的情况下(例如葡萄藤或苹果)精英品种,CRISPR-CAS9技术可确保其基因型保存,同时导致靶向遗传修饰。CRISPR-CAS成分可以以核酸的形式引入细胞内(即DNA/mRNA编码整个系统),或以核糖核蛋白(RNP)复合物的形式进行编码。虽然DNA可以整合到基因组中,而mRNA受其内在不稳定性的影响,但RNP的直接细胞递送打开了有吸引力的场景,因为它有可能体现出强大的方法论,导致特定而最小的突变,而没有外源性DNA的痕迹(Woo等,2015)。从这种角度来看,与经典的转基因生物相比,对植物的应用兴趣可能会更好地接受消费者(Saleh等,2021)。到目前为止,已经提出了三种主要策略将CRISPR-CAS系统输送到植物细胞中。1)使用工程化的农杆菌,可以轻松克服植物细胞壁。然而,该策略采用外源质粒DNA,这些DNA含有农杆菌的DNA部分,在转化后,该策略在细胞DNA中积分为细胞DNA。对于木本植物,外源性DNA只能通过杂交去除,从而导致遗传背景的变化。成功地应用于包括木本植物在内的许多农作物的替代方法,包括T-DNA的分子切除(Dalla Costa等,2020),几乎完全去除外源性DNA。但是,剩余的最小残留外国DNA可能与许多国家的当前严格转基因生物法规不相容。2)粒子轰击使用装有生物材料的纳米颗粒子弹来射击植物组织,从而超过了细胞壁垒,并释放了纳米颗粒装载的生物货物以诱导基因组编辑。尽管如此,各种物理参数严重影响了这种方法的效率。,并非所有细胞都会被子弹击中,因此下游再生过程可能会引起嵌合植物。3)替代解决方案是暂时清除细胞壁,有效地将生物材料递送到单个细胞中。根据此策略,细胞壁是酶法消化的,因此提供了一个“裸”植物细胞(即原生质体)由质膜界定。在有利的条件下,可以通过PEG浸润,电穿孔或LiPofection轻松实现RNP的细胞递送。2-3天后,恢复了细胞壁,进一步的细胞划分
摘要葡萄(Vitis Vinifera)是世界上最重要的水果作物之一,遭受了白粉病的产量损失,这是由Erysiphe Necator引起的主要真菌疾病。除了抑制宿主免疫外,植物病原体还调节宿主蛋白所称为易感性因素以促进其在植物中的增殖。在这项研究中,CRISPR/CAS9(群集定期间隔短的短文重复序列/CRISPR相关9)技术用于使MLO的靶向诱变(霉菌抗性基因座O)家族基因被认为是粉状霉菌真菌的S因子。在两个或两个葡萄树Mlo基因VVMLO3和VVMLO4的等位基因中诱导的小缺失或插入,在粉状霉菌敏感的品种Thompson无生物的转基因植物中。使用不同的CRISPR/CAS9构建体获得的编辑效率从0%到38.5%不等。在获得的20个VVMlo3/4编辑的线中,一个是单个突变的纯合子,三个备有的双重突变,突变中有7个是杂合的,九个是嵌合,嵌合是嵌合,如每个线路中有两个以上突变的等位基因所示。在20个VVMLO3/4编辑的葡萄藤线中,有6条显示出正常的生长,而其余的线则表现出衰老样的氯症和坏死。重要的是,四个VVMLO3编辑线显示出对白粉病的耐药性,这与宿主细胞死亡,细胞壁的伴侣(CWA)和H 2 O 2积累有关。综上所述,我们的结果表明,CRISPR/CAS9基因组编辑技术可成功地用于诱导感兴趣基因的靶向突变,以提高经济重要性的特征,例如葡萄藤中的抗病性。