摘要 31 协调细胞对压力的反应对于整个生命周期的健康至关重要。 32 转录因子 SKN-1 是一种必需的稳态因子,可介导应激环境中的生存和细胞功能障碍,但 SKN-1 的组成性激活会导致过早衰老,从而 34 揭示了关闭细胞保护途径的重要性。在这里,我们确定了秀丽隐杆线虫两个纤毛 ASI 神经元中的 SKN-1 激活如何导致生物体转录能力增加 36 ,从而驱动外周组织的多效性结果。除了几类非编码 RNA 的表达增加外,ASI 神经元中已确定的 37 SKN-1 应激反应和脂质代谢基因类 RNA 的表达增加,定义了具有组成性 SKN-1 激活和健康寿命缩短的动物的分子特征。我们揭示了 neddylation 是 SKN-1 稳态调节器的一种新型 40 调节剂,可介导肠道细胞内 SKN-1 的丰度。此外,41 肠道中 dicer 相关的 DExD/H-box 解旋酶 drh-1 的 RNAi 非依赖性活性可以对抗 42 异常 SKN-1 转录激活的影响并延缓与年龄相关的健康状况下降。43 综上所述,我们的研究结果揭示了一种细胞非自主回路,可响应感觉神经系统中过度的 SKN-1 转录活性来维持生物体水平的 44 稳态。45 46 47 48
摘要:富含鸟嘌呤的 DNA 可以折叠成高度稳定的四链 DNA 结构,称为 G-四链体 (G4)。它们最初是在端粒和致癌基因启动子的序列中发现的,可以改变 DNA 代谢。事实上,G4 形成序列代表 DNA 聚合酶的障碍,对细胞生命有重要影响,因为它们可能导致基因组不稳定。为了了解它们在细菌基因组不稳定中的作用,将不同的 G-四链体形成重复序列克隆到大肠杆菌遗传系统中,该系统报告了当 G 道在复制过程中包含前导或滞后模板链时重复序列的移码和完全或部分缺失。这些重复序列在单链 DNA 中形成稳定的 G-四链体,但在天然超螺旋双链 DNA 中不形成。尽管如此,转录促进了 (G 3 T) 4 和 (G 3 T) 8 重复序列在所得 R 环中形成 G-四链体。根据遗传背景和序列结构形成的倾向,突变率相差 5 个数量级。此外,虽然体外方法表明细菌解旋酶可以分解 G4,但目前仍不清楚 G4 解旋在体内是否重要。在这里,我们表明 recG 突变会降低突变率,而结构特异性解旋酶 DinG 和 RecQ 的缺陷会增加突变率。这些结果表明 G-四链体的形成会促进细菌的遗传不稳定性,解旋酶在体内控制这一过程中起着重要作用。
DEAD/H-box 解旋酶几乎参与了 RNA 代谢的各个方面,包括转录、前 mRNA 剪接、核糖体生物合成、核输出、翻译起始、RNA 降解和 mRNA 编辑。大多数解旋酶在各种癌症中上调,其中一些突变与多种恶性肿瘤有关。最近,合成致死 (SL) 和合成剂量致死 (SDL) 方法正在成为癌症研究的主要领域,其中利用癌症相关基因的遗传相互作用作为治疗靶点。几种 DEAD/H-box 解旋酶,包括 DDX3、DDX9 (Dbp9)、DDX10 (Dbp4)、DDX11 (ChlR1) 和 DDX41 (Sacy-1),已在人类和不同模型生物中进行了 SL 分析。是否可以利用 SDL 来识别 DEAD/H-box 解旋酶过表达癌症中的可用药物靶点仍有待探索。在本综述中,我们分析了多种癌症类型中 DEAD/H-box 解旋酶子集的基因表达数据,并讨论了如何利用它们的 SL/SDL 相互作用进行治疗。除了讨论针对 DEAD/H-box 解旋酶的药物发现中的一些挑战外,我们还总结了临床应用的最新进展。
全球冠状病毒病 (COVID-19) 大流行是由严重急性呼吸综合征冠状病毒 2 (SARS-CoV-2) 引起的。冠状病毒因其病毒衣壳在显微镜下与日冕相似而得名(作者匿名,1968 年),它广泛传播,可引起类似于普通感冒的轻微感染。事实上,所有四种人类冠状病毒:HCoV-OC43、HCoV-HKU-1、HCoV-299E 和 HCoV-NL63,都是地方性的,并在人类中持续传播(Corman 等人,2018 年)。此前已报告过三次冠状病毒疫情,尽管规模远低于 COVID-19 疫情:SARS-CoV-1、MERS-CoV 和冠状病毒 HuPn-2018。与 COVID-19 类似,所有这些都是人畜共患疾病,最初通过动物宿主传播给人类(Ye 等人,2020 年)。与以往的疫情不同,自 2019 年底出现以来,COVID-19 几乎对每个人的生活都造成了巨大的破坏。截至 2022 年 11 月 4 日,COVID-19 已在全球造成 660 万人死亡(Ritchie 等人,2020 年)。巨大的死亡人数和对社会的影响促使人们大规模开展疫苗和抗病毒药物的开发,以预防和对抗 COVID-19。这项研究工作的积极成果毋庸置疑;多种疫苗,例如阿斯利康、Moderna、辉瑞/BioNTech,已经开发出来并投入使用。
1 卡坦扎罗“大希腊”大学健康科学系,S 校区。 Venuta”,Viale Europa,88100 Catanzaro,意大利 2 Net4Science 学术衍生公司,卡坦扎罗“大希腊”大学,校区“S. Venuta”,Viale Europa,88100 Catanzaro,意大利 3 卡坦扎罗“大希腊”大学实验和临床医学系,S 校区。 Venuta”,Viale Europa,88100 Catanzaro,意大利 4 卡利亚里大学生命与环境科学系,Cittadella Universitaria di Monserrato,09124 卡利亚里,意大利 5 罗马 Tor Vergata 大学实验医学系,Via Montpellier,1,00133 罗马,意大利 6 计算应用研究所“Mauro Picone”-CNR,00185 罗马,意大利 * 通讯地址:artese@unicz.it;电话:+39-0961-3694297
1临床生理学研究所(IFC),国家研究委员会(CNR),意大利锡耶纳53100; lgrardini@ifc.cnr.it(L.G. ); inzalaco@student.unisi.it(g.i。 ); emperor@ifc.cnr.it(f.i。 ); franci36@student.unisi.it(L.F.)2核心研究实验室(CRL),研究,预防和肿瘤网络研究所(ISPRO),意大利锡耶纳53100; calandro2@unisi.it 3锡耶纳大学医学生物技术系,意大利锡耶纳53100; boccuto2@student.unisi.it 4计算机与远程信息处理学院(IIT),国家研究委员会(CNR),意大利PISA 56124; romina.daurizio@iit.cnr.it 5兽医科学系,皮萨大学,意大利Pisa 56126; vincenzo.miragliotta@unipi.it 6 First Health Pharmaceutical B.V.,1098 XH阿姆斯特丹,荷兰; matteo @finfifsthealthpharma.com(M.A。 ); Alessia@finfirSthealthpharma.com(A.T。) * corpsondence:mario.chiariello@cnr.it;电话 : +39-057-723-1274†这些作者对本文做出了贡献。); inzalaco@student.unisi.it(g.i。); emperor@ifc.cnr.it(f.i。 ); franci36@student.unisi.it(L.F.)2核心研究实验室(CRL),研究,预防和肿瘤网络研究所(ISPRO),意大利锡耶纳53100; calandro2@unisi.it 3锡耶纳大学医学生物技术系,意大利锡耶纳53100; boccuto2@student.unisi.it 4计算机与远程信息处理学院(IIT),国家研究委员会(CNR),意大利PISA 56124; romina.daurizio@iit.cnr.it 5兽医科学系,皮萨大学,意大利Pisa 56126; vincenzo.miragliotta@unipi.it 6 First Health Pharmaceutical B.V.,1098 XH阿姆斯特丹,荷兰; matteo @finfifsthealthpharma.com(M.A。 ); Alessia@finfirSthealthpharma.com(A.T。) * corpsondence:mario.chiariello@cnr.it;电话 : +39-057-723-1274†这些作者对本文做出了贡献。); franci36@student.unisi.it(L.F.)2核心研究实验室(CRL),研究,预防和肿瘤网络研究所(ISPRO),意大利锡耶纳53100; calandro2@unisi.it 3锡耶纳大学医学生物技术系,意大利锡耶纳53100; boccuto2@student.unisi.it 4计算机与远程信息处理学院(IIT),国家研究委员会(CNR),意大利PISA 56124; romina.daurizio@iit.cnr.it 5兽医科学系,皮萨大学,意大利Pisa 56126; vincenzo.miragliotta@unipi.it 6 First Health Pharmaceutical B.V.,1098 XH阿姆斯特丹,荷兰; matteo @finfifsthealthpharma.com(M.A。); Alessia@finfirSthealthpharma.com(A.T。) * corpsondence:mario.chiariello@cnr.it;电话: +39-057-723-1274†这些作者对本文做出了贡献。
作者手稿已通过同行评审并接受出版,但尚未编辑。作者手稿于 2021 年 4 月 9 日首次在线发表;DOI:10.1158/2159-8290.CD-20-1508
区域具有形成次级DNA结构的潜力,对DNA复制产生了频繁且显着的障碍,并且必须积极管理以保持遗传和表观遗传完整性。回复体如何检测和响应二级结构的理解很少。在这里,我们表明,在其C末端区域的真核重置,永恒的港口中叉式保护复合物的核心成分是先前未批准的DNA结合结构域,该结构域表现出与G- Qu-Qudruplex(G 4)DNA结构的结合。我们表明,该域有助于通过G 4形成序列维持过程复制,并具有相邻的PARP结合域的部分冗余。此外,这种永恒的功能需要与解旋酶DDX 11的相互作用和活性。永恒和DDX 11的丧失会导致G 4形成序列和DNA损伤的表观遗传不稳定性。我们的发现表明,永恒有助于重新分散体感知复制障碍G 4的形成的能力,并确保DDX 11通过DDX 11对这些结构的迅速解决,以维持过程中的DNA合成。
摘要 BLM 是一种多功能解旋酶,在维持基因组稳定性方面起着关键作用。在 DNA 复制和修复的许多步骤中,它处理不同的 DNA 底物,但不处理缺口 DNA。然而,BLM 如何为各种功能做好准备仍然难以捉摸。在这里,使用组合单分子方法,我们发现当施加外部不稳定力时,大量 BLM 确实可以单向解开缺口的 dsDNA。令人惊讶的是,人类复制蛋白 A (hRPA) 不仅确保有限数量的 BLM 在减小的力下逐步解开缺口的 dsDNA,而且还允许 BLM 在完整和缺口的 ssDNA 上易位,从而产生双向解旋模式。这种激活需要 BLM 靶向缺口,并且溶液中存在游离 hRPA,而它们之间的直接相互作用是可有可无的。我们的研究结果展示了 BLM 的新型 DNA 解旋活性,这可能促进其在 DNA 修复中的功能转换。