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World File Search System酵母菌
机器学习可以识别替代酵母菌利用率途径
基因组差异如何促进表型差异是生物学的主要问题。最近在酵母菌saccharomycotina中，来自1,049种真菌物种（几乎所有已知）的122个来源和条件的新生长基因组，隔离环境和定性模式提供了一个强大的，复杂但复杂的数据集来解决此问题。我们使用了对这些基因组，代谢和环境数据训练的随机森林算法，以高精度预测几种碳源的增长。已知的结构基因涉及这些来源的收集和其他来源中生长的存在/不存在模式是有助于预测准确性的重要特征。通过进一步检查半乳糖的生长，我们发现它可以从基因组（92.2％）或生长数据（82.6％）（82.6％）的准确度中进行预测，但不能从隔离环境数据（65.6％）中进行预测。预测准确性甚至更高（93.3％）。在GAL ACTOSE利用基因之后，预测半乳糖生长的最重要特征是半乳酸上的生长，提出了一个假设，即在两个阶，血清中心和皮基亚菌中的几种物种（分别包含Auris的新兴病原体念珠菌和ogataea属）缺少了GALACTOWAY的替代途径，因为它们缺乏GALACE GENES。生长和生化分析证实，这些物种的数量通过替代氧化剂D-半乳糖途径利用半乳糖，而不是规范的GAL途径。机器学习方法对于研究酵母基因型 - 表型图的演变非常有力，即使在良好的研究性状中，它们的应用也会发现新颖的生物学。
乳糖仿形的酵母菌含有高脂肪酸积累的酵母菌，未经靶向的生物镜头
抽象的生物探测可以发现具有有趣的生态特征和有价值的生物技术特征的新酵母菌菌株和物种，例如将不同的碳源从工业侧转化为生物蛋白酶UCT的能力。在这项研究中，我们在热带西非进行了未靶向的酵母菌生物镜头，收集了1,996株分离株，并在70种不同的环境中确定了它们的生长。该系列包含许多分离株，具有吸收几种具有成本效益且可持续的碳和氮源的潜力，但我们专注于含有203种能够生长在乳糖上的菌株的特征，乳糖是乳制品的主要碳源，这是乳制品行业丰富的侧流奶酪乳清中的主要碳源。通过内部转录的间隔测序对乳糖映射菌株，我们从腹部和基本肌菌群中鉴定了30种不同的酵母菌物种，以前没有证明其中有一些在乳糖上生长，有些是新物种的候选者。观察到的生长和细胞外乳糖酶活性的生长和比率差异表明，酵母菌使用一系列不同的策略来代谢乳糖。值得注意的是，几种基质菌酵母，包括apiotirichum mycotoxinivorans，Papiliotrema laurentii和Moesziomyces natararcitus，积累了多达40％的细胞干重的脂质，证明它们可以将乳糖转化为重大生物含量的生物产物。
氧合影响酵母菌属和Scheffersomyces
©作者2024。Open Access本文是根据Creative Commons Attribution 4.0 International许可获得许可的，该许可允许以任何媒介或格式使用，共享，适应，分发和复制，只要您对原始作者和来源提供适当的信誉，请提供与创意共享许可证的链接，并指出是否进行了更改。本文中的图像或其他第三方材料包含在文章的创意共享许可中，除非在信用额度中另有说明。如果本文的创意共享许可中未包含材料，并且您的预期用途不受法定法规的允许或超过允许的用途，则您需要直接从版权所有者那里获得许可。要查看此许可证的副本，请访问http：//创建ivecommons。org/licen ses/by/4。0/。Creative Commons公共领域奉献豁免（http：//创建ivecommons。Org/publi cdoma in/Zero/1。0/1。0/）适用于本文中提供的数据，除非在数据信用额度中另有说明。
优化酵母菌工厂的创新工具和策略
（发行日期）2021-05（资源类型）期刊文章（版本）接受手稿（权利）©2020 Elsevier Ltd.保留所有权利。此手稿版本可在CC-BY-NC-ND 4.0许可下提供https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nc-nd/4.0/
氟康唑用于预防和治疗婴儿酵母菌感染
氟康唑是一种抗真菌药物，常用于治疗和预防早产和足月婴儿的酵母菌感染。酵母菌可引起婴儿全身严重感染，包括皮肤、血液、心脏、眼睛和大脑。婴儿的免疫系统比大孩子和成人弱，因此会发生酵母菌感染，感染可能导致长期健康问题甚至死亡。尽管氟康唑在婴儿中经常使用，但关于其药代动力学或该药物在婴儿体内如何代谢的数据却很少。关于氟康唑对婴儿的安全性和有效性的数据也很少。需要进行这些研究来确定氟康唑的代谢过程、安全性和有效性，以及治疗和预防早产和足月婴儿以及使用生命支持系统的婴儿酵母菌感染的最佳剂量。
裂变酵母菌菌株提供了对遗传开关的见解
一个主要发现是发现了一对称为“纳图综合体”的转录因子。这种复合物似乎调节基因表达并影响某些基因在细胞核中的定位，这一发现可以更好地了解基因沉默机制，这对于调节发育，免疫反应和其他重要生物学过程至关重要。
小麦酵母菌效应分子阵列抑制植物免疫反应
图 1 Zymospetoria tritici 的各种效应物持续抑制 flg22 诱导的活性氧 (ROS) 爆发。候选效应物在本氏烟中用农杆菌瞬时表达。每片叶子的一半表达阴性对照 (sHF)，另一半表达效应物。渗入后 72 小时，用 flg22 处理叶子每一侧的叶盘。通过将表达效应物的叶盘的总发光度与阴性对照 (sHF) 进行比较，测量每次 ROS 爆发测定中所有叶盘的平均总相对发光 (RLU)。单独的实验进行了五次，每个图中有五个数据点表示。对于 Zt_2_242，有一个不符合要求的数据点。为了确认这是一个异常值，又进行了三次重复（即总共八个数据点）。与 sHF 对照相比，五种效应物被鉴定为 flg22 诱导的 ROS 爆发的显著抑制剂（Wilcoxon 检验：* p < 0.05，** p < 0.01）。
隔离和鉴定具有人畜共患的丝状真菌和酵母菌
构成鸟类正常微生物的不同微生物可以存在于不同底物中，例如土壤和构成栖息地的其他元素。在牛肠，由于部分迁移习惯，肠道菌群可能会改变。因此，这项研究旨在隔离和鉴定出从墨西哥东部经济区Tulancingo的牛群（bubulcus ibis）粪便粪便中获得的真菌和酵母。牛群粪便进行分析，共240个池样品，这些样品分布在Sabouraud琼脂上，并在25.00-37.00°C下孵育2至3天。丝状真菌和酵母是通过形态学和乳酚蓝染色或中国墨水染色鉴定的。丝状真菌属粘液属。（42.35％），根茎属。（26.71％）;青霉属。（13.35％）; Paecilomyces spp。（11.40％）; Scedosporium spp。（1.95％）;并且，来自诸如加密赛属的酵母。（2.29％）; Rhodotorula spp。（1.95％）被鉴定出来。在这项工作中，从牛肠粪便中分离出具有人畜共患势的丝状真菌属和酵母菌的存在。当存在免疫抑制或结合不同的倾向因子时，可能会发生真菌感染的临床表现。鸟类的存在及其在人为活性中的下降并不是在免疫学胜任人类中表现出疾病的诱人因素。
益生菌编程：布拉氏酵母菌中饮食反应性基因表达和定植控制
图 1. PGM2 的修复使 S. boulardii 能够代谢半乳糖 (a) 该图说明了 Sb 中的半乳糖利用途径，其中失活的 PGM2 酶导致有毒中间体积累。(b) 工程化的 SbGal⁺ 途径显示 PGM2 活性的恢复，从而实现高效的半乳糖代谢。(c) 野生型 Sb MYA-796 和基因修复的 Sb MYA-796 (SbGal⁺) 在具有各种碳源的完全合成培养基 (CSM) 中的生长比较。数据显示 SbGal⁺ 在 2% 半乳糖上的生长得到改善，证明了 PGM2 修复的好处（橙色突出显示）。在木糖和乳糖等不利用半乳糖代谢途径的替代糖上，Sb 和 SbGal⁺ 之间的生长差异很小甚至没有。 SbGal ⁺ 在棉子糖与葡萄糖共存时，生长增强，表明该菌株在肠道等复杂的糖环境中具有提高性能的潜力。值代表在所示培养基中生长 36 小时的三个生物重复的终点光密度的平均值。
评估抑制谷菌孢子菌素的能力，在某些酵母菌菌株的芒果上引起炭疽病
这项研究的目的是在HOA loc sand芒果果皮上收集，分离和识别一些酵母品种，能够抑制浓咖啡酸盐的糖菌蘑菇，这些蘑菇在收获后在舞台上在芒果上引起炭疽病。在这项研究中，酵母菌菌株从芒果壳中取代，芒果壳基于许多不同的方法，包括形态特征，生化特征和分析26S rDNA序列。结果确定了三种酵母菌，包括Hanseniasporta Thailandica，Hanseniasporta Oputiae和Pichia Barkeri。然后，这些酵母菌菌株对Colletotrichum gloeosporioides的抑制能力是通过CO培养方法在体外进行的，结果表明，在培养10天后，拮抗剂比50％以上的拮抗率高于50％。这项研究最初表明，使用酵母来控制生物学是控制收获后对芒果的致病作用的潜在方法。